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诱导神经元研究神经退行性和神经发育障碍
诱导的多能干细胞（IPSC）可以研究神经发育和神经退行性疾病，例如自闭症谱系疾病，包括脆弱的X综合征和RETT综合征，肌萎缩性侧面硬化症，阿尔茨海默氏病，阿尔茨海默氏病，帕克森氏病，亨廷顿病，亨廷顿病，亨廷顿氏病，亨廷顿病。人IPSC线是通过对成纤维细胞，头发或血液样本的重编程而产生的，这些[2]是由患有疾病相关表型的患者直接捐赠的，并且可以通过诸如CRISPR/CAS9等基因组修饰[3]引入IPSCS的基因组中，并且可以将已知的基因型或引起疾病的突变捐赠。为了研究突变对细胞水平的影响，可以将IPSC分化为与疾病相关的神经元亚型。常规分化方案依赖于在培养基中添加特定的可溶性生长因子和化合物。这些因素触发了影响转录因子（TFS）的细胞内信号传导途径，从而通过改变基因表达水平并触发基因调节网络来诱导神经元分化。然而，这些方案可能非常精致且耗时，持续数周到几个月，并在不同的发育阶段和神经胶质细胞下产生不同神经元亚型的异质混合物。在人IPSC中某些神经源TF的强制表达捷径神经元分化，导致神经发生迅速，产生了高度均匀的神经元群体[4-7]。在这里，我们描述了鲁棒诱导的神经元IPSC系的培养以及不同的方法，以将神经源性TF和基因组修饰引入人IPSC，以及如何将这些IPSC区分开为成熟的神经元。
对改变转录因子间距的自然插入和缺失的系统分析可识别耐受性和敏感的转录
基因表达的抽象调节需要在启动子和增强子上对序列特异性转录因子（TFS）的联合结合。先前的研究表明，TF结合位点之间间距的改变会影响启动子和增强子活性。然而，由于自然发生的插入和删除（Indels）导致的TF间距改变的重要性尚未系统地分析。为了解决这个问题，我们首先表征了通过ChIP-Seq（Chro-Matin免疫沉淀测序）确定的人类K562细胞中73 TF的全基因组间距关系。我们发现了协作因素之间放松的间距的主要模式，其中包括45个TFS专门与其结合伴侣展示了放松的间距。接下来，我们利用了遗传多样的小鼠菌株和人个体提供的数百万个indels来研究间距改变对TF结合和局部组蛋白乙酰化的影响。这些分析表明，与直接影响TF结合位点的遗传变异相比，通常可以容忍自然存在的插入的间距改变。为了实验验证这一预测，我们在巨噬细胞系中的六个内源基因组基因座上引入了PU.1和C/EBPβ结合位点之间的合成间距改变。在这些位置，PU.1和C/EBPβ的合作结合明显，可耐受的间距的变化范围从5 bp增加到> 30 bp的降低。总的来说，这些发现对理解增强子选择的机制以及对非编码遗传变异的解释具有影响。
针对转录因子YY1进行癌症治疗
简单总结：癌症是一个全球性的健康问题，后果严重。某些基因被称为转录因子 (TF)，在许多肿瘤中过度活跃。针对这些 TF 可能是对抗癌症的有效方法。其中一种 TF 被称为阴阳 1 (YY1)，在肿瘤发展中起着重要作用。在临床前研究中，抑制 YY1 已显示出减缓肿瘤生长、促进细胞死亡和提高化疗效果的前景。最近的研究表明，将 YY1 抑制与免疫疗法相结合可能会提高治疗效果。然而，开发专门针对 YY1 的药物并将其输送到肿瘤中存在挑战。本综述探讨了 YY1 生物学、其在癌症中的作用以及针对 YY1 的各种策略，包括小分子抑制剂、RNA 干扰和基因编辑技术。这些发现强调了 YY1 靶向治疗的临床意义以及可以改善患者预后的新治疗方法的潜力。
3D基因组和预测基因调控模型
• 转录调控由与启动子和增强子元件结合的转录因子 (TF) 协调 • 远端增强子可能距离启动子 >1Mb，通过染色质环路进行物理相互作用 • 1D 表观基因组数据（染色质可及性、组蛋白标记）映射候选增强子元件的存在但不映射它们的连接性
农业扩展杂志木质物种组成，结构，再生状态和碳
Mkulazi森林保护区（MFR）是位于坦桑尼亚摩洛哥区的最大森林保护区（Lovett and Pocs 1993，John 2018，TFS 2022）。MFR在1955年由于其高潜在的木材价值而被淘汰为生产森林。它由林地主导，每年收到估计的降雨量为1,000-1,500毫米（Lovett and Pocs 1993）。自1955年的公报以来，除了Malimbwi等人的研究外，还没有根据植物的组成，多样性，结构和再生状态进行的详细植被调查。（2005）报告了储备中可收获的木材量。随着森林保护区人类活动的越来越多的发生率（Lovett和Pocs 1993，Malimbwi等人2005，John 2018，TFS 2022），有关植物组成，结构和再生潜力的信息对于储备的声音管理和保护策略至关重要。这将有助于保护其余的生物多样性，这可能有可能减轻气候变化和相邻社区的生计（Godoy等人2011）。据报道的人类活动发生在森林储备中，例如凹坑，建筑杆的收获，柴火和药用植物，野火，木炭制造，牲畜放牧和耕种，被怀疑已经影响了
商业风险评估指南
AML/CFT 义务 2 应考虑的因素示例 AML-CFT 治理 更新的政策和程序到位，新产品和服务的评估，交付渠道，风险评估更新，董事会监督，MLRO 报告，董事会成员和高级管理层了解 AML/CFT 义务和责任 KYC/CDD/EDD 流程 客户入职 满足 AML/CFT 义务（例如完整的数据，正确的输入，及时进行的审查，对受益所有人的身份评估完成 TFS TFS 筛选，待处理制裁警报，当前阈值的有效性，最新更新，任何监管结果，针对正面打击的程序，理解 TF 和 PF 制裁之间的区别，PEP 风险管理系统以确定客户或 BO 是否是 PEP，筛选，高级管理层批准，始终确定财富来源和资金来源，EDD。 交易监控 场景调整，性能，待处理警报的质量数量，警报关闭所花费的时间，待处理案件，新场景，质量保证的审查，审计应该注意，这些是内部控制评估中应该考虑的最低限度的因素。
合成和基因组调控元件揭示顺式
摘要 在胚胎干细胞 (ESC) 中，核心转录因子 (TF) 网络建立了多能性所必需的基因表达程序。为了解决四种关键 TF 之间的相互作用如何促进小鼠 ESC 中的顺式调控，我们分析了两个由 SOX2、POU5F1 (OCT4)、KLF4 和 ESRRB 的结合位点组成的大规模并行报告分析 (MPRA) 文库。合成的顺式调控元件与具有可比结合位点配置的基因组序列之间的比较揭示了调控语法的某些方面。合成元件的表达受结合位点的数量和排列的影响。这种语法对基因组序列的作用很小，因为基因组序列的相对活性最好通过预测的结合位点占用率来解释，而与结合位点身份和定位无关。我们的结果表明，转录因子结合位点 (TFBS) 的影响受位点顺序和方向的影响，但在基因组中，TF 的整体占用率是活性的主要决定因素。
合成和基因组调控元件揭示小鼠胚胎干细胞中顺式调控语法的一些方面
摘要 在胚胎干细胞 (ESC) 中，核心转录因子 (TF) 网络建立了多能性所必需的基因表达程序。为了解决四种关键 TF 之间的相互作用如何促进小鼠 ESC 中的顺式调控，我们分析了两个由 SOX2、POU5F1 (OCT4)、KLF4 和 ESRRB 的结合位点组成的大规模并行报告分析 (MPRA) 文库。合成的顺式调控元件与具有可比结合位点配置的基因组序列之间的比较揭示了调控语法的某些方面。合成元件的表达受结合位点的数量和排列的影响。这种语法对基因组序列的作用很小，因为基因组序列的相对活性最好通过预测的结合位点占用率来解释，而与结合位点身份和定位无关。我们的结果表明，转录因子结合位点 (TFBS) 的影响受位点顺序和方向的影响，但在基因组中，TF 的整体占用率是活性的主要决定因素。
线粒体DNA中氧化链的命运
增强子在基因调节中起着至关重要的作用，对于介导与复杂性状相关的非编码遗传变异的影响至关重要。增强子活性是由转录因子（TFS），表观遗传学机构和遗传变异的细胞类型特异性术。尽管TFS和增强剂之间存在牢固的机械联系，但我们目前缺乏在细胞类型的基因调节网（GRN）中共同分析它们的框架。同样重要的是，我们缺乏一种公正的方法来讲述推断GRN的生物学意义，因为没有完整的地面真理。为了解决这些差距，我们提出了Granie（基因调节网络推断，包括增强剂）和Granpa（基因调节网络绩效分析）。granie（https://git.embl.de/grp-zaugg/granie）基于跨样品的染色质可及性和RNA-Seq的协变（例如个体），而Granpa（https：//git.embl。de/grp-Zaugg/granpa）评估了GRNS的性能，以预测细胞类型的特异性差异表达。我们通过研究巨噬细胞对感染，癌症和包括自身免疫性疾病（自身免疫性疾病的常见遗传特征的反应的基因调节机制）的基因调节机制来揭示其能力。最后，我们的方法将TF PURA识别为炎性巨噬细胞极化的推定调节剂。
先天性免疫缺陷症中的转录因子缺陷
转录因子 (TF) 是调节免疫系统发育、维持和功能的关键成分。因此，某些 TF 的单基因缺陷会导致先天性免疫缺陷 (IEI)，其临床意义深远，包括感染、恶性肿瘤，在某些情况下还会导致严重的过敏性炎症。本综述探讨了以严重过敏性为定义临床表型的 IEI 背后的 TF 缺陷，包括 STAT3 功能丧失、STAT6 功能获得、FOXP3 缺陷和 T-bet 缺陷。这些疾病为了解过敏性炎症的病理生理学提供了宝贵的见解，拓展了我们对罕见单基因和常见多基因过敏性疾病的理解。基因检测的进展可能会发现与过敏性相关的新 IEI，丰富我们对过敏性炎症分子通路的理解。单基因疾病的识别对患者的预后、治疗计划和遗传咨询有深远的影响。因此，对于患有严重、早发性过敏症的患者，考虑 IEI 至关重要。本综述强调需要继续研究 TF 缺陷，以加强我们对过敏性疾病的理解和管理。