携带不同 KRAS 突变的癌细胞对 SHP2 抑制的敏感性也不同。《自然通讯》最近发表的一项研究揭示了携带 KRAS Q61H 突变的癌细胞对 SHP2 抑制剂(SHP2i)的潜在耐药机制。1这项研究表明,KRAS Q61H 突变通过将 KRAS 与 SHP2 介导的上游核苷酸交换因子(鸟嘌呤核苷酸交换因子 [GEF])/GTPase 活化蛋白 (GAP) 调控分离而使癌细胞对 SHP2i 产生耐药性,为治疗携带 KRAS Q61H 突变的癌症提供了新的见解。KRAS 是突变最常见的 RAS 亚型,是一种编码小 GTPase 转导蛋白的原癌基因。响应上游信号,KRAS 可以通过 GEF(例如 Son of Sevenless (SOS) 或 GAP)在无活性的二磷酸鸟苷 (GDP) 状态和活性的三磷酸鸟苷 (GTP) 状态之间切换。2 KRAS 突变主要发生在密码子 12、13 或 61,占 RAS 突变的 86%。特别是,谷氨酰胺 61 通过定位攻击水分子和稳定水解反应的过渡态,在催化过程中起直接作用。3,4 通常,突变的 KRAS 可通过影响 GAP 介导的 GTP 水解导致活性 GTP 结合的 KRAS 积累,从而导致 RAS – RAF – MEK – ERK 通路过度活化,并伴有不受控制的细胞增殖。4 KRAS 突变在许多人类癌症中很常见,尤其是胰腺癌、非小细胞肺癌和结直肠癌。值得一提的是,特定的 KRAS 突变可能导致肿瘤患者的不同预后和治疗反应。因此,KRAS 突变对癌症治疗研究人员提出了挑战。2,4,5 从历史上看,KRAS 一直被认为是“不可成药”的药物靶点,因为它不包含经典的可用于药物的小分子结合口袋。6 通过关闭致癌基因,已经开发出用于抗癌药物开发的间接和直接方法
摘要:与开发新药相比,将 FDA 批准的药物用于新适应症是一种更快、更经济的寻找癌症治疗新药的方法。重新利用药物在药理学方面是有利的,因为这些药物已经拥有与其药代动力学相关的大量数据,从而有助于它们针对不同疾病的审批程序。多项研究报告了舍曲林单独和联合使用对不同类型的癌细胞系的良好抗癌作用。在这里,我们对舍曲林对不同人类癌细胞的抗癌潜力进行了文献综述,更具体地说是对肺癌、结直肠癌、乳腺癌、肝细胞癌、白血病、脑癌、皮肤癌、口腔癌、卵巢癌和前列腺癌的抗癌潜力。总之,这些发现表明,舍曲林除了是一种已确定的 P 糖蛋白调节剂外,还能降低细胞活力、增殖、迁移和侵袭,诱导细胞凋亡,并导致不同类型的癌细胞细胞周期停滞。研究还发现,这种药物能够调节自噬,引起 DNA 碎片化,并诱导自由基氧 (ROS) 形成。此外,研究还发现,这种药物靶向肿瘤发生中涉及的重要细胞通路,如 TNF-MAP4K4-JNK 通路、抗凋亡通路 PI3K/Akt/mTOR 和 AMPK/mTOR 轴。这种药物还会干扰 TCTP/P53 反馈回路和细胞质游离 Ca 2+
摘要:固体癌细胞对化学疗法和靶向疗法的耐药性不仅是由于癌细胞的突变状态,而且还因为肿瘤生态系统的基质细胞的共同存在,例如免疫细胞,脉管系统和癌症相关性纤维细胞(CAF)。癌细胞和CAF的相互教育有利于肿瘤的生长,生存和侵袭。线粒体功能控制,包括线粒体代谢,氧化应激和凋亡应激对于这些不同的肿瘤进展步骤至关重要。在这篇综述中,我们关注CAF如何通过调节癌细胞代谢功能和线粒体凋亡来参与癌症进展。我们强调,CAF的线粒体影响其激活状态和促肿瘤的影响。因此,我们主张理解线粒体介导的肿瘤 - 质性相互作用提供了考虑通过直接在肿瘤和 /或基质细胞中靶向这些相互作用或线粒体来改善当前治疗的癌症疗法的可能性。
*相应的作者。sahan@mskcc.org(N。Saha),nikolovd@mskcc.org(d.b.Nikolov)。信用撰稿人贡献声明Nayanendu Saha:概念化,方法论,调查,验证,写作 - 审查和编辑。du-san Baek:方法,调查,数据策划,验证。Rachelle P. Mendoza:资源,数据策划,调查。Dorothea Robev:调查,方法论。Yan Xu:调查,方法论。 Yehuda Goldgur:方法,软件,验证。 M. Jason de la Cruz:资源,数据策划。 Elisa de Stanchina:监督,方法论,调查。 Peter W. Janes:正式分析。 Kai Xu:方法,软件,验证。 Dimiter S. Dimitrov:监督,正式分析,资金获取。 Dimitar B. Nikolov:正式分析,资金获取,写作 - 原始草案,监督,项目管理,验证。Yan Xu:调查,方法论。Yehuda Goldgur:方法,软件,验证。M. Jason de la Cruz:资源,数据策划。Elisa de Stanchina:监督,方法论,调查。Peter W. Janes:正式分析。Kai Xu:方法,软件,验证。 Dimiter S. Dimitrov:监督,正式分析,资金获取。 Dimitar B. Nikolov:正式分析,资金获取,写作 - 原始草案,监督,项目管理,验证。Kai Xu:方法,软件,验证。Dimiter S. Dimitrov:监督,正式分析,资金获取。Dimitar B. Nikolov:正式分析,资金获取,写作 - 原始草案,监督,项目管理,验证。
补充方法:数据集和分析肿瘤学临床试验中细胞疗法的数据是从GlobalData的试验数据库中收集的,随后由CRI IO研究所(CRI)基于CRI IO分析的定义对不同的免疫疗法类型和药物目标信息进行了策划。数据截止是2024年3月。自身免疫性疾病中的细胞治疗试验来自GlobalData的试验数据库,其截止日期为2024年。Cell therapies were classified into 9 main modalities based on the cell type and mechanisms of action being leveraged: (1) CAR-T cells, (2) Other T cells, (3) Cell-based Cancer Vaccines, (4) CAR-NK cells, (5) Other NK cells, (6) Bacteria, (7) Stem cells, (8) Other cell types and (9) Undisclosed cell therapy type.“其他T细胞”类别已进一步分为这些资产的可用信息的子类别:GAMA/DELTA TCR T细胞,TCR T细胞,肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)和其他/未指定的T细胞。按身体位置/系统按身体位置/系统进行分类:https://www.cancer.gov/types/by-body-location real-world数据是从IQVIA前专用数据库中获得的“ CAR T-Cell Monitor”(Car t-cell Monitor)(中心Insights insights and Insights insights insights insights insights and corseiral Insignss)。该数据库提供了有关从参考肿瘤学家到管理这些疗法的高级治疗中心的患者旅程的见解。这项全球联合研究提供了有关沿该连续体的关键接触点的定量数据。美国数据来源是季度主要研究(治疗模块:n = 51个肿瘤学家,参考模块:n = 100个肿瘤学家)和公开可用的数据(销售,定价,中心)。在补充图12中,Q4 2023调查数据与https://doi.org/10.10.10.10.1038/d41573-022-00095-1中提出的Q4 2021调查结果进行了比较,这些调查结果是通过IQVIA使用可比方法收集的。2014年至2023年之间有关肿瘤学细胞疗法交易的数据是从2024年1月截至2024年1月的IQVIA专有数据库“ IQVIA Pharma Deals”获得的。分析,表和图形表示是通过使用Tableau进行的,除了补充图12、13和14中的表格和图形表示,这些图12、13和14是用功率点生成的。
随着合成生物学的努力变得更加雄心勃勃,活细胞中预定义功能的工程需要越来越准确的工具。此外,遗传构建体的表型性能的表征需要细致的测量和广泛的数据获取,以实现进食数学模型和沿设计构建测试生命周期的匹配预测。在这里,我们开发了一种遗传工具,可以简化高通量转座子插入测序(TNSEQ):携带HIMAR1 Mariner Transposase System的PBLAM1-X质粒载体。这些质粒源自Mini-TN5转座子矢量PBAMD1-2,并按照标准欧洲矢量体系结构(SEVA)格式的模块化标准构建。为了展示它们的功能,我们分析了60个土壤假单胞菌putida kt2440克隆的测序结果。新的PBLAM1-X工具已经包含在最新的SEVA数据库版本中,在这里我们使用实验室自动化工作流程描述其性能。
摘要:微管 (MT) 是一种由 α 和 β 微管蛋白异二聚体组成的高度动态结构,参与细胞运动和细胞内交通,对细胞分裂至关重要。在细胞内,微管并不统一,因为它们可以由不同的微管蛋白同种型组成,这些同种型经过翻译后修饰并与不同的微管相关蛋白 (MAP) 相互作用。这些不同的内在因素影响着微管的动态。微管靶向剂 (MTA) 等外在因素也会影响微管动态。MTA 可分为两大类:微管稳定剂 (MSA) 和微管不稳定剂 (MDA)。因此,微管骨架是抗癌治疗的重要靶点。本综述讨论了决定正常细胞和癌细胞中微管动力学的因素,并描述了微管-MTA 相互作用,强调了微管蛋白异构体多样性和翻译后修饰在 MTA 反应中的重要性以及这种现象的后果,包括耐药性的发展。
摘要背景/目的:染色体不稳定性是不同类型癌症(包括结直肠癌)进展的一个众所周知的因素。染色体不稳定性导致严重的核型重排和非整倍体。四倍体构成了致癌过程中多倍体/非整倍体级联的中间阶段,四倍体细胞对化疗特别有抵抗力。抑制有丝分裂蛋白 polo 样激酶 1 (PLK1) 是否会阻止四倍体结肠癌细胞的存活尚不清楚。方法:用 siPLK1 转染二倍体和四倍体细胞或用 PLK1 抑制剂 Bi2536 与纺锤体毒药联合处理。通过结晶紫染色和克隆形成测定评估细胞毒性。流式细胞术评估分析了许多细胞凋亡参数和细胞周期阶段。使用 CompuSyn 软件计算了 Bi2536 与紫杉醇、长春新碱或秋水仙碱之间的协同作用。结果:抑制或消除 PLK1 可阻止结肠癌细胞(特别是四倍体细胞)的存活。PLK 抑制引起的细胞死亡是由于有丝分裂滑移,随后激活了细胞凋亡的内在途径。我们进一步证明,用 PLK1 抑制剂和微管聚合抑制剂长春新碱或秋水仙碱(而不是微管解聚抑制剂紫杉醇)联合治疗四倍体结肠癌细胞会产生致命的协同效应。结论:PLK1 抑制与微管靶向化学物质相结合,可作为针对四倍体癌细胞的有效治疗策略。
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人类肿瘤是复杂的生态系统,由多种遗传克隆和在复杂肿瘤微环境中进化的恶性细胞状态组成。单细胞RNA-sequencing(SCRNA-Seq)提供了一种剖析这种复杂生物学的策略,并使我们在过去十年中了解肿瘤生物学的能力进行了革命。在这里,我们反映了人类肿瘤中SCRNA-SEQ的这一十年,并高光照这些研究收集的一些强大的见解。我们首先关注鲁棒定义癌细胞态及其多样性的计算方法,并突出了跨癌症类型的基因表达内肿瘤内异质性(EITH)的一些最常见的模式。然后,我们在定义和命名此类EITH程序的领域中讨论了歧义。最后,我们重点介绍了关键的发展,这些发展将促进未来的研究并在临床环境中更广泛的这些技术实施。