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World File Search System噬菌体
时间表观基因组调节可实现有效的噬菌体工程和噬菌体 DNA 修饰的功能分析
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证永久有效。它是在预印本（未经同行评审认证）下提供的，作者/资助者已授予 bioRxiv 许可，可以在该版本中显示预印本。版权持有者于 2024 年 1 月 28 日发布了此版本。；https://doi.org/10.1101/2024.01.28.577628 doi：bioRxiv 预印本
噬菌体的供应，存储，繁殖和净化
噬菌体悬浮液：如果排序噬菌体的“活跃培养”，或者仅以这种形式可用，我们的噬菌体作为宿主生长培养基中无细菌裂解物的1 ml部分进行。细菌细胞和碎屑通过离心和随后的过滤在单速用乙酸纤维素注射器过滤器（0.2或0.45 µm孔径）中消除。所有噬菌体库存都经过滴度和斑块形态/斑块纯度的测试。向我们的客户交付的噬菌体悬挂是可以使用的，可以在收件人的实验室中传播，通常效率在1 x 10 8-1 x 10 11 11 pfu/ml（pfu = p laque f laque forming units）。我们实验室对一些更困难的噬菌体商定的最低允许的滴度限制为10 6 pfu/ml。我们不提供噬菌体滴度数据，因为在我们的实验室的测试间隔期间滴度可能会下降。噬菌体应在收到后立即冷却和黑暗。不要在不添加冷冻保护剂的情况下冷冻噬菌体悬浮液。当存储冷却时，大多数噬菌体将保持活跃，而几个月内没有明显的活动损失。但是，DSMZ不能保证在较长的存储期内噬菌体生存，请参阅我们的主页信息。如果添加了冷冻保护剂，例如，无菌甘油的10％（v/v），最终浓度，可以将噬菌体裂解物存储为长期目的。
在癌症治疗中使用噬菌体
摘要癌症是一种灾难性疾病，全球死亡率显着，预计将在未来几年上升。当代治疗方式，包括化学疗法和放射疗法，包括不良反应，效力不一致，费用升高和限制可及性等限制。噬菌体已成为生物工程中的多方面仪器，在组织工程，疫苗配方和免疫疗法方面具有很大的希望。噬菌体广泛用于生物技术和医学领域，癌症治疗是最引人注目的应用。许多研究逐渐证实了基于噬菌体的载体作为癌症治疗中药用基因和药物的广泛递送机制的功效和功效。此外，噬菌体的遗传构成可以用于新型DNA疫苗和抗原表现系统的开发，因为它们提供了对免疫细胞的高度组织和重复的表现。噬菌体为癌细胞中特定分子标记的精确靶向带来了新的可能性。噬菌体可能充当抗癌药物，也可以充当成像剂和药物的车辆。本文介绍了噬菌体并分析了噬菌体和噬菌体工程在特定癌症治疗中的功效。
噬菌体lambda -dna-未消除
从受感染的大肠杆菌菌株W3350中分离出双链DNA（CL857 IND1 SAM7）分离出双链DNA。分子量为31.5 x 10e6 daltons，长度为48,502个碱基对。通过凝胶过滤从热诱导的溶菌原大肠杆菌CL857 S7中分离出噬菌体。通过苯酚/氯仿提取从纯化的噬菌体中分离出DNA，并透析透析于10mm Tris-HCl（pH7.4）和1mm EDTA。
噬菌体作为癌症治疗和诊断载体
摘要：纳米医学的发展是对合成和生物载体的重新设计，以实现新的治疗诊断平台。近年来，噬菌体研究有利于这一过程，这为药物和基因传递研究开辟了新道路。通过噬菌体展示技术将抗体、肽或蛋白质展示在不同噬菌体的表面，现在可以揭示癌细胞和肿瘤相关微环境分子的特定分子决定因素。下游应用多种多样，肽大多数时候用于功能化药物载体并提高其治疗指数。在这种情况下，噬菌体本身被证明是成像分子和治疗剂的良好载体。此外，操纵它们的遗传物质以稳定地在癌细胞内运送自杀基因极大地改变了基因治疗的观点。在这篇综述中，我们提供了如何将顺从的噬菌体用作抗癌剂的例子，特别是因为它们可以全身给药。我们还提供了一些关于如何在免疫肿瘤学中调节和利用它们的免疫原性特征来生产疫苗的见解。
综合生物学对工程师噬菌体基因组
报道的用于噬菌体基因组遗传操纵的第一个策略之一是噬菌体重新组合电子的DNA（繁殖，图，图，图。1）。该技术最初是为了产生裂解分枝杆菌噬菌体中的点突变，插入，缺失和基因替代的创建[13，14]。在繁殖方法中，噬菌体DNA和感兴趣的DNA（靶取代，缺失或插入）同时通过电穿孔到配备了重组系统（通常是λ红或RAC系统）的细菌细胞中引入，从而增强了同源性重组的频率[13]。也已用于遗传工程大肠菌噬菌体[15，16]，并且有人建议通过对方案进行了略微修改并适当的重新调节系统，该方法可以应用于许多其他针对不同细菌种类物种的其他细菌。与育种相关的主要问题之一是筛选突变噬菌体。但是，可以使用反选择技术来进一步改善突变噬菌体的选择。近年来，为此目的开发了多种基于CRISPR的方法，其中野生型噬菌体是由程序化的CRISPR-CAS系统瞄准的。DNA和RNA靶向CRISPR-CAS系统均已成功使用[17-23]。
通过微透析和体内噬菌体显示
体内噬菌体显示是一种用于识别有机或疾病的血管归巢肽的方法，用于靶向药物。对于目标分子的性质和身份而言，这是不可知论的。当前的体内生物植物缺乏内置机制，无法选择能够进行血管归巢的肽，这也将能够组织渗透到组织实质中的治疗相关细胞。在这里，我们将体内噬菌体显示与基于微透析的实质恢复和高通量测序相结合，以选择除血管归巢外，还可以促进渗出和组织穿透。我们首先在皮肤伤口中证明了该方法可以选择性地将已知的归巢肽与具有额外组织渗透能力的肽分开。筛查肽库中的肽鉴定在血管性和糖尿病伤口中的血管外肉芽组织中鉴定出肽，以及视网膜病中的视网膜屏障 - 视网膜屏障。我们的工作表明，体内噬菌体显示与微透析结合使用，可用于发现能够渗出和组织渗透的血管归巢肽的发现。
噬菌体疗法：从生物机制到未来……
作者 SA Strathdee · 2023 年 · 被引用 308 — 23 这些动态强烈影响了微生物的进化，细菌中存在多种病毒防御系统（例如限制修饰 [RM] 和。
RNA和单链DNA噬菌体
书籍章节平均和时间分辨率对混合光伏电池系统的能量，经济和技术问题的影响和影响的影响和影响波兰弗罗茨瓦夫科学技术大学 *通讯作者：意大利87036 Rende的独立研究员亚历山德罗·伯吉奥（Alessandro Burgio）出版于2021年12月8日，本书章节是一份重新出版的Alessandro Burgio等文章。在2020年1月的能量。（Burgio，A。; Menniti，d。; Sorrentino，n。; Pinnarelli，a。; Leonowicz，Z。数据平均和时间分辨率对混合光伏电池系统的能量，经济和技术问题评估的影响和影响。Energies 2020，13，354。https：//doi.org/10.3390/en13020354）如何引用本书章节：Alessandro Burgio，Daniele Menniti，Nicola Sorrentino，Nicola Sorrentino，Anna Pinnarelli，Anna Pinnarelli，Zbigniew Leonowowicz。数据平均和时间分辨率对混合光伏电池系统的能量，经济和技术问题评估的影响和影响。in：编辑玛丽亚·波特拉皮略（Maria Portarapillo）和艾哈迈德·卡纳马（Ahmad Karnama）。能源研究的进步：第3版。印度海得拉巴：录像。2021。
一种用于生成噬菌体基因组
3。ji，Y.，Zhou，Z.，Liu，H。＆Davuluri，R。V. Dnabert：预先训练的双向编码器119来自Transformers模型的DNA语言中DNA语言的表示。生物信息学37，120 2112–2120（2021）。121