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心肌纤维化：心脏分子成像的新兴目标和图像引导治疗的机会
心肌纤维化是心力衰竭发展和进展的主要因素。对其病理生物学理解的重大进展已导致多种高度特异性抗纤维化疗法的引入和临床前测试。由于纤维化的机制高度动态，并且所涉及的细胞群体是异质性和可塑性的，因此人们越来越强调，任何针对心肌纤维化的治疗方法都需要个性化和同样特异性的诊断测试指导，才能成功进行临床转化。非侵入性成像技术取得了重大进展，并提供了有关心肌纤维化的数量、质量和活动性的越来越具体的信息。心脏 MRI 可以精确地绘制心肌细胞外空间，而核成像则将激活的成纤维细胞和免疫细胞描述为导致纤维化的细胞成分。现有技术可以互补使用，以提供成功实施新型靶向疗法所需的成像生物标记。本综述提供了路线图，说明基础纤维化研究、抗纤维化药物开发和高端无创成像方面的进展如何结合起来，以促进针对纤维化的心血管医学的成功。
实验室负鼠 Monodelphis domestica 八个品系的遗传和基因组结构 熊晓 1,2 , Paul B. Samollow 3 , 曹文琪 1
1 奥本大学兽医学院病理生物学系，阿拉巴马州奥本 36849，美国 2 同济大学生命科学与技术学院，上海，中国 3 德克萨斯 A&M 大学兽医学与生物医学学院兽医整合生物科学系，德克萨斯州大学城 77843，美国 4 上海交通大学医学院上海精准医学研究所、上海市第九人民医院整形重建外科，上海，中国 5 德克萨斯大学里奥格兰德河谷分校医学院南德克萨斯糖尿病与肥胖研究所和人类遗传学系，德克萨斯州布朗斯维尔 78520，美国 6 阿拉巴马农业实验站，阿拉巴马州奥本 36849，美国 7 HudsonAlpha 生物技术研究所，阿拉巴马州亨茨维尔 35806，美国 † 通讯作者：王旭 电话：(334) 844-7511 传真：(334) 844-2618 电子邮件：xzw0070@auburn.edu ORCID：0000-0002-7594-5004 共同作者电子邮件地址：XX，xzx0019@auburn.edu；PBS，psamollow@cvm.tamu.edu，WC，wzc0047@auburn.edu；RM，Richard.Metz@ag.tamu.edu；CZ，zhangchao@shsmu.edu.cn；ACL，ana.leandro@utrgv.edu；JLV，john.vandeberg@utrgv.edu。 运行标题：实验室负鼠的种群遗传学 关键词：Metatheria、有袋动物、SNP 发现、遗传多样性、种群结构
最初发表于：Jonsdottir, Sigridur；Fettelschoss, Victoria；Olomski, Florian；Talker, Stephanie C；Mirkovitch, Jelena；Rhiner, Tanya；Birkm
1 伯尔尼大学 Vetsuisse 学院 VPH 临床研究系临床免疫学组，Länggassstrasse 124, 3012 伯尔尼，瑞士；sigridur.jonsdottir@vetsuisse.unibe.ch (SJ)；jelena.mirkovitch@vetsuisse.unibe.ch (JM)；eliane.marti@vetsuisse.unibe.ch (EM) 2 苏黎世大学医院皮肤病学系，Wagistrasse 12, 8952 Schlieren，瑞士；victoria.fettelschoss@usz.ch (VF)；florian.olomski@usz.ch (FO)；tanya.rhiner@uzh.ch (TR)； franziskazabel@hotmail.com (FT) 3 苏黎世大学医学院，8091 苏黎世，瑞士 4 Evax AG，Hörnlistrass 3, 9542 Münchwilen，瑞士；katharina@evax.ch 5 病毒学和免疫学研究所，Länggassstrasse 122, 3012 伯尔尼，瑞士；stephanie.talker@vetsuisse.unibe.ch 6 伯尔尼大学兽医学院传染病和病理生物学系，Länggassstrasse 122, 3012 伯尔尼，瑞士 7 康奈尔大学兽医学院人口医学和诊断科学系，纽约州伊萨卡 14853-0001，美国； bw73@cornell.edu 8 RIA 免疫学，伯尔尼大学医院，3012 伯尔尼，瑞士；Martin.Bachmann@insel.ch 9 詹纳研究所，纽菲尔德医学系，亨利·威尔科克分子生理学大楼，牛津大学，OX1 2JD 牛津，英国 10 苏黎世大学医院皮肤病学系，Gloriastrasse 31，8091 苏黎世，瑞士；Thomas.kuendig@usz.ch * 通信地址：antonia.gabriel@usz.ch
使用独立于复发活动框架的进展来揭示多发性硬化症的病理生物学基础
与复发活性（PIRA）无关的进展，这是一个与复发无关的多发性硬化症（MS）形式化应计的概念，它已成为潜在的临床试验结果。我们讨论其缺点，并评估在临床环境，实验试验和研究中实施它的挑战。PIRA的当前定义假设可以表现为复发的急性炎症，并且可以通过引入特定的时间窗口来散发出渐进的残疾应计的神经退行性，从而可以解散，并导致重复的发作和无视的增加。最近引入了术语Pirma（与复发和MRI活性无关），以表明在没有临床复发，新的大脑和脊髓MRI病变的情况下，残疾应计。在临床实践中评估PIRMA是高度挑战性的，因为它需要经常进行临床评估以及大脑和脊髓MRI扫描。PIRA通常使用扩大的残疾状态量表进行评估，这是针对运动障碍的重量，而对残疾人的更精细评估，包括认知能力下降，使用综合措施或其他工具，例如数字工具，将具有更大的效用。同样，在随机临床试验中使用PIRA作为结果度量也很具有挑战性，需要方法论考虑。这是由于MRI比纯粹的临床描述更好地反映MS致病机制的知识所支持的。The underpinning pathobiology of disability accumulation, that is not associated with relapses, may encompass chronic active lesions (slowly expanding lesions and paramagnetic rim lesions), cortical lesions, brain and spinal cord atrophy, partic- ularly in the gray matter, di ff use and focal microglial activation, persistent leptomeningeal enhancement, and white matter tract damage.我们建议使用PIRA了解未包括常规MRI扫描的观察性MRI扫描中的残疾应计的主要决定因素，并介绍“高级PIRMA”的术语，以调查使用常规和先进的成像。在考虑所有这些通过成像的机制考虑所有这些机制后仍无法解释的任何残留残疾应重点介绍未来的研究优先级，以帮助完成我们对MS发病机理的理解。
使用独立于复发活动框架的进展来揭示多发性硬化症的病理生物学基础
与复发活性（PIRA）无关的进展，这是一个与复发无关的多发性硬化症（MS）形式化应计的概念，它已成为潜在的临床试验结果。我们讨论其缺点，并评估在临床环境，实验试验和研究中实施它的挑战。PIRA的当前定义假设可以表现为复发的急性炎症，并且可以通过引入特定的时间窗口来散发出渐进的残疾应计的神经退行性，从而可以解散，并导致重复的发作和无视的增加。最近引入了术语Pirma（与复发和MRI活性无关），以表明在没有临床复发，新的大脑和脊髓MRI病变的情况下，残疾应计。在临床实践中评估PIRMA是高度挑战性的，因为它需要经常进行临床评估以及大脑和脊髓MRI扫描。PIRA通常使用扩大的残疾状态量表进行评估，这是针对运动障碍的重量，而对残疾人的更精细评估，包括认知能力下降，使用综合措施或其他工具，例如数字工具，将具有更大的效用。同样，在随机临床试验中使用PIRA作为结果度量也很具有挑战性，需要方法论考虑。这是由于MRI比纯粹的临床描述更好地反映MS致病机制的知识所支持的。The underpinning pathobiology of disability accumulation, that is not associated with relapses, may encompass chronic active lesions (slowly expanding lesions and paramagnetic rim lesions), cortical lesions, brain and spinal cord atrophy, partic- ularly in the gray matter, di ff use and focal microglial activation, persistent leptomeningeal enhancement, and white matter tract damage.我们建议使用PIRA了解未包括常规MRI扫描的观察性MRI扫描中的残疾应计的主要决定因素，并介绍“高级PIRMA”的术语，以调查使用常规和先进的成像。在考虑所有这些通过成像的机制考虑所有这些机制后仍无法解释的任何残留残疾应重点介绍未来的研究优先级，以帮助完成我们对MS发病机理的理解。
多维数据分析的影响
高性能计算 (HPC) 技术的进步已经能够通过归纳和建设性方法为心血管 (CV) 科学提供信息。临床试验允许比较干预的效果，而无需了解机制。这是归纳方法的典型示例。在 HPC 领域，训练由神经网络构建的人工智能 (AI) 模型以使用大规模多维数据集预测未来的 CV 事件是可以依赖并帮助理解机制基础以进行优化的对应方法。然而，与临床试验相比，AI 可以在个人层面计算事件风险，并有可能为个性化医疗的应用提供信息和改进。尽管 AI 具有明显的优势，但 AI 分析的结果可能会识别出多维数据与临床结果之间原本无法识别/意料之外（即非直观）的关系，这可能会进一步揭示潜在的机制途径并确定潜在的治疗目标，从而有助于从因果关系中解析观察关联。建设性方法对于克服现有知识的局限性和固有偏见以实现对心血管疾病复杂病理生物学的更深入理解仍然至关重要。HPC 技术有可能在心血管基础和临床科学中支撑这种建设性方法。一般来说，即使是复杂的生物现象也可以归结为简单的生物/化学/物理定律的组合。在演绎方法中，重点/意图是通过简单原理的组合来解释复杂的心血管疾病。
多维数据分析的影响
高性能计算 (HPC) 技术的进步已经能够通过归纳和建设性方法为心血管 (CV) 科学提供信息。临床试验允许比较干预的效果，而无需了解机制。这是归纳方法的典型示例。在 HPC 领域，训练由神经网络构建的人工智能 (AI) 模型以使用大规模多维数据集预测未来的 CV 事件是可以依赖并帮助理解机制基础以进行优化的对应方法。然而，与临床试验相比，AI 可以在个人层面计算事件风险，并有可能为个性化医疗的应用提供信息和改进。尽管 AI 具有明显的优势，但 AI 分析的结果可能会识别出多维数据与临床结果之间原本无法识别/意料之外（即非直观）的关系，这可能会进一步揭示潜在的机制途径并确定潜在的治疗目标，从而有助于从因果关系中解析观察关联。建设性方法对于克服现有知识的局限性和固有偏见以实现对心血管疾病复杂病理生物学的更深入理解仍然至关重要。HPC 技术有可能在心血管基础和临床科学中支撑这种建设性方法。一般来说，即使是复杂的生物现象也可以归结为简单的生物/化学/物理定律的组合。在演绎方法中，重点/意图是通过简单原理的组合来解释复杂的心血管疾病。
急性腺病毒心脏感染在炎症性心肌重塑和心肌炎之前引起心律失常的底物
标题急性腺病毒心脏感染在炎症性心肌重塑之前引起心律不齐的底物，并在心肌炎和隶属关系作者和隶属关系中，Rachel L. Padet 1,2,3，Grace A. Blair 1,2,3，1,2,3，Michael D. North 4，Michael J. Zeitz 2,3，Mira T. T. T. Taneneba s。 Hoeker 2,3，Sharon A. Swanger 2,4,5，Steven Poelzing 2,3,4,6，James W. Smyth 2,3,4,6,6,6,6 1美国4016年，美国弗吉尼亚州罗阿诺克市的FBRI心脏研究，美国4弗吉尼亚理工学院卡利翁医学院，罗阿诺克，弗吉尼亚州24016，美国5个生物医学科学与病理学系，弗吉尼亚 - 玛丽兰州兽医学院，弗吉尼亚州弗吉尼亚州科技学院，弗吉尼亚州弗吉尼亚州，弗吉尼亚州布莱克斯堡，弗吉尼亚州布莱克斯堡，弗吉尼亚州24061，弗吉尼亚州，美国弗吉尼亚州，弗吉尼亚州，弗吉尼亚州。 VA 24061，美国7生物科学系，弗吉尼亚理工学院，布莱克斯堡，弗吉尼亚州24061，美国，美国短名称心律失常腺病毒心脏感染，作者James W. Smyth，Fralin Biomedical Research Institute，VTC，VTC，2 Roanoke，Roanoke，Roanoke，Roanoke，Roanoke，VA 24016。电子邮件：smythj@vtc.vt.edu总词计数：9593
人工智能助力 COVID-19 药物研发和疫苗开发
SARS-COV-2 唤醒了科学界，呼吁他们采取行动抗击这一日益严重的流行病。在撰写本文时，尚无新型抗病毒药物或获批疫苗可作为前线防御。了解 COVID-19 的病理生物学可以帮助科学家阐明未知的病毒途径，从而发现有效的抗病毒药物。实现这一目标的一种方法是利用计算方法在计算机上发现新的候选药物和疫苗。在过去十年中，基于特定生物分子训练的基于机器学习的模型为发现有效的病毒疗法提供了廉价且快速的实施方法。给定目标生物分子，这些模型能够以基于结构的方式预测抑制剂候选物。如果向模型提供足够的数据，它可以通过识别数据中的模式来帮助寻找药物或疫苗候选物。在本综述中，我们重点介绍了使用人工智能开发 COVID-19 药物和疫苗的最新进展，以及智能训练在发现 COVID-19 疗法方面的潜力。为了促进深度学习在 SARS-COV-2 中的应用，我们重点介绍了 COVID-19 的多个分子靶点，抑制这些靶点可能会提高患者的生存率。此外，我们还介绍了 CoronaDB-AI，这是一个化合物、肽和表位的数据集，这些化合物、肽和表位是通过计算机模拟或体外发现的，可用于训练模型以提取 COVID-19 治疗方法。本综述中提供的信息和数据集可用于训练基于深度学习的模型并加速发现有效的病毒疗法。
多尺度相互作用分析与脱靶药物预测相结合，揭示了人类冠状病毒病的药物重新利用候选
1。加拿大多伦多的瑞尔森大学化学与生物学系。2。加拿大多伦多大学多伦多大学计算机科学系3。 矢量研究所，加拿大安大略省多伦多，4。 Cyclica Inc.，加拿大安大略省多伦多，5。 分子医学计划，加拿大安大略省多伦多的病儿童研究所医院6. 加拿大多伦多多伦多大学生物化学系。 7。 Biofisika Institute（CSIC，UPV/EHU）和西班牙毕尔巴奥的巴斯克大学（UPV/EHU）生物化学与分子生物学系。 8。 加拿大多伦多大学医学生物物理学系9. Precision心脏病学实验室，拜耳美国有限责任公司，美国马萨诸塞州剑桥市10。 加拿大多伦多的瑞尔森大学分子科学研究生课程。 11。 phoenox Pharma，多伦多，安大略省，加拿大12。 加拿大多伦多多伦多大学药理学与毒理学系13。 基南生物医学研究中心，加拿大多伦多，圣迈克尔医院。 14。 生物医学工程，科学技术研究所（IBEST），瑞尔森大学与加拿大安大略省多伦多的圣迈克尔医院之间的合作伙伴关系。 15。 加拿大多伦多的瑞尔森大学物理系。 16。 加拿大多伦多多伦多大学外科系。 17。 免疫学系，多伦多，安大略省，加拿大，18。 彼得·穆克心脏中心，加拿大安大略省多伦多大学健康中心19.加拿大多伦多大学多伦多大学计算机科学系3。矢量研究所，加拿大安大略省多伦多，4。Cyclica Inc.，加拿大安大略省多伦多，5。 分子医学计划，加拿大安大略省多伦多的病儿童研究所医院6. 加拿大多伦多多伦多大学生物化学系。 7。 Biofisika Institute（CSIC，UPV/EHU）和西班牙毕尔巴奥的巴斯克大学（UPV/EHU）生物化学与分子生物学系。 8。 加拿大多伦多大学医学生物物理学系9. Precision心脏病学实验室，拜耳美国有限责任公司，美国马萨诸塞州剑桥市10。 加拿大多伦多的瑞尔森大学分子科学研究生课程。 11。 phoenox Pharma，多伦多，安大略省，加拿大12。 加拿大多伦多多伦多大学药理学与毒理学系13。 基南生物医学研究中心，加拿大多伦多，圣迈克尔医院。 14。 生物医学工程，科学技术研究所（IBEST），瑞尔森大学与加拿大安大略省多伦多的圣迈克尔医院之间的合作伙伴关系。 15。 加拿大多伦多的瑞尔森大学物理系。 16。 加拿大多伦多多伦多大学外科系。 17。 免疫学系，多伦多，安大略省，加拿大，18。 彼得·穆克心脏中心，加拿大安大略省多伦多大学健康中心19.Cyclica Inc.，加拿大安大略省多伦多，5。分子医学计划，加拿大安大略省多伦多的病儿童研究所医院6.加拿大多伦多多伦多大学生物化学系。 7。 Biofisika Institute（CSIC，UPV/EHU）和西班牙毕尔巴奥的巴斯克大学（UPV/EHU）生物化学与分子生物学系。 8。 加拿大多伦多大学医学生物物理学系9. Precision心脏病学实验室，拜耳美国有限责任公司，美国马萨诸塞州剑桥市10。 加拿大多伦多的瑞尔森大学分子科学研究生课程。 11。 phoenox Pharma，多伦多，安大略省，加拿大12。 加拿大多伦多多伦多大学药理学与毒理学系13。 基南生物医学研究中心，加拿大多伦多，圣迈克尔医院。 14。 生物医学工程，科学技术研究所（IBEST），瑞尔森大学与加拿大安大略省多伦多的圣迈克尔医院之间的合作伙伴关系。 15。 加拿大多伦多的瑞尔森大学物理系。 16。 加拿大多伦多多伦多大学外科系。 17。 免疫学系，多伦多，安大略省，加拿大，18。 彼得·穆克心脏中心，加拿大安大略省多伦多大学健康中心19.加拿大多伦多多伦多大学生物化学系。7。Biofisika Institute（CSIC，UPV/EHU）和西班牙毕尔巴奥的巴斯克大学（UPV/EHU）生物化学与分子生物学系。8。加拿大多伦多大学医学生物物理学系9.Precision心脏病学实验室，拜耳美国有限责任公司，美国马萨诸塞州剑桥市10。加拿大多伦多的瑞尔森大学分子科学研究生课程。11。phoenox Pharma，多伦多，安大略省，加拿大12。加拿大多伦多多伦多大学药理学与毒理学系13。基南生物医学研究中心，加拿大多伦多，圣迈克尔医院。 14。 生物医学工程，科学技术研究所（IBEST），瑞尔森大学与加拿大安大略省多伦多的圣迈克尔医院之间的合作伙伴关系。 15。 加拿大多伦多的瑞尔森大学物理系。 16。 加拿大多伦多多伦多大学外科系。 17。 免疫学系，多伦多，安大略省，加拿大，18。 彼得·穆克心脏中心，加拿大安大略省多伦多大学健康中心19.基南生物医学研究中心，加拿大多伦多，圣迈克尔医院。14。生物医学工程，科学技术研究所（IBEST），瑞尔森大学与加拿大安大略省多伦多的圣迈克尔医院之间的合作伙伴关系。15。加拿大多伦多的瑞尔森大学物理系。16。加拿大多伦多多伦多大学外科系。 17。 免疫学系，多伦多，安大略省，加拿大，18。 彼得·穆克心脏中心，加拿大安大略省多伦多大学健康中心19.加拿大多伦多多伦多大学外科系。17。免疫学系，多伦多，安大略省，加拿大，18。彼得·穆克心脏中心，加拿大安大略省多伦多大学健康中心19.加拿大多伦多大学的实验室医学与病理学系