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简介:抗生素耐药性逃逸到环境中并持续存在,对 20 世纪取得的医疗保健进步构成了迫在眉睫的威胁。与耐药细菌共存的微生物群落可能有助于发现全球抗菌控制的新策略,并抑制耐药性的出现和维持。然而,缺乏临床相关样本以及来自人工和自然环境的补充样本,是有效研究受影响人群及其周围环境中耐药性动态的主要障碍。方法:我们通过结合现有的当地临床和环境监测计划,将微生物群落的环境和临床测量与新出现的耐药性证据结合起来。临床样本来自南卡罗来纳医科大学 (MUSC) 感染监测培养计划,该计划定期对 MUSC 患者群体进行临床相关病原体采样。环境样本是与当地非营利组织查尔斯顿水源保护者合作的结果,该组织在该地区受欢迎的休闲场所进行水质监测。结果:剩余的感染监测样本可通过 Living µBiome Bank 系统用于研究,该系统能够对患者群体进行细致的电子表型分析,从而及时捕获临床微生物样本。我们展示了对这些 cl 进行测序的可行性

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