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Brachypelma albiceps 的完整线粒体基因组测序和七种 Mygalomorphae 物种的比较密码子使用偏差分析
作者：Micha L. Rieser，归因，https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=35243275白头短毛虫的完整线粒体基因组测序和七种蝼蛄科物种的密码子使用偏倚比较分析摘要狼蛛（狼蛛科）是陆地上具有重要生态意义的无脊椎动物捕食者生态系统，但许多物种面临栖息地破碎化和国际宠物贸易不可持续收集的威胁。 Brachypelma albiceps 是 CITES 附录 II 所列物种，缺乏全面的线粒体基因组特征，限制了系统发育和进化研究。在这里，我们报告了白头孢菌的完整线粒体基因组序列（13,856 bp；GC 含量 32.84%），并提供了详细的注释。该基因组表现出典型的后生动物线粒体组织，包含13个蛋白质编码基因（PCG）、22个tRNA和2个rRNA，具有富含AT的核苷酸组成（67.16%），是节肢动物线粒体的特征。对白头孢子虫和其他六种 Mygalomorphae 物种的比较分析揭示了对 A/T 结尾密码子的强烈偏好，并回避 G/C 结尾密码子。 ENC-GC3、中性和 PR2 分析一致表明，自然选择在塑造同义密码子使用方面发挥着主导作用，突变压力也有所贡献。基于来自 23 个蜘蛛物种的 10 个高质量线粒体蛋白编码基因的系统发育重建证实了白头蜘蛛在该科中的地位
来源:ArácnidoBrachypelma albiceps 的完整线粒体基因组测序和七种 Mygalomorphae 物种的比较密码子使用偏差分析
摘要
狼蛛（Theraphosidae 科）是陆地生态系统中具有重要生态意义的无脊椎动物捕食者，但许多物种面临栖息地破碎化和国际宠物贸易不可持续采集的威胁。白头狼蛛 (Brachypelma albiceps) 是 CITES 附录 II 所列物种，缺乏全面的线粒体基因组特征，限制了系统发育和进化研究。在这里，我们报告了白头孢菌的完整线粒体基因组序列（13,856 bp；GC 含量 32.84%），并提供了详细的注释。该基因组表现出典型的后生动物线粒体组织，包含13个蛋白质编码基因（PCG）、22个tRNA和2个rRNA，具有富含AT的核苷酸组成（67.16%），是节肢动物线粒体的特征。对白头孢子虫和其他六种 Mygalomorphae 物种的比较分析揭示了对 A/T 结尾密码子的强烈偏好，并回避 G/C 结尾密码子。 ENC-GC3、中性和 PR2 分析一致表明，自然选择在塑造同义密码子使用方面发挥着主导作用，突变压力也有所贡献。基于来自 23 个蜘蛛物种的 10 个高质量线粒体蛋白编码基因的系统发育重建证实了白头蜘蛛在 Theraphosidae 科中的位置及其与 Cyriopagopus 物种的密切系统发育关系。这些结果为 Theraphosidae 系统学提供了宝贵的基因组资源，增强了我们对密码子偏向进化的理解，并为非法野生动物贸易中受 CITES 监管的标本的法医鉴定提供了关键的 DNA 条形码数据。
詹Q.、唐Y.、赵Y.、侯S.、黄Y.、赵X.、陈Y.、薛X. (2026)。白头短毛虫的完整线粒体基因组测序和七个 Mygalomorphae 物种的密码子使用偏差比较分析。
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