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主要编辑技术的最新进展及其在治疗应用方面的前景
Prime editing (PE) 是一种突破性的基因组编辑技术，可在靶向基因组修饰方面提供无与伦比的精度，并具有巨大的治疗应用潜力。本综述深入探讨了 PE 的核心原理，并强调了其进步、应用和前景。我们首先简要介绍 PE 原理，然后详细研究效率、精度和可行编辑规模方面的最新改进。这些改进是通过引导 RNA 工程、蛋白质工程、DNA 修复途径筛选、染色体或表观基因组修饰以及计算机设计和优化工具对 PE 系统进行的。此外，我们重点介绍了体内研究，展示了 PE 在模拟和治疗遗传疾病方面的治疗潜力。此外，我们讨论了 PE 在饱和基因组编辑中的多种应用及其对非人类生物的适用性。最后，我们讨论了与 PE 相关的挑战和机遇，强调了它对生物研究和治疗的深远影响。
共识分子亚型CMS4结肠癌的临床挑战
在Guinney及其同事在2015年的具有里程碑意义的研究中的共识分子亚型（CMS）的定义，基于大量转录组的专业填充，已将结直肠癌的新时代视为具有不同的实体，并具有不同的实验，并具有特定的基因疗法，基因分子疗法，临床上，分子，分类（Morecular），分类（Molecormult）。从那时起，CMS分类已成为描述大肠癌多样性的重要参考。这显着来自更专门的深入研究，表明该分类也与肿瘤微环境有关（TME;参考2），miRNA（3）或表观基因组景观（4）。表1总结了每个子类型的各种特征，我们将读者引用了几个出色的评论，以获取更多细节（5，6）。Brie pl Y，CMS1组（占患者的14％），称为“免疫”，在微卫星不稳定性的患者中富含（MSI；参考1）。“典型” CMS2（患者的37％）和“代谢” CMS3（13％的患者）亚组的特征都是上皮类型和良好的
关于“加速生物学2024
Speakers: Dr.Eric Stahlberg, Frederick National Laboratory for Cancer Research, USA : A Global Perspective for Accelerating Innovation in Biomedical Digital Twins and Precision Medicine Dr. Cezary Mazurek, PSNC, Poland: Enabling Digital Twins for Biomedicine in National eInfrastructure Prof. Peter Coveney, University College London, UK: Digital Twins: The Virtual Future of Medicine Dr. Mariano Vazquez，Elem Biotech，西班牙，Dan Isaacs博士，数字双胞胎财团，美国，Priyanka Banerjee博士，柏林慈善大学，柏林，12：30 - 13:30海报就职典礼和海报I 13:30 - 30:30 - 14:14:30乳腺癌：TMC体验Sudeep Gupta教授，TMH，孟买15：00 - 15:30胃肠道癌的新兴表观基因组景观：生物学和
胶质母细胞瘤面具背后的真相
胶质母细胞瘤是最常见的恶性脑肿瘤，其特点是预后不良。它们通常被分为原发性异柠檬酸脱氢酶 1 或 2 (IDH1-2) 野生型 (wt) 胶质母细胞瘤 (GBM) 和继发性 IDH 突变型 GBM，其中 IDH wt GBM 通常与高龄和预后不良有关。最近，遗传分析已与表观遗传学研究相结合，强有力地实现了脑肿瘤（包括 GBM）的分型和亚型，并导致了新的 WHO 2021 分类。GBM 基因组和表观基因组谱影响进化、耐药性和治疗反应。然而，与其他肿瘤不同，精细的 GBM 分析与有限的治疗机会之间存在很大差距。此外，涉及胶质细胞转化的不同致癌基因和肿瘤抑制基因、癌症的异质性以及血脑屏障对药物获取的限制限制了临床进展。本综述将总结在胶质母细胞瘤中发现的更相关的基因变异，并强调它们作为潜在治疗靶点的潜在作用。
DNA G-四链体是一种转录控制设备，可调节存储器
取决于基因表达的协调变化，特别是在内侧前额叶皮层的垂直区域（ILPFC； Martin等，2000； Bruel-Jungerman等，2007； Alberini，2009）。近年来，我们和其他人表明，此过程涉及转录机械和表观基因组机制之间的严格控制相互作用（Campbell和Wood，2019年）。DNA在细胞中比RNA，蛋白质或脂质更为持久，因此其调节的机制是理解行为适应的关键（Marshall和Bredy，2016年）。尽管长期以来与神经元的可塑性和记忆长期以来一直与DNA和组蛋白的修饰有关（Vanyushin，2006; Bredy等，2007; Vecsey等，2007; Wei等，2012;Grä虫，2014; li et al。这是因为DNA结构和功能之间的关系主要归因于右手双螺旋，
神经内分泌前列腺癌的治疗考虑
谱系可塑性和向小细胞神经内分泌前列腺癌 (NEPC) 的组织学转化是晚期前列腺癌治疗耐药的一种日益被认可的机制。这与侵袭性临床特征和不良预后有关。最近的研究已经确定了将 NEPC 与前列腺腺癌区分开来的基因组、表观基因组和转录组变化，并指出了新的机制和治疗靶点。治疗相关的 NEPC 在疾病进展过程中从前列腺腺癌克隆产生，保留早期基因组事件并获得导致肿瘤增殖而不依赖于雄激素受体活性的新分子特征，并最终显示出从腔内前列腺癌表型向小细胞神经内分泌癌的谱系转换。确定最容易受到谱系可塑性影响的前列腺肿瘤亚群并制定针对 NEPC 患者的早期检测和干预策略最终可能会改善预后。专注于谱系可塑性过程和/或 NEPC 药物靶向的临床试验将需要仔细选择患者。在这里，我们回顾新兴目标并讨论可能对未来临床研究设计有帮助的生物标志物考虑因素。
了解胶质母细胞瘤的基因组概况
摘要。胶质母细胞瘤 (GBM) 被世界卫生组织 (WHO) 归类为 4 级胶质瘤，是一种致命的中枢神经系统肿瘤。随着特定基因异常的发现，GBM 分类已被多次修改，以提供更好的诊断和预后准确性。尽管目前的治疗方式包括手术切除、辅助化疗和放疗相结合，可以短暂控制肿瘤进展，但生存结果仍然令人沮丧。GBM 仍然具有侵袭性，并且复发的主要原因是存在一群独特的无法治疗的胶质母细胞瘤干细胞 (GSC)。高突变率和转录景观失调增加了 GSC 对常规化疗和放射疗法的抵抗力，导致 GBM 患者的预后不佳。因此，GSC 已成为新 GBM 治疗模式的关注目标。因此，了解它们的独特特性（例如 GSC 与缺氧微环境的相互作用，从而促进其生长）非常重要。信号通路的表观基因组调节剂和基本分子成分是胶质母细胞瘤治疗的潜在靶点。在这篇综述中，我们旨在
整合基因组学，表观基因组学和传统智慧
在个性化医学的不断发展的景观中，将阿育吠陀原理与现代基因组科学融为一体为医疗保健带来了变革性的机会。本文探讨了普拉克里蒂（Prakriti）的概念，即阿育吠陀（Ayurveda）定义的个体的独特构成及其与遗传特征的潜在相关性。通过将阿育吠陀见解与基因组和表观基因组研究合并，我们提出了一个个性化医疗保健框架，以考虑遗传倾向和生活方式因素。该研究概述了实际方法，包括使用单核苷酸多态性（SNP）分析来识别与特定prakriti类型相关的遗传变异，以及表观遗传学在理解生活方式选择如何影响基因表达中的作用。此外，我们讨论了全基因组关联研究（GWAS）的实施，以识别可以增强针对个人需求量身定制的疾病预防和治疗策略的生物标志物。通过促进阿育吠陀从业者与基因组研究人员之间的合作，我们旨在促进对健康的整体理解，使古老的智慧与当代科学联系起来。最终，这种整合不仅丰富了个性化的医疗保健，而且为尊重遗传多样性和传统知识的创新治疗解决方案铺平了道路。
针对特异性STAT2抑制的黄病毒NS5的构象选择机制
实验在验尸后24小时内完成，这些健康细胞在单细胞转录组学实验中产生高质量的数据。这些血管细胞可以进行培养，转移和扩展，以进行许多体外测定，包括矩阵血管管形成，微流体腔室和代谢测量。在这些培养条件下，初级血管细胞至少三周保持细胞类型标记的表达。最后，我们描述了如何使用原代血管细胞将其移植到皮质器官中，该细胞捕获了产前人脑发育中神经血管相互作用的关键特征。就时间，组织加工和染色而言，大约需要3个小时，然后再花费3个小时的FACS。原发性FACS纯化的血管细胞中的移植程序需要额外2小时。不同的转录组和表观基因组协议所需的时间可能会根据特定应用而有所不同，我们提供了减轻批处理效果和优化数据质量的策略。总的来说，这种以Vasculo为中心的方法提供了一个综合平台来询问神经血管相互作用和人脑血管发育。
活性染色质中的 H3K9 三甲基化限制了 SINE B2 重复序列中功能性 CTCF 位点的使用
六种甲基转移酶分工建立组蛋白 H3 赖氨酸 9 甲基化 (H3K9me) 的基因组图谱，H3K9me 是一种控制组成性异染色质、基因抑制和逆转录元件沉默的表观基因组修饰。其中，SETDB1 被募集到活性染色质域以沉默内源性逆转录病毒的表达。在旨在确定 SETDB1 对巨噬细胞中刺激诱导基因表达的影响的实验中，我们发现 SETDB1 耗竭导致的 H3K9me3 丢失与 CTCF 募集增加有关，这些募集到 SINE B2 重复序列中包含的 >1600 个 DNA 结合基序，这是之前未确定的 SETDB1 介导的抑制靶点。CTCF 是染色质折叠的重要调节剂，可抑制黏连蛋白引起的 DNA 成环，从而在相邻拓扑域之间创建边界。 CTCF 与 SINE B2 重复序列的结合增加，增强了数百个位点的绝缘性，并增加了含有脂多糖诱导基因的拓扑域内的环形成，这与它们对刺激的调节受损有关。这些数据表明 H3K9me3 在抑制 CTCF 的基因组分布和活性方面发挥着作用，并对染色质组织和基因调控产生影响。