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靶向 ErbB4 受体激活可防止 D-半乳糖 - ...
1 江南大学无锡医学院细胞生物学系，江苏省无锡市，2 江南大学无锡医学院肠道菌群与慢性疾病教育部医学基础研究创新中心，江苏省无锡市，3 贵州护理职业学院病原生物学系，贵州省贵阳市，4 江南大学无锡医学院神经变性与神经损伤疾病实验室，江苏省无锡市，5 南华大学衡阳医学院第一附属医院神经内科、脑疾病多组学研究中心，湖南省衡阳市，6 南华大学衡阳医学院湖南省免疫相关脑病临床研究中心
小分子诱导的ERBB4激活以治疗心力衰竭
心力衰竭是一种常见的致命疾病，需要新的治疗方法。Neuregulin-1（NRG1）/红细胞性白血病病毒癌基因同源物4（ERBB4）途径是一个有趣的靶标，因为其心脏保护作用。重组NRG1的治疗用途很困难，因为它需要静脉内给药，并且对ERBB4受体是非选择性的。此外，通常认为受体二聚体的小分子激动剂的发展是具有挑战性的。在这里，我们假设小分子诱导的ERBB4激活是可行的，可以预防心肌细胞死亡和纤维化。为此，我们筛选了10,240种化合物，以诱导ERBB4均二聚化的能力。我们鉴定了一系列的8种结构相似化合物（称为EF-1 - EF-8），该化合物浓度依赖于诱导的ERBB4二聚体，而EF-1是最有效的。ef-1在培养的心肌细胞和培养的人类心脏成纤维细胞中培养的心肌细胞和胶原蛋白产生中的ERBB4依赖性方式和肥大降低。ef-1还抑制了血管紧张素II（AngII）诱导的野生型小鼠的心肌纤维化，但在ERBB4-NULL小鼠中却没有。此外，在用阿霉素（DOX）治疗的野生型小鼠中，EF-1降低了肌钙蛋白释放，但在ERBB4-NULL小鼠中却没有。最后，EF-1改善了心肌梗塞小鼠模型（MI）的心脏功能。总而言之，我们表明，小分子诱导的ERBB4激活是可能的，在心脏中显示抗纤维化和心肌细胞保护作用。这项研究可能是开发小分子ERBB4激动剂作为治疗心力衰竭的新型药物的开始。
Pharmacognj-13-5-1143.pdf
ERBB4（HER4）是表皮生长因子（EGF）/ERBB受体酪氨酸激酶（RTKS）1的成员，其他成员是EGFR（ERBB1/HER1），ERBB2（HER2/NEU），ERBB3（HER3）。2 ERBB2过表达发生在约20％的乳腺癌中，并且与整体生存率较差有关。3用ERBB2靶向抑制剂，曲妥珠单抗和拉帕替尼治疗在HER2阳性乳腺癌患者中可提供相当大的临床益处，但大多数由于激活CRBB2靶向ERBB2靶向的抑制剂4,5，由于激活CRBB 3，ERBBBB3上升7，ERBB3上升7，ERBBB4和ERBB4激活。 8,9 ERBB4激活在对ERBB2抑制剂产生抗性的癌细胞存活中起关键作用。 ERBB4敲低导致Akt磷酸化的降低，并激活Lapatinib-耐药细胞中的PI3K/AKT途径，从而触发凋亡。 9因此，有必要开发一种具有更好活性且作为ERBB4抑制剂更具选择性的新药。 93用ERBB2靶向抑制剂，曲妥珠单抗和拉帕替尼治疗在HER2阳性乳腺癌患者中可提供相当大的临床益处，但大多数由于激活CRBB2靶向ERBB2靶向的抑制剂4,5，由于激活CRBB 3，ERBBBB3上升7，ERBB3上升7，ERBBB4和ERBB4激活。8,9 ERBB4激活在对ERBB2抑制剂产生抗性的癌细胞存活中起关键作用。ERBB4敲低导致Akt磷酸化的降低，并激活Lapatinib-耐药细胞中的PI3K/AKT途径，从而触发凋亡。9因此，有必要开发一种具有更好活性且作为ERBB4抑制剂更具选择性的新药。9
卫生福利部食品药物管理署精准医疗分子检测实验室列册...
ABL1 AKT1 AKT3 ALK AR AXL BRAF CCND1 CDK4 CDK6 CTNNB1 DDR2 EGFR ERBB2 ERBB2 ERBB3 ERBB3 ERG ESR1 ESR1 ETV1 ETV1 ETV4 ETV4 ETV5 ETV5 ETV5 ETV5 FGFR1 MAP2K2 MET MTOR MYC MYCN NRAS NTRK1 NTRK2 NTRK3 PDGFRA PIK3CA PPARG RAF1 RAS ROS1 SMO
南亚疫苗接种的COVID状况
摘要背景：冠状病毒（COV）是一种新兴的人类病原体，在世界范围内引起严重的急性呼吸道综合征（SARS）。早期对SAR的生物标志物的鉴定可以促进检测并降低疾病的死亡率。 因此，通过集成的网络分析和结构建模方法，我们旨在探索冠状病毒药物SARS的潜在药物靶标和候选药物。 方法：使用Limma进行了COV感染宿主基因（HGS）表达谱的差异表达（DE）分析。 高度整合的De-cov-HG被选择构建蛋白质蛋白质相互作用（PPI）网络。 结果：使用WalkTrap算法高度互连模块包括模块1（202个节点）；从PPI网络检索模块2（126个节点）和模块3（121个节点）模块。 MYC，HDAC9，NCOA3，CEBPB，VEGFA，BCL3，SMAD3，SMAD3，SMURF1，KLHL12，CBL，ERBB4和CRKL被鉴定为潜在的药物靶标（PDT），这些药物靶标（PDT）在COV感染后在人类呼吸系统中高度表达。 功能项生长因子受体结合，C型凝集素受体信号传导，白介素1介导的信号传导，通过MHC I类的TAP依赖性抗原处理以及肽抗原的呈现，刺激T细胞受体信号传导，刺激性T细胞受体信号传导以及先天的响应信号通路，信号传输和细胞座的免疫通道富集。早期对SAR的生物标志物的鉴定可以促进检测并降低疾病的死亡率。因此，通过集成的网络分析和结构建模方法，我们旨在探索冠状病毒药物SARS的潜在药物靶标和候选药物。方法：使用Limma进行了COV感染宿主基因（HGS）表达谱的差异表达（DE）分析。高度整合的De-cov-HG被选择构建蛋白质蛋白质相互作用（PPI）网络。 结果：使用WalkTrap算法高度互连模块包括模块1（202个节点）；从PPI网络检索模块2（126个节点）和模块3（121个节点）模块。 MYC，HDAC9，NCOA3，CEBPB，VEGFA，BCL3，SMAD3，SMAD3，SMURF1，KLHL12，CBL，ERBB4和CRKL被鉴定为潜在的药物靶标（PDT），这些药物靶标（PDT）在COV感染后在人类呼吸系统中高度表达。 功能项生长因子受体结合，C型凝集素受体信号传导，白介素1介导的信号传导，通过MHC I类的TAP依赖性抗原处理以及肽抗原的呈现，刺激T细胞受体信号传导，刺激性T细胞受体信号传导以及先天的响应信号通路，信号传输和细胞座的免疫通道富集。高度整合的De-cov-HG被选择构建蛋白质蛋白质相互作用（PPI）网络。结果：使用WalkTrap算法高度互连模块包括模块1（202个节点）；从PPI网络检索模块2（126个节点）和模块3（121个节点）模块。MYC，HDAC9，NCOA3，CEBPB，VEGFA，BCL3，SMAD3，SMAD3，SMURF1，KLHL12，CBL，ERBB4和CRKL被鉴定为潜在的药物靶标（PDT），这些药物靶标（PDT）在COV感染后在人类呼吸系统中高度表达。功能项生长因子受体结合，C型凝集素受体信号传导，白介素1介导的信号传导，通过MHC I类的TAP依赖性抗原处理以及肽抗原的呈现，刺激T细胞受体信号传导，刺激性T细胞受体信号传导以及先天的响应信号通路，信号传输和细胞座的免疫通道富集。
引用本文：Castillo P、Marginet M、Jares P、García M、Gonzalvo E、Arance A 等。实施 NGS 面板用于临床实践
结果：共对 155 个样本进行了分子分析，但 40 个样本（25.8%）不适合进行测序。在 29 个样本中比较了 BRAF V600 实时聚合酶链反应和靶向 NGS 的临床实用性，观察到非常好的一致性（Kappa = 0.89，95% 置信区间 0.68 ± 1.05）。通过 NGS 在 75 个样本（65%）中发现了致癌突变，其中 53% 是需要个性化治疗的候选人。最常见的突变基因是 BRAF（39%）、TP53（23%）和 NRAS（14%）。其他发生率较低（< 5%）的基因是：PIK3CA、ERBB4、CTNNB1、STK11、FGFR1、SMAD4、KRAS、FGFR3、PTEN 和 AKT。 40% 的样本检测到致癌突变同时发生。在已识别的突变中，TP53 在男性中明显更普遍（男性 31.8% 对比女性 12.2%，P = 0.03），NRAS 在女性中明显更普遍（男性 9.1% 对比女性 24.4%，P = 0.03）。
一项探索 EGFR 在卵巢癌中的作用的计算机模拟研究
ERbB 家族受体酪氨酸激酶在多种实体瘤的形成中发挥作用，包括表皮生长因子受体 (EGFR)（也称为 HER1/ErbB1）、人 EGFR2 (HER2/neu)/ERbB2、HER3/ErbB3 和 HER4/ErbB4。7 这四种 HER 受体在癌症中都发挥着重要作用，并通过细胞增殖、存活、迁移、粘附和分化促进肿瘤形成。活化 HER 的受体后信号传导包括四种代表性途径：Ras-Raf/丝裂原活化蛋白激酶 (MAPK) 和信号转导和转录激活 (STAT) 途径、磷脂酰肌醇 3-激酶 (PI3K)/蛋白激酶 B (AKT)/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白 (mTOR) 途径和磷脂酶 Cγ (PLCγ) 途径。 EGFR 以及其他 HER 家族成员的突变、基因扩增和蛋白质过度表达与致癌作用有关。EGFR 和 HER2 的过度表达和/或突变在包括卵巢癌在内的多种实体肿瘤中都很明显，并且具有治疗意义。
OncoTrack 液体
ABL1、ABL2、AKT1、ALK、APC、AR、ARAF、ARID1A、ARID1B、ATM、ATR、ATRX、BAP1、BARD1、BRAF、BRCA1、BRCA2、BRIP1、C11orf65、CCND1、CDH1、CDK12、CDK4、CDKN2A、CDX2、CHEK1、CHEK2、CSF1R、CTNNB1、DDR2、EGFR、ERBB2、ERBB3、ERBB4、ERCC2、ESR1、EZH2、FANCL、FBXW7、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、FLT3、FOXA1、FOXL2、GATA3、GNA11、GNAQ、GNAS、HNF1A、HRAS、IDH1、IDH2、INPP4B、 JAK1、JAK2、JAK3、KDM5C、KDM6A、KEAP1、KIT、KRAS、MAP2K1、MAP2K2、MAPK1、MET（外显子 14 跳跃）突变）、MLH1、MPL、MSH2、MSH6、MTOR、MUTYH、MYC、MYCN、MYD88、NF1、NF2、NOTCH1、NPM1、NRAS、NTRK1、NTRK3、PALB2、PBRM1、PDGFRA、PIK3CA、PMS2、POLD1、POLE、PPP2R2A、PTCH1、PTEN、PTPN11、RAD51B、RAD51C、RAD51D、RAD54L、RAF1、RB1、RET、RHEB、RHOA、RIT1、ROS1、SETD2、SF3B1、 SMAD4、SMARCB1、SMO、SPOP、SRC、STK11、TERT、TP53、TSC1、TSC2、VHL
认可参数列表 Oncoscreen Jena v5.xlsx
Oncomine Comprehensive Assay v3 DNA 组：AKT1、AKT2、AKT3、ALK、AR、ARAF、ARID1A、ATM、ATR、ATRX、AXL、BAP1、BRAF、BRCA1、BRCA2、BTK、CBL、CCND1、CCND2、CCND3、CCNE1、CDK12、CDK2、CDK4、CDK6、CDKN1B、CDKN2A、CDKN2B、CHEK1、CHEK2、CREBBP、CSF1R、CTNNB1、DDR2、EGFR、ERBB2、ERBB3、ERBB4、ERCC2、ESR1、EZH2、FANCA、FANCD2、FANCI、FBXW7、FGF19、FGF3、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、FLT3、 FOXL2、GATA2、GNA11、GNAQ、GNAS、H3-3A、HIST1H1E、HNF1A、HRAS、IDH1、IDH2、IGF1R、JAK1、JAK2、JAK3、KDR、KIT、KNSTRN、KRAS、MAGOH、MAP2K1、MAP2K2、MAP2K4、MAPK1、MAX、MDM2、 MDM4、MED12、MET、MLH1、MRE11A、MSH2、MSH6、MTOR、MYC、MYCL、MYCN、MYD88、NBN、NF1、NF2、NFE2L2、NOTCH1、NOTCH2、NOTCH3、NRAS、NTRK1、NTRK2、NTRK3、PALB2、PDGFRA、PDGFRB、PIK3CA、 PIK3CB, PIK3R1、PMS2、POLE、PPARG、PPP2R1A、PTCH1、PTEN、PTPN11、RAC1、RAD50、RAD51、RAD51B、RAD51C、RAD51D、RAF1、RB1、RET、RHEB、RHOA、RICTOR、RNF43、ROS1、SETD2、SF3B1、SLX4、SMAD4、SMARCA4、SMARCB1、SMO、SPOP、SRC、STAT3、STK11、TERT、TOP1、TP53、TSC1、TSC2、U2AF1、XPO1
Tim Bigdeli博士合着者（S）：哈里斯·休伯曼（Harris Huberman）
收敛转录组特征：通过综合血液和神经发育分析自闭症谱系障碍（ASD）识别ASD遗传途径，影响了美国54名儿童中的1个，有大量证据支持遗传基础；但是，将发育遗传改变与持续的外围生物标志物联系起来仍然是一个重大挑战。我们的研究采用了双平台方法，结合了来自ASD个体的外周血样本和神经型对照的RNA测序以及对IPSC衍生和外围血液转录组学的荟萃分析。对于生物标志物发现，我们实施了高通量RNA测序，然后在独立队列中进行了qPCR验证，而我们的发育转录组分析则利用了生物信息学管道，并具有严格的质量控制措施，包括FASTQC/MULTIQC评估，恒星对齐，特征计数和特征计数量化。发布的数据表明在几种基因类别中的明显失调：突触功能基因（Syn1，PSD95，SYP，NR2B）影响神经传递；细胞粘附分子（PCDHA1，PCDHHA6，CNTN3）破坏神经连通性；离子通道和受体（CACNA2D3，SCN9A，GRIK2）改变了神经元兴奋性；和神经发育基因（ERBB4，NTNG1，TSHZ3）影响关键的神经发育过程。通过将“大数据”分析方法与持续的临床计划配对，我们的研究计划有可能提高我们对与发育改变相关的分子途径的理解，这可能促进了早期的ASD诊断并揭示了新的治疗靶标。