XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System特异性
监测抗原特异性记忆 B 细胞的重要性以及 ImmunoSpot 检测如何适合这项任务
摘要：确定个体对病原体、自身抗原或环境因子的体液免疫反应性传统上是通过评估血液中的特定抗体水平来实现的。然而，在许多情况下，特异性抗体的滴度会随着时间的推移而下降，因此不能如实地反映先前的抗原暴露或免疫记忆的建立。因此，为了评估个体的体液免疫能力，有必要评估功能性 B 细胞记忆。在这里，我们描述了新的 B 细胞 ELISPOT 和 FluoroSpot 检测（统称为 ImmunoSpot），这些检测可以快速开发和验证，以在体外和单细胞分辨率下表征对任何所需抗原特异的记忆 B 细胞 (B mem ) 库。此外，B 细胞 FluoroSpot 检测的多重变体能够以最少的细胞材料要求对分泌不同抗体类别和/或 IgG 亚类的抗原特异性 B 细胞进行高通量测试。 B 细胞 ImmunoSpot 检测还可以测量抗原特异性 B mem 区室内的亲和力分布，并允许进行交叉反应测量，从而可以深入了解针对未来病原体变体建立的 B mem。总的来说，这里介绍的 ImmunoSpot ® 系统具有高度可重复性，并且可以轻松验证是否适用于受监管的测试。新获得的监测抗原特异性 B mem 区室的能力应该会促进对健康和疾病中的体液免疫的更全面了解。
白色念珠菌和克柔念珠菌的特异性检测...
一项多中心研究分析了侵袭性念珠菌病中的混合酵母菌感染组合，结果表明最常见的组合是白色念珠菌/光滑念珠菌、白色念珠菌/近平滑念珠菌、光滑念珠菌/热带念珠菌和白色念珠菌/克柔念珠菌 [9] 。临床上治疗混合酵母菌感染的挑战在于考虑每种酵母菌对抗真菌药物的敏感性。此外，如果没有检测到克柔念珠菌，治疗白色念珠菌/克柔念珠菌混合酵母菌感染比其他组合更困难，因为它对唑类和两性霉素 B 有很高的耐药性，而这两者都是一线治疗选择 [9,10] 。因此，成功治疗混合酵母的关键之一是准确识别念珠菌种类并选择正确的抗真菌药物。
针对复合杂合卟啉症的突变特异性引导 RNA 通过干细胞中的 CRISPR/Cas9 进行靶向无瘢痕矫正
Florence Prat、Jérôme Toutain、Julian Boutin、Samuel Amintas、Grégoire Cullot 等人。通过 CRISPR/Cas9 在干细胞中对复合杂合卟啉症进行突变特异性引导 RNA 的无瘢痕靶向矫正。Stem Cell Reports，2020 年，15，第 677-693 页。�10.1016/j.stemcr.2020.07.015�。�hal-03492339�
3D染色质结构对细胞类型特异性基因调节的贡献
真核基因组以3D方式组织，并且在这些量表中的每一种中作用的不同机制都会有助于转录调节。但是，3D染色质结构中的大型单细胞变异性是了解如何以稳健和有效的方式在细胞类型之间差异调节转录的挑战。在这里，我们描述了3D染色质结构的不同机制有助于细胞类型特异性的转录调节。令人兴奋的是，几种能够在其天然组织环境中测量单个细胞中3D染色质构象和转录的新方法，或者检测顺体调节相互作用的动力学，开始允许对染色质结构噪声进行定量解剖，并将其与不同细胞类型之间的转录相关联。
干细胞特异性NF-κB是干细胞存活和肠道损伤时上皮再生所必需的
。CC-BY 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本（未经同行评审的认证）提供的，他已授予Biorxiv的许可证，以在2025年2月4日发布的此版本中显示在版权所有的此版本中。 https://doi.org/10.1101/2025.01.30.635658 doi：biorxiv preprint
比较现代和古代亚麻纤维中细胞壁多糖的扭结结构和特异性
亚麻（Linum Usitatissimum L.）是一种工业重要性，其纤维目前用于高价值纺织品应用，复合增援部队以及自然致动器。人类对这种纤维丰富的植物的兴趣可以追溯到几千年，包括古埃及，那里的亚麻在各种quotidian物品中广泛使用。尽管亚麻纤维的最新技术发展继续通过科学研究多样化，但《亚麻的历史使用》也为今天提供了丰富的课程。通过仔细检查古埃及和现代亚麻纤维，本研究旨在进行从纱线到纤维细胞壁尺度的多尺度表征，将结构和多糖含量的差异与亚麻的机械性能和耐用性联系起来。在这里，通过扫描电子显微镜和纳米力学研究来丰富多尺度的生化研究。关键发现是纤维素特征，结晶度指数和古代纤维和现代纤维之间的局部机械性能的相似性。从生物化学上讲，单糖肛门，深紫外和NMR的研究表明，古代纤维表现出较少的果胶，但类似的半纤维素含量，尤其是通过尿酸和半乳糖，表明这些非晶体成分的敏感性。
CTBP脱氢酶抑制剂MTOB和4-CL-HIPP的特异性
C末端结合蛋白（CTBP）是对癌症和炎症重要的保守转录阻遏物。 在转录共同调节剂中独特的CTBP具有功能性脱氢酶结构域。 由于多种恶性肿瘤显示CTBP水平升高，因此已经开发了针对该脱氢酶结构域的CTBP抑制剂。 尽管CTBPS脱氢酶功能对转录调节的重要性尚不清楚，但几项研究取决于CTBP抑制剂。 体外实验已经证实了这些化合物与CTBP活性位点的结合，但是缺乏特异性的证据。 为了解决这个问题，我们用MTOB或4-CL-HIPP处理了WildType和CTBP1，2个双基因敲除J774.1细胞并进行了RNA-Seq。 我们观察到，两种抑制剂都会引起不同的转录变化，表明非重叠的作用方式。 此外，在CTBP1/2双基因敲除细胞中观察到了任何一种抑制剂引起的大多数变化，提示靶向效应。 我们假设那些CTBP脱氢酶抑制剂对CTBPs缺乏特异性，并强调使用这些抑制剂从研究中推断出的发现进行仔细的重估。C末端结合蛋白（CTBP）是对癌症和炎症重要的保守转录阻遏物。在转录共同调节剂中独特的CTBP具有功能性脱氢酶结构域。由于多种恶性肿瘤显示CTBP水平升高，因此已经开发了针对该脱氢酶结构域的CTBP抑制剂。尽管CTBPS脱氢酶功能对转录调节的重要性尚不清楚，但几项研究取决于CTBP抑制剂。体外实验已经证实了这些化合物与CTBP活性位点的结合，但是缺乏特异性的证据。为了解决这个问题，我们用MTOB或4-CL-HIPP处理了WildType和CTBP1，2个双基因敲除J774.1细胞并进行了RNA-Seq。我们观察到，两种抑制剂都会引起不同的转录变化，表明非重叠的作用方式。此外，在CTBP1/2双基因敲除细胞中观察到了任何一种抑制剂引起的大多数变化，提示靶向效应。我们假设那些CTBP脱氢酶抑制剂对CTBPs缺乏特异性，并强调使用这些抑制剂从研究中推断出的发现进行仔细的重估。
粘附 G 蛋白偶联受体脑特异性血管生成抑制剂 2 (BAI2/ADGRB2) 对海马兴奋性突触发育的调节
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2025 年 2 月 3 日发布。；https://doi.org/10.1101/2025.02.02.636169 doi：bioRxiv 预印本
白癜风疾病特异性肠道微生物标志物的鉴定
白癜风与肠道菌群存在潜在的相关性，但目前这方面的研究有限。该研究采用16S rRNA高通量测序技术检测49例白癜风患者和49例非白癜风患者粪便样本的肠道菌群。研究包括四个对照组：（1）DI（疾病）组vs. HC（健康对照）组；（2）DI_m组（未成年人疾病组）vs. HC_m组（未成年人健康对照组）；（3）DI_a组（成人疾病组）vs. HC_a组（成人健康对照组）；（4）DI_m组vs. DI_a组。研究结果表明白癜风患者与健康对照者的肠道菌群组成存在空间异质性。无论是未成年人组还是成年人组，白癜风患者的肠道菌群多样性都显著降低。但不同年龄段白癜风患者肠道菌群差异已得到证实，其中拟杆菌属和副拟杆菌属已被鉴定为白癜风未成年组和成年组患者肠道菌群的特异性标记物，相关性分析显示，这两个菌属与白癜风面积评分指数（VASI）和病程呈正相关。值得注意的是，DI_m组和DI_a组之间的菌群多样性差异并不显著，菌群组成和功能特征相似。然而，相关性分析表明，随着年龄的增长，拟杆菌属和副拟杆菌属呈下降趋势。白癜风患者肠道菌群与健康对照组相比有明显差异，且不同年龄段患者与健康对照组之间存在差异的微生物标记物属也不同。疾病特异性微生物标记属（拟杆菌属和副拟杆菌属）与 VASI、病情持续时间和年龄有关。这些发现对于改善白癜风患者的早期诊断和制定潜在治疗策略至关重要。
基于 CUL4B 的 E3 泛素连接酶通过募集磷酸化特异性 DCAF 来调节有丝分裂和大脑发育
旁系同源物 CUL 4 A 和 CUL 4 B 组装 cullin-RING E 3 泛素连接酶 (CRL) 复合物，调节多种染色质相关的细胞功能。尽管它们结构相似，但我们发现 CUL 4 B 独特的 N 端延伸在有丝分裂期间被大量磷酸化，而磷酸化模式在导致 X 连锁智力残疾 (XLID) 的 CUL 4 BP 50 L 突变中受到干扰。表型表征和突变分析表明，CUL 4 B 磷酸化是有效进行有丝分裂、控制纺锤体定位和皮质张力所必需的。虽然 CUL 4 B 磷酸化触发染色质排斥，但它促进与肌动蛋白调节剂和两个以前未被认识的 CUL 4 B 特异性底物受体 (DCAF) LIS 1 和 WDR 1 的结合。事实上，共免疫沉淀实验和生化分析表明 LIS 1 和 WDR 1 与 DDB 1 相互作用，并且 CUL 4 B 的磷酸化 N 端结构域增强了它们的结合。最后，人类前脑类器官模型表明 CUL 4 B 是形成与前脑分化开始相关的稳定脑室结构所必需的。总之，我们的研究发现了以前未被发现的与有丝分裂和大脑发育相关的 DCAF，它们通过磷酸化依赖机制特异性结合 CUL 4 B，但不结合 CUL 4 BP 50 L 患者突变体。