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将整数细胞分化为体细胞类型是一个高度精心策划的过程,其特征是细胞塑造其转录组身份的表观遗传景观的变化。这些表观遗传层之一是DNA甲基化,主要局限于对称的CPG环境,在人类基因组中约有2800万CpG中约有60-80%是甲基化的。然而,几乎所有癌症通常都以非常具体的方式偏离了这种规范的甲基化剖面。在这里,我们利用了先前发表的大型Illumina甲基化阵列(Capper等,2018)来训练一个实用的可行机器学习模型以及快速的纳米孔测序,以实现术中术中脑癌的分类。

Helene Kretzmer

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