上皮卵巢癌(EOC)是全球女性与癌症相关死亡的主要原因之一,其特征是手术和化学疗法后的复发率很高。我们试图实施循环的肿瘤DNA(CTDNA) - 基于血液检查,以对该疾病进行更准确的术后监测。我们分析了2016年6月至2021年9月在63名EOC患者之间收集的264个血浆样品,使用肿瘤引导的无血浆细胞DNA分析,以检测治疗后的残留疾病。分析进行了验证。ctDNA,在进展中检测到18个(100%)样品中的18个(100%)。在最后进行处理样本中的阳性ctDNA与快速进展(中位数1.02对3.38年,HR = 5.63,p <0.001)和降低的总生存率(中位2.31对NR YR,HR,HR = 8.22,P <0.001)患者在高级别浆液癌的患者中。对于12例患者,ctDNA测定法比标准监视早得多,中间时间为5.9 mo。要接近ctDNA检测的物理极限,使用超敏感的测定法对五名患者进行了询问479 - 1,856肿瘤突变,能够跟踪CtDNA馏分降至0.0004%。我们的结果表明,CTDNA测定在检测EOC中术后残留疾病时具有高灵敏度和特异性。
摘要:肝细胞癌 (HCC) 占原发性肝恶性肿瘤的 90%,是癌症相关死亡的主要原因之一。在过去的 15 年中,HCC 的分子图景已被揭示,并鉴定出属于六大生物学通路的肝癌主要驱动基因,例如端粒维持、Wnt/b-catenin、P53/细胞周期调控、氧化应激、表观遗传修饰因子、AKT/mTOR 和 MAP 激酶。遗传和转录组数据的组合构成了与风险因素、病理特征和预后密切相关的各种 HCC 亚类。然而,尚未实现临床实践的转化,主要是因为最常见的突变基因无法用药。此外,从单个组织样本的分析得出的结果可能无法充分捕捉肿瘤内和肿瘤间的异质性。循环肿瘤 DNA (ctDNA) 分析已广泛应用于其他类型的癌症,用于系统性治疗下的早期诊断、预后和监测,以确定原发性和继发性耐药机制。本综述旨在描述有关 HCC 分子图谱的最新数据,并讨论 ctDNA 未来如何用于 HCC 检测和管理。
抽象背景免疫检查点抑制剂(ICI)疗法已大大提高了非小细胞肺癌(NSCLC)患者的总生存率(OS);但是,它的响应率仍然适中。在这项研究中,我们开发了一个基于机器的基于机器的平台,即基于细胞因子的ICI反应指数(CIRI),以根据外周血细胞因子特征来预测NSCLC患者的ICI反应。方法我们分别在培训和验证队列中分别接受了抗PD-1/PD-L1单一疗法或联合化学疗法的NSCLC患者的123例和99例NSCLC患者。在基线(前)和治疗后6周(治疗期间:EDT)从患者获得的外周血中检查了93种细胞因子的血浆浓度。集合学习随机生存森林分类剂是为了选择特征细胞因子并预测接受ICI治疗的患者的OS。在基线和治疗时分别选择了14个和19个细胞因子,以生成CIRI模型(即PROCIRI14和EDTCIRI19),这两者都成功地鉴定出了两个完全独立的人群中OS较差的患者。在人口水平上,如一致性指数(C-Indices)所示,PROCIRI14和EDTCIRI19的预测准确性分别为0.700和0.751在验证群体中。在单个水平上,CIRI评分较高的患者表现出较差的OS [危险比(HR):0.274和0.163,以及PROCIRI14和EDTCIRI19的P <0.0001和P = 0.0044]。通过包括其他循环和临床特征,在高级模型中观察到了提高的预测功效(PROCIRI21和EDTCIRI27)。验证队列中的c指数分别为0.764和0.757,而PROCIRI21和EDTCIRI27的HRS分别为0.141(P <0.0001)和0.158(P = 0.038)。结论CIRI模型在确定NSCLC患者的抗PD-1/PD-L1治疗方面具有高度准确且可重复性,并且可能有助于在治疗早期和/或治疗早期进行临床决策。
在非肌肉侵入性膀胱癌中,据报道,血浆中的ctDNA可以预测疾病复发,并且具有较高的体细胞变异与肿瘤DNA的一致性[7]。使用尿液和血液对前列腺癌进行分子分析表明,血浆中突变等位基因频率与转移性前列腺癌患者之间存在显着关联[8]。加法,尽管与血液相比,尿液表现出更多的突变,但突变的数量与前列腺癌患者的临床特征无关。然而,研究表明,尿液CFDNA可能是早期检测和预测膀胱癌治疗反应的血浆更好的来源[9-11]。与血浆CTDNA相比,在膀胱癌患者中,尿ctDNA与肿瘤DNA表现出很高的一致性[12],强调了尿液作为尿液的替代ctDNA的重要性,用于诊断,疾病监测和个性化药物。
•臂之间的基线时中位CTDNA水平没有显着差异:Giredestrant 0.100(95%CI = 0.044,0.160); PCET 0.073(0.020,0.120); Fulvestrant 0.085(0.016,0.140)。•58/89(65%)的CTDNA水平降低了经过Giredestrant治疗的患者,44/75(59%)PCET治疗的患者和34/56(61%)(61%)在基线时可检测到的可检测/可检测到的TF的患者。•a)与PCET(–29%)或Fulvestrant(–36%)相比,Giredestrant(–66%)的中位数从C1D1到C2D1更大。在EOT上,经PCET处理的患者相对于C1D1,CTDNA水平显着增加。Giredestrant没有看到这种效果,该作用仍显示出–47%CtDNA的中位数。•b)和c)PR或SD患者的CTDNA降低明显更高,与PD患者相比,基线CTDNA水平明显降低(最佳研究者反应),无论治疗组如何。
1. IV 期或转移性肺腺癌,或 2. IV 期或转移性大细胞肺癌,或 3. IV 期或转移性鳞状细胞肺癌,或 4. IV 期或转移性非小细胞肺癌(NSCLC)未另作规定(NOS),或 5. 局部晚期或转移性胰腺腺癌,或 6. 转移性或晚期胃癌,或 7. 转移性或晚期食管或食管胃连接处癌,或 8. 转移性前列腺癌,或 9. III 期或更晚期皮肤黑色素瘤,或 10. 转移性结直肠癌,或 11. 局部晚期或转移性壶腹部腺癌,或 12. 持续性或复发性宫颈癌,或 13. 不可切除或转移性胆道癌,或 14. 疑似或确诊的组织细胞肿瘤,或 15. 局部区域不可切除或转移性肺外低分化神经内分泌癌,或 16. 局部区域不可切除或转移性大细胞或小细胞癌,或 17. 局部区域不可切除或转移性混合神经内分泌-非神经内分泌肿瘤,或 18. 初步确定组织学的疑似转移性恶性肿瘤,或 19. 复发性卵巢癌、输卵管癌或原发性腹膜癌,或 20. 复发性或 IV 期乳腺癌,并且 B. 如果正在通过循环肿瘤 DNA 进行广泛的分子分析小组测试
抽象背景循环肿瘤DNA(CTDNA)在局部和转移性癌症中具有预测性和预后价值。这项研究使用特定区域特异性的下一代测序(NGS)面板分析了基线和治疗CTDNA的预后值和治疗CTDNA的预后值。方法在一线姑息性全身治疗开始之前和9周和18周后,从患者的血浆中分离出无细胞DNA。设计了两个NGS面板,其中包括GEC中最常见的突变基因和靶向突变。匹配的转移活检中的肿瘤衍生的突变用于验证测序面板评估了真正的肿瘤衍生的变体。肿瘤体积,并与变异等位基因频率(VAF)相关。使用单变量和多变量COX-回归分析进行生存分析。在72例患者中有75%的预处理血浆中检测到ctDNA,并且与转移性活检中的突变很好地相关(86%符合度)。VAF与基线肿瘤体积相关(Pearson的R 0.53,P <0.0001)。在血浆中基线时多个基因突变的检测与总体存活率较差(OS,HR 2.16,95%CI CI 1.10-4.28; P = 0.027)和无进展生存率有关(PFS,HR 2.71,95%CI CI 1.28-5.73; P = 0.009)。在治疗9周后,患有残留可检测CTDNA的患者(OS:HR 4.95,95%CI 1.53-16.04; P = 0.008; PFS:HR 4.08,95%CI 1.31-12.75; P = 0.016)。基于我们的NGS小组的结论,一线化学疗法开始之前的CTDNA突变的数量具有预后价值。此外,三个循环全身治疗后的残留ctDNA与下生存率有关。
当疟原虫 (P.) spp. 寄生虫侵入并溶解红细胞 (RBC) 时,就会出现重症疟疾,从而产生细胞外血红蛋白 (HB),并从中释放出不稳定血红素。在这里,我们测试了通过结合珠蛋白 (HP) 和/或血红素结合蛋白 (HPX) 分别清除细胞外 HB 和/或不稳定血红素是否会对抗重症疟疾的发病机制。我们发现,循环不稳定血红素是儿童重症恶性疟原虫疟疾大脑和非大脑表现的独立危险因素。不稳定血红素与循环 HP 和 HPX 呈负相关,但后者不是重症恶性疟原虫疟疾的危险因素。小鼠基因性 Hp 和/或 Hpx 缺失导致疟原虫感染后不稳定血红素在血浆和肾脏中积聚。这与老年小鼠死亡率和急性肾损伤 (AKI) 发生率较高有关,但与成年感染疟原虫的小鼠无关,血红素和 HPX 与恶性疟原虫疟疾 AKI 血清学标志物呈负相关,证实了这一点。总之,HP 和 HPX 以年龄依赖的方式发挥作用,防止小鼠和人类出现严重的疟疾症状。
此预印本版的版权持有人于2024年3月26日发布。 https://doi.org/10.1101/2023.11.30.569167 doi:Biorxiv Preprint
抗PD-(L)1治疗在某些癌症患者中表现出了极大的效率。但是,癌症患者的显着比例没有反应。抗PD-(L)1治疗的另一种未满足的临床需求是治疗效果的动态监测。因此,鉴定可以在PD-(L)1治疗和及时监测PD-(L)1治疗的效率之前,可以将潜在响应者分层的生物标志物在临床环境中至关重要。通过液体活检对生物标志物的识别引起了极大的关注。在识别的生物标志物中,循环T细胞是最有前途的,因为它们对抗PD-(L)1疗法的不可或缺贡献是必不可少的。 目前的综述旨在彻底探索循环T细胞作为抗PD-(L)1治疗及其优势和局限性的生物标志物的潜力。,因为它们对抗PD-(L)1疗法的不可或缺贡献是必不可少的。目前的综述旨在彻底探索循环T细胞作为抗PD-(L)1治疗及其优势和局限性的生物标志物的潜力。