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信号网络分析揭示了fostamatinib是控制SARS-COV-2感染期间血小板过度激活的潜在药物
1功能基因组学和系统生物学小组，生物信息学系，生物中心，武兹堡大学，德国武兹堡大学，2个进化基因组学集团，计算和理论生物学中心，尤尔兹堡大学，德国，德国，尤恩斯堡，3岁，纽约市，3岁，纽约市，纽约州，纽约市。医学，德国武兹堡大学，5算法生物信息学，计算机科学系，海因里希海恩大学，德国杜塞尔多夫，杜斯堡6号，尤斯堡，尤斯堡大学医院6大学医院，实验性生物医学研究所，德国7号董事会，林科式的生物学席位。德国温尔兹堡大学温兹堡大学，欧洲分子生物学实验室（EMBL）Heidelberg 8号，生物计算单位，海德堡，德国，德国
2025; 16（5）：1736-1746。 doi：10.7150/jca.107236研究论文ADAM10是非小细胞LUN
凋亡是一种高度调节的细胞死亡形式，可能是革命癌症治疗的关键。由于癌症的发病率高和死亡率，带来了重大的全球健康挑战，因此必须探索非常规治疗方法。中药以其整体原则而闻名，为治疗胃癌（GC）带来了有趣的可能性。值得注意的是，在传统的中国草药症状症状中发现的重要组成部分是Baicalin在胃癌治疗中表现出了有希望的临床潜力。要阐明这种有趣的现象，一种多学科的方法是一种多学科的方法，将系统生物学，生物学研究结合结合在一起。主要目的是揭开巴西阿氏蛋白促进胃癌细胞凋亡的能力的复杂工作。这项综合研究的发现揭示了一个涉及NF-κB-NLRP3的基本信号轴，该信号轴在巴西氏蛋白诱导的胃癌细胞中起着关键作用。随着调查的进行，很明显，黄胶蛋白具有逆转NLRP3抑制剂MCC950钠的作用的显着能力。令人兴奋的是，巴西林诱导细胞凋亡的疗效表现出了可见的剂量依赖性关系，展示了其作为有价值的治疗剂的潜力。这些发现的复杂性质强调了Baaicalein，NF-κB-κB-NLRP3信号传播和气体癌症细胞的复杂相互作用。随着科学界深入研究凋亡及其治疗意义的世界，Baicalein在与胃癌作斗争中改变了游戏的潜力变得越来越明显。
抽象Zilurgisertib有效抑制ALK2信号通路...
引言：贫血在骨髓纤维化（MF）的患者中很常见，并且与红细胞输血的需求和临床预后不良有关。Janus激酶（JAK）抑制剂（如鲁唑替尼）被广泛用于治疗MF的症状并改善生活质量，但也广泛地是骨髓抑制。可以阻止JAK信号传导同时避免贫血的新治疗性干预措施，通过减少导致停用和/或次优剂量的不良副作用来使MF患者受益。最近的研究表明，抑制激活素A受体1（ACVR1）/激活素受体样激酶2（ALK2）是肝素转录调节上游的骨形态发生蛋白（BMP）受体，可以降低MF患者的血清HEPCIDIN水平，并改善MF的肝素水平。1,2降低肝素的水平，是调节铁稳态的关键激素，并恢复红细胞生成会使通过JAK抑制剂治疗的MF患者有益。 当前，批准或正在研究的几种ALK2抑制作用，包括Momelotinib（JAK1/JAK2和ALK2抑制剂）和Pacritinib（JAK2，Interleukin-1受体相关激酶1 [IRAK1]和ALK2抑制剂）。 Momelotinib和Pacritinib研究的最新临床数据表明，ALK2抑制可改善MF患者的贫血。 因此，我们寻求一种有效，有选择性的ALK2抑制剂，并且可以滴定。 在这里，我们讨论了Zilurgisertib，这是一种ALK2特异性抑制剂，可以滴定以满足患者需求。1,2降低肝素的水平，是调节铁稳态的关键激素，并恢复红细胞生成会使通过JAK抑制剂治疗的MF患者有益。当前，批准或正在研究的几种ALK2抑制作用，包括Momelotinib（JAK1/JAK2和ALK2抑制剂）和Pacritinib（JAK2，Interleukin-1受体相关激酶1 [IRAK1]和ALK2抑制剂）。Momelotinib和Pacritinib研究的最新临床数据表明，ALK2抑制可改善MF患者的贫血。因此，我们寻求一种有效，有选择性的ALK2抑制剂，并且可以滴定。在这里，我们讨论了Zilurgisertib，这是一种ALK2特异性抑制剂，可以滴定以满足患者需求。
信号传导和分子视角以及前方的道路
摘要：左心脏综合征（HLHS）是一种致命的先天性心脏病（CHD），全球影响每100,000名新生儿8-25。主要是手术的临床干预措施，多年来已大大提高了受影响受试者的预期寿命。然而，HLHS的病因基础从根本上仍不清楚。基于现有的研究范式，HLHS表现出由复杂的遗传和信号传导级联反应介导的多因素的病因模式。本评论列出了HLHS表型，产前和产后风险以及驱动HLHS发病机理的信号传导和分子机制的详细概述。审查讨论了可以解决现有科学差距的研究的潜在局限性和未来观点。解释HLHS病因的机理研究将有可能阐明新的可药物目标，并增强未来针对HLHS的治疗方案的发展。
激素受体信号传导和抗乳腺癌对抗肿瘤免疫的抗性
摘要：乳腺癌重新组合许多异质性疾病对当前可用的疗法反应不足。大约70-80％的乳腺癌表达激素（雌激素或雌激素）受体。患有这些激素依赖性乳腺恶性肿瘤的患者靶向内分泌途径的疗法受益。然而，尽管有可用的治疗，但转移性疾病仍然是一个主要挑战，并且经常复发。通过改善患者的生存和生活质量，癌症免疫疗法在过去十年中引起了极大的热情和希望，但仅导致乳腺癌的成功有限。此外，只有非依赖激素乳腺癌的患者似乎从这些基于免疫的方法中受益。本综述研究并讨论了与激素受体信号传导（特定于雌激素受体）的作用相关的当前文献，以及其调节对乳腺癌细胞对抗肿瘤癌的敏感性的影响，对抗肿瘤免疫反应的效应机制以及乳腺癌能力逃脱保护性抗癌症的能力。未来的研究前景与使用激素治疗剂促进基于免疫干预措施的效率有关的可能性。
无标签的定量热蛋白质组谱分析揭示了目标转录因子，其活动由MC3R信号调节
摘要：使用离子动力增强的LC-MS提供无标记定量的热蛋白质组分析，提供了多功能数据集，提供有关蛋白质差异表达，热稳定性和转录因子活性的信息。我们开发了一种多维数据分析工作流程，用于无标记的定量热蛋白质组分析（TPP）实验，该实验结合了基因集富集分析的各个方面，差异蛋白蛋白表达分析以及从LC- MS数据中推断转录因子活性的推断。我们将其应用于黑色素质素3受体（MC3R）激活的信号传导过程，这些激动剂源自促蛋白酶素皮质素激素：ACTH，α -MSH和γ -MSH。获得的信息用于绘制MC3R下游的信号通路，并推断出负责配体治疗的细胞反应的转录因子。使用我们的工作流程，我们确定了差异表达的蛋白质并研究了它们的热稳定性。我们在总共298个蛋白质中发现了由MC3R激活导致的热稳定性改变的蛋白质。在这些中，几种蛋白质是转录因子，表明它们是参与MC3R信号级联的下游目标调节剂。我们发现转录因子CCAR2，DDX21，HMGB2，SRSF7和TET2的热稳定性改变了。MC3R信号级联中的这些明显的目标转录因子在免疫反应中起着重要作用。此外，我们推断了数据集中确定的转录因子的活动。这种综合方法生成复杂这是使用贝叶斯统计数据使用我们使用无标签定量LC-MS获得的差异表达数据完成的。通过我们观察到的磷酸化肽丰度，在我们的生物学管道中验证了推断的转录因子活性，这突出了转录因子调节中翻译后修饰的重要性。我们的多维数据分析工作流程允许对MC3R激活下游的信号过程进行全面表征。它提供了有关蛋白质差异表达，热稳定性和关键转录因子活性的见解。本研究中生成的所有蛋白质组学数据均可在DOI上公开获取：10.6019/pxd039945。■引入蛋白质 - 配体相互作用在几乎所有生物过程中都起着至关重要的作用，这使得他们的研究对于不足的细胞功能和发展疗法至关重要。已经开发了许多方法来表征这些相互作用，通常集中于配体亲和力。然而，随访蛋白 - 配体相互作用与其下游效应（包括跨文字组，蛋白质组学和翻译后修饰（PTM）变化）非常重要。热蛋白质组分析（TPP）已成为一种有价值的技术，可以深入了解蛋白质功能，蛋白质 - 蛋白质相互作用，甚至预测与生理相关环境中的不良药物影响。1，2 TPP基于蛋白质 - 配体相互作用的内在特性，例如，当配体结合稳定蛋白质结构并因此增加了其熔化温度时。1，2详细使用，TPP采用了多步方法，包括配体处理，加热，提取，纯化，消化和LC -MS分析。
Notch信号在调节神经元中起双重作用
神经祖细胞会产生兴奋性神经元，其次是少突胶质细胞（OLS）和垂体细胞。然而，调节该神经元时间 - 胶质开关的特定机制尚未完全了解。在这项研究中，我们表明，在胚胎发育的后期阶段，需要在背前祖细胞中Notch信号的适当平衡才能产生少突胶质细胞。在两性的小鼠胚胎中使用离体和子宫方法中，我们发现Notch抑制减少了背胸膜中少突胶质细胞的数量。然而，缺口过度活化也阻止了寡构成并保持祖细胞状态。这些结果表明，在促进和抑制寡头生成中，Notch信号传导的双重作用，必须对其进行微调才能在正确的时间和正确的数字中生成少突胶质细胞谱系细胞。在此过程中，我们进一步将其下游的典型档位hes1和hes5确定为负调节剂。crispr（群集定期间隔短的短质体重复）/cas9介导的hes1和hes5的敲低敲低导致促寡胶质细胞因子ASCL1的表达增加，并导致早产性寡构成。相反，将缺口与ASCL1过表达结合起来，可稳健地促进寡头生成，表明与ASCL1合成的Notch机制单独的机制，以指定少突胶质细胞的命运。我们提出了一个模型，其中Notch信号与ASCL1一起工作以指定祖细胞朝向少突胶质细胞谱系，但也通过hES依赖ASCL1的抑制来维持祖细胞状态，从而使少突胶质细胞不太早，从而导致神经元的精确时间促成神经元 - Glia Switch。
昆虫中通行信号的新功能化
信号信号在整个动物王国的病原体防御中起着至关重要的作用。然而，它是因为它在果蝇中背腹（DV）轴形成中的功能。到目前为止所研究的所有其他昆虫中，但在昆虫之外没有研究，DV构图也需要通行费。然而，在与果蝇更遥远相关的昆虫中，Toll的模式作用经常被BMP信号的扩大影响降低和取代，BMP信号的影响，在所有主要的后生动物谱系中，在DV轴形成中呈现的途径。这表明TOLL被整合到昆虫底部或昆虫进化过程中的基于祖先的BMP的图案系统中。观察到Toll信号传导在大多数昆虫胚胎的早期差异组织中具有免疫功能，这表明了如何从祖先免疫功能中使用TOLL的情况，用于其在轴形成中的新作用。
蛋白质-配体相互作用：从药物开发到细胞信号传导的生物过程和分子编排
蛋白质-配体相互作用是许多生物过程的核心，是支撑从细胞信号传导到药物开发等所有过程的分子编排。了解这些相互作用的复杂性不仅是生物化学的一个基本方面，也是设计针对各种疾病的靶向疗法的关键步骤。蛋白质-配体相互作用，探索其意义、机制和应用。
通过跨数据集迁移学习增强脑电信号通路中的病理检测
基于脑电信号和解码大脑活动的病理诊断对于理解神经系统疾病具有重要意义。随着人工智能方法和机器学习技术的进步，准确的数据驱动诊断和有效治疗的潜力显着增长。然而，将机器学习算法应用于现实世界的数据集在多个层面上提出了不同的挑战。标记数据的稀缺性，特别是在低水平场景中，由于招募成本高，真实患者队列的可用性有限，凸显了扩展和迁移学习技术的重要性。在本研究中，我们探索了一个现实世界的病理分类任务，以突出数据和模型扩展以及跨数据集知识转移的有效性。因此，我们观察到通过数据扩展可以获得不同的性能改进，这表明需要仔细评估和标记。此外，我们确定了可能的负转移挑战，并强调了一些关键成分对克服分布偏移和潜在的虚假相关性并实现正转移的重要性。当可用的标记数据量较少时，通过使用源数据集 (TUAB) 中的知识，我们发现目标模型在目标 (NMT) 数据集上的性能有所提高。我们的研究结果表明，小型通用模型（例如 ShallowNet）在单个数据集上表现良好，而大型模型（例如 TCN）在从大型多样化数据集进行迁移和学习方面表现更好。