基于关键字的搜索是当今数字库中的标准。然而,像科学知识库中的复杂检索场景一样,需要更复杂的访问路径。尽管每个文档在某种程度上有助于一个领域的知识体系,但关键字之间的外部结构,即它们的可能关系以及每个单个文档中跨越的上下文对于有效检索至关重要。遵循此逻辑,可以将单个文档视为小规模的知识图,图形查询可以提供重点文档检索。我们为生物医学领域实施了一个完全基于图的发现系统,并证明了其过去的好处。不幸的是,基于图的检索方法通常遵循“确切的匹配”范式,该范式严重阻碍了搜索效率,因为确切的匹配结果很难按相关性进行排名。本文扩展了我们现有的发现系统,并贡献了有效的基于图的无监督排名方法,一种新的查询放松范式和本体论重写。这些扩展程序进一步改善了系统,因此由于部分匹配和本体论重写,用户可以以更高的精度和更高的回忆来检索结果。