机构名称：
¥ 2.0
图1：Braker3管道的示意图。所需的输入是基因组序列，简短读取RNA-seq数据和蛋白质数据库。RNA-Seq数据可以以三种不同的形式提供：在序列读取存档中可用的库的ID（Leinonen等，2010），未对齐的读取或对齐的读取。如果给出了库ID，则Braker3使用SRA工具包（https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/traces/traces/sra/sra/sra/sra.cgi?view=software）下载RAW RNA-SEQ，并使用HisAT2（Kim等，2019，2019年）与基因组对齐。使用多个库时也可以使用这些格式的组合。
braker3：使用RNA的完全自动基因组注释...
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