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拟南芥的遗传结构响应天然非致病细菌物种，在田间条件下，全基因组关联映射
非致病细菌可以通过动员和供应养分，保护病原体并减轻非生物胁迫来实质性地促进植物健康。但是，全基因组关联研究的数量报告了对受益微生物群体各个成员的遗传结构的遗传结构。在这项研究中，我们在条件下建立了一项全基因组的关联研究，以估计162个拟南芥的162次植物变异水平和潜在的遗传结构，该拟南芥的加入来自法国西南部的54个自然种群，响应于法国西南部，响应于13种二种菌株的二种菌株，这些菌株与较丰富的非植物构图相同，构成了叶子的隔离，并构成了叶子的隔离，并构成了叶子的分离。 地区。使用高通量表型方法来评分与营养生长相关的特征，在这些物种和菌株
全基因组CRISPR-CAS9屏幕显示
Olivier Petitjean，Erika Girardi，Richard Patryk Ngondo，Vladimir Lupashin，SébastienPfeffer。全基因组CRISPR-CAS9筛查揭示了乙par硫酸盐途径和保守的低聚高尔基复合物对合成DSRNA摄取和信德氏病毒感染的重要性。2020。hal-03003129
Zeb1和TMEJ在调节乳腺癌基因组稳定性
乳腺癌细胞经常在忠实的DNA修复基因中获取突变，例如BRCA降低的效率。此外，不准确的DNA修复途径的过表达也可能是癌症进展过程中遗传不稳定的起源。POLQ表达中的特定增益，编码参与theta介导的末端连接（TMEJ）的易于的DNA聚合酶theta（polθ）与特征突变签名有关。为了深入了解POLQ表达的机械调节，这篇评论介绍了有关Claudin-Low乳腺肿瘤亚型POLQ的调节的最新发现，这些调节特定地表达了参与上皮到 - 质质转变（EMT）（例如Zeb1）和诸如Zeb1和Paimic Abn in paimic abn的上皮性转变（EMT）的转录因子。
利综合症：两个基因组的故事
Leigh综合征是一种罕见，复杂且无法治愈的早期发作（通常是婴儿或幼儿期）线粒体疾病，具有表型和遗传异质性。这种疾病的异质性，部分基于线粒体遗传学的复杂性，以及核和线粒体基因组之间的显着相互作用使研究和开发疗法特别具有挑战性。本评论文章讨论了迄今为止在领域中取得的一些进步。虽然预后较差，目前没有实质性治疗方案，但正在进行多项研究以了解利综合征的病因，发病机理和病理生理学。随着可用研究工具的进步，可以更好地了解健康和疾病中的线粒体，因此将来有新的治疗选择。
基因组序列和评估乳酸杆菌CNCM I-4884
摘要：Johnsonii CNCM I-4884的益生菌菌株在体外和体内表现出抗牙齿活性。这项研究的目的是鉴定和表征Johnsonii CNCM I-4884的益生菌潜力及其安全评估。该菌株最初是基于16S基因序列分析将其分类为Gasseri的乳杆菌。整个基因组测序导致了L. johnsonii的重分类。对生物合成途径的全基因组搜索揭示了高度的合理营养，并通过大型运输和分解代谢系统平衡。该菌株还表现出对低pH和胆汁盐的耐受性，并显示出较强的胆汁盐水解酶（BSH）活性。测序结果表明缺乏抗菌抗性基因和其他毒力因子。表型测试证实，该菌株易于人类和动物相关性的8种抗生素。总的来说，在硅和体外结果中证实了约翰逊氏菌I-4884的cncm I-4884非常适合胃肠道环境，并且可以安全地用于益生菌配方中。
balrog-mon：用于基因组牛津纳米孔
宏基因组测序是一种最近可行的方法，可以同时表征样品中的ARG，微生物组和病原体的数据，与分离和培养细菌相比，它是一种更有效，更全面的方法。对宏基因组数据的典型分析涉及一种基于组装的方法或基于读取的方法，每种方法都有其自身的好处和限制。宏基因组装配允许对ARGS进行上游或下游研究，并提供对其起源的准确识别。但是，这种方法可能导致信息丢失，因为低覆盖的基因组通常不会组装。相比之下，基于读取的方法可实现所有可用数据的映射，但缺乏探索周围基因组环境或提供准确分类分类的能力。为了应对这些挑战，我们开发了Balrog-mon，这是一种多功能且可重现的NextFlow管道，用于测量病原体和元基因组长阅读测序的ARG，提供“组装”和“无装配”工作流程选项。
混合轻型态在拓扑超导体中与空腔光子搭配的
细菌“ candidatus nardonella dyophthoridicola”是一种革兰氏阴性的gam- maproteotototototabterial tocyobterial tocytobiont（图。1）。特别是，它是与象鼻虫相关的细胞内义务共同主义者（1）。通过向其宿主供应酪氨酸，细菌在表皮中起着至关重要的作用（2）。与第二个象鼻虫相关的符号不同，“ candidatus sodalis pierantonius”，它在宿主的整个生命周期中保持在功能性细菌中（3-5）。我们使用长阅读测序来研究“ Ca.nardonella dryophthoridicola”菌株nardrf，与意大利人种群相关的Rhynchophorus ferrugineus。2017年，昆虫宿主是从卡塔尼亚地区的一棵棕榈树中取样的。p在25°C，黑暗的24小时内，直到分成人。剖析了十个新出现的成年人以提取其细菌。然后按照制造商的动物组织提取说明，使用Dneasy血液和组织试剂盒（意大利Qiagen，意大利）合并细菌以进行DNA提取。在90V时通过0.8％琼脂糖凝胶电泳对DNA完整性进行了1H的验证。用纳米体100分光光度计（意大利的Thermo Fisher Scienti）和Qubit双链DNA（DSDNA）高敏化测定试剂盒测量了DNA纯度和浓度。使用R9.5流单元在奴才MK1B设备上进行了长阅读测序。使用Minknow V18.03.1进行测序48小时。读取量超过500 bp进行后续分析。重点识别为“ Ca.用于图书馆制备，使用1D连接测序试剂盒（SQK-LSK 108）原始Col使用了2.5 m g的非大量和非大小选择的总基因组DNA。然后，将最终DNA的0.5 m g加载到流动细胞上。基本调用，具有高准确性算法，质量截止值为7。所有工具均使用默认参数运行，除非另有说明。使用min-iasm（7）组装了元基因组fastq读取（主机和共生体）。nardonella dyophthoridicola”，以ncbi非冗余（NR）数据库进行鉴定。提取这些概念并用于重新填充组件。重叠群用于映射和提取“ Ca.nardonella dryophthoridicola”使用minimap2 v2.17（8）。然后使用Flye v2.8.1（9）重新组装836,116读。使用Circlator v1.5.5（10）与选项进行了循环 - Merge_Min_ID 85和 - Merge_breaklen 1000，如牛津Nanopore读取。使用公开的Illumina简短读数（SRA登录
ICAR-IVRI启动基因组编辑技术培训计划
IVRI主任Triveni Dutt博士对该研究所对兽医研究的重要贡献提供了见解。 主任IVRI强调了IVRI在兽医研究中的遗产，并强调了其在疫苗和诊断的开发中的贡献。 他讨论了基因组编辑在推进牲畜特征和疫苗开发中的重要性，并强调了这些技术在兽医领域的变革潜力。 他祝贺整个NP Get团队为年轻的大脑组织培训研讨会。IVRI主任Triveni Dutt博士对该研究所对兽医研究的重要贡献提供了见解。主任IVRI强调了IVRI在兽医研究中的遗产，并强调了其在疫苗和诊断的开发中的贡献。他讨论了基因组编辑在推进牲畜特征和疫苗开发中的重要性，并强调了这些技术在兽医领域的变革潜力。他祝贺整个NP Get团队为年轻的大脑组织培训研讨会。