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World File Search System代谢
gmd@csb.db：GOLM代谢数据库
摘要摘要：代谢组学，特别是气相色谱 - 质谱法（GC -MS）基于生物提取物的代谢物培养物，正迅速成为功能基因组学和系统生物学的基石之一。代谢物促进在发现药物或除草剂的作用方式以及揭示基因表达改变对生物技术应用中代谢和生物性能的影响方面具有深刻的应用。因此，许多实验室都需要使用该技术。为此，需要开放的信息交换，就像已经针对转录本和蛋白质数据实现的那样。代谢物培养的主要步骤之一是在高度复杂的生物样品中代谢物中的代谢物明确鉴定。质谱的集合（构成已知或未知确切的化学结构的代谢产物）代表了汇集目前在世界许多实验室中执行的识别工作的最有效方法。在这里，我们提出GMD，GOLM代谢组数据库，一个开放访问代谢组数据库，该数据库应启用这些过程。GMD提供了公众访问Cusmom质谱库，代谢物专业实验以及其他信息和工具的访问权限，例如关于方法，光谱信息或化合物。主要目标是代表一个通过多学科合作来开发和改善代谢组学的实验研究活动和生物毒素格式的交换平台。可用性：http：//csbdb.mpimp-golm.mpg.de/gmd.html联系：steinhauser@mpimp-golm.mpg.de补充信息：http：//csbdb.mpimp-golm.mpg.mpg.de/
引用原始发表的论文（记录的版本）：Mao，J。，Zhang，H.，Chen，Y。等（2024）。减轻新陈代谢负担以改善强大的
夏尔默斯技术大学的生命科学系，SE412 96哥德堡，瑞典B天津工业生物技术研究所，中国科学学院，蒂安金300308，pr中国C中国生命科学学院，中国科学学院，北欧科学学院，北北方，北方，北部。深圳高级技术研究所，中国科学院，深圳518055，中国Pr中国e工程生物学主要实验室低碳工业研究所，工业生物技术学院，中国科学院，中国科学院DK2200哥本哈根，丹麦G Novo Novo Nordisk生物维护基金会，丹麦技术大学DK2800 Kongens Lyngby，丹麦
去甲肾上腺素对败血症的免疫和氧化代谢的影响
败血症是美国（美国）的主要健康问题，构成了重症患者死亡率的主要贡献者。尽管治疗进展，败血症的潜在病理生理仍然难以捉摸。活性氧（ROS）在抗菌宿主防御和炎症中具有重要作用，并且由于过度的炎症，其功能失调会导致不良适应反应。越来越多的证据证明了中枢神经系统与免疫系统响应感染。下丘脑 - 垂体和肾上腺轴以及交感神经系统是介导这种相互作用的两个主要途径。肾上腺素（EPI）和去甲肾上腺素（NE）分别是这些相互作用的效应子。刺激后，NE将从淋巴器官内局部的交感神经末端释放，并激活在免疫细胞上表达的肾上腺受体。同样，从肾上腺分泌的肾上腺素也被系统地释放出对免疫细胞的影响。但是，了解神经免疫的特定影响仍处于起步阶段。在这篇综述中，我们专注于交感神经系统，特别是神经递质去甲肾上腺素对免疫细胞的作用。去甲肾上腺素已被证明可以调节免疫细胞反应，从而导致抗炎性抗炎和钝性作用的钝化。此外，有证据表明，去甲肾上腺素参与调节免疫细胞中的氧化代谢。本综述试图总结去甲肾上腺素对感染的免疫细胞反应和氧化代谢的已知作用。
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肠道胆管癌中肠道菌群和代谢产物的特征及其对切除病变的预后价值
这项研究旨在研究肝外胆管癌（ECCA）患者的肠道菌群组成，粪便代谢产物和术后预后之间的关系。包括53例可切除的ECCA患者和21名健康志愿者作为对照组。16S rRNA基因测序和代谢组学分析揭示了肠道微生物群落结构的显着差异，并且改变了ECCA患者与健康对照组之间的粪便代谢物。单变量和多变量COX回归分析表明，术前胆红素，间接胆红素和特定代谢物等因素与ECCA后手术后患者的总体存活密切相关。构造的nom图模型进一步证明了这些因素的预测值，达到了0.718的C索引，校准曲线证实了其强大的预测性能。总而言之，肠道菌群组成和粪便代谢产物在ECCA患者的手术预后中起着至关重要的作用，为临床预后评估提供了新的见解。
口腔片片转换牙科科学 公式优化 研究方法的范式 jname Paper 用于管理上颌面筋膜空间感染 孟加拉国妊娠糖尿病的危险因素 蘑菇粉通过在高糖饮食喂养的小鼠中维持葡萄糖和脂质稳态来改善代谢综合症 圣罗勒（Ocimum Sanctum linnaeus）的影响... 大脑外侧心室的正角及其与年龄，性别和侧面的关系：孟加拉国流行中计算机断层扫描的形态计量学研究 在孟加拉国空军人员中筛查糖尿病前和II型糖尿病 如何引用本文：Altowairqi TK，Shafi Me。全世界和T 中的淡水鱼物种的生物多样性的全面评论
为口腔 - 芯片模型创建基本结构涉及设计一个微流体芯片，该微流体芯片复制必需的组件并创建模拟口腔复杂性的微环境。微流体芯片可以由各种材料制成，包括玻璃，硅和聚合物。微流体芯片的标准制造技术包括软光刻，光刻图和注射成型。这些方法可以在芯片上创建复杂的微观结构和通道。微流体芯片应复制口腔的关键成分，包括代表各种口腔组织的细胞培养室，例如上皮细胞，成纤维细胞和唾液腺细胞，这些细胞包含在细胞外基质中。细胞外基质可以结合水凝胶或其他材料，以提供结构支撑和细胞附着和生长的基板。结合灌注系统可模拟血液，使营养素，氧气和药物的递送2,3。
CRISPR技术在植物药有效成分次级代谢途径中的应用及发展
CRISPR/Cas9系统作为一种高效的基因编辑工具，被广泛应用于研究和调控药用植物有效成分的生物合成途径，在提高药用植物有效成分的产量和质量方面具有巨大的潜力。通过精准调控关键酶和转录因子的表达，CRISPR技术不仅加深了我们对药用植物次生代谢途径的认识，也为药物研发和中药现代化开辟了新的途径。本文首先介绍了CRISPR技术的原理及其在基因编辑中的应用，然后详细讨论了其在药用植物次生代谢中的应用，包括有效成分的组成和CRISPR策略在代谢途径中的实施，以及Cas9蛋白变体和先进的CRISPR系统在该领域的影响。此外，本文还展望了CRISPR技术对药用植物研发进程的长远影响，并提出了目前研究中存在的问题，包括脱靶效应、基因组结构复杂、转化效率低、对代谢途径了解不足等，同时提出了一些见解，以期为CRISPR在药用植物中的后续应用提供新思路。总之，CRISPR技术在药用植物次生代谢研究中具有广阔的应用前景，有望促进生物医药和农业科学的进一步发展。随着技术进步和挑战的逐步解决，CRISPR技术有望在药用植物有效成分研究中发挥越来越重要的作用。
肠道微生物组和代谢组，以发现强直性脊柱炎的致病细菌和益生菌
结果：使用宏基因组测序系统和填充微生物群落分类学组成，总共注释了7,703种，而使用代谢物促进液则鉴定了50,046个代谢物。AS和健康对照患者之间发现了差异微生物和代谢物。此外，TNFI得到了确认，以部分恢复肠道菌群和代谢产物。对菌群和代谢产物进行了多词分析，以确定差异微生物和代谢产物之间的关联，鉴定出与抑制病原菌细菌ruminococcoccus gnavus以及促进促进性细菌细菌的抑制相关的化合物，这些化合物（如羟硫素醇和生物素）相关。通过实验研究，进一步确定了微生物与代谢产物之间的关系，并且探索了这两种类型的微生物对肠上皮细胞的影响以及炎症性细胞因子介绍介物-18（IL-18）。
Pogostemon Cablin的综合代谢组和转录组分析为Pogostone的完整生物合成途径提供了新的灯光
pogostemon cablin（Patchouloi）是一种著名的多年生草本植物，用于中药，其主要的生物活性化合物是Patchouloulolol和Pogostone。Patchouli的生物合成途径已经很早就解决了，而Pogostone的生物合成途径由于缺乏直接合成Pogostone的末端酶而无法完全解决。在这里，本研究旨在通过综合转录组和代谢组分分析来预测Pogostone生物合成的末端酶，并重建其最可能的完整生物合成。广香叶的代谢组和转录组纤维与根和茎的叶子大致不同。广圆紫胶类似物（如广宁酸酯和叶氨基烯）主要积聚在叶片中，而pogostone含量的根部含量更高。基于对差异表达的基因和代谢产物的综合分析，我们重建了广丘洛尔的生物合成途径，并预测了pogostone的最可能完整的生物合成途径。此外，我们还鉴定了29个涉及广patlouli的新辛托比底基因组Pogostone生物合成的高表达基因，并且它们的大多数表达水平与Pogostone含量密切相关。尤其是Patcholi Bahd-DCR酰基转移酶（BAHD-DCR）在系统发育上远离但与其他已知的植物Bahd酰基转移酶相似，但结构上相似。他们中的大多数具有保守的催化基序HXXXD，催化中心可以与4-羟基-6-甲基-2-吡酮和4-甲基化甲基-COA和Pogostone的产物分子的广泛认识的底物分子结合。因此，建议广pation胶根中高表达的bahd-dcrs是直接合成pogostone的末端酶。这里的发现提供了更多支持的证据
代谢综合征和2型糖尿病
摘要代谢综合征是一个高度普遍的临床实体。最近的成人治疗面板（ATP III）指南已提出针对靶向代谢综合征的心血管危险因素作为一种降低风险疗法的方法的重要性。该综合征的主要因素是腹部肥胖症，动脉粥样硬化血脂异常，血压升高，胰岛素抵抗（有或没有葡萄糖不耐症），血栓形成和促炎状态。核过氧化物酶体增殖物活化受体（PPAR）停用后的胰岛素抵抗（主要是与肥胖相关）是代谢综合征起始的关键阶段。之后，有2种代谢综合征发展的主要途径：1）具有保留的胰腺β细胞的功能和胰岛素超分泌，可以补偿胰岛素抵抗。该途径主要导致代谢综合征的大型并发症。 2）由于胰腺β细胞的巨大损害导致胰岛素分泌和高血糖的逐渐减少（例如公开2型糖尿病）。该途径导致微血管和大血管并发症。我们建议，基于PPAR的代谢综合征和2型糖尿病的评估可以提高我们对这些疾病的理解，并为他们的治疗中的全面方法树立基础。