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World File Search System丝氨酸
高活性转座酶的发现和语言模型指导设计
传统上，合成生物学仅限于在自然界中进行生物勘探，然后进行重构和优化。随着生成式 AI 方法应用于蛋白质设计的发展，可以增强采样的自然多样性，以生成自然界中未见过的功能序列 8–10。例如，RFdiffusion 11 与设计催化位点的新方法相结合，创造了具有新折叠的活性合成丝氨酸水解酶 12。有趣的是，最近使用蛋白质大语言模型来生成 CRISPR-cas9，这是一种与 DNA 和 RNA 结合的非常复杂的多结构域蛋白质，它在自然界中并不存在，但在基因编辑应用中效果很好 8。此类模型的发展为扩展自然目录之外的生物多样性以及利用生成式 AI 为生物技术创建具有更高活性的基因编写器开辟了非常令人兴奋的机会。
评估终点方法预测蛋白激酶抑制剂的结合亲和力趋势的能力
蛋白激酶（PK）酶是巨大的超家族的一部分，在各种细胞活化事件中起着重要作用。1 PK酶会催化磷酸基团在酶（苏氨酸，丝氨酸，酪氨酸和组氨酸）中存在于酶的催化位点（也称为ATP结合位点）中，这代表了调节酶活性的关键过程。PK酶的三维结构是由两个域（也称为Lobes）形成的，它们通过固定铰链区域相互关联。这两个结构域之间的界面形成了疏水性CLE构造ATP结合位点（图1）。较小的N端子结构域由B-表格（B 1 - B 5）和一个螺旋（称为C）构成，而第二个C末端域则由多个A螺栓（A D - A I）富集。2 - 4 PK酶共享一些2 - 4 PK酶共享一些
IU印第安纳波利斯学者 - 印第安纳大学
人类表皮生长因子受体2（HER2）被靶向的剂已被证明是有效的，但是，对这些药物的抗性发展已成为治疗HER2+乳腺癌的障碍。证据表明，汉克是抗癌和耐药性HER2+乳腺癌的抗癌靶标。在这项研究中，在大块头的下游基板的磷酸化事件中，有选择性的块状抑制剂，作为HER2+乳腺癌中大块头活性的标志。Rubicon已被确定为在丝氨酸上磷酸化的大块头的底物。的发现表明，在S92处，大块介导的Rubicon磷酸化促进了HER2/NEU+乳腺癌中的自噬和肿瘤发生。HUNK抑制可防止Rubicon S92在HER2/NEU+乳腺癌模型中抑制磷酸化并抑制肿瘤发生。这项研究将下游磷酸化事件描述为对大块活性的量度，并鉴定出对HER2+乳腺癌具有有意义疗效的选择性大块头抑制剂。
针对酪蛋白激酶 1 进行癌症治疗
酪蛋白激酶 1 (CK1) 是丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶家族，在细胞增殖、存活和代谢等各种细胞过程中发挥着至关重要的作用。CK1 表达失调与多种癌症的发展和进展有关，因此成为抗癌治疗的一个有吸引力的靶点。在这篇综述中，我们概述了目前用于靶向 CK1 进行癌症治疗的策略，并讨论了该领域的未来前景。我们重点介绍了不同的方法，包括小分子抑制剂、RNA 干扰、基因组编辑和免疫疗法，这些方法在靶向调节癌细胞中的 CK1 活性方面具有巨大潜力。此外，我们讨论了与靶向 CK1 相关的挑战，并提出了克服这些障碍的潜在策略。总体而言，靶向 CK1 作为癌症治疗的治疗策略具有巨大的前景，值得进一步研究这一领域。
CDK2 抑制剂作为抗癌药物的最新进展
细胞周期依赖性激酶 (CDK) 是一组丝氨酸/苏氨酸激酶，它们与称为细胞周期蛋白的调节亚基相互作用以发挥其活性。1,2 这些 CDK 在调节细胞周期进程和转录方面至关重要（►图 1）。3,4 在人类细胞中已鉴定出 20 种 CDK（CDK1 – 20）和 29 种细胞周期蛋白。5 其中，CDK1、CDK2、CDK4 和 CDK6 在细胞周期调控中起关键作用，而 CDK7 – 9、11 – 13、19 和 20 主要在转录调控中起关键作用。2,4,6,7 值得注意的是，许多 CDK 具有多种催化底物并参与各种细胞过程。例如，CDK7 是一种在细胞周期期间激活 CDK 的激酶，也是转录期间 RNA 聚合酶 II 的调节剂。 CDK5 被广泛认为是调节神经元功能和细胞迁移的关键因素。8 癌症的一个标志性特征是细胞周期失调，导致不受控制和过度的细胞
期末考试问题
硒43。芳香氨基酸的代谢44。组氨酸和色氨酸的代谢45。赖氨酸，苏氨酸和丙氨酸的代谢46。精氨酸的代谢，肌酸的形成和第47号。跨甲基化和羧化，其机制48。THFA和部分氧化的一碳碎片49。甲基化与THFA 50的参与。甘氨酸和丝氨酸的代谢51。氨基酸降解的概述52。生酮和糖原代谢物53。嘧啶核苷酸的生物合成和降解54。嘌呤核苷酸的生物合成和降解55。卟啉的生物合成56。下摆降解和胆汁颜料的代谢57。黄疸的生化方面58。核酸和染色质的结构59。生物合成和DNA 60的功能。DNA修复和DNA重组61。单个类型RNA的结构和功能62。转录及其法规63。mRNA的形成（hnRNA，剪接，编辑，
遗传学和与年龄相关的黄斑变性
与年龄相关的黄斑变性（AMD）是一种多因素遗传疾病，在34个基因座处至少有52个可识别的相关基因变异，包括补体因子H（CFH）中的变体（CFH）和年龄相关的超级疾病易感性2/高磁体需求2/高敏感性丝氨酸肽肽-1（Arms2/herm2/Hrtra）。遗传因素最多占疾病变异性的70％。但是，基于人群的遗传风险评分通常对临床试验设计和风险组的分层比对个别患者咨询更有帮助。有一些证据表明对AMD患者使用的各种治疗方式的药物遗传学影响，包括与年龄相关的眼病研究（AREDS）补充剂，光动力疗法（PDT）和抗血管内皮生长因子（抗VEGF）。但是，目前尚无令人信服的证据表明遗传信息在常规临床护理中起作用。
RIPK1介导的途径和神经毒性反应 -
受体相互作用的丝氨酸/苏氨酸 - 蛋白激酶1（RIPK1）和神经毒性的反应性星形胶质细胞在神经退行性疾病的进展中的关键作用而获得了认识。RIPK1是坏死和炎症的关键调节剂，与星形胶质细胞相互作用，以加剧神经炎症和神经元损伤。神经毒性反应性星形胶质细胞通常由炎症性小胶质细胞诱导，导致突触功能障碍和神经元死亡，进一步提高疾病病理学。这篇评论强调了RIPK1介导的信号传导和反应性星形胶质细胞的产生的机制，强调了它们在神经退行性疾病中的相互作用，例如阿尔茨海默氏病，帕金森氏病和肌萎缩性侧面硬化症。了解这些途径为有针对性的治疗策略提供了新的机会来减轻神经退行性。
纯化的抗NF-κBp65抗体
描述NF-κBp65，也称为NFKB3和RERA，是核因子KB（NF-KB）/RER家族的五个成员之一。非活性NF-κBp65在细胞质中被隔离为IκB抑制蛋白的复合物。激活NF-κB途径后，IκB蛋白会降解，从而将NF-κBp65释放到核。NF-κBp65与转录辅助因子的结合是通过丝氨酸276、529、536和471的磷酸化诱导的。作为转录因子，NF-κBp65对于细胞增殖，免疫反应，存活和凋亡至关重要。通过调节软骨细胞和成骨细胞分化和存活，NF-κBp65在骨骼发育中具有至关重要的作用。在几种癌症中过表达NF-κBp65充当癌基因，并与肿瘤发生，转移，肿瘤血管生成和化学抗性有关。
Schmidt_遗传性血管性水肿和静脉血栓栓塞症的孟德尔随机化研究结果_审查后划红线
遗传性血管性水肿是一种罕见疾病，每 5 万到 10 万中就有一例发生。[1] 其特征是皮肤和黏膜下组织反复肿胀，这是由于遗传性 C1 抑制剂缺乏导致缓激肽产生抑制不足所致。C1 抑制剂通过抑制几种丝氨酸蛋白酶（包括补体 C1a、C1r、甘露聚糖结合凝集素丝氨酸蛋白酶 1 (MASP-1)、MASP-2、纤溶酶、激肽释放酶和凝血因子 XIa 和 XIIa）来控制补体、纤溶酶、内源性凝血和接触系统。[2] D-二聚体水平通常在血管性水肿发作期间升高（可能是由于纤溶酶生成增强），但血管性水肿发作期间的这种升高与血栓风险增加无关。[3]几篇关于遗传性血管性水肿的评论指出，HAE（即使在 D-二聚体水平升高的情况下）也不会增加静脉血栓栓塞症 (VTE) 的风险。但是，除了患者和医生的经验之外，没有其他资料可以支持这一说法。但是，最近的一项回顾性队列研究检查了遗传性血管性水肿与 C1 抑制剂缺乏症的许多潜在合并症，报告了遗传性血管性水肿与 VTE 之间的关联。[4, 5] 值得注意的是，这些发现可能会因 VTE 的指征和错误分类而受到混淆。[6] 鉴于遗传性血管性水肿极为罕见，很难通过前瞻性队列研究进一步调查这一发现。如果 HAE 确实与 VTE 有关，则可以假设 C1 抑制剂水平不太明显的变化也可能与 VTE 风险有关。孟德尔随机化 (MR) 是一种适合进一步研究 C1 抑制剂水平与 VTE 潜在风险之间潜在因果关系的方法。MR 是一种使用遗传变异作为工具来评估暴露和结果之间潜在因果关系的方法。MR 方法的优势在于，它受通常困扰观察性研究的混杂和反向因果关系风险的影响要小得多。Davies 等人撰写了一份关于孟德尔随机化工作原理的全面概述。[7] 为了探索较低的 C1 抑制剂水平与静脉血栓栓塞之间的因果关系，我们进行了一项孟德尔随机化研究。