*国家校正系数适用于生活津贴,以确保所有研究人员的平等待遇和购买权力平等**家庭津贴为可以在项目期间授予的家庭义务的研究人员的出行相关费用做出贡献。
AU:请确认所有标题级别均正确显示:生物体已经进化出一系列组成性(始终活跃)和可诱导性(由寄生虫引起)防御机制,但我们对这些正交防御策略进化的驱动因素的理解有限。细菌及其噬菌体提供了一个易于研究的系统:细菌可以通过噬菌体受体突变(表面突变,sm)或通过其 CRISPR-Cas 适应性免疫系统诱导抗性来获得组成性抗性。通过理论与实验相结合,我们证明了首先建立的机制具有很强的优势,因为它削弱了对替代抗性机制的选择。因此,改变获得不同抗性的相对频率的生态因素具有强烈而持久的影响:高生长条件通过增加流行病早期受体突变事件的涌入来促进 sm 抗性的进化,而流行病这一阶段的高感染风险促进了 CRISPR 免疫的进化,因为它促进了(感染依赖性)CRISPR 免疫的获得。这项工作强调了流行病早期瞬态进化动态对组成性和诱导性防御的长期进化的强烈而持久的影响,这可用于在临床和应用环境中操纵噬菌体抗性的进化。
病毒是地球上最丰富的生物学实体(Breitbart和Rohwer,2005年)。噬菌体或噬菌体,特别是感染了脑原生物的微生物。这些噬菌体通过裂解循环复制,裂解循环是典型的有毒噬菌体的,或以预言整合到宿主基因组中,或者在宿主细胞质中复制为质粒(Piligrigimova等,2021)。综合噬菌体基因组(预言)与宿主染色体一起复制,并通过细胞分裂从初始感染细胞转移到其后代(Maurice等,2013)。整合到细菌染色体中可以改变宿主表型,并将新基因和功能引入细菌代谢库中(Ramisetty和Sudhakari,2019年)。预言编码负责抗生素耐药性和/或毒力因子的基因(Costa等,2018; Kondo等,2021;López-Leal等,2020;Piña-González等,2024,2024),为其细菌宿主提供适应性益处(Li et al。
反发是细菌免疫系统,可通过杀死受感染的宿主来保护细菌种群免受噬菌体的影响。反击通常包含逆转录酶,一个非编码RNA的模板,该模板被部分转录为RT-DNA和毒性效应子。逆转录酶,非编码RNA和RT-DNA复合物隔离了毒性效应子,直到被噬菌体感染触发为止,此时,毒素被释放出来诱导细胞死亡。由于它们在体内产生单链DNA的能力,还设计了回试以在原核生物和真核生物中生产用于基因组编辑的供体模板。然而,当前的实验表征反元的曲目受到限制,大多数回试来自细菌的临床和实验室菌株。为了更好地了解反逆转录生物学和自然多样性,并扩大了基于反逆转录基因组编辑器的当前工具箱,我们开发了一条管道来分离反替补箱及其细菌宿主与各种环境样品的分离。在这里,我们介绍了这些新颖的反词中的六个,每一个都从不同的宿主细菌中分离出来。我们表征了这些重试的完整操纵子,并测试了它们防御大肠杆菌噬菌体小组的能力。对于其中两个重演,我们通过识别负责触发流产感染的噬菌体基因来进一步揭示其防御机理。最后,我们在大肠杆菌中对这些基因组编辑进行了设计,证明了它们在生物技术应用中的潜在用途。
。CC-BY 4.0国际许可证。根据作者/资助者,它是根据预印本提供的(未经同行评审的认证),他已授予Biorxiv的许可证,以在2025年1月16日发布的此版本中在版权所有者中显示预印本。 https://doi.org/10.1101/2025.01.16.633327 doi:Biorxiv Preprint
多药耐药细菌对公共卫生构成了重要的全球威胁,尤其是在严重的医院感染患者中。值得注意的是,由于它们与人类感染和抗生素耐药基因的转移,克雷伯氏菌和拉乌尔特省属引起了人们的关注。噬菌体疗法最近引起了人们的注意,作为治疗这些感染的一种新方法。但是,这种方法的效率依赖于具有广泛宿主范围的噬菌体。在这项研究中,使用肺炎克雷伯氏菌作为宿主,从河水样品中分离出具有较宽宿主范围的噬菌体K14-2。噬菌体的生物学特性的特征是评估其感染的多样性,杀死曲线,一步生长曲线以及跨不同pH水平和温度的稳定性。形态学分析表明,噬菌体非常类似于肌瘤病毒。宿主范围包括来自克雷伯氏菌,拉乌尔特氏菌和埃希里希氏菌的6种菌株。发现K14-2的基因组是双链DNA,包括175,759个碱基对,GC含量为41.8%。基因组注释揭示了280个蛋白质编码基因,其中96个分配了功能。与K14-2具有最高基因组相似性的噬菌体为vb_kpm-牛奶。基于主要衣壳蛋白建造的系统发育树发现噬菌体属于Straboviridae家族的Slopekvirus属。鉴于这些特征,新型噬菌体K14-2的发现具有广泛的宿主范围,具有增强噬菌体疗法在未来研究中的有效性的潜力。
咖啡休息14:25-15:00 15:00 - 16:30 3:噬菌体申请由AlešPodgornik主持,15:00-15:20 Katja Molan:使用噬菌体的抗菌表面:使用新的卫生科学学院证明了Novo MeSto Dep的健康科学。卢布尔雅那大学金属金属学院生物技术学院卢布尔雅那大学生物技术教师15:20-15:40AndrejCör:使用工程性噬菌体疫苗使用工程性噬菌体疫苗的黑色素疗法valdoltra obthopedic Hospital 15:40-16:40-16:00-40-16:00-16:00-tomage for tomage for tomage for tomage for tomage for tomage for tomage for tomage,商业规模的研发Jafral 16:00-16:20 Martina Durcik:从噬菌体隔离和体内测试到特殊临床需求中患者的噬菌体疗法Cobik 16:20-16:25 Flash Talk Talk
分枝杆菌噬菌体是专门感染分枝杆菌属细菌的病毒。目前已分离并鉴定了大量的分枝杆菌噬菌体,为了解其多样性和进化提供了宝贵的见解。这些噬菌体在治疗应用方面也具有巨大的潜力,特别是作为抗生素的替代品来对抗耐药性细菌菌株。在本研究中,我们报告了一种新的分枝杆菌噬菌体 Vic9 的分离和鉴定,该噬菌体使用结核分枝杆菌 mc (2)155 作为宿主菌株。Vic9 被归类为 B 簇的 B2 亚簇。形态学分析显示,Vic9 具有该亚簇的典型噬菌体结构,并形成特征性斑块。噬菌体在 30 分钟内吸附到宿主菌株细胞上,根据一步生长实验,其潜伏期持续约 90 分钟,随后是 150 分钟的生长期,平均产量约为每个受感染细胞 68 个噬菌体颗粒。在宿主范围实验中,Vic9 能有效裂解宿主菌株,并且还表现出裂解结核分枝杆菌 H37Rv 的能力,尽管接种效率较低(EOP ≈ 2 × 10 − 5),这是 B2 噬菌体的典型特征。在其他测试的分枝杆菌种中未观察到裂解。Vic9 的基因组包含 67,543 bp 的双链 DNA 并编码 89 个开放阅读框。尽管 Vic9 与其他 B2 亚簇噬菌体关系密切,但我们的分析揭示了 Vic9 的独特特征,即使在密切相关的噬菌体中也突显了其独特的特性。特别值得注意的是在负责 queuosine 生物合成的基因簇内发现了一个独特的 435 bp 序列,以及在 B1、B2 和 B3 亚簇成员之间的结构盒区(Vic_0033-Vic_0035)内发现了重组事件。这些遗传特征值得进一步研究,因为它们可能揭示噬菌体-细菌相互作用的新机制及其开发新型噬菌体治疗方法的潜力。
噬菌体通常被简单地称为噬菌体,是专门针对和感染细菌的病毒。这些微观实体是地球上最丰富的生物,在任何给定的环境中,人数超过10至1的细菌。尽管尺寸很小,但噬菌体对自然世界有重大影响,并且越来越多地探索其在医学,农业和生物技术方面的潜力。它们由包围其遗传物质的蛋白质外套组成。噬菌体的结构可以很大变化,有些具有简单的球形形状,而另一些则具有复杂的,尾巴状的结构,可促进它们对细菌细胞的附着。
摘要 Öz 目的:近年来,许多重要细菌群落对抗生素的耐药性不断增加,导致人们对噬菌体分离和表征以及噬菌体不断扩大的临床潜力的文献兴趣日益浓厚。考虑到抗菌素耐药性特征,分离用于治疗鲍曼不动杆菌感染的噬菌体、确定其作用谱并进行表征非常重要。本研究旨在从环境水源中分离针对目标微生物鲍曼不动杆菌的特异性噬菌体。材料和方法:研究了 16 种不同的环境水样作为噬菌体的潜在来源。以具有多重耐药性的鲍曼不动杆菌临床分离株作为宿主细菌。使用单噬斑分离法分离针对目标细菌的特异性噬菌体。在体外研究期间,使用双琼脂法增加分离噬菌体的滴度,并评估其噬斑形态和宿主特异性。结果:噬菌体 vB_KlAcineto13 仅对目标细菌表现出溶解活性,不会感染其他细菌分离株。结论:根据本研究的结果,可以得出结论,噬菌体 vB_KlAcineto13 的宿主范围较窄,不会感染宿主细菌以外的其他测试细菌。然而,特性研究可能会提供有关噬菌体的更多详细信息。