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序列建模和设计从分子到基因组量表，
纳米孔信号分析能够检测天然DNA和RNA测序的核苷酸修饰，从而在没有其他文库准备的情况下提供了准确的遗传/转录组和表观遗传信息。目前，只能直接对一组有限的修改（例如5-甲基胞霉素），而大多数其他则需要探索方法，这些方法通常以纳米孔信号与核苷酸参考的比对开始。我们提出了Uncalled4，这是一种用于纳米孔信号对准，分析和可视化的工具包。uncalled4具有有效的带信号对准算法，BAM信号对准文件格式，用于比较信号对准方法的统计数据以及基于K-MER的孔模型的可重复的DE NROVE训练方法，揭示了ONT尚未访问的途径的可能错误。我们在七个人类细胞系中的RNA 6-甲基趋化（M6A）检测应用于RNA 6-甲基丹宁（M6A），使用M6ANET鉴定的修饰比Nanopolish多26％，其中包括M6A已知在癌症中具有含义的几种基因。uncalled4可在github.com/skovaka/uncalled4上开放源4。
从激光...
摘要X/γ-砂在实验室天体物理学和粒子物理学中具有许多潜在的应用。已经提出了几种具有角动量（AM）的电子，正电子和X/γ-光子束的方法，但超强度的亮γ射线的产生仍然具有挑战性。在这里，我们提出了一个全光方案，以产生具有大型束角动量（BAM），小差异和高光彩的高能量γ-光束。在第一个阶段，强度为10 22 W/cm 2的圆形极化激光脉冲辐射一个微通道目标，从通道壁上拖出电子，并通过纵向电力场将它们加速到高能。在此过程中，激光将其自旋角动量（SAM）转移到电子轨道角动量（OAM）。在第二阶段，驱动脉冲通过附着的风扇翼反映，因此形成了涡流激光脉冲。在第三阶段，能量电子与反射的涡流脉冲正面碰撞，并通过非线性康普顿散射将其AM传递到γ-播种。三维粒子中的模拟表明，γ射线束的峰值光彩为〜10 22
承认常见问题 (FAQ)
DAPA 记录（通常在船上保存 2 年） 成员评估/FITREP 从 ADMITS 记录检查中获得的筛查和/或治疗结果 如果无法证实 DAR，CO 或 DAR 审批人必须删除 DAR。 Q10。如何编辑 DAR？ A10。如果 DAR 已提交但尚未获得批准，仍然可以编辑。要编辑 DAR，请转到输入 DAR 记录。输入成员的完整 SSN 后，会出现他们的姓名，然后会出现一个编辑按钮。您可以根据需要进行更正。DAR 获得批准后，编辑按钮就会消失，您唯一能够更正 DAR 的方式是通过命令信头（可通过 ADMITS 帮助台获得模板）通过加密电子邮件向 ADMITS 支持 MILL_N17_ADMITS@NAVY.MIL 提交需要添加到 DAAR 的内容。 Q11。我需要多久登录一次 BOL？ A11. 所有用户必须拥有并维护一个有效的 BUPERS 在线 (BOL) 帐户，并且必须每 30 天登录一次以防止帐户被暂停。要解锁 BOL 帐户，请按照网站 https://www.bol.navy.mil/bam/ 上的指示操作，或联系 BOL 帮助台 1-800-951-6289 或 bupers07_it_eoc.fct@navy.mil。
发行说明代理3.0.6
•尖叫（共识读套件），这是一种新的分子条形码感知的PCR重复工具，用于SUELESELECT XT HS和XT HS2数据，可代替SURESELECT分析的Locatit。•吱吱作响专门解决了Locatit应用程序中的大型内存资源需求，并使用户能够处理与LoCatit相比的内存较少的数据。•尖叫还增加了一种可用于处理嵌合对齐的鲁棒算法，该嵌合对齐由读取段组成，这些片段在同一染色体或不同染色体上彼此之间彼此远远遥不可及。•尖叫报告的基本统计信息具有明确的定义，可以直接追溯到输出BAM文件中的读取。Statistics include: number of processed reads, number of reads passing the filter steps, number of correctly paired reads, number of read pairs flagged as duplicates in the input file, number of read pairs with at least one unmapped mate, number of chimeric read pairs, number of read pairs called as single consensus, number of read pairs called as duplex consensus, number of read pairs called as chimeric consensus, total duplicates确定的，失败的共识过滤器的读对数，读对的数量称为单个共识，在双工模式下质量过滤器失败。
通过实时定量PCR（QPCR）筛选食品和环境表面上沙门氏菌的方案（2023年11月28日）
这种FDA开发的QPCR方法适用于使用Applied Biosystems TM（ABI）7500快速实时PCR系统快速筛选食品和环境表面。该方法靶向沙门氏菌浸润基因（INVA），该基因已被证明与s的内在化有关。哺乳动物上皮细胞中的伤寒（1-4）。该基因被发现是沙门氏菌（3,5）独有的，其DNA序列在沙门氏菌属中高度保守。（2,4,6）。该方法使用定制设计的引物和塔克曼探针来扩增具有严格特异性的沙门氏菌特异性Inva基因的262 bp片段（7,8,9），并包括定制设计的内部扩增对照（9），这是识别通常在食物中发现的PCR抑制pCR抑制的虚假结果所需的。可以在BAM第5章E9（https://www.fda.gov/media/107724/107724/download）中找到使用此QPCR方法作为沙门氏菌分离株的验证性测定的协议。在我们的两项MLV研究中，QPCR方法被证明是一种可再现，敏感和特定的快速筛选方法（11）。在MLV婴儿菠菜研究中，qPCR方法的检测极限50（LOD 50）为0.811 cfu/ 25g，用于BAM培养方法的0.837 CFU/ 25G（13）。在MLV冷冻鱼类研究中，QPCR和培养方法的LOD 50为0.75 CFU/25G。使用QPCR方法作为快速筛选工具的协议如下所述。协议中的QPCR组件和数据分析是针对ABI 7500快速实时PCR系统的。This qPCR method has been shown to be an effective and rapid screening tool for a broad range of foods that includes fruits, fresh leafy green vegetables and herbs (blackberry, blueberry, raspberry, strawberry, baby spinach, cabbage, iceberg lettuce, romaine lettuce, spring mix, basil, cilantro, parsley, dill, oregano, watercress), low-moisture foods (almond, almond butter, chia seed powder, dried cereal, dried egg noodle, infant formula, peanut butter, pine nuts, soy formula, walnuts), seafoods (fish, shrimp, raw oyster), whole shell eggs, spices (crushed red pepper, ground basil, ground black pepper, ground cumin, ground white pepper, paprika, red chili powder), and environmental surfaces (plastic, stainless钢，陶瓷瓷砖，橡胶和铸铁）以及多个动物饲料（小鸡饲料，优质苜蓿颗粒，小麦麸，整燕麦），它们是在一系列SLV研究中用浸泡或混合程序制备的（7,8,9,10）。必须首先根据FDA微生物学方法验证指南（https://wwwww.fda.gov/media/83812/download）或其他国际认可的验证指南，例如AOAC International的Appendix j（httpp：htttp：htttp：/JAPF：标准化组织的16140：2 2016（www.iso.org）。
系统鉴定结直肠癌中的MACC1驱动的代谢网络
1血液学，肿瘤学和肿瘤免疫学，以及Molekulares Krebsforschungszentrum（MKFZ），Chariteé -Universitaätsmedizin柏林，13353年，德国柏林； jan.lisec@bam.de（J.L。）; carsten.jaeger@charite.de（C.J.）2德国癌症联盟，德国Heidelberg 69120 Deutsches Krebsforschungzentrum（DKFZ）； dennis.kobelt@mdc-berlin.de（d.k.）; wowalt@mdc-berlin.de（W.W.）; Margarita.mokrizkij@mdc-berlin.de（M.M.）; carsten.groetzinger@charite.de（C.G.）; winfried.brenner@charite.de（W.B。）3部门1.7分析化学，联邦材料研究与测试研究所（BAM），柏林12489，德国4 4实验和临床研究中心，慈善 - 埃纳弗斯蒂尼辛伯林，麦克斯 - 戴尔布鲁克 - 梅克斯 - 戴尔布吕克 - 中心，用于赫尔姆霍尔兹协会的分子医学，固体统治学，固体肿瘤学，3. Charité–universitätsmedizin柏林胃肠病学，德国柏林13353 6 Hasso Plattner Institute，数字工程学院，波茨坦大学，14482 Potsdam，德国Potsdam； katharina.baum@hpi.de 7 MaxDelbrück分子医学中心在Helmholtz协会，蜂窝过程数学建模，德国柏林13125； mareike.simon@mdc-berlin.de（M.S.）; jana.wolf@mdc-berlin.de（J.W。）8柏林实验性放射性核素成像中心（Beric），Charité -Universitätsmedizin柏林，13353柏林，德国； nicola.beindorff@charite.de 9核医学系慈善委员会 - Universitätsmedizin柏林，13353柏林，德国 *通信：ustein@mdc-berlin.de;电话。： +49-30-94063432
甲基化操作向导（Meow）
图1。Meow在长阅读测序数据中识别差异甲基化区域。A. Meow需要一组带有填充的MM和ML标签的对齐的BAM文件以及包含感兴趣区域列表的床文件，例如CPG岛，以构建参考数据库。在构建参考数据库后，可以在参考队列中执行一项输出分析，以识别该数据集中的唯一差异甲基化区域（DMR）。也可以使用已经构建的参考数据库来识别DMR的测试样本运行。两种方法的输出都在表或图形格式中获得。B.与已知具有Prader-Willi综合征的测试样品相比，与19个随机样品的对照数据库相比，显示了已知具有Prader-Willi综合征的测试样品的显着差异甲基化的位点（红色），该数据库是1000个基因组项目ONT测序联盟的一部分。C. Meow生成图形，说明了测试样品和对照数据集之间甲基化频率的显着差异。所示的五个DMR表示（b）中的显着值。D.色带图显示了查询中每个C和G的甲基化频率，相对于控制数据库甲基化频率在同一位置的平均值和标准误差。
2023 年第 1 份工作
ALTEN – Apple – Argon Consulting – Astek – ATOS – Azmed – Bain et Compagnie – BAM – Barclays – Bearing Point – BEWAI – BMW Group – BNP PARIBAS – Bouygues Telecom – Broceliand SAS – Buf Compagnie – Capgemini – Energy Regulatory Commission – Corps of Armament Engineers – Crédit Agricole CIB – Datadog – Deeptimize – Deloitte – EDF R&D – National Education – Ekimetrics – Ekinops – Ericsson – Eurodecision - Flash contract – Gfk – Google – Greenly - BPCE Group - Headmind partners – IBM – idealWine - IDEMIA IS - Incepto Medical – INGEROP - Inoa Sistemas – Invivoo - JP Morgan – Kleep - Koios Intelligence – KPMG – LocalSolver - Loft orbital technologies – MBDA – Microsoft - Ministry of the Interior - Ministry of the Armed Forces - Murex SAS - Naox technologies – Natixis - Natwest市场 - Nexter Munitions - Numberly - OCP Solutions - Orange - Parrot Drone - Point72 - PwC France - Quantic Dream - Renault Digital - Rogers - Roland Berger - Safran electronics & defense - SATVAC - Secure-IC SAS - SHIFT TECHNOLOGY - Sia Partners - Siemens Advanta Consulting - Skillcorner - SLB - SMILE GROUP - SNCF Réseau - Société Générale - ST Microelectronics - Thales - The Boston Consulting Group - Theodo - Untie Nots - VELTYS - Wavestone - WYLR…
就业报告
ALTEN – Apple – Argon Consulting – Astek – ATOS – Azmed – Bain et Compagnie – BAM – Barclays – Bearing Point – BEWAI – BMW Group – BNP PARIBAS – Bouygues Telecom – Broceliand SAS – Buf Compagnie – Capgemini – Energy Regulatory Commission – Corps of Armament Engineers – Crédit Agricole CIB – Datadog – Deeptimize – Deloitte – EDF R&D – National Education – Ekimetrics – Ekinops – Ericsson – Eurodecision - Flash contract – Gfk – Google – Greenly - BPCE Group - Headmind partners – IBM – idealWine - IDEMIA IS - Incepto Medical – INGEROP - Inoa Sistemas – Invivoo - JP Morgan – Kleep - Koios Intelligence – KPMG – LocalSolver - Loft orbital technologies – MBDA – Microsoft - Ministry of the Interior - Ministry of the Armed Forces - Murex SAS - Naox technologies – Natixis - Natwest市场 - Nexter Munitions - Numberly - OCP Solutions - Orange - Parrot Drone - Point72 - PwC France - Quantic Dream - Renault Digital - Rogers - Roland Berger - Safran electronics & defense - SATVAC - Secure-IC SAS - SHIFT TECHNOLOGY - Sia Partners - Siemens Advanta Consulting - Skillcorner - SLB - SMILE GROUP - SNCF Réseau - Société Générale - ST Microelectronics - Thales - The Boston Consulting Group - Theodo - Untie Nots - VELTYS - Wavestone - WYLR…
循环经济的数字产品护照（DPP）
7全球团队GmbH GTS 8 +撞击卢森堡 +impach 9 F6S Nevimed F6S欧洲欧洲GS1的APS DK 12 GS1在欧洲是13个政治上的米拉诺，它是14循环的。挖掘这个16 KIC InnoEnergy SE SE NL 17 Technischniscity Universite至18高的19 Fellicha Itha itha Beltha Beltha Beltha Beltha Beltha Beltha 20 Energy Web Stiftung（Eneergy Web基金会）EWF CH 21联合毛皮材料Forgorchungund 22 Syncforce SyncForce NL 23 asyncforce nl 23 asynocia。 Innovalia 24纺织交换纺织品汇款25 IPOOINT-SYSTMS GMBH IPOINT 29全球电子委员会GOC US/NL 30 Avery Dennison Atma GmbH atma.io 31全球Labry Alliance gba be