这种称为病毒体的颗粒可用于将所需的遗传物质传递到具有广泛应用的细胞中,包括基因疗法和工程生物学。专门为所需的行动部位提供药物构成了重大挑战,并且是药物开发的关键,科学家试图在不引起负面副作用的情况下实现所需的治疗作用。这项工作有可能为这项挑战做出解决方案。
作者的完整列表:Alessandri,Giulia;帕尔马大学,兽医医学系米兰,莱昂纳多克里斯蒂安·曼卡贝利;帕尔马大学,生命科学Mangifesta,Marta;帕尔马大学,生命科学Lugli,Gabriele Andrea;帕尔马大学,化学,生命科学与环境可持续性系Alice,Alice;帕尔马大学,Genprobio Srl Duranti,Sabrina Turroni,Francesca Ossiprandi,Maria;帕尔马大学,医学兽医科学系,杜威(Douwe);爱尔兰国立大学,Marco微生物学系;帕尔马大学生命科学
宿主和肠道微生物群落之间的抽象共生对于人类健康至关重要。这种共生中的破坏与胃肠道疾病有关,包括炎症性肠病,以及淋巴结外疾病。不平衡的肠道微生物组或肠道营养不良以多种方式促进疾病频率,严重程度和进展。微生物组分类分析和代谢组学方法极大地改善了我们对肠道生物的理解。但是,仍需要澄清肠道营养不良的机制。这篇综述的目的是介绍寄生虫感染后或在改变盆地细胞变化的情况下形成的新的参与者和机制,揭示了Paneth和Tuft细胞之间存在关键的串扰以控制微生物组组成。
“我们知道从诺如病毒感染中受到微生物群保护的成年小鼠,我们知道新生儿很容易受到严重的诺罗维斯病毒的攻击,” UF新兴病原体研究所的成员,在UF医学学院的教授,UF医学学院的一名近期对Norovelus的Microb the Mrob the Mrob的研究。“因此,这使我们提出了一个问题:新生儿很容易受到诺如病毒的影响,因为他们的肠道菌群不成熟?”
利益冲突Philipp Karschnia-从Ludwig-Maximilians-University慕尼黑的“研究与教学支持计划”(Föfole)授予了“ LMU医学研究与科学学会”(Wifomed)(Wifomed)的“弗里德里希·贝尔·贝尔(Friedrich-Baur) - 贝尔·贝尔(Friedrich-Baur-Baur-Roundation)和“ Familie mehdontation”。Emilie le Rhun -Elr获得了Abbvie,Adastra,Daiichi Sankyo,Leo Pharma,Seagen和Tocagen的讲座或顾问委员会的酬金。Michael Vogelbaum- Infuseon Therapeutics的间接股权和患者特许权使用权益。来自Celgene和Cellinta的Honararia。从Celgene和Oncosynergy获得的研究赠款。Martin van den bent- Celgene,BMS,Agios,Boehringer,Abbvie,Abbvie,Bayer,Carthera,Nerviano和Genenta的顾问。Stefan J. Grau - 未报告披露。Matthias Preusser – MP has received honoraria for lectures, consultation or advisory board participation from the following for-profit companies: Bayer, Bristol- Myers Squibb, Novartis, Gerson Lehrman Group (GLG), CMC Contrast, GlaxoSmithKline, Mundipharma, Roche, BMJ Journals, MedMedia, Astra Zeneca, AbbVie,礼来(Lilly),梅达德(Medahead),戴伊(Daiichi Sankyo),赛诺菲(Sanofi),默克·夏普(Merck Sharp&Dome),托卡根(Tocagen),阿法斯特拉(Adastra)。以下营利性公司支持MP向其机构支付的临床试验和合同研究:Böhringer-Ingelheim,Bristol-Myers Squibb,Roche,Daiichi Sankyo,Daiichi Sankyo,Merck Sharp&Dome,Novocure,Novocure,GlaxoSmithkline,Abbvie。Riccardo Soffietti-未报告披露。Louisa von Baumgarten - 尚无报告。 Manfred Westphal - 未报告披露。Louisa von Baumgarten - 尚无报告。Manfred Westphal - 未报告披露。Michael Weller-来自Abbvie,Adastra,Merck,Sharp&Dohme(MSD),默克(EMD),Novocure,Piqur和Roche的研究赠款。荣誉仪式或咨询委员会的参与或咨询咨询,来自Abbvie,Adastra,Basilea,Bristol Meyer Squibb(BMS),Celgene,Merck,Sharp&Dohme(MSD),Merck(EMD),Novocure,Orbus,Roche,Roche,Tocagen和Ymabs和Ymabs和Ymabs和Ymabs和Ymabs。Joerg -Christian Tonn- Brainlab和Carthera的顾问/发言人Honoraria,以及Springer Publisher Intl的特许权使用费。
体细胞变体检测是癌症基因组学分析的组成部分。尽管大多数方法都集中在短阅读测序上,但长阅读技术现在在重复映射和变体相位方面具有潜在的优势。我们提出了一种深度学习方法,一种深度学习方法,用于从短读和长阅读数据中检测体细胞SNV,插入和缺失(indels),具有用于全基因组和外显子组测序的模式,并且能够以肿瘤正常,唯一的肿瘤正常,ffpe pppe的样本进行运行。为了帮助解决公共可用培训的缺乏和基准测试数据以进行体细胞变体检测,我们生成并公开提供了一个与Illumina,Pacbio Hifi和Oxford Nanopore Technologies的五个匹配的肿瘤正常细胞线对的数据集,以及基准的变体。在样本和技术(短读和长阅读)中,深度态度始终优于现有呼叫者,特别是对于Indels而言。
抽象理解雕刻鱼类肠道微生物组的因素是挑战,尤其是在以高环境和宿主基因组复杂性为特征的自然种群中。然而,密切相关的宿主是通过突显的生物学和共晶发育模式来解解宿主进化史对微生物组组装的贡献的宝贵模型。在这里,我们提出,最近在南大洋的几种竖琴物种的多样化将允许检测宿主与其微生物组之间强大的系统发育一致性。我们表征了来自四个野外收集的harpagifer物种的77个个体的肠粘膜微生物组(Teleostei,notothenioidei),分布在南大洋的三个生物地理区域。我们发现海水物理化学特性,宿主系统发育和地理学共同解释了竖鼠肠粘膜中细菌群落组成的35%。harpagifer spp的核心微生物组。肠粘膜的特征是多样性低,主要由选择性过程驱动,并由超过80%的个体中检测到的单个Aliivi Brio操作分类单元(OTU)主导。在包括Aliivibrio在内的核心微生物组分类群的几乎一半(包括Aliivibrio)在微反应分辨率下具有宿主系统发育的共生信号,表明与Harpagifer具有亲密的共生关系和共同的进化历史。清晰的细胞传友和共晶发育信号强调了harpagifer模型在站立在塑造肠道微生物组组装中的作用下的harpagifer模型的相关性。我们提出,最近的竖琴数多样化可能导致了Aliivibrio的多样化,表现出反映宿主系统发育的模式。
摘要:黑色素蛋白是通过长时间和强烈的加热在食品中生产的最终的maillard反应产物(蛋白质 - 碳水化合物复合物)。我们评估了大麦麦芽中黑色素蛋白消费对肠道菌群的影响。七十只小鼠分为五组,在那里对照组消耗非黑素蛋白麦芽饮食,而其他组则以25%的增量为25%至100%的黑色素麦芽糖。粪便进行采样,并使用V4细菌16S rRNA扩增子测序和短链脂肪酸(SCFA)确定菌群。发现黑色素蛋白增加会导致肠道微生物蛋白质发散显着,并支持持续的SCFA产生。dorea,振荡杆菌和静脉曲张的相对丰度减少了,而乳酸杆菌,帕拉索氏菌,阿克氏菌,双杆菌和barnesiella则增加了。双杆菌属。和Akkermansia spp。在消耗黑色素素量最高的小鼠中显着增加,这表明益生元的潜力显着。
tick传播的立克斯曲霉是由立克属的革兰氏阴性细菌引起的,构成了日益增长的全球威胁,各种节肢动物载体为它们的传播做出了贡献。了解壁虱微生物群中的复杂相互作用,包括立克氏症的作用,对于阐明立克疾病的动力学至关重要。在这里,我们研究了RH的Rickettsia的分类学概况和共发生网络。sanguineus sensus lato(s.l.)和RH。turanicus tick虫,揭示了立克群体的社区组成和局部连通性的显着差异。虽然这两个壁虱物种的微生物群都有共同的分类单元,但相对丰度和网络拓扑的明显差异表明了独特的生态壁ches。此外,鲁棒性分析表明对扰动的韧性有所不同,这表明网络组织的策略不同。我们的发现还强调了tick物种之间的代谢差异,这表明对立克相互作用的潜在影响。总体而言,这项研究提供了有关壁虱中复杂的微生物景观的见解,从而阐明了与立克相关的功能冗余和代谢途径,从而促进了我们对tick传播疾病的理解。