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¥ 2.0
引言鉴于微生物群落的高度动态和复杂性，识别和预测其时间依赖性模式对于理解其结构和功能至关重要。纵向微生物组样本的收集为捕捉微生物群落的动态及其与宿主表型的关联提供了独特的机会。然而，纵向微生物组数据的性质带来了一些分析挑战。首先，微生物组数据是高维的，降维是指导分析和解释的关键。其次，宿主内变异的模式可能随时间而改变，并因宿主而异，这使得提取微生物特征的稳健时间模式具有挑战性 1 。第三，由于纵向研究固有的实际限制（例如，错过患者随访或样本采集不一致），多个宿主经常缺少时间样本，这会导致跨宿主的时间采样不规则 2–5 。
基于时间的纵向微生物组研究降维
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