4。分配背景数据在基因组学和生物信息学领域中,研究人员分析了大量的DNA序列数据,以研究遗传变异,识别突变并提高医学研究。您已被招募从事Project Helix,这是一项旨在改善DNA序列比对的生物信息学计划。您的目标是开发一种基于Python的算法,以优化基因组数据分析。以下是有关您需要执行的任务的一些背景。4.1 DNA序列比对科学家通过查看关键蛋白的DNA序列并查看它们的相似性/不同来衡量该物种的关系。如果DNA的两个序列本质上是相同的,则两种物种在变化与时间之间存在关系,在进化上更接近。此过程称为序列比对。考虑下面的两个DNA串(完全构成,在红色中错过比赛):物种1:Aa t a acg aaA物种2:aa a a a a a a a a a a a a a a aaa a科学家可以通过假设其中一种基础的插入或删除来改变对齐方式。他们可以做出这样的变化,称为简称Indel,以查看它是否改善了对齐方式:物种1:Aa t aacgaaa-种类2:aa -aa -aacgaaa -aacgaaa,假设两个indels标记为两个破折号( - ),对齐方式得到了极大的改善。科学家会认为发生了两次变化,每种物种发生了一个变化。尽管存在复杂的算法来进行序列比对,但它对于支持研究人员并允许他们手工进行对齐也很有用。5。项目说明您的程序将:
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