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毒液作为药物库的计算研究:从 Androctonus zagrosensis 毒腺转录组中发现多功能虾红素样金属蛋白酶
毒液作为药物库的计算研究:从 Androctonus zagrosensis 毒腺转录组中发现多功能虾毒素样金属蛋白酶摘要虾毒素金属蛋白酶是具有药用潜力的 metzincin 超家族的锌依赖性内肽酶,代表了有希望的治疗靶点。认识到蝎毒是丰富的药物发现资源,并认识到计算方法可以加速这些发现转化为治疗方法,我们利用转录组数据作为“药物发现库”来鉴定具有医学重要性的蝎子 Androctonus zagrosensis 中的毒液虾红素金属蛋白酶 (VAMP)。通过定制的本地数据库,我们对 VAMP 进行了首次全面分析,识别出 23 个具有保守 HEXXHXXGXXH 基序和特征域(CUB、EGF-like、MAM)的新基因。具体而言,这些蛋白被分为四组,包括蝎子 tolloid 蛋白 (scTLD)、BMP1/TLD 样蛋白酶、虾红素样金属肽酶和 meprin A 亚基 β 样蛋白酶。结构域结构揭示了进化适应:scTLD 保持保守的 5-CUB/2-EGF 构型,BMP1/TLD 样变体表现出 CUB/EGF 多样性,虾红素样 MP 仅保留催化结构域,meprin β 样蛋白酶具有 MAM 结构域。理化分析显示亚家族特异性多样性(scTLD:1000–1008 aa/114 kDa;虾红素样:240–250 aa)。表达分析highlig
来源:Arácnido虾青素金属蛋白酶是具有药用潜力的美津青超家族的锌依赖性内肽酶,是有前景的治疗靶点。我们认识到蝎毒是丰富的药物发现资源,并认识到计算方法可以加速将这些发现转化为治疗方法,因此我们利用转录组数据作为“药物发现库”来鉴定具有医学重要性的蝎子 Androctonus zagrosensis 中的毒液虾红素金属蛋白酶 (VAMP)。通过定制的本地数据库,我们对 VAMP 进行了首次全面分析,识别出 23 个具有保守 HEXXHXXGXXH 基序和特征域(CUB、EGF-like、MAM)的新基因。具体而言,这些酶被分为四组,包括蝎子类毒素蛋白 (scTLD)、BMP1/TLD 样蛋白酶、虾红素样金属肽酶和 meprin A 亚基 β 样蛋白酶。
Androctonus zagrosensisSalabi, F. (2025)。毒液作为药物库的计算研究:从 Androctonus zagrosensis 毒腺转录组中发现多功能虾红素样金属蛋白酶。
生物学和医学中的计算机,
198,111247。
https://doi.org/10.1016/j.compbiomed.2025.111247