1英国剑桥大学犬遗传学中心兽医系,英国剑桥大学(前身为纽马克特动物健康信托基金会,纽马克特,萨福克郡,英国纽马克特),2人口健康服务部,曼彻斯特曼彻斯特大学,曼彻斯特大学,英国曼彻斯特大学,英国曼彻斯特大学,国王曼彻斯特大学,国王3神经病学/神经疗法,国王king for smally Artish for smally Artist for smally nek for new formist Linnaeus兽医有限公司,雪莉,索利哈尔,英国,5号养犬俱乐部,伦敦,英国,6兽医医学与科学学院,诺丁汉大学,诺丁汉大学,萨顿·邦宁顿大学,英国,英国7,医学与临床遗传学系7 Folkhälsan研究中心,芬兰赫尔辛基
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受污染的奶酪,但这种物种越来越多地据报道,该物种越来越多地显示出高丙核麦克风的奶酪,这是人类侵入性感染的原因[4-6]。在这里,我们提供了从头基因组组装和临床D. catenulata型CBS565的注释。D. catenulata型CBS565在1926年是从一个痴呆症患者的粪便中分离出来的,当时居住在波多黎各[1]。基因组DNA提取。使用连接测序试剂盒(SQK-LSK109; ONT,UK,UK)和本机条形码套件(EXP-NBD114; ONT)进行连接测序试剂盒(SQK-LSK109; ONT)进行纳米孔测序文库制备。根据制造商的协议,将两个库运行到奴才流中心(Flo-Min106; ont)上。使用Guppy v5.0.16对原始的纳米孔读数进行了基础?B9FCD7B5B(ONT)使用设置 - 浮雕flo-min106-Kit SQK-LSK109-Barcode_kits exp-nbd114-device cuda:0,由消除电源和条形码放在同一软件中。使用参数-nano- raw \ fastq [ - uot-dir \ directory \ div> flye v2.9(https://github.com/ fenderglass/flye; [8])进行 de Novo基因组组装。使用GenomeQC评估了组装的基因组质量[9]。总基因组大小为14,464,696 bp,n50为2,438,920 bp,在9个重叠群上分配(范围为3,918,888-888-370,337 bp;
增加农作物对环境压力的韧性:ISDRA2TNPB可能有助于创建更短的稻作作物,而稻草在旋风中较不容易受到损害,这是易受旋风分离的地区的常见问题。基因组是生物体中的完整遗传信息集,它存储在称为染色体的DNA分子中。它包括将RNA和蛋白质编码的基因,其真核生物在核中包含其基因组和原核生物中的基因。
现在几乎可以测量植物的所有部分,但是评估植物基因组的大小仍然具有挑战性。尽管可以在显微镜下测量染色体大小(Albini,1994),但通常未知单细胞中所有DNA分子的合并长度。在第一个拟南芥基因组序列释放近25年后,对于最重要的模型之一而言,这甚至是正确的。最初,诸如Reassociation Kinetics之类的生化方法(Leutwiler等人,1984),Feulgen光度法(Bennett&Smith,1991),定量凝胶印迹杂交(Francis等人。,1990年),Southern印迹(Fransz等人,2002)和流式细胞仪(Arumuganathan&Earle,1991; Bennett&Leitch,2011)。不幸的是,这些实验方法依赖参考基因组(Bennett等人。,2003)。下一代测序技术的兴起(Metzker,2010年)启用了基于K-MER配置文件或唯一K-Mers计数的新方法(Li&Waterman,2003;Marçais&Kingsford,2011年)。水母(Marçais&Kingsford,2011年),Kmergenie(Chikhi&Medvedev,2014年),
小王王1.2 *,Pooja Middha Kapore 3.4,Paul L. Open 5.6,Joe Dennis 7,Alison M. Dunk 7,Michael Lush 7,Kyria Michailidu 7,K。Michailidu 7,K。Bill 7,Majjet K. 7,Majjet K. 13.16 , Emili Cordinina‑Duverer 17 , Trug 17 , Clir Trug 17 , Clir Mut 18 , Lauren R. Treat 19 , Alpa V. Patel 19 , Laure Dossus 20 , Rudolf Capy 3 , Reiner Hops 21.22 , Thomas Brüning 21 , Thomas Brümon , Kamila Czen 24 , Kamila Czen 24 , Kamila Czen 24 , Kamila春24,Kamila czen 25 Marike Gabrielson 25,每厅25.26,Mikael Eriksson 25,Audrey Jung 3,Heiko Becher 27,Nicole L. Larson 29,Janet E. Olson 29,Janet E. Olson 29,Graham Gilles 30 31.3334,Loic Le Marchan 36,Christopher A. Hallman 37,HåkanOlsson38,Autain Auttain 38 TheCrüger38,Philip Wagger 38,Christoper Scott 29,Stacey J. Winham 39,Celine M. Olshan 40.41,MSREW F. Olshan 42,Melisa A. A.S. Melisa A. 42,David 42,David j. 42,David jodester 42。Hunter 43.44,Heather A. Eliassen 44.45,Rull M. Timimi 44.46,Cristens Brantley 45,Irene L. Andruliis 47.48,Jonine Figueroa 49.50.51,Stephen J. Chanock 51,Thomas U.Ahearn 51,Montsersertserrat Garciith 33 G. Newman 52.53 , Anthony Hous 55 , Hoda Anton‑Culver 57 , Argyrios Ziogas 57 , Michael E. Jones 58 , Nick Orus J. Swing 58 , Anthog 58.60 , Cari , Cari 61 , Martha Lint 61 , Martha Lint 61 Ross L. Prentice 2 , Douglas F. Eastton 7.8 , Roger L. Millen 31.32.33 ,Peter Kraft 44.62,Jenny Changu 1.63和Sara Lindstrum 1.2
digitalis purpurea(foxglove)是一种广泛分布的装饰植物,也是生物医学复合地高辛的生产商。在这里,我们提出了一个长期读取测序的基于测序的基因组序列,该基因组序列和基因模型的相应预测。高组装连续性由4.3 Mbp的N50表示,并且发现约96%的完整BUSCO基因支持完整性。这种基因组资源为对D. purpurea的花色素沉着的深入研究铺平了道路。鉴定了花色苷生物合成的结构基因和相应的转录调节剂。 红色和白色开花植物的比较显示,白色开花植物中花青素合酶基因的插入很大,很可能使该基因具有非功能性,并且可以解释花青素色素沉着的丧失。 此外,花青素生物合成激活剂MYB5在白色开花植物中显示了18 bp的缺失,导致蛋白质中6种氨基酸损失。 此外,我们发现在DPTFL1/CEN基因中插入大量插入,负责大末端花的发展。鉴定了花色苷生物合成的结构基因和相应的转录调节剂。红色和白色开花植物的比较显示,白色开花植物中花青素合酶基因的插入很大,很可能使该基因具有非功能性,并且可以解释花青素色素沉着的丧失。此外,花青素生物合成激活剂MYB5在白色开花植物中显示了18 bp的缺失,导致蛋白质中6种氨基酸损失。此外,我们发现在DPTFL1/CEN基因中插入大量插入,负责大末端花的发展。
引言人线粒体DNA(mtDNA)是圆形双链体,由16 569个碱基对(BPS)组成。1 mtDNA变体是在没有进行重组的情况下进行母体传播的,从而使它们在连续的世代上积累。mtDNA的这种特征使其成为研究人群遗传学,系统发育进化,人类迁移以及医学和法医研究的流行工具。许多关于mtDNA分析的研究已经发表。2-11线粒体单倍群包括具有相同累积mtDNA变体的个体,通常在特定地理区域中发现,并且可以通过母体谱系进行追踪。这些单倍体在线粒体系统发育树中构成不同的分支。某些单倍体主要与特定地理区域相关。单倍群L0 – L6通常在撒哈拉以南非洲人中发现,而R5 – R8,M2 – M6和M4 –
。cc-by 4.0国际许可(未经Peer Review尚未获得认证)是作者/资助者,他已授予Biorxiv的许可证,以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人,该版本发布于2025年3月6日。 https://doi.org/10.1101/2025.02.28.640817 doi:Biorxiv Preprint
Kranzler博士是Altimmune和Clearmind Medicine的咨询委员会成员; Sobrera Pharmaceuticals和Altimmune的顾问;来自Alkermes的研究人员提出的研究的研究资金和药物供应的接受者;美国临床心理药理学学会的酒精临床试验计划的成员,在过去三年中得到了Alkermes,Dicerna,Dicerna,Ethypharm,Imbrium,Indivior,Kinnov,Kinnov,Lilly,Otsuka和Pear的支持;以及美国临时专利的发明者“丁丙诺啡治疗反应的多功能基因组协会荟萃分析”。