生物医学知识图(BKG)已成为组织和利用整个生物医学领域发现的庞大而复杂的数据的强大工具。然而,当前对BKG的评论通常将其范围限制在特定的领域或方法上,从而忽略了更广泛的景观和快速的技术进步来重塑它。在本调查中,我们通过从三个核心角度提供对BKG的系统审查来解决这一差距:域,任务和应用程序。我们首先研究了如何从不同的数据源构建的BKG,包括分子相互作用,药理数据集和临床记录。接下来,我们讨论BKGS启用的基本任务,重点是知识管理,检索,推理和解释。最后,我们重点介绍了精确医学,药物发现和科学研究中的现实世界应用,这说明了BKG在多个领域的翻译影响。通过将这些观点综合为一个统一的框架,这项调查不仅阐明了BKG研究的当前状态,而且为将来的探索建立了基础,从而实现了创新的方法论进步和实践实现。
主要关键词