Thanh Do,分析化学 驯服离子赛道上的构象异质性 大约 85% 的人类蛋白质组无法通过传统的小分子进行治疗。潜在的药物必须足够大且足够灵活,才能与大的凹槽状结合位点结合,或结合在两种蛋白质的界面上。环孢菌素是一类 N-甲基化的大环肽,它挑战了基于结构药物设计的传统观点。尽管环孢菌素 A (CycA) 自 1983 年以来彻底改变了器官移植领域,但针对不同靶点设计类似药物的尝试均未成功,这表明在 N-甲基化的作用和构象异质性在环孢菌素化学中的功能方面存在知识差距。环孢菌素由于 N-甲基化而具有灵活性,每次顺式/反式酰胺异构化都会改变分子的构象和物理化学性质。 CycA 可以与多个靶标(目前已知两个)结合,结合状态不同,这表明结合状态取决于靶标。先前的研究表明,结合状态(与已知靶标)在溶液中以次要构象异构体的形式存在。这表明环孢菌素可能通过反向诱导契合模型与其靶标结合,其中配体改变其构象以适应结合位点。因此,环孢菌素可以结合的靶标数量可能与其可以采用的可能构象异构体数量成正比。因此,为了充分了解环孢菌素的生化特性,我的实验室致力于准确探测 CycA 和 CycA 类似物的主要和次要构象异构体,使用多种技术,包括实验(X 射线/中子晶体学、离子迁移质谱、2D-NMR、离子光谱)和计算方法。我们发现了一个由二价离子调节的复杂构象网络和动力学。
近年来,随着美国食品药品监督管理局 (FDA) 于 2014 年批准 alvocidib 用于治疗急性髓性白血病,黄酮类化合物作为抗癌药物的研究出现了一个新的研究方向 (3-6)。黄酮类化合物广泛存在于植物界,流行病学研究表明,膳食黄酮类化合物对癌症具有化学预防作用 (7-9)。多甲氧基黄酮 (PMF) 是被两个或多个甲氧基取代的黄酮类化合物。对各种药用植物和柑橘的研究表明,PMF 的结构变化很大,例如较小的甲氧基黄酮和结构异构体。结构异构体包括 5,6,7,4'-四甲氧基黄酮、橘皮素、3,5,6,7,3',4'-六甲氧基黄酮、川陈皮素、3,5,6,7,8,3',4'-庚甲氧基黄酮和金圣草素。虽然一些研究表明,黄酮类化合物的组成和结构对抗肿瘤能力有重大影响,但很少有研究
此技术说明证明了Zenotof 7600混合时间质谱(TOFMS)系统的功能和能力,以灵敏地检测,量化和结构表征生物标本的胆汁酸含量。通过名义质量仪器(例如三肢(TQMS)系统)对胆汁酸的分析,因为在几种前体离子与基于前体的多反应监测(MRM)过渡中发现的高化学背景(MRM)在当前的现状ART分析(1-4)中都具有挑战性。高分辨率质谱(HRMS)为每个靶向胆汁酸生成完整的产物离子光谱,并用狭窄的质量到电荷(M/z)窗口提取片段离子可以减少背景化学干扰,并改善该测定的信噪比(S/N)。当前的单个胆汁酸异构体的检测取决于色谱分辨率;碰撞诱导的解离(CID)基于碎片无法区分这些异构体代谢物。电子激活解离(EAD; 5-7)是
RNA 剪接失调是几乎所有肿瘤类型的分子特征。癌症相关的剪接变异既来自复发性突变,也来自控制剪接催化和调节的反式因子表达改变。癌症相关的剪接失调可通过多种机制促进肿瘤发生,导致细胞增殖增加、凋亡减少、迁移和转移潜能增强、化疗耐药和逃避免疫监视。最近的研究已经确定了在癌细胞转化和生长中发挥关键作用的特定癌症相关异构体,并证明了纠正或以其他方式拮抗此类癌症相关 mRNA 异构体的治疗益处。调节或抑制 RNA 剪接的临床级小分子同样已被开发为有前途的抗癌疗法。在这里,我们回顾了癌细胞转录组特有的剪接变异、失调剪接对肿瘤发生和进展的贡献,以及针对剪接进行癌症治疗的现有和新兴方法。最后,我们讨论了将这些发现转化为临床应用必须解决的悬而未决的问题和挑战。
照片开关是在光线激发后在异构体之间可逆的分子。自然存在的光异构分子的关键例子是视网膜,它经历了吸收光子的z / e同组化,该光子启动了负责视觉的细胞信号传导级联。1 During the last century, chemists have designed a myriad of arti cial photoswitch structures: azobenzenes, 2 (sti ff -)stilbenes, 3 indi- goids, 4 diarylethenes, 5 norbornadienes/quadricyclanes, 6 spi- ropyrans/merocyanines, 7 and donor – acceptor Stenhouse adducts (DASAs), 8 to name一些(图1a)。同组化时开关变化的理化特性,并引起光反应函数。例如,可以利用Azobenzenes,Stilbenes和Indigoid的E - Z异构体来控制分子系统的超分子相互作用或将菌株诱导到宏观材料中。另一方面,日钟甲烯和螺旋形的电循环分别改变了这些分子的结合和偶极矩。这些现象可以在医学分子或宏观水平上运行的光响应系统中被利用,9个生物科学,10,11催化,12
手性分子的准确检测,分类和分离是推进药物和生物分子创新的关键。设计的手性光提出了一种有希望的途径,以增强光与物质之间的相互作用,从而提供一种无创,高分辨率和具有成本效益的方法来区分对映异构体。在这里,我们提出了一个基于ACHIRAL等离子体系统的纳米结构平台,用于表面增强红外吸收吸收诱导的Vi-Brational圆形二色性(VCD)。该平台可以对对映体混合物的精确度量,分化和量化,包括浓度和对映体的多余确定。与常规的VCD光谱技术相比,我们的手性对映异构体的检测灵敏度高13个数量级的检测敏感性,这是相应的路径长度和浓度。该刺激性等离子体系统的可调光谱特性促进了多种手性化合物的检测。平台的简单性,可调节性和出色的灵敏度具有在药物设计,药物和生物应用中分类的巨大潜力。
摘要麻黄是麻黄科家族的属,在温带地区,例如中亚和欧洲。在各种麻黄种中,莫黄(Ephedra Herb)源自Ephedra Sinica Stapf的空中部分,Ephedra Equisetina Bunge和Ephedra Intermedia Schrenk&C.A.Mey。 Ma Huang contains various ephedra alkaloids, including ( )-ephedrine, (+)-pseudoephedrine, ( )-norephedrine, (+)- norpseudoephedrine, ( )-methylephedrine, and (+)-methylpseudoephedrine, which are found naturally as single enantiomers, although they can be prepared作为种族。 尽管在韩国禁止在食品中使用ma huang,但可以进口含有马黄的产品,因此有必要开发合适的分析技术来检测食品中的ma huang。 在此,我们报告了用于检测包含马黄产品的麻黄碱的分析方法的开发。 通过固相提取样品纯化后,使用超表现液相色谱 - 三极杆质谱法(UPLC-MS/MS)进行定量分析。 此外,使用HPLC-DAD成功分离了对映异构体。 我们成功地分析了各种食物样本,在这些食物样本中,在促定性和定量上确定了麻黄碱,并分离了对映异构体。 预计这些方法可能有助于防止含有Ma Huang的非法产品的分布。 关键字ma huang,ephedra生物碱,uplc-ms/ms,hplc-dad,对映体分离Mey。Ma Huang contains various ephedra alkaloids, including ( )-ephedrine, (+)-pseudoephedrine, ( )-norephedrine, (+)- norpseudoephedrine, ( )-methylephedrine, and (+)-methylpseudoephedrine, which are found naturally as single enantiomers, although they can be prepared作为种族。尽管在韩国禁止在食品中使用ma huang,但可以进口含有马黄的产品,因此有必要开发合适的分析技术来检测食品中的ma huang。在此,我们报告了用于检测包含马黄产品的麻黄碱的分析方法的开发。通过固相提取样品纯化后,使用超表现液相色谱 - 三极杆质谱法(UPLC-MS/MS)进行定量分析。此外,使用HPLC-DAD成功分离了对映异构体。我们成功地分析了各种食物样本,在这些食物样本中,在促定性和定量上确定了麻黄碱,并分离了对映异构体。预计这些方法可能有助于防止含有Ma Huang的非法产品的分布。关键字ma huang,ephedra生物碱,uplc-ms/ms,hplc-dad,对映体分离
摘要 DNA 拓扑异构酶 II α (170 kDa, TOP2 α /170) 诱导增殖细胞中瞬时 DNA 双链断裂,以解决染色体凝聚、复制和分离过程中的 DNA 拓扑纠缠。因此,TOP2 α /170 是抗癌药物的主要靶点,其临床疗效常常因化学耐药性而受到影响。尽管已经确定了许多耐药机制,但人类癌细胞系对 TOP2 α 界面抑制剂/毒药的获得性耐药通常与 Top2 α /170 表达水平的降低有关。我们实验室最近的研究,结合其他研究人员的早期发现,支持以下假设:对 TOP2 α 靶向药物的获得性耐药的主要机制是由于替代的 RNA 加工/剪接。具体而言,已报道了几种 TOP2 α mRNA 剪接变体,它们保留了内含子,并被翻译成缺乏核定位序列的截短 TOP2 α 异构体,随后导致核质分布失调。此外,内含子保留可能导致截短异构体缺乏核定位序列和活性位点酪氨酸 (Tyr805),而活性位点酪氨酸是形成酶-DNA 共价复合物所必需的,并且在存在 TOP2 α 靶向药物的情况下诱导 DNA 损伤。最终,这些截短的 TOP2 α 异构体导致药物对细胞核中的 TOP2 α 的活性降低并表现出耐药性。因此,对调节 TOP2 α 前 mRNA 的替代 RNA 加工的机制的完整表征可能会产生新的策略来规避获得性耐药性。此外,新型 TOP2 α 剪接变体和截短的 TOP2 α 同工型可用作药物耐药性、预后和/或直接未来 TOP2 α 靶向治疗的生物标志物。
照片开关是在光线激发后在异构体之间可逆的分子。自然存在的光异构分子的关键例子是视网膜,它经历了吸收光子的z / e同组化,该光子启动了负责视觉的细胞信号传导级联。1 During the last century, chemists have designed a myriad of arti cial photoswitch structures: azobenzenes, 2 (sti ff -)stilbenes, 3 indi- goids, 4 diarylethenes, 5 norbornadienes/quadricyclanes, 6 spi- ropyrans/merocyanines, 7 and donor – acceptor Stenhouse adducts (DASAs), 8 to name一些(图1a)。同组化时开关变化的理化特性,并引起光反应函数。例如,可以利用Azobenzenes,Stilbenes和Indigoid的E - Z异构体来控制分子系统的超分子相互作用或将菌株诱导到宏观材料中。另一方面,日钟甲烯和螺旋形的电循环分别改变了这些分子的结合和偶极矩。这些现象可以在医学分子或宏观水平上运行的光响应系统中被利用,9个生物科学,10,11催化,12
摘要:通常认为开放壳分子石墨烯片段的反应被认为是不希望的分解过程,因为它们导致诸如π-磁性等所需特征的丧失。氧化二聚二聚体表明,这些转化是通过在单个步骤中形成多个键和环制造复杂结构的合成结构的希望。在这里,我们探讨了使用Phena-lenyyl的这种“不希望”反应来构建应变并提供非平面多环芳烃的可行性。为此,我们设计并合成了一个双烯基单元通过双苯基骨架链接的Biradical系统。设计促进了分子内级联反应对螺旋扭曲的鞍形产物,其中一个反应中的关键转换(环锁和环形融合)在一个反应中。通过单晶X射线衍射分析证实了最终的绿吡就产物的负曲率,该植物诱导的曲率通过分辨率通过分辨率的映异构体验证,该螺旋扭转验证了螺旋扭曲,这些向映异构体显示圆形极化的发光和高构型稳定性。