图1。在各种动物DNA中,CpG缺乏与HPA II位点甲基化水平之间的相关性。水平的甲基化水平表示为线而不是点,因为难以准确定量HPA II和MSP I溴化乙锭染色模式之间的差异。CpG缺乏症已被表示为预期频率计算的FRAM的百分比,相关DNA的碱基组成。这些数字是由Setlow(26)和Fram参考15和G. Russell,D。Mkgeoch和J. Subak-Sharpe(Bee,Bee-Fly-Fly和Sea Amone)的未发表的数据收集的最接近的邻居数据的集合。(a)男人,(b)小鸡,(c)小鼠,(d)兔子,(e)BHK细胞(仓鼠),(f)海星,(g)海胆(echinus),(h)海胆(h)海胆(paracentrotus)(paracentrotus),(i)海洋羊水,(i)海洋空?
图 12. Sanger 法。A) 双脱氧核苷酸 (ddNTP) 的结构与脱氧核苷酸 (dNTP) 相似,只是缺少 3'OH 基团。B) 当荧光标记的 ddNTP 被掺入 DNA 链时,合成会停止。在包含不同 ddNTP 的反应中,DNA 片段合成可以在不同点终止。然后根据大小分离合成产物,并使用荧光标记来确定序列中添加核苷酸的顺序。基因组很大 - 通常有数百万个碱基对 - 因此无法在一个步骤中端到端测序。要对基因组进行测序,必须首先将其 DNA 分解成较小的片段,并对每个片段进行单独测序。特定 DNA 片段的既定碱基顺序称为“序列读取”。然后利用计算工具组装各种片段并推断出起始基因组的序列。这个过程在历史上被称为“散弹枪测序”。人类基因组计划 (HGP) 是全基因组 DNA 测序的首次重大尝试,由美国国立卫生研究院牵头。HGP 于 2003 年完成,利用桑格测序法对来自多个个体的 DNA 的基因组克隆进行测序,以生成人类基因组的代表性序列。
1。Kernighan,B.W。 和Plauger,P.J。 (1976)软件工具,Addison-Wesley Publishing Company,Reading,Massachusetts。 2。 Maizel,J.V。 和Lenk,R.P。 (1981)美国国家科学院的会议记录78,7665-7669。 3。 Needleman,S.B。 和Wunsch,C.D。 (1970)分子生物学杂志48,443-453。 4。 卖家,P.H。 (1974)应用数学杂志26,787-793。 5。 Smith,T.F。 和Waterman,M.S。 (1981)应用数学2,482-489的进步。 6。 Schroeder,J.L。 和Blattner,F.R。 (1982)核酸研究10,69-84,图1。 7。 Zuker,M。和Stiegler,P。(1981)核酸研究9,133-148。 8。 Gribskov,M.,Devereux,J。和Burgess,R.R。 “密码子偏好图:蛋白质编码序列和基因表达的图形分析”,提交给核酸研究。 9。 Grantham,R。Gautier,C。Guay,M。Jacobzone,M。和Mercier R.(1981)核酸研究9(1),R43-R74。 10。 Fickett,J.W。 (1982)核酸研究10,5303-5318 11。 Smithies,O.,Engels,W.R。,Devereux,J.R。,LiTher,J.L。和S. Shen,(1981)Cell 26,345-353。 12。 Smith,T.F.,Waterman,M.S。 和Sadler,J.R。(1983)核酸研究11,2205-2220。 13。 Staden,R。(1980)核酸研究8,3673-3694。 14。 15。 16。 17。Kernighan,B.W。和Plauger,P.J。(1976)软件工具,Addison-Wesley Publishing Company,Reading,Massachusetts。2。Maizel,J.V。和Lenk,R.P。(1981)美国国家科学院的会议记录78,7665-7669。3。Needleman,S.B。和Wunsch,C.D。(1970)分子生物学杂志48,443-453。4。卖家,P.H。(1974)应用数学杂志26,787-793。5。Smith,T.F。 和Waterman,M.S。 (1981)应用数学2,482-489的进步。 6。 Schroeder,J.L。 和Blattner,F.R。 (1982)核酸研究10,69-84,图1。 7。 Zuker,M。和Stiegler,P。(1981)核酸研究9,133-148。 8。 Gribskov,M.,Devereux,J。和Burgess,R.R。 “密码子偏好图:蛋白质编码序列和基因表达的图形分析”,提交给核酸研究。 9。 Grantham,R。Gautier,C。Guay,M。Jacobzone,M。和Mercier R.(1981)核酸研究9(1),R43-R74。 10。 Fickett,J.W。 (1982)核酸研究10,5303-5318 11。 Smithies,O.,Engels,W.R。,Devereux,J.R。,LiTher,J.L。和S. Shen,(1981)Cell 26,345-353。 12。 Smith,T.F.,Waterman,M.S。 和Sadler,J.R。(1983)核酸研究11,2205-2220。 13。 Staden,R。(1980)核酸研究8,3673-3694。 14。 15。 16。 17。Smith,T.F。和Waterman,M.S。 (1981)应用数学2,482-489的进步。 6。 Schroeder,J.L。 和Blattner,F.R。 (1982)核酸研究10,69-84,图1。 7。 Zuker,M。和Stiegler,P。(1981)核酸研究9,133-148。 8。 Gribskov,M.,Devereux,J。和Burgess,R.R。 “密码子偏好图:蛋白质编码序列和基因表达的图形分析”,提交给核酸研究。 9。 Grantham,R。Gautier,C。Guay,M。Jacobzone,M。和Mercier R.(1981)核酸研究9(1),R43-R74。 10。 Fickett,J.W。 (1982)核酸研究10,5303-5318 11。 Smithies,O.,Engels,W.R。,Devereux,J.R。,LiTher,J.L。和S. Shen,(1981)Cell 26,345-353。 12。 Smith,T.F.,Waterman,M.S。 和Sadler,J.R。(1983)核酸研究11,2205-2220。 13。 Staden,R。(1980)核酸研究8,3673-3694。 14。 15。 16。 17。和Waterman,M.S。(1981)应用数学2,482-489的进步。6。Schroeder,J.L。和Blattner,F.R。(1982)核酸研究10,69-84,图1。7。Zuker,M。和Stiegler,P。(1981)核酸研究9,133-148。 8。 Gribskov,M.,Devereux,J。和Burgess,R.R。 “密码子偏好图:蛋白质编码序列和基因表达的图形分析”,提交给核酸研究。 9。 Grantham,R。Gautier,C。Guay,M。Jacobzone,M。和Mercier R.(1981)核酸研究9(1),R43-R74。 10。 Fickett,J.W。 (1982)核酸研究10,5303-5318 11。 Smithies,O.,Engels,W.R。,Devereux,J.R。,LiTher,J.L。和S. Shen,(1981)Cell 26,345-353。 12。 Smith,T.F.,Waterman,M.S。 和Sadler,J.R。(1983)核酸研究11,2205-2220。 13。 Staden,R。(1980)核酸研究8,3673-3694。 14。 15。 16。 17。Zuker,M。和Stiegler,P。(1981)核酸研究9,133-148。8。Gribskov,M.,Devereux,J。和Burgess,R.R。“密码子偏好图:蛋白质编码序列和基因表达的图形分析”,提交给核酸研究。9。Grantham,R。Gautier,C。Guay,M。Jacobzone,M。和Mercier R.(1981)核酸研究9(1),R43-R74。10。Fickett,J.W。 (1982)核酸研究10,5303-5318 11。 Smithies,O.,Engels,W.R。,Devereux,J.R。,LiTher,J.L。和S. Shen,(1981)Cell 26,345-353。 12。 Smith,T.F.,Waterman,M.S。 和Sadler,J.R。(1983)核酸研究11,2205-2220。 13。 Staden,R。(1980)核酸研究8,3673-3694。 14。 15。 16。 17。Fickett,J.W。(1982)核酸研究10,5303-5318 11。Smithies,O.,Engels,W.R。,Devereux,J.R。,LiTher,J.L。和S. Shen,(1981)Cell 26,345-353。12。Smith,T.F.,Waterman,M.S。 和Sadler,J.R。(1983)核酸研究11,2205-2220。 13。 Staden,R。(1980)核酸研究8,3673-3694。 14。 15。 16。 17。Smith,T.F.,Waterman,M.S。和Sadler,J.R。(1983)核酸研究11,2205-2220。13。Staden,R。(1980)核酸研究8,3673-3694。14。15。16。17。Clayton,J。and Kedes,L。(1982)核酸研究10,305-321。GenBank(TM)遗传序列数据库可从美国马萨诸塞州剑桥市Moulton Street 10号Bolt Beranek and Newman Inc.韦恩·里顿(Wayne Rindone)获得美国马萨诸塞州穆尔顿街10号。EMBL核苷酸序列数据库可从Greg Hamm,欧洲分子生物学实验室,后10.2209,Meyerhofstrasse 1,6900 Heidelberg,West Gestery获得。来自法国Strasbourg 67000的Transgene SA的Richard Lathe博士的个人交流。
摘要Poly(嘧啶)植脂(嘌呤)裂纹已在许多嗜酸性基因的5'频乘区域中发现。它们可能参与表达的调节,因为它们可以映射到活性染色质的核酸酶敏感位点。我们发现聚(嘧啶).poly Spurine)DNA,其中含有5-甲基环肽(例如poly [d(tm c)]。poly [d(ga)])将在8个以下的pH下形成三元。相反,未甲基化的类似物,poly [d(tc)]合成5DNA包含重复的三核苷酸和poly [d(um c)]。poly [d(ga)]以类似的方式行为。因此,可以通过胞嘧啶的甲基化来控制三元的稳定性。这提出了一个基于在胞核基因5'侧的特定三边形形成的表达调节模型。