几种抑制 70S 核糖体蛋白质合成的抗生素,包括克林霉素、吡利霉素、4'-戊基-N-去甲基克林霉素、四种四环素、氯霉素、甲砜霉素和红霉素,在培养中对恶性疟原虫具有抗疟作用,这种作用受药物暴露时间和氧张力的影响很大。在 96 小时的孵育中,效力在前 48 小时内增加高达 106 倍,在 15% 02 与 1% 02 中增加高达 104 倍。两种氨基糖苷类药物,卡那霉素和妥布霉素,没有抗疟活性。抑制核酸合成的利福平和萘啶酸与 70S 抑制剂不同。线粒体抑制剂 Janus Green、罗丹明 123、抗霉素 Al 和 8-甲基氨基-8-去甲基核黄素的活性受暴露时间和氧张力的影响。含喹啉的抗疟药、离子载体和其他抗疟药受暴露时间的影响较小,但不受氧张力的影响。这些数据可以用以下假设来最好地解释:抗疟 70S 核糖体特异性蛋白质合成抑制剂通过作用于线粒体对寄生虫产生毒性。
在全球范围内,疟疾仍然是最普遍的寄生虫之一。世界卫生组织(WHO)2022年世界疟疾报告显示,全球估计有2.47亿例和96%的疟疾死亡发生在非洲(1)。引起该疾病的生物来自疟原虫属。当感染性雌性蚊子摄取血液餐时,这些寄生虫会传播到易感宿主。四种不同的疟原虫感染了人类,即恶性疟原虫,P。ovale,P。疟疾和Vivax。虽然Vivax是全球最广泛的质量物种,但恶性疟原虫是最普遍,最危险的,并且主要在非洲发现,占估计全球临床疟疾病例的99.7%(1)。卵子疟原虫进一步分为两个亚种; P.O。柯蒂西和P. Wallikeri(2)。除了典型的人类寄生虫外,最近还发现了许多猿猴寄生虫
WHO治疗指南建议在所有区域对由疟原虫疟原虫引起的血液阶段感染的41治疗中阿甘莫动蛋白 - 综合疗法(ACT)(氯喹42仅在维瓦克斯疟原虫仍然对氯喹敏感的地区推荐)。在恶性疟原虫中,在体内定义了43个对青蒿素衍生物的部分耐药性,是治疗后第44天检测到的寄生虫病,或者是寄生虫清除斜率≥5小时的半衰期。我们搜索了45 PubMed,以在1990年至2月47日在47 2025年之间发表的术语“ vivax”和“清除率”和(“ Artesunate”或46“ Dihydroartemisinin”或“ Artemisether”或“ Artemisinin”),没有语言限制。我们的搜索检索了102个研究,对标题和48个摘要进行了筛选,以识别21项用49个青蒿素衍生物报告的维瓦克斯治疗结果的研究。所有这些研究得出的结论是,青蒿素衍生物提供了50次快速的疟原虫寄生虫清除率,但两项研究报告了第3天的阳性频率很低,阳离子51阳性51次阳离子治疗(巴西为2.6%)或二脑蛋白酶素磷酸52(Indononesia的0.6%)。没有研究报告清除斜率半衰期≥5小时。53
疟原虫造成非洲以外的大多数疟疾病例。与p不同。恶意,p。Vivax生命周期包括休眠的肝脏,催眠症,在没有蚊子传播的情况下会引起感染。一种针对p的有效疫苗。Vivax血液阶段将限制这种复发感染的症状和病理,因此可能在控制该物种的控制中起关键作用。p。vivax落后于p。恶性菌,有许多识别的tar-得到了几个转换为II期测试。相比之下,只有一个p。基于Divax血液阶段疫苗基于DUFFY结合蛋白(PVDBP)的候选疫苗已达到IA期,这在很大程度上是因为缺乏p的持续体外培养系统。Vivax限制了新候选人的系统筛选。我们使用了p之间的密切系统发育关系。vivax和p。knowlesi(人类红细胞中存在体外培养系统),以测试系统反疫苗学的可扩展性以识别和确定p的优先级。Vivax血液阶段目标。p。在哺乳动物的表达系统中,预测在红细胞侵袭中起作用的可在红细胞侵袭中起作用。 这些抗原中的八种用于产生多克隆抗体,这些抗体被筛选,以识别p中的直系同源蛋白的能力。 knowlesi。 knowlesi和嵌合p。 knowlesi基因与他们的p。在哺乳动物的表达系统中,预测在红细胞侵袭中起作用的可在红细胞侵袭中起作用。这些抗原中的八种用于产生多克隆抗体,这些抗体被筛选,以识别p中的直系同源蛋白的能力。knowlesi。knowlesi和嵌合p。knowlesi基因与他们的p。然后对这些抗体进行了测试,以抑制两种野生型P的生长和侵袭。使用CRISPR/CAS9进行修改以交换p。Vivax直系同源物。诱导抑制抗体的候选者
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疟原虫的无性血液阶段很容易通过同源重组来适应遗传修饰,从而使寄生虫基因的功能性研究在生命周期的这一部分中并非必不可少。然而,常规的反向遗传学不能应用于无性血液阶段复制中必不可少的基因的功能分析。已经开发了各种策略,用于浆细胞的条件诱变,包括基于重组酶的基因缺失,可调节启动子以及mRNA或蛋白质破坏稳定系统。在其中,可二聚Cre(DICRE)重组酶系统已成为p中有条件基因缺失的强大方法。恶意。在该系统中,噬菌体CRE以两种单独的酶无活性多肽的形式表达,每种酶融合了不同的雷帕霉素结合蛋白。雷帕霉素诱导的两个成分的异二聚化恢复重组酶活性。我们已经在啮齿动物疟原虫p。berghei,并表明可以在哺乳动物和蚊子寄生虫阶段具有很高的效率来实现雷帕霉素诱导的floxed DNA序列切除。此工具可用于投资基本基因的功能,不仅在无性血液阶段,而且在疟原虫生命周期的其他部分。
摘要 人类疟原虫恶性疟原虫利用 PfEMP1 编码 var 基因家族的互斥表达来逃避宿主免疫系统。尽管在分子层面上对默认沉默机制的理解取得了进展,但独特表达的 var 成员的激活机制仍然难以捉摸。富含 GC 的非编码 RNA (ncRNA) 基因家族与表达 var 基因的疟原虫物种共同进化。在这里,我们表明这个 ncRNA 家族以克隆变异的方式转录,当 ncRNA 位于活性 var 基因相邻和上游时,单个成员的主要转录发生。我们开发了一种特定的 CRISPR 干扰 (CRISPRi) 策略,可以抑制所有富含 GC 的成员的转录。缺乏富含 GC 的 ncRNA 转录导致环状期寄生虫中整个 var 基因家族的下调。令人惊讶的是,在成熟的血液阶段寄生虫中,富含 GC 的 ncRNA CRISPRi 影响了其他克隆变异基因家族的转录模式,包括所有 Pfmc-2TM 成员的下调。我们为富含 GC 的 ncRNA 转录在 var 基因激活中的关键作用提供了证据,并发现了与寄生虫毒力有关的各种克隆变异多基因家族的转录控制之间的分子联系。这项工作为阐明控制恶性疟原虫免疫逃避和发病机制的分子过程开辟了新途径。
疟疾是由疟原虫属的原生动物寄生虫引起的,并且仍然是全球健康问题。寄生虫具有高度适应的生命周期,其中包括脊椎动物宿主中的连续无性复制和蚊子载体围绕中的性成熟。寄生虫的遗传操纵对破译疟原虫基因功能的功能具有重要作用。常规的反向遗传工具不能用于研究无性血液阶段的基本基因,从而需要制定条件策略。在各种此类策略中,雷帕霉素可诱导的可二聚化CRE(DICRE)重组酶系统是一种有条件地编辑人类感染的恶性疟原虫和啮齿动物疟疾模型寄生虫寄生虫P. Berghei的强大方法。我们先前生成了表达二甲虫的berghei线,并通过有条件地删除了几个必不可少的无性阶段基因来验证它,从而揭示了它们在孢子虫中的重要作用。另一个有效的工具是CRISPR/CAS9技术,该技术已启用了具有更高精度和特异性的目标基因组编辑,并且在疟原虫属中具有大量先进的基因组工程。在这里,我们通过在寄生虫中整合了Dicre盒和荧光标记来开发新的Berghei寄生虫线,以组成表达Cas9。由于CRISPR/CAS9和DICRE的双重整合,这些新系列允许同时进行无与伦比的基因修饰和条件调节。为了说明这种新工具的多功能性,我们有条件地淘汰了编码贝尔格(P. Berghei)类似claudin的apicomplexan微米蛋白(夹具)的基本基因,并确认了夹具在侵入红细胞细胞中的作用。
1个单位进化和寄生姐妹(UNEREP),国际研究中心,弗朗西斯维尔(CIRMF),弗朗西维尔bp 769,加蓬; biteghebiteghe@gmail.com(J.-C.B.-B.-E.); borislendongo@yahoo.fr(J.B.L.W。); onouaseinnat@gmail.com(S.-S.O.); lyds_ass@yahoo.fr(L.S.O.-L。); mpega_mb2@yahoo.fr(c.n.m.m.n.); charleneklc@gmail.com(l.c.k.); lekana_jb@yahoo.fr (J.-B.L.-D.) 2 Laboratory of molish and cellular biology (LABMC), University of Masuku Sciences and Techniques, Franceville BP 943, Gabon 3 unit of Emerging Viral Diseases (UMVE), International Research Center M É DICALES DE FRANCEVILLE, Franceville BP 769, Gabon; s_lekana@yahoo.fr 4 Mivegec,IRD,CNRS,Montpellier大学,法国蒙彼利埃34900; rougeron.virginie@gmail.com 5博士学位学校在热带感染力学领域,法国维尔bp 876,Gabon 6 D Ettement de Parasitologie-Mycologie,Universitédesciencesde des Sciences de laSanté大学,Libreville BP 4008,Gabon * sostomence:Imboumykarl@imboumykarl@imboumykarl@imboumykarl@imboumykarl@n n@gmail@gmail@gmail;这样的。: +241-660-72638
摘要背景:人类疟原虫恶性疟原虫中异染色质的维持、调节和动态变化因其在互斥毒力基因表达和关键发育调节因子沉默中的调节作用而受到越来越多的关注。染色质免疫沉淀后测序 (ChIP-seq) 等全基因组分析的出现有助于了解染色质组成;然而,即使在模型生物中,ChIP-seq 实验也容易受到由潜在染色质结构引起的内在实验偏差的影响。方法:我们进行了一项对照 ChIP-seq 实验,重新分析了之前发表的 ChIP-seq 数据集,并比较了不同的分析方法,以表征恶性疟原虫全基因组分析的偏差。结果:我们发现用于 ChIP-seq 标准化的输入对照样本中的异染色质区域在整个恶性疟原虫基因组的测序覆盖率方面系统性地代表性不足。这种代表性不足,加上非特异性或低效的免疫沉淀,可能导致在这些区域识别出假富集和峰值。我们观察到,在特定和有效的 ChIP-seq 实验中,背景水平也会出现这种偏差。我们进一步报告了不同的读取映射方法如何扭曲高度相似的亚端粒区域和毒力基因家族中的测序覆盖率。为了改善这些问题,我们讨论了可用于表征真正的染色质相关蛋白的正交方法。结论:我们的结果强调了染色质结构对寄生虫全基因组分析的影响以及谨慎的必要性