监测粪便社区的传统方法是劳动和专业知识密集的,并且通常效率低下。最近,非侵入性环境DNA(EDNA)元法编码已被试用,用于粪便相关无脊椎动物的生物监测(Sigsgaard等。,2021年)。结果是有希望的,有几个官能团,并且生态关联很明显。在这里,我们使用类似的EDNA技术进行了一个小型试点项目,以评估使用牲畜粪便样品监测英国牧场的粪甲虫和更广泛的无脊椎动物社区。该项目的成功可以证明粪便无脊椎动物DNA调查的倾向,以监测土壤管理实践和再生耕作的影响,从而导致土壤生物多样性增加。
。cc-by 4.0国际许可证(未经同行评审证明)获得的是作者/资助者,他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可,以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人,该版本于2024年3月18日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.03.18.584290 doi:biorxiv preprint
我在追求研究生学习的同时,在2016年参与了ASPET。当时我的Adivsor Alan Smrcka博士鼓励我提交摘要并参加2017年实验生物学(EB)会议的ASPET年度会议。我在芝加哥的EB 2017上介绍了我的作品,并参与了“科学三月”,发现了介绍研究和与其他科学家互动的价值。这种经历激发了我继续参与随后的EB会议。在2020年,当我被选为ASPET华盛顿研究员时,我与Aspet的互动加深了。这项奖学金为我提供了一个机会,为美国科学人才管道中的年轻和外国科学家倡导,并通过美国国会大厦的出版物和会议有助于对资金政策优先事项的认识。从那时起,我就在社会内的多个委员会中积极任职,包括年轻的科学家和科学政策委员会。
抽象背景结直肠癌(CRC)构成了重大的医疗挑战,占全球癌症病例的近6.1%。通过使用创新生物标志物进行的人口筛查促进的早期检测对于MITIGAT的CRC发病率是关键的。与CRC阴性对应物(CNS)相比,这项研究旨在仔细检查CRC阳性个体(CP)的粪便和唾液微生物组,以通过微生物生物标记物来增强CRC诊断。材料和方法总共从伊朗德黑兰的Shahid Beheshti医学科学大学Taleghani医院收集了80个口头和粪便样品,其中包括接受筛查的CPS和CNS。使用16S rRNA测序测定法进行了微生物介绍,并在Illumina novaseq平台上采用Nextera XT Index套件。结果在CP的唾液和粪便样品中观察到了不同的微生物谱,与各种分类水平的CNS(包括门,家庭和种类)的粪便显着不同。CPS的唾液样品表现出大量的Calothrix Parietina,颗粒状Adiacens,Rothia dentocariosa和Rothia Mucilaginosa,在CNS中没有。此外,在CPS的粪便中,Lachnospileceae和Prevotellaceae明显更高,而CPS唾液中的fusobacteria phylum显着升高。相反,与CNS相比,非致病细菌akkermansia粘蛋白iphila的CPS粪便样品显着降低。关键字结直肠癌,口腔微生物群,粪便菌群,早期检测,16S rRNA测序通过一致选择唾液和粪便微生物的结论,基于平均值降低的Gini值,并采用唾液的逻辑回归,并支持粪便模型,我们成功地开发了一种微生物群检测,具有提高的敏感性和提高crc检测的敏感性和特异性。
使用宿主特异性细菌的微生物源跟踪(MST)和线粒体DNA(mtDNA)标记是一种有效的工具,可以识别环境水中粪便污染的来源。这项研究评估并更新了先前报道的七个宿主特异性细菌标记的性能(三个人,两个牛和两个特定于猪)。此外,评估了牛特异性牛MtDNA和猪特异性猪MTDNA标记物的性能,然后应用于日本Yamanashi县收集的河水样品的MST。我们收集了48个粪便源样品,包括原始缝纫,继发处理的污水,一种家庭废水处理罐的废水,猪粪便,猪废水和牛粪便,这些污水是使用宿主型螺旋体和mtdna标记进行了定量分析的。bachum和gyrb标记物(人类特异性),牛和牛mtDNA标记(牛特异性)以及猪2BAC和猪MTDNA标记(特异性)是表现最佳的标记。然后,将这些选定的标记物应用于MST,以鉴定在21个地点收集的59个河水样品中的粪便污染源。分别为至少一个人,牛和猪标记的20(95%),21(100%)和16个(76%)位点为阳性,这表明需要立即采取行动和监测以控制粪便污染。
多发性骨髓瘤是一种复杂的疾病,呈现不同的临床阶段和风险水平。这些包括不确定意义(MGU)的单克隆性γ-以及多发性骨髓瘤,也称为无症状骨髓瘤。[1] MGU是一种通常的良性疾病,每年约1%至2%的症状性浆细胞疾病转化率。[2]多发性骨髓瘤闷烧代表了从mgus到弗兰克多发性骨髓瘤的发展;在头五年中,它每年都有转化为多发性骨髓瘤的风险。[2]尽管这两个实体都缺乏多发性骨髓瘤的许多临床特征,但它们最终可能具有需要治疗的特征。相比之下,有症状的多发性骨髓瘤由特定的临床症状,血液或尿液中单克隆免疫球蛋白蛋白的积累以及包括肾病和神经病在内的相关器官功能障碍。首字母缩写,螃蟹,用于反映多发性骨髓瘤的标志特征:钙高度;肾功能不全;贫血;以及骨骼疾病。[3]肌瘤前浆细胞最初需要与骨髓微环境相互作用,但是在疾病进展过程中,会发展出在骨髓外增殖的能力,表现为表现为肿瘤外骨髓瘤和血浆细胞白血病。这些“骨髓独立”细胞代表了从正常骨髓瘤到多发性骨髓瘤的多步化过程中的末端阶段。
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3。抗寄生虫治疗后重新定量粪便检查。 驱虫后的粪便样品采集的建议时间取决于活性成分类或 活动成分:抗寄生虫治疗后重新定量粪便检查。驱虫后的粪便样品采集的建议时间取决于活性成分类或活动成分:
背景和目的:粪便菌群 - 基于粪便的疗法包括常规的粪便菌群移植和美国食品和药物管理 - 批准的疗法,粪便菌群Live-JSLM和粪便菌群孢子Live-BRPK。美国胃肠道学协会(AGA)制定了该指南,以提供有关使用粪便微生物群 - 在患有卵泡菌群的基于粪便菌群疗法的建议;严重到暴发的C差异感染;炎症性肠道疾病,包括囊炎;和肠易激综合征。方法:该指南是使用等级(评估,评估,开发和评估)框架制定的,以优先考虑临床问题,确定以患者为中心的结果并进行证据综合。指南面板使用证据到决策框架来开发用于在特定的胃肠道条件下使用基于粪便菌群的疗法的建议,并为临床实践提供了实施考虑。结果:指南面板提出了7个建议。在具有复发性C差异感染的免疫能力成年人中,AGA建议选择使用基于粪便菌群 - 基于粪便的疗法,以完成护理标准抗生素以防止复发。在有反复发作的C差异感染的轻度或中度免疫功能低下的成年人中,AGA建议选择使用常规的粪便微生物群移植。在严重免疫受损的成年人中,AGA建议反对使用任何基于粪便菌群的疗法,以防止复发性C差异。在患有严重或暴发的C差异的成年人中,AGA建议选择使用常规的粪便菌群移植。AGA建议不使用常规的粪便菌群移植作为炎症性肠道疾病或肠易激综合征的治疗,除非在临床试验的背景下。结论:基于粪便菌群 - 基于粪便的疗法是预防精选患者反复发作的C差异的有效疗法。常规的粪便微生物移植是针对患有严重或暴发的C差异感染的精选成年人的辅助治疗,对护理抗生素的标准不反应。粪便微生物群移植尚不能推荐。
最近已经建立了针对患有胃肠道和代谢性疾病的人类的新鲜粪便银行,并正在持续努力建立第一家兽医新鲜冻结的凳子银行。新鲜的冷冻储存的粪便提供了提高能力和可访问性高质量最佳供体粪便材料的优势。尚未在狗中报道过冷冻犬粪在粪便微生物组组成和多样性方面的稳定性,这为这项研究提供了基础。我们假设,与在冷冻前评估的基线样品相比,将粪便微生物组成和健康狗的多样性保持稳定,持续12个月。粪便样品,手动匀浆,冷冻保存在20%的甘油中并等分,在液氮中冷冻,并在-20°C或-80°C下储存3、6、6、9和12个月。在基线和存储期间后,在粪便DNA提取之前将等分试样融化并用单丙嗪治疗。在治疗组中比较了长阅读16S-RRNA扩增子测序,细菌群落组成和多样性。我们证明,从20个显然健康的狗中收集的新鲜固定犬凳可以在-80°C中存储长达12个月,而微生物群落组成和多样性的变化很小,并且在-80°C的储存量最小,而在-20°C下的存储量优于存储。我们还发现,狗之间的差异对社区组成和多样性的影响最大。某些细菌类群的相对丰度,包括已知的短链脂肪酸生产者,随着特定的储存温度和持续时间的差异很大。需要进一步的工作来确定细菌群落组成和多样性不同的粪便供体材料以及持续时间的多样性是否可能导致临床疗效的差异,以造成粪便微生物群移植的特定临床指示。