基因组组装和测序技术的抽象进步使整个基因组序列(WGS)数据和参考基因组可访问多倍体物种。与流行的减少表示测序方法相比,WGS数据提供的基因组广泛覆盖范围和更大的标记密度可以极大地提高我们对多倍体物种和多倍体生物学的理解。然而,使多倍体物种有趣的生物学特征在读取映射,变异识别和基因型估计中也带来了挑战。在等位基因剂量不确定性,亚基因组之间的同源性和染色体遗传模式的差异等变体中考虑字符 - 属性可以减少错误。在这里,我讨论了多倍体WGS数据中变体呼叫的挑战,并讨论可以将潜在解决方案集成到标准变体呼叫管道中。