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测试摄影年度报告2021-22
在董事的桌子上，我很高兴地宣布，CSIR-IICB年度报告的2021 - 22年发布。它在这一年中瞥见了研究所的成就，尤其是为将科学和技术带给社会各个角落所做的努力。该研究所成立于1935年，是印度医学研究所。目前，它是CSIR的组成实验室之一，参与了人类疾病的疗法和诊断策略的发展。除了加尔各答Jadavpur的主要校园外，它在盐湖还有一个卓越的转化研究单位。六个研究部门管理CSIR-IICB的研发活动。该研究所在化学生物学，生物化学，细胞生物学，基因组学，表观基因组学，结构生物学，生物信息学和药物化学领域的知识产生显着促进了知识的产生。在研究所进行的尖端研究涉及与该国最相关的传染性和非传染性疾病相关的基本生物和生物医学研究挑战。我们的科学家在理解各种蛋白质的结构和机械特征，大分子复合物和细胞途径，靶向RNA的小分子，挽救生命药物的成本效益过程化学以及农业化学的化学化学化学，对纯草药和合成性抗癌的癌症造成癌症的癌症，对生命的癌细胞的鉴定，对生命的癌细胞的鉴定，对生命的癌症的疾病造成了重大的癌症， 部门。部门。部门。部门。部门。研究所提供的优秀科学基础设施包括X射线晶体学，核磁共振（NMR），冷冻EM，单分子荧光测量和荧光相关光谱，拉曼光谱，质谱法和纳米分离技术。除了探究研究的前沿外，该研究所的科学家还参与指导年轻学生确保继续稳定的研究人员，致力于国家的进步。我借此机会感谢我们的合作者，CSIR的姊妹实验室和CSIR-Beadquarters的及时帮助，支持和合作。我非常感谢CSIR-IICB家族的每个人，因为他/她在使该研究所成为该国主要的研究机构之一。
TaCIM_教室 2024-2025.pdf
2024 年 11 月 5 TaCIM 博士课程简介，随后由 Rania El Backly 教授主持研讨会 Pietro Ameri 11 临床前研究原则：基因组学和表观基因组学 Gabriele Zoppoli 18 临床前研究原则：从起源到未来的测序 Gabriele Zoppoli 26 临床前研究原则：基因编辑 Lorenza Pastorino 2024 年 12 月 3 统计学原则 Vincenzo Fontana、Luca Carmisciano 10 统计学原则 17 统计学原则 2025 年 1 月 7 统计学原则 Vincenzo Fontana、Luca Carmisciano 14 统计学原则 21 统计学原则 27 临床研究原则：观察性研究 Matteo Lambertini 2025 年 2 月 4 临床研究原则：临床试验 Lucia Del Mastro 11 临床研究原则：随机化 Alberto Ballestrero 18临床研究原则：偏见 Elisa Russo 25 临床研究原则：终点 Roberto Pontremoli 2025 年 3 月 4 临床前研究原则：组织标本处理 Federica Grillo 11 临床前研究原则：临床病理学 Paolo Nozza 18 临床前研究原则：临床生物化学和自身免疫 Paola Pesce 25 IRCCS Ospedale Policlinico San Martino 的研究 Antonio Uccelli 2025 年 4 月 8 动物研究原则：IRCCS Ospedale Policlinico San Martino 的动物设施 Michele Cilli、Simonetta Astigiano、Laura Emionite 15 动物研究原则：IRCCS Ospedale Policlinico San Martino 的动物设施 29 研究监管原则：机构动物护理和使用委员会 2025 年 5 月 6 研究监管原则：伦理委员会 TBD 13 和 20 如何展示您的研究 Pietro Ameri、Federico Gatto 27 内科和专科医学现状：血液学 Fabio Guolo、Michele Cea 2025 年 6 月 3 内科和专科医学现状：肿瘤学 TBD 10 内科和专科医学现状：癌症遗传学 TBD
社论：固体癌症治疗的新型组合疗法
联合疗法的概念是在1965年Emil Frei等人的1965年提出的。在急性白血病的小儿患者中发起了有史以来的第一种组合化疗（1）。这种组合治疗方法的成功已经极大地改变了临床肿瘤学的景观（2）。因此，癌症研究的许多重点是研究针对不同途径以产生有利的抗癌活性的组合疗法（3）。与此相一致，癌细胞基因组学，表观基因组学，转录组学和蛋白质组学的进步为鉴定新分子靶标和选择性靶向抗癌疗法的发展铺平了道路（4）。有针对性的疗法已大大扩展了可以与其他靶向疗法或化学治疗药物结合的组合抗癌疗法的选择（5）。抗癌疗法的组合在临床上吸引人，原因有几个。首先，联合疗法改善了治疗结果并产生了优异的治疗作用，尤其是在达到协同抗癌活性时（6）。其次，组合方法克服了克隆异质性，这进一步与提高的响应率有关（7）。第三，联合药物方案降低了该方案的毒性，因为它允许在维持的治疗效率下使用降低剂量的单个药物（6）。组合疗法的另一个优点是降低了耐药性的出现（6）。因此，制定策略在这种情况下，联合疗法可以同时靶向癌细胞存活所必需的几种分子途径，并取消与自适应耐药性相关的细胞机制（8）。尽管结合癌症治疗具有优势，但合并疗法的发展和利用伴随着一些挑战。组合疗法的一个挑战性方面是潜在的药物相互作用和共同管理药物的药代动力学，这些药物可能影响该方案的治疗活性（2，9）。此外，可能需要在组合中施用次优剂量的药物以避免毒性（9）。协同作用的定义尚无定论，尤其是在临床研究中，其预测具有挑战性（10）。从历史上看，大多数药物组合的发展是使用经验实验或临床环境进行的（7、8）。在这种情况下，很少进行详细的机械分析以预测有效组合（7）。
全球研究TR
小儿急性髓样白血病（AML）是一种恶性血液学疾病，其特征是骨髓中髓样前体的克隆增生（1）。尽管在了解和治疗小儿AML方面取得了重大进展，但它仍然是儿童与癌症相关死亡率的主要原因（2）。在过去的几十年中，在识别遗传和分子标记中取得了很大进步，这些标志在预测预后和指导治疗结果中起着至关重要的作用（3-6）。这些进步导致了靶向疗法的发展和更精确的风险地层方法，从而显着改善了患者的结果（7-9）。然而，高复发和难治案件的高度继续强调了这一领域正在进行的研究和创新的需求（10）。小儿AML研究中的一个关键挑战是该疾病的固有异质性，这使治疗决策和预后复杂化（11，12）。虽然关键的遗传突变和分子异常（例如FLT3-ITD，WT1，CEBPA突变和KMT2A重排）已被确定为重要的预后标记（13-16），但在我们对这些标记相互作用和促进疾病进步的理解方面仍然存在显着的差距（17）。解决这些差距对于克服复发和难治性疾病的持续挑战以及更好地将个性化治疗策略纳入临床实践至关重要。此分析提供了1999年至2023年小儿AML预后全球研究趋势的全面书目概述。通过检查诸如出版趋势，领先国家，著名的机构，影响力期刊，主要研究类别，著名贡献者，开创性参考和新兴趋势等关键方面，旨在为文件的当前景观和未来的文件提供清晰的快照。分析特别关注基因组学，转录组学和表观基因组学的进步如何塑造预后和治疗结果。此外，它探讨了临床试验在制定治疗方案中的关键作用，并突出了新兴疗法，这些疗法显示出改善患者预后的希望。这种文献计量方法综合了广泛的研究数据，提供了详细的系统概述。通过确定显着的趋势和关键研究，它为研究人员，临床医生和决策者提供了宝贵的见解。
10月17日，下一代HIV疫苗César...
10月17日，下一代HIV疫苗CésarBoggianoPhD首席科学家免疫生物学IAVI设计与发展实验室Brooklyn陆军末端（BAT）10月31日，我们可以将转移性癌细胞转化为正常细胞吗？用于转移性癌症的细胞转换治疗Jianjun Wang，博士学位副教授B i化学和分子生物学副教授韦恩州立大学医学院11月14日，人类人体化小鼠的人类肝病感染分析Alexander Ploss Alexander Ploss Alexander Ploss，Alexander Ploss，PhD编码RNA处理和抗体多元化机制Uttiya Basu，博士学位助理教授微生物学和免疫学哥伦比亚大学医师和外科医生学院医师和外科医生学院蛋白质退化道路对VLDL分泌的调节Edgradative Pathways Edgradative Pathways Edgradative Pathways Edgradate Pathways Edgradate Pathways Edgradate Pathways，Edward A. Fisher，MD预防心血管疾病纽约大学医学院1月23日电压 - 通过计算和实验ted bargiello对连接蛋白通道的控球大学2月20日，Harn Essing干细胞用于研究和治疗帕金森氏病Lorraine Iacovitti博士。Grant，医学博士，佛罗里达大学药理学和治疗学院博士学位教授神经病学教授托马斯·杰斐逊大学3月6日激活和灭活机制，内皮炎症性超级渗透性 - 渗透率 - 沃尔特·杜兰（Walter N. 15 CNS神经炎症在糖尿病微血管并发症的发病机理Maria B.
人工智能与癌症研究相遇 2025 年 11 月 11-12 日
• Mohammed Alquraishi，哥伦比亚大学医学中心系统生物学系数学基因组学项目 • Fatima Al-Shahrour，西班牙国家癌症研究中心 (CNIO) 生物信息学部门 • Alberto Ciccia，哥伦比亚大学欧文医学中心遗传学与发育系 • Marcos Diaz-Gay，加州大学圣地亚哥分校细胞与分子医学系 • Joaquin Dopazo，进步与健康基金会计算系统医学组 • Anum Glasgow，哥伦比亚大学欧文医学中心生物化学/分子生物物理学系 • Daniel Gonzalez-Peña，维哥大学生物信息学与机器学习 • Despina Kontos，哥伦比亚大学欧文医学中心放射学系 • Tal Korem，哥伦比亚大学医学中心系统生物学系数学基因组学项目 • Michal Levo，哥伦比亚大学医学中心生物化学/分子生物物理学系数学基因组学项目 • Oscar Llorca， DNA 损伤反应中的大分子复合物西班牙国家癌症研究中心 (CNIO) • Geoff Macintyre，计算肿瘤学组西班牙国家癌症研究中心 (CNIO) • Nuria Malats，遗传和分子流行病学组西班牙国家癌症研究中心 (CNIO) • Jaewon Min，哥伦比亚大学欧文医学中心病理学和细胞生物学系 • Macha Nikolski，波尔多大学生物信息学中心 (CBiB) 波尔多大学 • Beatriz Ocaña-Tienda，数学肿瘤学卡斯蒂利亚大学曼恰大学 • Vera Pancaldi，生命科学 - 计算生物学生命科学组巴塞罗那超级计算中心 • Solip Park，计算癌症基因组学组西班牙国家癌症研究中心 (CNIO) • Raul Rabadan，哥伦比亚大学医学中心系统生物学系数学基因组学项目 • Antonio Rausell，临床生物信息学研究实验室巴黎想象研究所 • Daniel Rico，计算表观基因组学和细胞身份CABIMER 塞维利亚 • Yufeng Shen，哥伦比亚大学欧文医学中心系统生物学系数学基因组学项目 • David Torrents，生命科学 - 计算基因组学巴塞罗那超级计算中心生物学生命科学组巴塞罗那超级计算中心
探索人工智能中的高级技术，以进行环境监测和
1作家和研究人员，艾滋病大学，诺伊达大学2作家和研究人员，帕特纳大学，帕特纳大学摘要，这项研究研究了环境污染与人类遗传学之间的复杂关系，阐明了多方面的机制，这些机制通过这些机制施加了污染物，这些机制施加了基因毒性影响和影响健康的影响。通过生化，基因组和流行病学证据的合成，我们阐明了污染物如何诱导DNA损伤，破坏表观遗传调节以及损害细胞修复机制，从而导致多种不良健康效应，包括癌症，发育异常和生殖分裂。利用多学科方法，包括基因组学，表观基因组学，转录组学，蛋白质组学和代谢组学，我们揭示了污染诱导的遗传突变的分子基础，公开复杂的基因环境相互作用和与疾病病原体有关。人口水平的基因组监测是一种关键工具，用于监测基因毒性负担，为基于证据的干预措施和促进环境正义。期待，跨学科的合作和创新的研究策略有望减轻遗传毒性风险并在环境污染带来的挑战中保护人类遗传完整性。在污染的无数影响中，也许最阴险的是它的能力，能够扰动人类遗传学的微妙平衡，煽动一系列分子事件，这些事件可以达到遗传突变，疾病易感性和不良健康结果。KEYWORDS: Genotoxicity, Environmental pollution, Heavy metals, Polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs), Airborne particulate matter, Pesticides,Industrial chemicals, DNA damage, Epigenetic alterations, DNA repair mechanisms,Genetic susceptibility,Epidemiological studies, Health outcomes, Cancer, Developmental abnormalities, Reproductive disorders, Neurotoxicity,Population基因组学，环境正义，公共卫生干预措施引言环境污染对人类健康和生态完整性构成了巨大威胁，对分子，细胞和生物水平的生物系统产生了极大的影响。了解环境污染物对人类遗传学发挥遗传学作用的机制对于阐明与污染有关的健康障碍的病因以及为缓解和预防制定有效策略至关重要。本引入为对环境污染与人类遗传学之间复杂的相互作用的全面探索奠定了基础。我们踏上了遗传毒性的迷宫途径，穿越了DNA损伤，表观遗传失调和细胞防御机制的分子景观。利用跨越的科学文学
人类基因组项目以外的基因组学和人类遗传学的年度综述：完整的人类基因组序列和Pangenome参考的时代
人类基因组的测序是一个具有里程碑意义的成就，它彻底改变了我们对人类生物学的理解，从而深刻了解了特征和疾病的遗传基础以及人类进化史（53，55，86）。在人类基因组参考序列的可用性之前，人类遗传学领域在很大程度上依赖于家庭的谱系分析，细胞遗传学技术和低分辨率的遗传测定，以研究遗传疾病的原因（70）。这些早期方法有助于为统计方法奠定基础，例如关联测试，培养遗传咨询的概念，并为更复杂的分子遗传研究铺平了道路。然而，缺乏人类基因组参考序列限制了洞察力的深度和广度，尤其是对于受众多基因座基因组影响的复杂性状。从2001年的历史出版物开始（86），人类的基因组参考序列已发挥了多种作用。最重要的是作为控制人类发展，生理学和病理学许多方面的基因和调节序列的全面目录。通过诸如DNA元素百科全书（Eckode）（46）和路线图表观基因组学（124）项目等倡议增强，参考序列也使人们更深入地了解了调节元件的复杂网络，这些元件的复杂网络跨越了基因表达，塑造细胞功能和生物体跨健康和疾病状态的基因表达。在线Mendelian在MAN（OMIM）数据库中的继承证明了这一进展，该数据库现在分类了近7,000个疾病和特征的遗传基础（9）。通过促进基于家庭的联系分析和关联研究，参考序列指数级加速了突变，基因和途径的发现和表征，这些突变，基因和途径介导了各种特征和疾病中的变化。也已经确定了许多常见的遗传危险因素；截至2023年10月，全国人类基因组研究研究所 - 欧洲生物毒素格式化研究所全体基因组协会研究（GWASS）（96）包含> 500,000个关联，> 500,000个关联，> 6,500个已发表的研究。人类基因组参考序列的另一个变革性方面是其在遗传变异的鉴定和分析中的作用，这推动了人口基因和比较基因组学领域（19，80）。在最基本的级别上，参考序列充当一个分析资源和坐标系，可以精确地映射DNA序列变化。关于人群内部和人群之间遗传多样性的结果信息已提高了对进化过程的更深入的了解，例如历史迁移，人口规模的变化以及对新环境的遗传适应性。随着我们的前进，人类的基因组参考序列将在人类遗传学的不断发展的叙事中仍然是一个基石。但是，使用最广泛的参考序列
摘要书
1 德国海德堡大学医院病理研究所，2 德国癌症研究中心 (DKFZ)，临床合作单位神经病理学，3 德国癌症研究中心 (DKFZ)，癌症表观基因组学，4 慕尼黑工业大学病理研究所，5 海德堡大学医院胸科，诊断和介入放射学，6 海德堡大学医院普通、内脏和移植外科部，7 国家肿瘤疾病中心，肿瘤医学部电子邮件：stephanie.roessler@med.uni-heidelberg.de 背景和目标：详细了解不同形式的胆管癌发生的分子改变对于更好地理解胆管癌 (CCA) 至关重要，并可能为早期诊断和更好的治疗选择铺平道路。目前，世界卫生组织（WHO）的消化系统肿瘤分类已确认并详细描述了两种可能导致侵袭性胆道前体病变的主要亚型：微观胆道上皮内肿瘤（BilIN）和宏观可见的胆管内乳头状或管状乳头状肿瘤（IPNB和ITPN）。在本研究中，我们重点研究了IPNB和ITPN的分子改变，以更好地了解早期致瘤事件以及IPNB与ITPN之间的差异。方法：我们分析了一组临床病理学特征明确的胆道高级别导管内乳头状（IPNB）或管状乳头状（ITPN）肿瘤前体病变患者群（N=54），并将结果与独立的非IPNB/ITPN相关胆道前体病变群（N=294）进行了关联。采用二代测序、DNA拷贝数和全基因组甲基化分析方法对非肿瘤性胆道上皮、前体和侵袭性CCA的三联体样本集进行分析。结果：根据MUC1、MUC2、MUC5AC和CDX2的形态学和免疫组织化学分析，该队列包括44例（81.5%）IPNB和10例（18.5%）ITPN。解剖学上，ITPN多与肝内CCA有关，而IPNB多与远端CCA同时发生。IPNB/ITPN与小管型和大赛型肝内CCA的相关性相同。源自IPNB/ITPN的侵袭性CCA患者的预后优于没有IPNB/ITPN的CCA患者。在分子水平上，IPNB中最常见的突变基因是TP53、KRAS、SMAD4和CDKN2A；这些突变在肝外CCA中也很常见，而ITPN的突变明显较少。大多数突变在癌前病变和相应的侵袭性CCA之间是相同的，但ROBO2突变仅发生在侵袭性CCA中，而CTNNB1突变主要存在于癌前病变中。此外，IPNB和ITPN的DNA甲基化谱不同，潜在甲基化成分分析表明IPNB和ITPN可能有不同的细胞来源。结论：我们发现 IPNB 和 ITPN 具有不同的早期基因改变，IPNB 富含典型的肝外 CCA 突变，而 ITPN 表现出很少的基因改变并显示出不同的表观遗传特征，并且 IPNB/ITPN 可能代表肝内和肝外胆管癌变的一种独特的中间形式。