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在零碎的供应链中追踪钴
手机，电动汽车和许多在可充电电池上运行的其他产品都包含钴。它们在全球范围内生产，出售和使用。因此，钴供应链，尤其是其扩展价值链，是高度国际化的。相比，钴矿物质的采购在很大程度上受到地理定义的区域的限制。刚果民主共和国（DRC）是迄今为止全球钴的最大提供商。这本身就是一个挑战，这是由于经常痛苦的条件加速了，在这种情况下，小规模的矿工尤其是在世界市场上提取钴。然而，全球迅速增长的需求导致消费者，投资者，公共和重要的公司在各个领域对钴经常采购的有问题条件的认识。这些功能强调了研究最佳实践的重要性和紧迫性，以及与沿钴价值链实施负责任的业务行为相关的挑战。
Synechococcus elongatus 基因组中的系统性大片段缺失及其导致的转录组学变化
摘要：基因组精简是微生物进化过程中的自然过程，已成为生成理想底盘细胞用于合成生物学研究和工业应用的常用方法。然而，由于基因操作非常耗时，系统性基因组减少仍然是蓝藻生成此类底盘细胞的瓶颈。Synechococcus elongatus PCC 7942 是一种单细胞蓝藻，是系统性基因组减少的候选者，因为其必需基因和非必需基因已通过实验确定。本文报告，23 个超过 10 kb 的非必需基因区域中至少有 20 个可以被删除，并且可以实现这些区域的逐步删除。生成了一个七重缺失突变体（基因组减少了 3.8%），并研究了基因组减少对生长和全基因组转录的影响。在祖先三重至六重突变体（ b 、 c 、 d 、 e1 ）中，与野生型相比，上调的基因数量越来越多（最多 998 个），而在七重突变体（ f ）中上调的基因数量略少（831 个）。在来自五重突变体 d 的另一个六重突变体（ e2 ）中，上调的基因数量要少得多（232 个）。在本研究的标准条件下，突变体 e2 的生长率高于野生型、e1 和 f 。我们的结果表明，大量减少蓝藻基因组以生成底盘细胞和进行实验进化研究是可行的。
RDD-HCD 提供由自由基稳定性决定的可变裂解路线
摘要：自由基定向解离 (RDD) 是一种碎裂技术，其中通过选择性 213/266 nm 光解离碳 − 碘键产生的自由基被重新分离并碰撞活化。在之前的 RDD 实验中，碰撞活化是由离子阱碰撞诱导解离 (CID) 实现的。高能碰撞解离 (HCD) 与 CID 的不同之处在于离子的激发方式以及观察到的碎片的数量、类型或丰度。在本文中，我们探讨了 HCD 在 RDD 实验中的活化用途。尽管无论采用何种活化能，RDD-CID 都有利于由自由基定向途径（例如 a/z 离子和侧链损失）产生的碎片，但 RDD-HCD 光谱随活化能的变化而变化很大，较低的能量有利于 RDD，而较高的能量有利于由移动质子（b/y 离子）引导的裂解产生的产物。因此，RDD-HCD 可以根据提供的 HCD 能量提供更可调的碎片。重要的是，随着 HCD 能量的增加，自由基产物的丰度会降低，这证实了 RDD 通常通过较低能量屏障进行，而不是通过移动质子驱动的解离。因此，对于 RDD-HCD，b/y 离子在较高能量下占主导地位可以通过在初始或后续解离事件后不含自由基的碎片的更高存活率来解释。此外，这些结果证实了先前的猜测，即由于多次解离事件，HCD 光谱与 CID 光谱不同。关键词：碎片化、光解离、自由基定向解离、高能碰撞解离、碰撞诱导解离■ 简介
RDD-HCD提供了由根部稳定性决定的可变碎片途径
摘要：自由基导向解离（RDD）是一种脆弱的技术，其中通过选择性的213/266 nm光解离的碳 - 碘键被重新分离并碰撞激活。在先前的RDD实验中，通过离子陷阱碰撞诱导的解离（CID）实现碰撞激活。高能碰撞解离（HCD）与CID在离子的激发方式以及观察到的片段的数量，类型或丰度方面都不同。在本文中，我们探讨了HCD在RDD实验中激活的使用。虽然RDD-CID有利于从根本导向的途径（例如A/Z-ION和侧链损耗）产生的碎片，而不管使用的激活能量如何，RDD-HCD光谱差异很大，而较低的能量有利于RDD，而较高的能量则偏向于由移动蛋白（b/y-y）引起的较高能量的产品，而较高的能量有利于RDD，而较高的能量则偏爱。RDD-HCD基于所提供的HCD能提供了更可调的碎片化。重要的是，激进产物的丰度随着HCD能量的增加而降低，证实RDD通常相对于移动 - 普罗顿驱动的解离而通过较低的能源屏障进行。因此，可以通过在初始或随后的解离事件后不包含自由基的片段的较高生存能力来解释b/y型在较高能量的b/y敌人的优势。此外，这些结果证实了先前怀疑HCD光谱与由于多个解离事件引起的CID光谱不同。关键字：碎片，光解离，自由基导向解离，更高能量的碰撞解离，碰撞引起的解离■简介
通过电流零模式波导直接测序对DNA片段的快速识别
在单分子，实时（SMRT）测序中，通过单个DNA聚体在DNA链复制过程中实时监测单个核苷酸，跟踪掺入multicolor荧光标记的核苷酸。[3A]通过扩散过程将要测序的DNA模板加载到100 nm直径的纳米线的底部，称为零模式波导（ZMW），这自然有利于捕获由于井的大小约束而捕获较短的DNA分子。[3b，4]为了从长片段中获取读数，使用尺寸选择系统，其中短片段通过凝胶电泳去除。[5]总体而言，在SMRT测序方案中需要高输入DNA量（> 3 µg每1 GB基因组），[5,6]，尽管可提供来自亚纳米图DNA的库制备方法[7] [7]来自低输入的这种低输入量的DNA负载限制可有效读取来自低输入的有效读数。需要新平台有效地将各种尺寸的DNA碎片加载到没有长度偏差的ZMW中，并且从超值输入（PICOGRAMPOMPOM级别）导致了几种类型的电气致命ZMW的发展，包括纳米孔ZMWS（NZMWS）（NZMWS）[8]和POOL ZMWS（POOL ZMWS）（POROUL ZMWS（POLOUL ZMWS））（POROUL ZMWS）（POLFOOL ZMWS）。[9]在这些设备中，跨设备的电压应用导致离子流过ZMWS的多孔碱基，从而导致电动介导的生物分子（DNA，RNA和蛋白质）的电动介导的负载。与基于扩散的负载相反，电力学介导的负载功能低尺寸偏差和亚纳米革兰氏DNA输入要求。在该设备中，波导在其底部嵌入了电极，可以使电压诱导的DNA分子捕获到EZMWS中。但是，这些设备都依赖于独立的超薄膜，这在某种程度上承诺了设备的寿命并增加背景光致发光。为了克服这些问题，我们在这里脱颖而出，电光ZMWS（EZMWS），这是一种新型的电气可致动ZMW的设计，其中不需要独立的membranes。我们的新设备功能
At 标记的抗 HER2 单域抗体片段
单域抗体片段 (sdAbs) 是靶向 a 粒子治疗的理想选择，尤其是使用 211 At 时，因为它们在肿瘤中快速积累并从正常组织中清除。在这里，我们评估了这种策略的治疗潜力，使用 5F7 和 VHH_1028 — 2 个 sdAbs，它们以高亲和力结合人类表皮生长因子受体 2 型 (HER2) 的结构域 IV。方法：使用 N-琥珀酰亚胺基-3-211 At-astato-5-胍基甲基苯甲酸酯 (iso-211 At-SAGMB) 标记 HER2 特异性 sdAbs 和 HER2 无关的 VHH_2001。比较了 iso-211 At-SAGMB-5F7 和 iso-211 At-SAGMB-VHH_2001 对 HER2 表达的 BT474 乳腺癌细胞的细胞毒性。在皮下移植 BT474 异种移植瘤的小鼠中进行了三项实验，以评估单剂量 iso-211 At-SAGMB-5F7（0.7 – 3.0 MBq）、iso-211 At-SAGMB-VHH_1028（1.0 – 3.0 MBq）以及 iso-211 At-SAGMB-VHH_1028 和 iso-211 At-SAGMB-VHH_2001（1.0 MBq）的治疗效果。结果：暴露于 iso-211 At-SAGMB-5F7（D 0 5 1.313 kBq/mL）后，BT474 细胞的克隆形成存活率降低，而 iso-211 At-SAGMB-VHH_2001 无效。使用 211 At 标记的 HER2 特异性 5F7 和 VHH_1028 观察到剂量依赖性肿瘤生长抑制，但使用 HER2 无关的 VHH_2001 则未观察到。在 3.0 MBq 剂量下，使用 iso-211 At-SAGMB-5F7 治疗的 4 只小鼠中有 3 只出现肿瘤完全消退，使用 iso-211 At-SAGMB-VHH_1028 治疗的 11 只小鼠中有 8 只出现肿瘤完全消退；中位生存期分别延长了 495% 和 414%。结论：将快速内化、高亲和力的 HER2 靶向 sdAb 与 iso-211 At-SAGMB 残留修复剂相结合，是一种针对 HER2 表达癌症的靶向 α 粒子治疗的有前途的策略。
在轨卫星碎片史，第 16 版
自第 15 版（信息截止日期为 2018 年 7 月 4 日，发布于 2018 年 11 月）以来，已（新发现或已发现）发现 26 起在轨解体和 9 起异常事件，历史共发生 268 起碎裂和 87 起异常事件。这些活动加上发射活动，导致自 2018 年 7 月 4 日起编目的空间物体数量增加了约 21%，其中包括在轨物体和衰变物体，或在轨物体增加了 34%。2009 年 2 月 10 日，两艘完整的航天器铱 33 号和宇宙 2251 号首次意外碰撞，以及 2007 年 1 月 11 日（FY-1C）航天器的故意毁坏，继续对在轨碎片环境产生重大影响。截至撰写本文时，对这三个碎片云的编目仍在继续，直到雷达截面 (RCS) 达到极限。由于最近发生的两次故意碰撞，即 2019 年 3 月 27 日的印度 Microsat-R 反卫星 (ASAT) 试验事件和 2021 年 11 月 15 日的俄罗斯 Cosmos 1408 ASAT 试验，以及持续发生的有效载荷和上级碎片，已编入目录的碎片有所增加。当前作者承认本文前几版作者的重大贡献。此外，美国太空部队和第 18 太空防御中队人员的协助对本工作至关重要。作者将本版献给尼古拉斯·约翰逊先生，他是前几版的主要作者，前 ODPO 首席科学家、同事、导师和朋友。
使用片段分子轨道法
摘要：蛋白质 - 蛋白质相互作用（PPI）对于许多蛋白质的功能至关重要。异常PPI有可能导致疾病，这使PPI有望成为药物发现的靶标。人类Interactome参考数据库中有超过64,000个PPI，但是迄今为止，很少有PPI调节剂被批准用于临床使用。PPI特异性疗法的进一步开发高度取决于结构数据的可用性以及可靠的计算工具的存在，以探索两种相互作用的蛋白质之间的接口。碎片分子轨道（FMO）量子力学方法提供了一种全面且计算的廉价平均值，可以识别出在蛋白质蛋白质界面上发生的分子相互作用的强度（Kcal/mol）和化学性质（静电或疏水性）。我们已经集成了FMO和PPI探索（FMO-PPI），以识别对蛋白质 - 蛋白质结合至关重要的残基（热点）。为了验证这种方法，我们已将FMO-PPI应用于代表几种不同蛋白质亚家族的蛋白质 - 蛋白质复合物的数据集，并获得了与已发布的诱变数据一致的FMO-PPI结果。我们观察到临界PPI可以分为3个主要类别：两种蛋白质（分子间）的残基之间的相互作用，同一蛋白质（分子内）中的残基之间的相互作用以及两种由水分子（水气囊）介导的两个蛋白质的残基之间的交互。我们通过证明如何利用FMO-PPI获得的这些信息来支持基于结构的PPI调节剂（SBDD-PPI）的药物设计，从而扩展了发现。
海报：resDNASEQTM HEK293 和 E1A 片段长度定量分析：基因治疗和疫苗制造中 GMP 批签发的综合解决方案
目的生物制药产品必须限制宿主细胞残留 DNA 污染物，以防止对患者产生基因毒性和免疫毒性风险。现有的残留宿主细胞 DNA 监管指南要求每剂量 ≤10ng，DNA 大小为 200bp 或更低。在病毒载体生产中，衣壳化 DNA 的数量、大小和致癌序列是额外的关注点。为了满足这一需求，赛默飞世尔科技开发了两种旨在满足监管指导的互补检测方法。Applied Biosystems™ resDNASEQ™ 定量 HEK293 DNA 试剂盒可定量总残留宿主细胞 DNA，Applied Biosystems™ resDNASEQ™ E1A DNA 片段长度试剂盒可对针对 E1A 致癌基因的短（86bp）、中（200bp）和长（476bp）片段进行大小分析。
