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![从强直性脊柱炎的遗传学到新的生物学和药物靶标的发现
基因编辑，身份和收益
arxiv：2103.14564v1 [cond-mat.supr-con] 2021年3月26日
绿色氨作为空间能量矢量：评论
光化学探针鉴定刺猬酰基转移酶（HHAT）中的小分子抑制剂结合位点**
使用大脑刺激靶向ADHD执行功能的神经元相关
幼儿园量子力学毕业生
测量高功率激光脉冲的轨道角动量
大脑刺激 - 牛津大学研究档案
对英国和英国频道群岛实用潮汐水源资源的审查
疾病x疫苗生产和供应链
遗传研究对同性性的遗传学伦理...
将风和太阳能放在他们的位置
自然投资组合|报告摘要
CRISPR-CAS9编辑用于病毒工程和... 的应用
脑损伤后的数值认知：亚列表和算术能力之间是否存在关系？
在被困的量子网络节点中稳健的量子内存](/simg/9\989e4def6652e0f83e79531ceb1de7d86519ee88.webp)
从强直性脊柱炎的遗传学到新的生物学和药物靶标的发现 基因编辑，身份和收益 arxiv：2103.14564v1 [cond-mat.supr-con] 2021年3月26日 绿色氨作为空间能量矢量：评论 光化学探针鉴定刺猬酰基转移酶（HHAT）中的小分子抑制剂结合位点** 使用大脑刺激靶向ADHD执行功能的神经元相关 幼儿园量子力学毕业生 测量高功率激光脉冲的轨道角动量 大脑刺激 - 牛津大学研究档案 对英国和英国频道群岛实用潮汐水源资源的审查 疾病x疫苗生产和供应链 遗传研究对同性性的遗传学伦理... 将风和太阳能放在他们的位置 自然投资组合|报告摘要 CRISPR-CAS9编辑用于病毒工程和... 的应用 脑损伤后的数值认知：亚列表和算术能力之间是否存在关系？ 在被困的量子网络节点中稳健的量子内存
全基因组关联研究（GWAS）已鉴定出113个影响发生连性脊椎炎（AS）风险的单核苷酸多态性（SNP），并且正在进行的GWAS研究可能会识别100 +新的风险基因座。由于以下挑战，将遗传发现向新型疾病生物学和治疗的翻译很难：（1）在确定与疾病相关SNP调控的因果基因时的困难，（2）（2）在确定相关细胞型的caus型基因的差异方面的困难（2）确定其功能（3），（3）（3）询问因果基因在疾病生物学中的功能作用。本评论将讨论最近的进展和未解决的问题，重点是这些挑战。此外，我们将回顾生物学的研究以及与IL-23/IL-17途径相关的药物的开发，该途径是由AS遗传学部分驱动的，并讨论从这些研究中可以从未来的AS-CYPAID基因的功能和翻译研究中学到的知识。
克唑替尼治疗晚期非小细胞肺癌中 MET 外显子 14 突变或 MET 扩增：一项回顾性、单一机构经验
摘要引言：非小细胞肺癌（NSCLC）占肺癌的大多数，并且是美国癌症相关死亡的主要原因。酪氨酸激酶受体c-MET的改变与许多NSCLC进展和转移有关。克唑替尼和其他酪氨酸激酶抑制剂（TKI）已用于NSCLC治疗，但效果有限。方法：在这项回顾性观察研究中，我们分析了2015年1月至2020年1月期间在索罗卡大学医学中心确诊为肺癌患者的数据。我们调查了患者的特征，包括疾病相关突变类型和对不同TKI治疗的反应的中位生存期。结果：共纳入780例肺癌患者，其中134例患有小细胞肺癌，646例患有NSCLC。在 NSCLC 患者中，403 人被诊断为晚期或转移性疾病，374 人接受了分子检测。我们确定了 16 名患者患有
解读非编码变异：研究其在基因调控和人类疾病中的作用的最新方法
全基因组关联研究 (GWAS) 已经绘制了非编码基因组中 90% 以上的疾病和数量性状相关变异。非编码调控 DNA（例如启动子和增强子）和 RNA（例如 5 ′ 和 3 ′ UTR 和剪接位点）对于调节时间和组织特异性基因表达至关重要。非编码变异可能会通过改变顺式调控元件的分子识别影响生物体的表型，从而导致基因失调。然而，确定非编码变异、基因调控和人类疾病之间的因果关系仍然具有挑战性。已经开发了实验和计算方法来了解转录和转录后水平上非编码变异干扰所涉及的分子机制。本综述讨论了评估疾病相关单核苷酸变异 (SNV) 的最新方法，并确定了它们对转录因子 (TF) 结合、基因表达、染色质构象、转录后调控和翻译的影响。
先进的 SPR 应用加速基于片段的药物发现中的命中识别和验证
是分子量为 500 Da 的可能化合物的估计数量。即使与最多 10 6 个分子的工业级小分子库相比，片段库也大大简化了筛选过程。我的研究小组将 FBDD 原则应用于与氧化还原信号、氧化应激和炎症有关的疾病相关蛋白质-蛋白质相互作用。这些靶标在多发性硬化症、中风、肺部炎症、纤维化、类风湿性关节炎和某些癌症等疾病中发挥着重要作用。FBDD 分为两个阶段：1) 片段筛选以确定初始匹配项，2) 随后对这些匹配项进行表征和优化，使其成为真正的线索。我们使用灵敏的生物物理方法，如表面等离子体共振 (SPR) 和基于配体的 NMR，来筛选大约 2,500 个分子的片段库。在此阶段，我们期望低亲和力匹配项处于高微摩尔或低毫摩尔亲和力范围内。然后我们通过更多轮 SPR 测试或其他分析来验证匹配结果，
Lawrence M. Brass，医学博士临床研究培训......
资格要求 1. 就本奖学金而言，研究定义为“以患者为导向，以人类为参与者开展的研究，或专门为开发治疗方法或增强神经系统疾病诊断而设计的转化研究。这些研究领域包括流行病学或行为学研究、临床试验、疾病机制研究、新技术开发以及卫生服务和结果研究。” 如果主要目标是开发疗法、诊断测试或其他工具来预防或缓解神经系统疾病，也鼓励开展不直接涉及人类或人体组织的疾病相关研究。 2. 获奖者必须是 AAN 会员，对神经系统研究的学术生涯感兴趣，拥有医学博士、哲学博士或同等博士级临床学位，并且在本奖项开始前 5 年内完成临床住院医师培训或博士学位（2025 年 7 月 1 日）。如果您已完成住院医师培训和博士学位，您的资格取决于您完成住院医师培训的时间。如果您在住院医师培训后完成了任何类型的奖学金，您的资格仍取决于您完成住院医师培训的日期。
疾病网络中的基因靶向
整个转录组的分析已成为分子生物学的基石，也是表征临床表型和识别疾病亚型的宝贵工具。随着我们不再局限于简单的比较，而是考虑高阶相互作用和关联网络，对这些数据的分析变得越来越复杂。基因调控网络模拟了转录因子和基因的调控关系，并允许识别疾病系统中差异调控的过程。从这个角度来看，我们讨论了基因靶向评分，它衡量推断的调控网络相互作用的变化，以及它们在识别疾病相关过程中的用途。此外，我们提供了一个胰腺导管腺癌的示例分析，展示了基因靶向评分识别复杂表型之间差异过程的能力；如果只进行差异表达分析，这些过程可能会被忽略。这个例子表明，基因靶向评分是基因表达分析在疾病和其他复杂表型表征中的宝贵补充。
受量子启发的从头药物设计方法
药物设计的目的是寻找能与特定蛋白质（与特定疾病相关）结合并阻断（或增强）蛋白质活性的新分子，从而改变疾病的进程。药物分子还具有其他某些必要的特性，例如选择性和安全性。由于药物开发成本不断增加以及潜在候选药物的失败率很高，因此需要不断开发新的创新药物。例如，进入临床试验的新药的 FDA 批准率仅为 19% [1] 。在过去的几年里，人们对从新型化学中寻找候选药物产生了浓厚的兴趣，这促使设计师探索越来越大的化学空间 [2] 。然而，对于大多数计算机系统来说，探索大型化学空间需要太长时间，尤其是那些包含超过 10 亿个分子的化学空间。我们在此介绍使用量子启发技术来搜索大型化学空间，作为显著加速任何计算药物设计活动的第一步的手段。
受量子启发的从头药物设计方法
药物设计的目的是寻找能与特定蛋白质（与特定疾病相关）结合并阻断（或增强）蛋白质活性的新分子，从而改变疾病的进程。药物分子还具有其他某些必要的特性，例如选择性和安全性。由于药物开发成本不断增加以及潜在候选药物的失败率很高，因此需要不断开发新的创新药物。例如，进入临床试验的新药的 FDA 批准率仅为 19% [1] 。在过去的几年里，人们对从新型化学中寻找候选药物产生了浓厚的兴趣，这促使设计师探索越来越大的化学空间 [2] 。然而，对于大多数计算机系统来说，探索大型化学空间需要太长时间，尤其是那些包含超过 10 亿个分子的化学空间。我们在此介绍使用量子启发技术来搜索大型化学空间，作为显著加速任何计算药物设计活动的第一步的手段。
检测 HDR 后的有害靶向效应 - ...
CRISPR 基因组编辑是一种很有前途的转化研究工具，但可能会导致不良的编辑结果，既可能在编辑的位点上命中目标，也可能在其他基因组位点上脱靶。在这里，我们研究了通过同源定向修复 (HDR) 和使用非同源末端连接 (NHEJ) 的基因编辑插入疾病相关突变后，人类干细胞中有害的靶向效应 (OnTE) 的发生情况。我们在多达 40% 的编辑克隆中发现了逃避标准质量控制的大型单等位基因基因组缺失和杂合性缺失。为了可靠地检测此类事件，我们描述了简单、低成本且广泛适用的定量基因分型 PCR (qgPCR) 和基于单核苷酸多态性 (SNP) 基因分型的工具，并建议将它们用作编辑后的额外质量控制。这将有助于确保编辑位点的完整性并提高 CRISPR 编辑的可靠性。