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翻译研究需要生物组织多个尺度的数据。测序和多摩学技术的进步提高了这些数据的可用性,但研究人员面临着重大的整合挑战。知识图(kgs)用于对复杂现象进行建模,并存在自动构造它们的方法。但是,解决复杂的生物医学整合问题需要在知识建模的方式上灵活。此外,现有的KG施工方法提供了强大的工具,以固定或有限选择的成本在知识表示模型中。pheknowlator(表型知识翻译器)是一个语义生态系统,用于自动化公平(可访问,可访问,可互操作和可重复使用的)本体理学基础KGS的构建,具有完全可定制的知识表示。生态系统包括kg施工资源(例如,数据准备API),分析工具(例如,SPARQL端点资源和抽象算法)和基准(例如,预构建KGS)。我们通过系统地将其与现有的开源kg施工方法进行了系统的比较,并分析其计算性能时,我们评估了生态系统。具有灵活的知识表示,Pheknowlator可以完全自定义的KG,而不会损害性能或可用性。

生命科学的开源知识图生态系统

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