质粒DNA的产率和质量受质粒拷贝数,质粒大小,插入毒性,宿主应变,抗生素选择,生长培养基和培养条件的影响。对于大肠杆菌的标准克隆菌株,我们建议使用新鲜条纹的选择板中的单个菌落来接种标准的生长培养基,例如LB(Luria-Bertaini)培养基。培养物通常在37°C和200-250 rpm的血管中生长,该容器允许曝气(Erlenmeyer烧瓶或滚筒上的Erlenmeyer烧瓶或培养管),并在12-16小时后收获,因为培养物从对数生长到固定相的培养过渡。这是质粒DNA含量最高的时间。LB中的培养物通常在3-6之间的最终OD 600中饱和,但生长至饱和度通常会导致细胞裂解。结果,质粒的产量和质量降低,并增加不需要的宿主染色体DNA的可能性增加。使用丰富的培养基(例如2x YT或TB)在较短的时间内会产生更高的生物量。如果选择用于生长,则应对准备中使用的培养时间和细胞数量进行调整以纠正这些差异,并避免矩阵过载并降低DNA的产量和质量。
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