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PhD学生（M/F/D）在CAR T细胞的表观遗传学上PhD学生（M/F/D）在CAR T细胞的表观遗传学上
Helmholtz生物医学工程研究所 - 干细胞生物学研究所 - 为CAR T细胞表观遗传学的博士学位学生（M/F/D）提供位置（TV -L E13; 65％）的位置（TV -L E13; 65％）尽快开始，并最初为3年提供了用于扩展的选择。CAR T细胞疗法是各种类型癌症的一种有前途的治疗方法。但是，我们的初步工作表明，表观遗传学变化在体外CAR T细胞的体外扩张期间，尤其是在DNA甲基化模式中，这可能会干扰临床结果。在该项目中，由JoséCarrerasLeukemia Foundation资助，我们希望更好地了解表观遗传修饰如何影响细胞功能并开发生物标志物，以用于CAR T细胞生产的质量控制。纳米孔测序，Illumina beadchips和Scrna-seq轮廓。我们将使用CRISPR技术更好地了解相关的信号级联。该项目是与G. Ferrer博士/教授的研究小组合作进行的。M. Esteller（巴塞罗那）。 您可以在我们的研究小组下找到更多信息：http：//www.stemcellbiology.ukaachen.de。 参考：Salz等人，白血病2023 https://www.nature.com/articles/s41375-023-023-01966-1.pdf您的任务M. Esteller（巴塞罗那）。您可以在我们的研究小组下找到更多信息：http：//www.stemcellbiology.ukaachen.de。参考：Salz等人，白血病2023 https://www.nature.com/articles/s41375-023-023-01966-1.pdf您的任务
控制人白血病干细胞和抗药性的表观遗传机制 在压力下，具有较高代谢独立性的微生物富含人类肠道微生物 柱子中的再生人肝癌（HLOS）/ ... div> 聚ADP-核糖信号在亨廷顿疾病中失调 大语言模型克服了生态学中非结构化文本数据的挑战 宿主菌群中促进寿命的clanic酸的化学诱导 标题：蝴蝶翼尺度的山脊和Crossrib的高度是... 解释混合种群中的SNP遗传力 冥想专业知识的功能连接指纹 评估伪细菌中基因表达的载体及其在Aplysina Marine Sponge研究中的应用 多蛋白质结构与flodmason 进行比对
许多人类癌症，包括急性髓样白血病（AML），是由茎和祖细胞突变引起的。免疫表型分析表明，白血病在层次上发展，白血病干细胞中的突变与疾病传播相关并复发1,2。尽管可以使用细胞表面标记来富集白血病，但它们的频率往往是可变且低，遮盖机制，并阻碍有效的疗法3,4。为了定义人类患者的AML干细胞，我们使用旨在保留造血干细胞（HSC）功能的标签跟踪技术对各种白血病进行了功能基因组分析。我们发现，人类AML的传播是由罕见但静止的静态标签细胞（LRC）种群介导的，该细胞（LRC）种群通过当前已知的免疫表型标记逃避检测。我们表明，人类AML LRC静止是可逆的，保留遗传克隆竞争，维持其表观遗传。lrc静止是由以不同的以启动子为中心的染色质和基因表达动力学定义的，并由不同的AP-1/ETS转录因子网络控制，包括JUN，这与疾病持久性和不同患者的化学疗法抗性有关。这些结果能够对人类患者标本中免疫类型的白血病干细胞的前瞻性隔离和功能性遗传操纵，并在白血病发育和耐药性中建立了表观遗传可塑性的关键功能。我们预计这些发现将导致阐明白血病干细胞静止的基本特性，以及为其临床鉴定和控制的治疗策略设计。
FOXP3与乳头状甲状腺癌易感性的遗传和表观遗传关联
摘要：乳头状甲状腺癌（PTC）是最常见的甲状腺恶性肿瘤类型，女性发病率增加。X染色体遗传的特定特征可能与PTC易感性的性别差异有关。这项研究的目的是研究两个X连锁基因，即叉子盒P3（FOXP3）和蛋白质磷酸酶1调节性亚基3F（PPP1R3F）与PTC倾向和性别差异的关联。参加了1006名PTC患者，并参与了相等数量的匹配健康志愿者。RS3761548（FOXP3）和RS5953283（PPP1R3F）的基因分型是使用聚合酶链反应 - 限制性片段长度多态性测定（PCR-RFLP）进行的。使用亚硫酸盐限制分析（COBRA）方法评估FOXP3的甲基化状态。SPSS软件用于统计分析。性别分层分析表明，CA和AA基因型以及FOXP3 RS3761548变体的AR等位基因仅与女性中的PTC倾向有关。此外，在PTC女性患者之间，携带CA和CC基因型以及对照组的PTC女性患者之间观察到Foxp3的启动子基因座的不同甲基化状态。两者揭示的关联都可以通过减少与免疫相关血细胞中报道的FOXP3表达来解释女性的PTC发病率更高。
用于表观遗传学研究的 FFPE 肿瘤样本的规模化制备
图 4. Charles River Laboratories 共享了小鼠模型患者来源的异种移植瘤 (PDX) 的 FFPE 卷轴。来自 2 名患者样本的 PDX 肿瘤被嵌入 1 至 7 年的石蜡块中。使用 Qiagen AllPrep DNA/RNA FFPE 试剂盒从核材料中提取 gDNA，并通过 Agilent TapeStation 评估 DNA 完整性评分 (DIN)。K562 对照 A (未固定) gDNA 由 Qiagen AllPrep DNA/RNA FFPE 试剂盒提取，K562 对照 B (未固定) gDNA 由 Zymo Quick-DNA/RNA 纯化试剂盒提取，以提供来自 2 个 DNA 提取试剂盒的高质量样本示例。顶部代表性图像：明场碎片。底部代表性图像核标记：碘化丙啶。
5-氟尿嘧啶和表格曲霉3-甘酸酯的协同细胞毒性在结直肠癌干细胞上
背景：结直肠癌干细胞（CR-CSC）源自HCT-116细胞系建立的人类结肠癌细胞系，用CD44+/CD133+验证。这项研究通过全面的细胞毒性评估来研究将上瓜蛋白酶（EGCG）与5-氟尿嘧啶（5-FU）组合对CR-CSC的协同作用，旨在增强治疗结果。EGCG是一种在绿茶中具有抗癌活性的多酚。先前的研究报道，EGCG的抗癌活性涉及抑制凋亡的增殖和诱导，从而在脊柱切除术后结直肠腺瘤的患者中降低了多达51.6％的复发。意义在于通过了解常规化学治疗剂和天然化合物之间的潜在协同作用来优化治疗策略。鉴于5-FU作为CR-CSC化学疗法中的基石和EGCG的出现作为有希望的天然化合物的地位，该研究探讨了其个体和组合的细胞毒性谱。
表观遗传调节剂为理解疾病和治疗机会提供了途径
表观遗传学研究的是基因组的非遗传干扰产生的可遗传表型以及 DNA 核苷酸序列之上发生的机械过程。例如，对 DNA 的直接修饰、DNA 围绕构成染色质的组蛋白八聚体的组织以及翻译后修饰 (PTM) 在组蛋白尾部形成的直接能力会影响基因调控和细胞命运决定等可遗传特征。表观遗传状态不仅可遗传，而且可以动态且可逆（Jenuwein 和 Allis 2001）。新兴发现和尖端技术的使用为表观遗传调节剂控制的生理过程提供了见解。大量研究已经证实，蛋白质编码基因的异常表达以及种系和体细胞突变会影响 PTM、基因组组织格局的调控，进而影响发病机制，从而揭示出对抗多种疾病的生物标志物和新的治疗靶点（Dawson 和 Kouzarides 2012；Rando 和 Chang 2012；Sen 等人 2016；Dobson
病毒基因组的表观遗传沉默作为慢性乙型肝炎的疗法
RUO分析合并：•将评估新颖的测定法，以检测血液中直接的CCCDNA活性，并有助于临床疗效并定义成功。•随着数据的出现，必须讨论此MOA的NUC停止标准的决策。
用于乙肝治疗的基因编辑和表观遗传平台
• 全球已有 143 多名患者接受了基因编辑疗法治疗。• FDA 最近批准 Intellia 的 NTLA-2001 计划启动关键的 III 期试验。• 已批准基因编辑临床试验的监管机构包括美国、英国、法国、澳大利亚、加拿大新西兰、德国、瑞典和荷兰。• 利用 Precision BioSciences 专有的 ARCUS 平台进行体内基因编辑，最近已获准在英国、美国和澳大利亚进行临床试验（ECUR-506）。
铬、镍和镉的表观遗传调控
摘要：环境和职业暴露于六价铬、镍和镉等重金属是全球主要的健康问题。一些重金属是已证实的人类致癌物。DNA损伤、基因表达失调和异常的癌症相关信号传导等多种机制已被证明会导致金属诱发的致癌作用。然而，重金属诱发致癌和血管生成的分子机制仍不完全清楚。近年来，越来越多的研究表明，除了基因毒性和基因突变外，表观遗传机制在金属诱发的癌症中起着至关重要的作用。表观遗传学是指在不改变DNA序列的情况下对基因组进行的可逆性修饰；表观遗传修饰通常涉及DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重塑和非编码RNA。表观遗传调控对于维持正常的基因表达模式至关重要；表观遗传修饰的破坏可能导致细胞功能改变，甚至恶性转化。因此，异常的表观遗传修饰广泛参与金属诱导的癌症形成、发展和血管生成。值得注意的是，表观遗传机制在重金属诱导的致癌作用和血管生成中的作用仍不清楚，迫切需要进一步研究。在这篇综述中，我们重点介绍了目前在理解表观遗传机制在重金属诱导的致癌作用、癌症进展和血管生成中的作用方面的进展。
影响乳腺癌治疗反应的表观遗传机制。
大多数乳腺癌是雌激素受体 (ER)+，几十年来，针对 ER 信号通路的药物显著提高了乳腺癌女性的生存率。然而，治疗耐药性最终会出现，尤其是在转移性环境中。在过去十年中，破坏表观遗传调控过程已成为许多癌症类型致癌的主要因素。染色质修饰剂和转录因子的异常也被认为是乳腺癌发展和治疗结果的介质，并且已经提出了新的表观遗传疗法与靶向疗法相结合。在这里，我们将讨论我们对乳腺肿瘤发生染色质机制的理解的最新进展，这些机制如何影响对标准治疗的治疗反应，并讨论克服耐药性的治疗干预新策略。