跳蛛 Spartaeus platnicki 的染色体水平基因组组装

跳蛛 Spartaeus platnicki 的染色体水平基因组组装摘要跳蛛是一个多样化且富有魅力的无脊椎动物群体,以其高度专业化的视觉系统、复杂的求偶行为和广泛的生态适应性而闻名。然而,高质量基因组资源的持续缺乏阻碍了对这些关键性状的遗传基础和表型进化的研究。为了解决这一空白,我们对 Spartaeus platnicki(一种代表跳蛛基础谱系的物种)的染色体水平基因组进行了从头组装。该组装通过整合 PacBio HiFi 长读长、Illumina 短读长、RNA-seq 和 Hi-C 数据实现,包含 15 条假染色体,包括 X1 和 X2 性染色体,总长度为 3.71 Gb,支架 N50 为 262 Mb,BUSCO 完整性为 98.60%。重复元件约占基因组的65.57%。我们注释了 15,660 个蛋白质编码基因,实现了 97.60% 的 BUSCO 完整性。这种高质量的基因组为研究跳蛛关键性状及其表型进化的遗传结构奠定了基础资源。Yang, Z.、Chen, A.、Zhang, F. 和Zhang, J. (2026)。跳蛛 Spartaeus platnicki 的染色体水平基因组组装。科学数据。 https://doi.org/10.1038/s41597-026-07685-3

来源:Arácnido

跳蛛是一个多样化且富有魅力的无脊椎动物群体,以其高度专业化的视觉系统、复杂的求偶行为和广泛的生态适应性而闻名。然而,高质量基因组资源的持续缺乏阻碍了对这些关键性状的遗传基础和表型进化的研究。为了解决这一空白,我们对 Spartaeus platnicki(一种代表跳蛛基础谱系的物种)的染色体水平基因组进行了从头组装。该组装通过整合 PacBio HiFi 长读长、Illumina 短读长、RNA-seq 和 Hi-C 数据实现,包含 15 条假染色体,包括 X1 和 X2 性染色体,总长度为 3.71 Gb,支架 N50 为 262 Mb,BUSCO 完整性为 98.60%。重复元件约占基因组的65.57%。我们注释了 15,660 个蛋白质编码基因,实现了 97.60% 的 BUSCO 完整性。这种高质量的基因组为研究跳蛛关键性状及其表型进化的遗传结构奠定了基础资源。

杨 Z.、陈 A.、张 F. 和张 J. (2026)。跳蛛 Spartaeus platnicki 的染色体水平基因组组装。科学数据。https://doi.org/10.1038/s41597-026-07685-3