什么促使基因适应?问一只雀科鸟。

开创性的泛基因组研究表明,DNA 的大翻转可能使小鸟对某些疾病具有抵抗力

来源:哈佛大学报

一种新颖的遗传学研究方法能否让我们更清楚地了解进化适应是如何发生的?这就是对一种常见的后院鸟类——家雀的新研究结果所暗示的。一项开创性的泛基因组学研究揭示了一种重大的 DNA 翻转,似乎使这种小鸟对某些疾病具有抵抗力。

在其发表于《美国国家科学院院刊》(PNAS)的论文《从家雀泛基因组推断的结构变异对适应性的影响》中,生物和进化生物学系博士后研究员 Bohao Fang 使用先进的测序和一种新的泛基因组学方法来获得更好、更广泛的遗传适应性视角。Fang 说,这种方法结合了许多个体标本的基因组信息,查看了大量的遗传信息,并提供了“更高的遗传信息分辨率”。

从家朱雀泛基因组推断结构变异对适应性的影响 美国国家科学院院刊 有机体和进化生物学系 方伯豪

“传统上,人们研究单个碱基对 [DNA] 中的遗传变异,”爱德华兹实验室的研究员方伯豪解释道。虽然早期的研究集中在特定基因上,希望破译方伯豪所说的“抗病性背后的可遗传基因机制”,但这些研究的重点较窄,没有提供明确的结果。然而,通过研究更广泛的 DNA 片段,“我们发现长读测序可以帮助我们捕捉重要的大规模结构变异,否则可能会被忽略。”

爱德华兹实验室

在家朱雀中,这种新方法揭示了存在了数百万年的 DNA 倒位——这可能有助于鸟类抵抗感染。

“这让我们更好地了解了在没有疫苗的情况下,野生生物如何进化来应对新疾病。”Bohao Fang
Bohao Fang 比较动物学博物馆 Scott V. Edwards