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靶向蛋白质的环状肽的设计 -
摘要：近年来已经确定了超过930,000个蛋白质蛋白质相互作用（PPI），1个，但它们的理化特性与常规药物靶标有所不同，这使使用2种常规小分子作为模态复杂化。环状肽是靶向3种蛋白质蛋白相互作用（PPI）的一种有希望的方式，但是很难预测靶蛋白4环状肽复合物的结构或设计使用5个计算方法与靶蛋白结合的环状肽序列。最近，具有环状偏移的Alphafold已启用了预测环状肽的结构6，从而实现了从头环状肽设计。我们开发了一个环状肽7复合物的偏移，以实现靶蛋白和环状肽络合物的结构预测，而8种具有环状肽络合物复合物偏移量的Alphafold2可以高精度预测结构。我们9还将环状肽复合物的偏移量应用于Afdesign的粘合剂幻觉方案，即使用Alphafold的10新蛋白设计方法，我们可以设计高预测的局部距离11差异测试和比天然MDM2/P53 12结构的单位界面区域的分离差异11差异测试和较低的分离结合能。此外，该方法被应用于其他12种蛋白质肽复合物和13个蛋白质蛋白质复合物。我们的方法表明，可以设计针对PPI的假定环状肽14个序列。15
环状纤维肽偶联物作为整合素...
摘要：为了研究靶向肿瘤光活化化疗的潜力，手性氟氨酸抗癌弹头，λ /δ-[ru（pH 2 phen）2（oh 2）2] 2+，通过直接的METARE和METAR均与METAR共轭含有RGD的AC-MRGDH-NH 2肽连接到含RGD的AC-MRGDH-NH 2肽。此设计提供了两个环状金属肽的两个非映异构体λ-[1] Cl 2和δ-[1] Cl 2。在黑暗中，唯一的螯合肽具有三重作用。首先，它防止其他生物分子与金属中心协调。第二，它的亲水性[1] Cl 2两亲性使其在培养基中自组装成纳米颗粒。第三，它通过与整联蛋白的强烈结合（K d =0.061μm）作为λ-[1] Cl 2与αIIIBβ3的结合）充当肿瘤靶向基序，从而导致受体介导的偶联物在体外的摄取。在A549，U87MG和PC-3人类癌细胞系和U87mg三维（3D）肿瘤球体的二维（2D）单层中的光毒性研究的机理研究表明，这种光毒性是由于光动力疗法（PDT）和光活化化疗（PACT）作用的结合，这是由活性氧的产生和肽摄取的肽产生的。最后，在皮下U87mg胶质母细胞瘤小鼠模型中的体内研究表明，注射后12小时12小时有效地在肿瘤中有效地积累了[1] Cl 2，其中绿光辐照比非核心的模拟拟态谱系复合物产生更强的肿瘤作用[2] Cl [2] Cl 2。考虑到治疗的小鼠缺乏全身毒性，这些结果表明了基于光敏的整联蛋白靶向氟苯甲酸抗癌化合物的高潜力，用于在体内治疗脑癌。
对环状温度依赖性性能的调查
图2。（a）QD的吸收和PL光谱，（b）LMZO在溶液中的吸收光谱（c）QLED（d）的层（d），层堆栈（e）的能级比对，QLED结构（f）的横截面TEM图像（f）和性能参数。（g）中的插图显示了在12 V.
乳腺癌：环状 RNA 在临床前体内模型中介导疗效
摘要。为了确定乳腺癌的新靶点和治疗方式，我们在文献中搜索了在临床前乳腺癌相关体内模型中有效的环状 RNA (circRNA)。通过我们的搜索，我们确定了 26 个上调和 6 个下调的 circRNA，它们在乳腺癌相关的临床前体内模型中起着作用。我们讨论了已确定的 circRNA 的重建和抑制，以及在化学耐药性、增殖抑制和转移背景下确定的靶点的药物性和验证。由细胞因子和高迁移率族蛋白抑制剂、核因子 ĸB 和 Hippo 信号传导驱动的途径成为肿瘤生长和转移的重要驱动因素。三叶因子 1 在雌激素受体阳性乳腺癌转移中的作用也值得进一步研究。此外，粘蛋白 19 已成为乳腺癌治疗的一个未开发的靶点。
组合化学开发的环状肽脂蛋白抑制剂
摘要：Furin是一种负责激活许多生理相关细胞底物的人丝氨酸蛋白酶，还参与了各种病理状况的发展，包括炎症性疾病，癌症，病毒和细菌感染。因此，具有抑制脂蛋白的蛋白水解作用能力的化合物被视为潜在的疗法。在这里，我们采用了组合化学方法（由2000种肽组成），以获得新的，强和稳定的肽脂蛋白抑制剂。广泛研究的胰蛋白酶抑制剂SFTI-1用作领先结构。进一步修饰了选定的单核抑制剂，以最终产生五个在亚洋摩尔范围内的K I值的单一或双环脂蛋白抑制剂。抑制剂5是最活跃的（K I = 0.21 nm），并且比文献中描述的参考脂蛋白抑制剂具有更明显的蛋白水解耐药性。此外，它降低了panc-1细胞裂解物中的液样活性。还报道了使用分子动力学模拟对脂蛋白 - 抑制剂复合物进行详细分析。关键字：弗林，向日葵胰蛋白酶抑制剂1，抑制剂，肽库，组合化学
环状 CrO3 簇对热力学的敏感性...
利用密度泛函理论讨论了环状三氧化铬团簇与各种气体的相互作用。研究了 n=1 至 6 的环状 (CrO 3 ) n 团簇。相互作用的气体包括 CO、H 2 、NH 3 、CH 4 和 O 2 。所有相互作用的气体都会从 CrO 3 团簇中吸收氧原子（O 2 除外），留下缺氧的团簇，而环境空气中的 O 2 会重新氧化这些团簇。CrO 3 缺氧团簇具有较低的能隙，这提高了这些团簇对相互作用气体的敏感性。讨论了相互作用的热力学，包括对吉布斯自由能、焓和反应熵的评估。反应温度的变化使用吉布斯能量值显示了反应发生的温度范围。一些气体反应是放热的还是吸热的，具体取决于焓的值。自然键轨道 (NBO) 分析显示了 CrO 3 团簇和气体中每个原子上的电荷。这些电荷解释了团簇和气体之间的反应静电。可以使用能隙和反应速率的变化来计算气体对这些气体的相对敏感度。
环状单链 DNA 是一种优良的同源性 - ...
（未经同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此预印本的版权所有者此版本于 2022 年 12 月 2 日发布。；https://doi.org/10.1101/2022.12.01.518578 doi：bioRxiv preprint
凝聚蛋白 DC 从募集位点加载并扩散，在秀丽隐杆线虫中形成环状锚定 TAD
摘要 凝缩蛋白是通过线性易位压缩 DNA 的分子马达。在秀丽隐杆线虫中，X 染色体含有一种参与剂量补偿 (DC) 的专门凝缩蛋白。凝缩蛋白 DC 被招募到 X 染色体 (rex) 上的少数招募元素并从中扩散，并且是拓扑关联域 (TAD) 形成所必需的。我们利用基本上没有凝缩蛋白 DC 和 TAD 的常染色体来解决 rex 位点和凝缩蛋白 DC 如何引起 TAD 的形成。当常染色体和 X 染色体物理融合时，尽管凝缩蛋白 DC 扩散到常染色体中，但不会产生 TAD。在 X 染色体上插入强 rex 都会导致 TAD 边界形成，无论序列方向如何。当相同的 rex 插入到常染色体上时，尽管有凝缩蛋白 DC 募集，但没有扩散或 TAD 特征。另一方面，当由六个 rex 位点或三个单独的 rex 位点组成的“超级 rex”插入到常染色体上时，凝缩蛋白 DC 的募集和扩散导致 TAD 的形成。因此，募集到 rex 位点并从 rex 位点扩散是重现 X 染色体上观察到的环锚定 TAD 的必要和充分条件。总之，我们的数据表明一个模型，其中 rex 位点既是凝缩蛋白 DC 的加载位点，也是双向屏障，凝缩蛋白 DC 是一种具有可移动非活性锚的单侧环挤出器。
含线性和环状四氟硼酸铵乙腈电解质的超级电容器活性炭界面内压变化比较
（EDLC），其中流行的机制需要在高表面积材料和液体电解质之间的界面处进行非法拉第电荷存储。这些储能装置由于其高功率密度（10 kW kg −1 ）、快速响应时间（1 s）、循环寿命（10 5 次循环）和安全性而引人注目。[1] 纳米多孔碳材料通常用于 EDLC。它们的多孔结构充当任何介质的批量缓冲库，从而减少离子对孔内表面的传输阻力。[2] 增加的孔隙可及性可容纳更多阳离子来填充电极的双层，从而产生 200 F g −1 数量级的比电容，就像活性炭的情况一样。 [3] 后者在这些储能装置中被广泛使用，因为它价格低廉，即碳化过程源自木材、煤和坚果壳，与其他多孔材料（如模板碳和碳化物衍生碳）相比，更容易制备。 它的比表面积约为 2000 m 2 g − 1 ，可为标准电池电极提供 ≈ 30 mAh g − 1 V − 1，而标准电池电极为 150 mAh g − 1 V − 1。[4,5]
子宫内膜癌中的环状 RNA（综述）
摘要：子宫内膜癌（EC）是西方发达国家女性死亡的主要原因之一，是严重威胁女性健康的常见妇科恶性肿瘤。近年来，EC 呈年轻化趋势，总体发病率逐渐上升。环状 RNA（circRNA）是一类新的内源性转录本，由于其共价闭环结构，与其他类型的 RNA 不同，其编码蛋白质的能力有限。越来越多的证据表明，circRNA 在肺癌、胃癌、乳腺癌、EC 等恶性肿瘤中发挥着重要作用，并通过多种途径影响这些恶性肿瘤的发生发展，进一步证明了 circRNA 作为恶性肿瘤诊断、治疗和预后的分子生物标志物的潜力。本综述的目的是总结目前对环状RNA的生物发生和作用的理解，并讨论环状RNA在EC中的表达、功能和潜在机制，以便识别潜在的新生物标志物。