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乳腺癌细胞的检测和母乳衍生细胞的表征
放射学技术仍然是乳腺癌早期检测的主要方法，对于从癌症中获得有利的结果至关重要。但是，需要更敏感的检测方法来补充放射学技术，以增强早期检测和治疗策略。使用我们最近建立的培养方法，该方法允许传播腔原性的正常和癌性乳房上皮细胞，流式细胞仪表征和基因组测序，我们表明可以在母乳中检测到癌细胞。细胞从乳腺癌中衍生而来的乳腺癌富含CD49F+/EPCAM-，CD44+/CD24-和CD271+癌症干细胞（CSC）。这些CSC在HDAC6的细胞质保留结构域，MORF4L1中的停止/增益插入以及SWI/SNF复合物分量Smarcc2中的缺失突变。csc对HDAC6抑制剂，BET溴ab剂抑制剂和EZH2抑制剂敏感，因为已知SWI/SNF复合成分的突变会增加对这些药物的敏感性。来自其他10名未知患有乳腺癌的女性的母乳的细胞中，其中两个含有富含CSC表型的细胞，并在NF1或KMT2D中携带突变，这些突变经常在乳腺癌中突变。具有NF1突变的母乳源性细胞在CDKN2C，PTEN和REL基因中还带有拷贝数变化。此处描述的方法可以使快速癌细胞表征，包括妊娠/产后乳腺癌的驾驶员突变检测和治疗性筛查。
II7神经肿瘤学进步•2021年7月 开发共识驱动的精神和配偶扩展，用于早期剂量调查试验：定义研究 热还原氧化石墨烯钢筋丙烯腈... 广泛的遗传研究确定了几个SARS-COV-2 实体药物筛查知情的靶向治疗用于转移性腮腺鳞状细胞癌 量子限制的范围和速度估计
血管异常，包括血栓形成，是Glio Blastoma（GBM）的标志，是癌细胞基因组和表观基因组失调的后果。癌细胞对podoplanin（PDPN）的上调最近与胶质母细胞瘤患者静脉血栓栓塞的风险增加有关。因此，通过将事件转化并从癌细胞转化为循环的该血小板激活跨膜蛋白的调节引起了很大的关注。我们利用了单细胞和批量GBM转录组数据集挖掘，并在几个数据库中提出了PDPN表达的模式。我们的分析表明，PDPN通过不同的（间充质）胶质母细胞瘤细胞亚群来表达，并通过EGFR和IDH1基因的致癌突变通过染色质修饰（EZH2）和DNA甲基化的变化而下调。此外，我们还利用了同基因和茎GBM细胞系，小鼠的异种移植模型，ELISA的PDPN分析，组织因子（TF），血小板因子4（PF4）（PF4）和凝结激活标记（D-Dimer），以及纳米 - 流动的细胞均和TF的extpn和tf extpn extpn extpn and/e extpn extpn extry and/tf。像凝结的细胞外囊泡EV。我们还记录了分别具有相应的PDPN或TF表达胶质瘤异种移植物的小鼠中血小板激活（PF4）或凝结标记物（D-二聚体）的折痕。虽然PDPN是Sys Temic血小板激活的主要调节剂，但PDPN和TF的共表达影响了局部微型骨骼。我们的工作表明，不同的细胞子集驱动了与GBM相关的血栓形成的多个方面，并且可能代表诊断和干预的目标。
针对生物标志物和治疗性TAR鉴定的小细胞肺癌中氟胞菌相关基因的原始研究综合分析
背景：铁铁作用是一种依赖铁的编程细胞死亡模式，该模式是由磷脂过氧化的有毒积累引起的。尽管已知它会影响肿瘤的起始和生长，但尚未建立与铁毒相关基因（FRGS）（FRGS）（FRGS）（SCLC）之间的关联。方法：我们使用基因表达综合（GEO）和铁毒数据库（FERRDB）来获取有关SCLC及其相关FRG的信息。随后，使用最小绝对收缩和选择算子（LASSO）和支持向量机递归特征Eilmination（SVM-RFE）算法鉴定出标记基因，并分析单基因函数和途径富集。使用药物 - 基因相互作用数据库（DGIDB），我们确定了针对六个标记基因的40种药物。竞争性的内源性RNA（CERNA）网络揭示了基于标记基因的长期非编码RNA（LNCRNA） - microRNA（miRNA） - 梅纳（miRNA） - 梅纳（miRNA） - 通用RNA（mRNA）。结果：将六个差异表达的FRG（ATG3，MUC1，RRM2，IDH2，PARP1和EZH2）鉴定为具有准确诊断能力的标记基因。根据单基因功能和途径富集分析，这些标记基因可能与免疫调节和细胞周期有关，以及与肿瘤发生相关的许多途径，包括JAK-Stat和PPAR信号途径。此外，Cibersort分析表明，MUC1和PARP1表达可能会影响SCLC中的免疫微环境。现在必须在临床应用之前通过进一步的研究来确认这些结果的准确性。结论：我们使用逻辑回归模型确认了标记基因诊断SCLC的准确性，从而提供了进一步研究与SCLC相关机制的机会。
二价染色质作为癌症治疗靶点
肿瘤细胞异质性是有效设计靶向抗癌疗法的主要障碍。药物治疗前表型不同的肿瘤细胞亚群的多样化分布容易导致反应不一致，导致敏感癌细胞被消除，而耐药亚群却不受伤害。很少有人提出量化与个体癌细胞异质性相关的变异性并将其对临床结果的不良影响降至最低的策略。在这里，我们报告了一种计算方法，该方法可以合理设计涉及针对染色质修饰剂的表观遗传药物的组合疗法。我们制定了一个二价转录因子的随机模型，使我们能够表征三种不同的定性行为，即：双稳态、高基因表达和低基因表达。分析结果与实验数据的比较确定了所谓的双稳态和高基因表达行为可以分别与未分化和分化细胞类型识别。由于具有异常自我更新潜能的未分化细胞可能表现出癌症/转移起始表型，我们在双稳态子集合内的异质性背景下分析了表观遗传药物组合的效率。虽然单靶向方法大多无法规避肿瘤异质性所代表的治疗问题，但组合策略的效果要好得多。具体而言，预计更成功的组合涉及组蛋白 H3K4 和 H3K27 去甲基化酶 KDM5 和 KDM6A/UTX 的调节剂。然而，那些涉及 H3K4 和 H3K27 甲基转移酶 MLL2 和 EZH2 的策略预计效果较差。我们的理论框架为开发一种计算机模拟平台提供了连贯的基础，该平台能够识别最适合治疗管理异质癌细胞群非均匀反应的表观遗传药物组合。
PARP抑制剂和蛋白质与SLX4相互作用
PARP-1蛋白通过将XRCC1募集到修饰的DNA位置来参与单链断裂修复。当抑制PARP时，细胞依赖其他DNA修复机制，尤其是同源重组，以正确复制基因组信息，而无需进行致命性有丝线的风险。在具有同源重新组合的细胞中，例如BRCA1-或BRCA2突变的细胞，PARP抑制是致命的[1，2]。在2005年提供了这些描述后，合成致死性的概念出现，而PARP抑制剂（PARPI）的开发是为了治疗BRCA-Muthated患者，在该患者中，非癌细胞具有一个野生型等位基因，而癌细胞则是BRCA的定义，因此是特异性敏感的，因此具有特异性敏感性。几个PARPI已在临床上进行了研究，可用于治疗癌症患者（Olaparib，Rucaparib，Talazoparib，Niraparib和Veliparib（ABT-888））。有关PARPI的科学文献非常丰富（自2005年以来> 12,000篇论文），研究论文，临床试验和评论涉及有关作用机理，抗药性，临床活动以及新化合物的发展。最初认为PARPI的作用机理是对PARP1相关的单链破裂修复的“简单”抑制作用，随后出现更具毒性和更容易恢复的双链断裂。然而，真理要复杂得多，正如T. Helleday [3]已经讨论的那样，自从该出版物[4]开始。关于Parpi的许多知识仍然未知，它们的临床可能比今天所描述的要强。基于这些知识的工作促进了与PARPI活性和耐药机制有关的其他蛋白质的鉴定，并有助于发展与其他DNA相关蛋白（如RAD51 [5]和EZH2 [6]的药理抑制其他与DNA相关蛋白的相关策略[6]。特别是其他DNA修复的可能参与
晚期前列腺癌中极光激酶A的治疗靶向
评论前列腺癌（PCA）通常从雄激素依赖性状态转变为雄激素剥夺疗法（ADT）后，更具侵略性的形式称为耐custatration-Castration-Castration-Castration canstration Cancer（CRPC）。ADT，包括手术或医疗cast割，最初通过抑制Andro Gen受体（AR）信号传导来减轻肿瘤负担，这是Pros Tate癌症生长的关键驱动力[1，2]。但是，由于恢复或绕过AR信号的几种机制，CRPC最终会发展。这些机制包括AR基因扩增，AR突变，con活性AR剪接变体的表达和肿瘤内雄激素合成[1-3]。该过渡的基础机制涉及遗传，表观遗传和激素变化，这些变化促进了细胞塑性。关键的遗传改变包括肿瘤抑制基因（例如RB1，TP53和PTEN）的丧失，以及表观遗传调节剂（例如EZH2）的变化，这有助于从前列腺腺癌cinoma转变为NEPC [4，5]。此外，诸如ASCL1和SOX2之类的转录因子在驱动神经内分泌分化和主要表型中起着至关重要的作用[6，7]。NEPC的发展通常遵循广泛的雄激素受体途径抑制剂，抗雄激素耐药性和雄激素受体表达的丧失。尽管循环雄激素的cas含量水平，但这些适应性允许持续的AR活性，驱动肿瘤pro的疗程[1，2]。CRPC肿瘤的一个子集可以独立于AR信号传导并采用神经内分泌特征，从而导致神经内分泌前列腺癌（NEPC）。NEPC的出现与对常规疗法的抵抗力和预后不良有关。NEPC的特征是AR表达的丧失和神经内分泌标记物的增益，例如铬烷蛋白A和突触素蛋白[4]。这种过渡通常是由遗传和表观遗传学变化驱动的，包括肿瘤SUP压力器（如TP53和RB1）的丧失，谱系的激活
剪接靶向药物强调内含子保留是晚期前列腺癌的一个可操作弱点
摘要背景晚期前列腺癌 (PC) 的特点是对雄激素剥夺疗法和化疗不敏感，导致大多数患者的预后不良。因此，晚期 PC 迫切需要新的治疗策略。越来越多的证据表明剪接失调是晚期 PC 的标志。此外，药物抑制剪接过程正在成为治疗这种疾病的一个有希望的选择。方法通过使用代表性的雄激素不敏感 PC 细胞系 (22Rv1)，我们研究了三种剪接靶向药物：Pladienolide B、indisulam 和 THZ531 产生的细胞毒作用背后的全基因组转录组效应。进行了生物信息学分析以揭示对这些治疗的转录和剪接调控敏感性背后的基因结构特征。通过基因本体分析注释了这些治疗改变的生物途径，并通过细胞模型中的功能实验进行了验证。结果尽管 Pladienolide B、indisulam 和 THZ531 对晚期 PC 细胞具有相似的细胞毒作用，但它们会调节特定的转录和剪接特征。药物敏感性与受调控的外显子和内含子中不同的基因结构特征、表达水平和顺式作用序列元素有关。重要的是，我们确定了与 PC 相关的基因 (即 EZH2、MDM4)，其药物诱导的剪接改变会对细胞存活产生影响。此外，计算分析发现剪接靶向药物对内含子保留有广泛影响，并且在与前 mRNA 3' 端加工有关的基因 (即 CSTF3、PCF11) 中富集。与此相符的是，晚期 PC 细胞对裂解和多聚腺苷酸化复合物的特定抑制剂表现出高度敏感性，这增强了已经用于治疗这种癌症的化疗药物的效果。结论 我们的研究发现内含子保留是晚期前列腺癌的一个可操作弱点，可以利用它来改善这种目前无法治愈的疾病的治疗管理。关键词 晚期前列腺癌、剪接抑制剂、可变剪接、内含子保留、3'-末端 mRNA 加工、转录组学
表观遗传分子因子的表达与癌细胞系中化学治疗剂的DNA甲基化和敏感性的表达相关性
抽象背景：改变的DNA甲基化模式在癌症的发展和进展中起着重要作用。我们检查了直接或间接参与DNA甲基化和脱甲基化的基因的表达水平是否与癌细胞系对用多种抗肿瘤药物进行化学疗法治疗的反应有关。结果：我们分析了直接或间接参与DNA甲基化和脱甲基化过程的72个基因。我们检查了它们的预处理表达水平与单个DNA甲基化探针的甲基化β值，基因区域内的DNA甲基化平均以及平均层状甲基化水平的关联。我们分析了癌细胞系百科全书中的645种癌细胞系和23种癌症类型的数据，以及癌症数据集中药物敏感性的基因组学。我们观察到编码表观遗传因子的基因表达与对化学治疗剂的反应之间的许多相关性。编码各种表观遗传因子的基因的表达，包括KDM2B，DNMT1，EHMT2，SETDB1，EZH2，APOBEC3G和其他基因，与多个药物的响应有关。DNA甲基化的众多靶探针和基因区域与编码表观遗传因子的多个基因的表达相关，强调通过多个相交的分子途径来强调表观遗传组甲基化的复杂调节。结论：编码表观遗传因子的多个基因的表达与药物反应以及可能影响对治疗剂反应的许多表观遗传组靶标的DNA甲基化有关。The genes whose expression was associated with methylation of multiple epigenome targets encode DNA methyltransferases , TET DNA methylcytosine dioxyge- nases , the methylated DNA-binding protein ZBTB38, KDM2B, SETDB1, and other molecular factors which are involved in diverse epigenetic processes affecting DNA methylation.虽然许多表观基因组靶标的基线DNA甲基化与细胞系对抗肿瘤药物的反应相关，但每个表观遗传因子对特定靶标的甲基化的重叠作用与肿瘤对单个药物反应中这种影响的重要性之间的复杂关系需要进一步研究。我们的发现表明了调节表观基因组中DNA甲基化的互连途径，这可能直接和间接影响对化学疗法的反应。
2024日本白血病研究基金奖获得者
◆2024年日本白血病研究基金奖获奖者◆[Ogimura Takashi特别奖] Yasunobu Nagata [Nippon医学院血液学助理教授，助理教授]，“克服Bcl-2抑制剂 - 蒸发剂 - 溶性白血病，通过阐明分子麦克乳杆菌的抗抗菌抗菌抗衰变的分子抗衰变。。” [Takaku fumimaro奖] Kazumasa Aoyama [keio大学菲律学院，卫生化学司法部・助理教授]“识别EZH2功能障碍的药物目标骨髓发育异常综合症丧失“在AML理论中使用BCL2抑制剂开发新疗法” [Shimizu Yasunobu奖] Kohichi Kawahara [医学和牙科科学研究生院Kagoshima Univ，分子肿瘤学副教授]“分子肿瘤学的副教授”“ Molecuar the Molecuar the the Pediatrics Lew the Pediatrics Lew the Pate''[信用Saison Award] Yoshio Katayama [Kobe University Hospital，HemaTology ・ Junor副教授]“脂质介体概况老年骨髓及其用于控制骨髓软化疾病的应用。”[IDE Yukiko Award] Yasushige Kamimura [横滨城市大学医疗学院研究生院，干细胞和LMMUNE重新排出]“用于骨髓发育症的新治疗方法，用于脊髓卵形质量的脊髓石质量疾病的脑静脉曲张syudromes bascd。 [特别奖项---临床医学特别奖（无特殊顺序）]高摩·卡米亚（Takahiro Kamiya卢克国际医院儿科部长，参谋长]“用降低综合征的髓样白血病建立了新型风险分层疗法。” [一般研究奖（无特殊顺序）] Genki Yamato [Gunma University医学院，儿科教授，助理教授]，“小儿急性髓样白血病中的全基因组DNA DNA甲基拉顿分析”。 Dai Keino [卡纳那川儿童医疗中心，血液学 /肿瘤学系]“ ｓｔｕｄ y ｏｆ ｏｆ ｏｆ ｏｆ ｐ ｐ ｐ ｐ ｐ ｐ ｐ ｐ ｏｐ ｏｐ ｏｐ ｏｐ ｏｐ ｏｆ ｏｆ ｏｆ ｏｆ ｏｆ ｏｆ ｏｆ ｏｆ ｏｆ ｃｏｎｄ-代代代酪氨酸激酶抑制剂在治疗儿童的慢性和加速相的奇异性髓样性白血病。”
Kim Jy，Lee J，Kim SG，Kim NH。最近的糖症是2型糖尿病中β细胞功能的主要决定因素。糖尿病Metab J 2024; 48：1135-11 肝纤维化和癌症：代谢综合征的沉默威胁 2023韩国糖尿病协会的糖尿病临床实践指南 糖尿病通过AMPK/EZH2/... 促进心肌纤维化
背景：β细胞功能的逐渐恶化是2型糖尿病（T2DM）的特征。我们旨在介绍临床因素对T2DM中β细胞功能的相对贡献。方法：在470名成年人的T2DM队列中（疾病持续时间为0到41年），使用胰岛素生成IN- DEX（IgI），性格指数（DI），口服性格指数（DI O）和β-Cell函数的稳态（HOMA-B）衍生（HOMA-B）的稳态评估估算β细胞功能。 （OGTT）。年龄，性别，疾病持续时间，体重指数，糖基化血红蛋白（HBA1C）水平（在OGTT时），HBA1C曲线下的面积（HBA1C AUC）（HBA1C AUC），HBA1C CV（HBA1C CV）的差异（HBA1C AUC）的曲线（HBA1C AUC）和替代品均与抗差异级别相比。还进行了这些指数的纵向分析。结果：随着时间的推移，Igi，Di，di O和Homa-B随着时间的推移而下降（所有人的p <0.001）。值得注意的是，在多变量回归分析中，HBA1C是影响IgI，DI，DI O和HOMA-B的最重要因素。与HBA1C≥9％相比，DI为1.9-，2.5-，3.7-和5.5倍，在8％的HBA1C（<9％，7％，<8％，6％ - <7％ - <7％– <7％和<6％）调整后，调整了混淆因子后（P <0.001）。相反，β细胞功能不受抗糖尿病药物，HBA1C AUC或HBA1C CV的类型或持续时间的影响。Igi，di，di o和homa-b的轨迹反映了HbA1c的轨迹。结论：随着时间的流逝，β细胞功能会下降；但是，它是灵活的，在很大程度上受T2DM中最近的糖脂的影响。