XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System异构
通过异构 OATP 预测 OATP1B1 抑制剂...
会损害另一种药物的吸收，从而导致可能致命的药理作用。由于有关 OATP 抑制机制的信息有限，并且不同研究中的实验性 OATP 抑制数据不一致，因此预测 OATP 介导的 DDI 具有挑战性。本研究引入了异构 OATP-配体相互作用图神经网络 (HOLIgraph)，这是一种新颖的计算模型，它将分子建模与图神经网络相结合，以增强对药物诱导的 OATP 抑制的预测。通过将配体（即药物）分子特征与来自严格对接模拟的蛋白质-配体相互作用数据相结合，HOLIgraph 的表现优于仅依赖配体分子特征的传统 DDI 预测模型。HOLIgraph 在预测 OATP1B1 抑制剂时实现了超过 90% 的中位平衡准确度，明显优于纯基于配体的模型。除了改善抑制预测之外，用于训练 HOLIgraph 的数据还可以表征参与抑制药物-OATP 相互作用的蛋白质残基。我们确定了某些优先与抑制剂相互作用的 OATP1B1 残基，包括 I46 和 K49。我们预计此类相互作用信息将对未来对 OATP1B1 的结构和机制研究很有价值。科学贡献。HOLIgraph 通过将对接模拟得出的蛋白质-配体相互作用纳入图神经网络框架，为 DDI 预测引入了一种新范式。这种方法得益于 OATP1B1 的最新结构突破，与仅依赖配体特征的传统模型有很大不同。通过实现高预测准确性和揭示机制见解，HOLIgraph 为药物设计和 DDI 预测中的计算工具设定了新的轨迹。
Tongsheng Geng、Marcos Amaris、Stéphane Zuckerman、Alfredo Goldman、Guang Gao 等人。一种基于配置文件的人工智能辅助异构架构动态调度方法。国际并行编程杂志，2022 年，50 (1)，第 115-151 页。 10.1007/s10766-021-00721-2。hal-03606185
虽然异构架构在高性能计算系统中越来越受欢迎，但其有效性取决于调度程序将工作负载分配到合适的计算设备上的效率，以及通信和计算如何重叠。随着不同类型的资源集成到一个系统中，调度程序的复杂性也相应增加。此外，对于在不同异构资源上具有不同问题规模的应用程序，最佳调度方法可能会有所不同。因此，我们引入了一种基于配置文件的人工智能辅助动态调度方法，以动态和自适应地调整工作负载并有效利用异构资源。它结合在线调度、应用程序配置文件信息、硬件数学建模和离线机器学习估计模型，实现异构架构的自动应用设备特定调度。硬件数学模型提供粗粒度计算资源选择，而配置文件信息和离线机器学习模型估计细粒度工作负载的性能，在线调度方法动态自适应地分配工作负载。我们的调度方法在事件驱动的运行时系统中对控制规则应用程序、2D 和 3D Stencil 内核（基于 Jacobi 算法）和数据不规则应用程序稀疏矩阵向量乘法 (SpMV) 进行了测试。实验结果表明，PDAWL 的表现与产生最佳结果的 CPU 或 GPU 相当或远远优于后者。关键词：异构多核计算、工作负载平衡、自适应建模、机器学习辅助调度、并行计算
单分子 DNA 压缩中凝聚素 I 和拓扑异构酶 IIα 之间的功能相互作用
topo II WT 、topo II CTD 在染色体组装过程中无法检测到。这些观察结果被解释为 CTD 施加的长停留时间有助于 topo IIα 催化连锁 8,37 和重组试验中的染色单体内缠结 8 。我们推测，对于本研究报告的 topo IIα 刺激的团块形成和 DNA 打结也是如此。尽管直接证据
落叶橡木的异构，生物量和生产力...
Orest生态系统在全球范围内因其在陆地碳动态中的关键作用而闻名，为人类提供了宝贵的服务，并充当了重要的碳汇（Bonan，2008; Pan等，2011）。自工业革命开始以来，急剧的气候变化主要归因于人类活动升级温室气体排放，尤其是二氧化碳（CO 2），甲烷（CH 4）和一氧化二氮（N 2 O）。在其中，CO 2是主要的贡献者，其大气浓度自从工业前时代以来显着增加（Forster等，2007）。根据国家海洋和大气管理局（NOAA）的最新数据，CO 2级别达到了前所未有的高点，越过百万分之421份（PPM），表明迫切需要了解和增强碳固执过程（NOAA，2022）。
有毒表皮坏死>的狗中的局部异构外泌体治疗
本报告描述了狗在狗中对有毒表皮坏死（十）的局部外泌体治疗的积极结果。在尿道病手术后的第二天和7天，皮下施用了霉素。停止治疗后的十四天，将狗送到诊所，以在背侧区域散布浅表组织丧失，这与不良药物反应有关，基于评估表皮坏死的药物因果关系的评估。牛衍生的脐带血外泌体以100万千克的剂量每天两次施用，并在伤口周围的多个点进行皮内和喷雾路线。每周监测狗，并在治疗后58天观察到完全恢复。本报告表明，局部异构外泌体可能是狗伤口愈合的另一种治疗方法。
层流反应器中二丁醚异构体氧化的化学动力学研究
摘要：利用活塞流反应器，实验研究了三种对称柴油沸程醚异构体的燃烧动力学。这些异构体分别是二正丁基醚 (DNBE)、二异丁基醚 (DIBE) 和二仲丁基醚 (DSBE)。流动反应器实验采用氧气作为氧化剂，氦气作为稀释剂，氧化在大气压和高压条件下进行，温度从 400 到 1000，间隔为 20 K。燃料、氧化剂和稀释剂的流速在不同温度下变化，以在化学计量条件下保持恒定的初始燃料摩尔分数 1000 ppm，停留时间为 2 秒。反应产物用气相色谱 (GC) 分析。根据结构，醚表现出不同程度的负温度系数 (NTC) 行为。然后将 GC 分析的形态结果与使用现有和新开发的化学动力学模型的模拟结果进行比较。大多数模拟产物浓度与实验数据具有合理的一致性。化学动力学模型用于阐明不同异构体的反应性和 NTC 行为的主要特征。化学动力学分析表明，三种异构体的燃烧行为受低温反应过程中形成的关键物种的影响。在常压下，DNBE、DIBE 和 DSBE 确定的关键物种分别是正丁醛、异丁醛和仲丁醇。
吉泊汀和佐利氟达星如何稳定与细菌IIA型拓扑异构酶的DNA裂解复合物？1.金属结合位点的实验定义
摘要：21 世纪实验结构生物学面临的挑战之一是观察化学反应的发生。金黄色葡萄球菌 (S. aureus) DNA 旋转酶是一种 IIA 型拓扑异构酶，可产生暂时的双链 DNA 断裂来调节 DNA 拓扑结构。吉泊汀、佐利氟达星和喹诺酮类莫西沙星等药物可以稳定这些通常短暂的 DNA 链断裂并杀死细菌。在相同的 P6 1 空间群 (a = b ≈ 93 Å，c ≈ 412 Å) 中，已解析出含有吉泊汀前体 (2.1 Å GSK2999423) 或双裂 DNA 和佐利氟达星 (或其前体 QPT-1) 的未裂解 DNA 的晶体结构。这表明可能可以观察到该 P6 1 空间群中的两个 DNA 切割步骤（和两个 DNA 连接步骤）。这里，解决了这种晶体形式的 2.58 Å 异常锰数据集，并重新细化了这种晶体形式的四个先前的晶体结构（1.98 Å、2.1 Å、2.5 Å 和 2.65 Å）以阐明晶体接触。这些结构清楚地表明了单一移动金属机制——在附带的（第二篇）论文中提出。先前发表的酵母拓扑异构酶 II 的 2.98 Å 结构，它在晶体二重轴周围具有静态无序，被发表为在一个活性位点包含两种金属。这个 2.98 Å 酵母结构的重新细化坐标与其他 IIA 型拓扑异构酶结构一致，在两个不同的活性位点各只有一个金属离子。
AVA6103，一种新型拓扑异构酶 I FAP 激活的预
多种 pre|CISION ® exatecan 化合物表现出 FAP 诱导的细胞毒性。用 exatecan、pre|CISION ® exatecan、pre|CISION® exatecan + hFAP 或 pre|CISION ® exatecan + FAPi 处理 CFPAC-1 细胞 72 小时。培养基中血清中的 FAP 活性水平较低，因此具有不同 kcat/Km 的化合物表现出不同的活性；这用于监测化合物特性。调节封端基团 (A) 和自毁连接子 (B) 将改变 FAP 亲和力和化合物特性，如其各自的细胞毒性图所示。
ZW251 是一种新型靶向磷脂酰肌醇蛋白聚糖-3 的抗体-药物偶联物，携带拓扑异构酶 I 抑制剂有效载荷，表现出引人注目的临床前活性
图 4. (A) ZW251 在植入 Hep3B CDX 或 LI1037 PDX 肿瘤的小鼠中的剂量反应活性，每组 8 只小鼠。 (B) ZW251 在植入 HCC PDX 模型的小鼠中以 8 和 16 mg/kg 剂量的活性，每组 3 只小鼠。 (C) 代表性研究显示 ZW251 在植入一系列 HCC PDX 模型的小鼠中以 8 mg/kg 剂量的活性，每组 3 只小鼠。 (D) ZW251 在所有测试的 HCC CDX/PDX 模型中的抗肿瘤活性广度。 8 mg/kg 剂量的抗肿瘤活性通过第 21 天或最接近的可评估时间点的肿瘤生长抑制百分比确定，计算为 [(1-TV 治疗 /TV 载体 ) x 100]。 GPC3 表达通过 codrituzumab 进行 IHC 确定，然后由病理学家评分。