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合成生物学识别植物底盘中紫杉醇生物合成所需的最小基因集
二萜紫杉醇（紫杉醇）是一种化学疗法药物，被广泛用作针对几种固体癌的第一线治疗。自然来源的紫杉醇供应有限。然而，关于紫杉醇生物合成的几个特定代谢步骤所涉及的基因的缺失知识使其很难设计完整的途径。在这项研究中，我们使用了转录组学，细胞生物学，代谢组学和途径重建的组合来确定紫杉醇生产所需的完整基因集。我们从紫杉醇生物合成的当前模型中识别了缺失的步骤，并通过尼古拉·本塔米亚纳（Nicotiana Benthamiana）的异源表达确认了大多数缺失酶的活性。值得注意的是，我们确定了一种新的C4 B -C20环氧酶，该酶可以克服最初的代谢工程。We used both previously characterized and newly identified oxomutases/epoxi- dases, taxane 1 b -hydroxylase, taxane 9 a -hydroxylase, taxane 9 a -dioxygenase, and phenylalanine-CoA ligase, to successfully biosynthesize the key intermediate baccatin III and to convert baccatin III into pacli- taxel in N.本塔米亚娜。结合使用，这些方法为分类生物合成建立了代谢途径，并提供了植物用来产生复杂生物活性代谢物的独特化学反应的见解。
与SuCLG1相关的线粒体DNA耗竭综合征
References • Carrozzo R, Verrigni D, Rasmussen M, de Coo R, Amartino H, Bianchi M, Buhas D, Mesli S, Naess K, Born AP, Woldseth B, Prontera P, Batbayli M, Ravn K, Joensen F, Cordelli DM, Santorelli FM, Tulinius M, Darin N, Duno M, Jouvencel P, Burlina A, Stangoni G, Bertini E, Redonnet-Vernhet I, Wibrand F, Dionisi-Vici C, Uusimaa J, Vieira P, Osorio AN, McFarland R, Taylor RW, Holme E, Ostergaard E. Succinate- CoAligase deficiency due to mutations in SUCLA2 and SUCLG1: phenotype and 71例患者的基因型重复相关。J继承Metab dis。2016年3月; 39（2）：243-52。 doi：10.1007/s10545-015-9894-9。EPUB 2015年10月16日。引用于PubMed（https：//www.n cbi.nlm.nih.gov/pubmed/26475597）•El-Hattab AW，Scaglia F.线粒体DNA DNA耗竭综合症：复习及遗传基础，表现，表现形式，以及治疗方法和治疗方法。神经疗法。2013年4月; 10（2）：186-98。 doi：10.1007/s13311-013-0177-6。引用于PubMed（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23385875）•El-Hattab AW，Scaglia F. Suclg1与Suclg1相关的线粒体DNA DNA DNA DNA dnnandrome，伴有甲基甲基甲基甲基酸性酸性。2017年3月30日。in：Adam MP，Feldman J，Mirzaa GM，Pagon RA，Wallace SE，Amemiya A，Editors.genereviews（R）[Internet]。西雅图（WA）：西雅图华盛顿大学； 1993-2025。 可从http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/nbk425223/提供，PubMed引用（https：//pu bmed.ncbi.nlm.nlm.nih.gov/28358460） Salmani TA，Ghaedi H. suclg1突变和线粒体脑膜病：文献研究的案例研究。 EPUB 2020 11月23日。 Epub 2007年6月4日。西雅图（WA）：西雅图华盛顿大学； 1993-2025。可从http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/nbk425223/提供，PubMed引用（https：//pu bmed.ncbi.nlm.nlm.nih.gov/28358460） Salmani TA，Ghaedi H. suclg1突变和线粒体脑膜病：文献研究的案例研究。EPUB 2020 11月23日。Epub 2007年6月4日。MOL BIOLREP。2020DEC; 47（12）：9699-9714。 doi：10.1007/ s11033-020-05999-y。 PubMed的引用（https：//www.ncbi.nlm。 nih.gov/pubmed/33230783) • Ostergaard E, Christensen E, Kristensen E, Mogensen B, Duno M, Shoubridge EA, Wibrand F. Deficiency of the alpha subunit of succinate-coenzyme A ligase causesfatal infantile lactic acidosis with mitochondrial DNA depletion. Am J Hum Genet.2007 Aug; 81（2）：383-7。 doi：10.1086/519222。 引用MOL BIOLREP。2020DEC; 47（12）：9699-9714。 doi：10.1007/ s11033-020-05999-y。PubMed的引用（https：//www.ncbi.nlm。nih.gov/pubmed/33230783) • Ostergaard E, Christensen E, Kristensen E, Mogensen B, Duno M, Shoubridge EA, Wibrand F. Deficiency of the alpha subunit of succinate-coenzyme A ligase causesfatal infantile lactic acidosis with mitochondrial DNA depletion.Am J Hum Genet.2007 Aug; 81（2）：383-7。 doi：10.1086/519222。引用
BSC2086L |人体解剖与生理学2实验室
1。描述了基因化学的历史。2。原核生物和真核生物中的基因结构对比。3。展示了DNA复制的机理和酶学（解旋酶，原始酶，DNA聚合酶，DNA连接酶）。4。对比原核生物和真核生物中的DNA复制。5。定义RNA的结构并赋予RNA亚型的功能。6。研究分子生物学的中心教条。7。解释转录过程。8。解释了细胞核中转录后修饰的过程。9。解释转录的控制，包括操纵子模型。10。解释翻译的机制并提供了启动，伸长和终止的细节。能力3：学生将通过：
基因库一个DNA库是DNA片段的集合...
纯化mRNA后，将寡-DT（脱氧 - 胸腺苷核苷酸的短序列）标记为互补底漆，该引物与poly-A尾巴结合，从而可以通过反转录酶来扩展自由3'-OH端，以创建互补的DNA链。现在，使用RNase酶去除去mRNA，将单个链cDNA（SSCDNA）取出。借助于DNA聚合酶，将此SSCDNA转化为双链DNA。但是，要使DNA聚合酶合成互补链，需要3'- oh-end。这是由SSCDNA本身通过在3'端产生发夹循环来通过围绕自身来提供的。聚合酶延伸了3'-OH端，然后通过S 1核酸酶的剪刀作用打开3'端的环。然后，使用限制性核酸内切酶和DNA连接酶来克隆序列到细菌质粒中。
分子胶的进展：探索靶向蛋白质降解的化学空间和设计原理
E3 连接酶 cereblon (CRBN) 被发现是沙利度胺及其类似物的靶标，这彻底改变了靶向蛋白质降解 (TPD) 领域。这种泛素介导的降解途径首先由二价降解剂利用。最近，低分子量分子胶降解剂 (MGD) 的出现扩大了 TPD 领域，因为 MGD 通过相同的机制运作，同时提供与小分子疗法一致的有吸引力的物理化学特性。本综述深入探讨了 MGD 的发现和发展，并以细胞周期蛋白 K 和锌指蛋白 IKZF2 为例进行了研究，重点介绍了设计原理、生物测定和治疗应用。此外，它还研究了分子胶的化学空间，并概述了推动该领域创新的合作努力。
回顾文章的DNA复制和损坏检查点和减数分裂细胞周期控制，并在酵母中进行酵母
细胞周期检查点机制确保细胞周期事件的顺序保留基因组完整性。在其中，当DNA复制被抑制或DNA损坏时，DNA恢复和DNA破坏检查点可防止染色体分离。最近的研究已经确定了这两个对照的调节网络的概述，这些对照显然在所有真核生物中起作用。此外，看来这些检查点有两个逮捕点，一个是在进入有丝分裂之前，另一个是在染色体分离之前。前一点需要中央细胞周期调节剂CDC2激酶，而后者涉及称为促进复合物的泛素连接酶的几个关键调节剂和底物。这些细胞周期调节器与几个键
鉴定一种新型变构口服 CBL-B 抑制剂，该抑制剂可在体内和体外增强 T 细胞反应并增强 NK 细胞杀伤力
这里我们报告了我们的主要抑制剂系列中的一种，一种通过应用我们的 Smart AllosteryTM 平台识别的具有皮摩尔结合亲和力的低纳摩尔强效抑制剂。该抑制剂与 CBL-B 的非活性形式结合，其在识别的热点中的结合模式由共晶体结构证实。它抑制激酶对 CBL-B 的磷酸化，抑制 CBL-B 的 E3 连接酶活性，促进细胞因子释放并增强 T 细胞增殖以及 NK 细胞活化和杀伤。在体内，我们的 CBL-B 抑制剂有效增强了抗 CD3 治疗小鼠的 T 细胞反应。我们在此通过预测和用药重要免疫肿瘤学靶点上的调控热点，证明了我们专有的 Smart Allostery™ 平台的验证，而该靶点迄今为止很难用药。
在靶向蛋白质降解器的硅硅设计中
作为治疗方法的靶向蛋白质降解已经看到了惊人的发展和巨大的投资[1]。蛋白水解 - 靶向嵌合体（protac）和诱导靶向蛋白质降解的相关分子具有很大的价值，主要是因为与常规目标占用驱动抑制剂相比，对于给药，安全性，有效性，选择性和调节“不可用的”目标[2] [2]。这些异常小分子具有三个化学特征：与靶蛋白的部分结合，另一种与E3泛素连接酶结合，以及与这两个元素结合的接头[3]。除了protac，还有某些称为分子胶地的非晶状体小分子蛋白蛋白二聚体，它们还结合了泛素E3连接酶和募集蛋白质以降解，类似于带有靶向蛋白质降解的Protacs [4]。
CRISPR屏幕在IPSC衍生的神经元中揭示了tau proteostasis 的原理 人类诱导的多能干细胞的扰动细胞图集 多态串联重复在免疫景观上形状的单细胞基因表达 蛋白质生成进化扩散 注释冷冻卷：机器学习挑战 胎盘猪中的胎盘HIGF1纳米颗粒基因治疗在肝脂质和葡萄糖代谢相关的信号通路中以胎儿性别特异性方式改善胎儿生长限制相关的变化 西尼罗河病毒在欧洲传播的生物气候建模，特别关注乌克兰 单元格中的信号：用于治疗的多模式和上下文化的机器学习基础 SPAMTP：空间代谢组学和转录组学数据的综合统计分析和可视化 使用捕获的离子迁移率和DDAP 通过成对的细胞表面和病毒1 增强了慢病毒基因递送到哺乳动物细胞 坏死性到凋亡信号轴是炎症性肠病的基础 Devider：多种单倍型的长阅读重建 pyr1生物传感器驱动的全基因组CRISPR筛选，用于改善Kluyveromyces Marxianus的单甲苯样产生 果糖-2,6-双磷酸盐恢复TDP-43病理 - bean（psophocarpus tetragonolobus）
蛋白质tau的抽象聚集定义了tauopathies，其中包括阿尔茨海默氏病和额颞痴呆。特定的神经元亚型有选择地容易受到tau聚集的影响，随后的功能障碍和死亡，但潜在的机制尚不清楚。系统地揭示了控制人类神经元中Tau聚集体积累的细胞因子，我们在IPSC衍生的神经元中进行了基于基因组CRISPRI的修饰筛网。屏幕发现了预期的途径，包括自噬，以及意外的途径，包括ufmylation和GPI锚构成。我们发现E3泛素连接酶CUL5 SOCS4是人类神经元中tau水平的有效修饰符，泛素化tau，与小鼠和人类中的auopanty的脆弱性相关。线粒体功能的破坏会促进tau的蛋白酶体错误处理，从而产生tau蛋白水解片段