XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemTranslational
碱基编辑工具在单基因疾病基因治疗中的转化潜力
全球有数百万人患有由 DNA 序列各种突变引起的罕见遗传病。罕见遗传病的传统治疗方法往往无效，因此人们对基因编辑方法寄予厚望。基于 nCas9（具有切口酶活性的 Cas9）或 dCas9（催化无活性的 DNA 靶向 Cas9 酶）的 DNA 碱基编辑系统能够在不造成双链断裂的情况下进行编辑。这些工具在不断改进，增加了它们在治疗中的潜在用途。在这篇综述中，我们描述了主要类型的碱基编辑系统及其在体外和体内实验中治疗单基因疾病的应用。此外，为了了解这些系统的治疗潜力，我们还研究了碱基编辑系统的优缺点。
Jenny Craigen 博士 CRUK CDD 首席转化科学家
• 靶向药物 – 靶点和途径是否可比？ • 肿瘤特异性靶点 – 健康动物中是否存在靶点？ • 是否存在与人类反应方式相同的毒性物种 • 化合物的相互作用方式是否与人类相同
建立基于荧光素酶的转化癌症模型来评估抗肿瘤疗法
摘要：荧光素酶 (luc) 生物发光 (BL) 是最常用的发光蛋白，已被设计为在多种癌细胞系中表达，由于它可以穿透大多数组织，因此可用于体内检测肿瘤结节。本研究的目的是开发一种可以表达荧光素酶的抗溶瘤腺病毒 (OAd) 的人类三阴性乳腺癌 (TNBC)。因此，当将 OAd 与化疗或靶向疗法相结合时，我们将能够实时监测这些化合物使用 BL 增强 OAd 抗肿瘤功效的能力。TNBC 细胞系 HCC1937 稳定转染质粒 pGL4.50[luc2/CMV/Hygro] (HCC1937/luc2)。建立后，将 HCC1937/luc2 原位植入 NSG（非肥胖糖尿病严重联合免疫缺陷病 γ）雌性小鼠的第 4 个乳腺脂肪垫中。生物发光成像 (BLI) 显示，HCC1937/luc2 细胞系随着时间的推移发展出原位乳腺肿瘤和肺转移。然而，luc 质粒的整合改变了 HCC1937 表型，使 HCC1937/luc2 对 OAdmCherry 的敏感性高于亲本细胞系，并减弱了干扰素 (IFN) 抗病毒反应。对另外两种 luc 细胞系的测试表明，这并不是普遍的反应；然而，需要评估适当的对照，因为荧光素酶的整合可能会影响细胞对不同治疗的反应。
社论：贝叶斯和其他模型在翻译神经科学中的新应用
大脑和神经科学家的任务都是为了理解大量相互依存和不确定的变量（即概率）。这部分解释了为什么统计模型（尤其是贝叶斯模型）在分析神经数据的脑功能和方法论中都越来越突出。贝叶斯定理指定了将先前信念与概率推断中的数据相结合的最佳方法，其中1个是在不确定性下进行推理的强大工具（van Amersfoort等，2020）。在贝叶斯网络的框架内，可以通过贝叶斯定理的连续应用从观察数据中计算出通过条件依赖性网络相互关联的多个变量的值（或概率分布）。贝叶斯网络可以用作大型和一般的动力学现象类别的统计模型，并且可以使用专家知识构建或通过结构学习过程从数据中学到。最新的大脑功能理论表明，感知，认知和动作都可以富有成果理解为贝叶斯推论的形式，在这种形式上，世界内部生成模型被反转以拟合感官数据。该内部生成模型可以正式化为动态和层次深度的贝叶斯网络 - 即由多个（越来越抽象的）解释变量及时演变而来。在感知中，模型被更改以匹配感觉数据，而在动作中，更改了感官数据以通过所谓的活动推断匹配模型。反转该网络是通过预测处理来实现的，其中大脑活动主要编码模型生成的预测和感觉数据之间的差异，即预测错误。
生物材料辅助基因治疗用于治疗肌肉骨骼疾病的转化方法
生物材料辅助基因疗法是一种有前途的策略，用于治疗各种肌肉骨骼疾病，例如与关节软骨，骨骼，骨骼，肌腱和韧带以及拟南芥相关的肌肉疾病，因为它可以在空间和时间上损害持续的延长程度，以使其在持续的延长时期内损害持续的方式，以使其在持续的方式上损害，以至于可以在持续的时间内损害候选基因序列。在直接无创的过程中进行体内机制，以避免艰苦的操纵和植入患者依赖性细胞在体外进行了基因修饰。在目前的工作中，我们概述了使用生物材料引导的基因转移在体内的实验，相关模型中最新的方法和结果，这些基因转移可能会在不久的将来使用，以治疗患者在临床干预期间作为一种有效的，安全的，安全的，持久的，持续性的，安全的肌肉症状，并具有持续性的肌肉症状。©2020作者。由Elsevier Ltd.这是CC BY-NC-ND许可证（http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/）下的开放访问文章。
极化显微镜及其在心脏的实验和翻译诊断中的应用
关键字：极化，心脏病发作，肌节，各向异性直接极化显微镜使A型磁盘能够双向射线折射[1]并评估心肌细胞收缩的状态，从而使肌原纤维肉瘤可视化。已经确定，在呼吸道或心脏骤停的条件下，器官和组织的病理变化发生不同[2]。因此，这项研究的目的是评估在两个根本不同的急性条件下与心脏氧气供应不足相关的急性疾病。通过Zeiss Axio Imager进行了极化图像和非极化图像的比较分析。A1（德国Carl Zeiss）具有和不具有极化系统的显微镜。 由于心肌的各向异性现象，观察到光学特性，例如双折射。 这使我们能够可视化肌膜的成分，因为磁盘具有异质性和独特的光学特性。 在我们的实验中，我们使用了lambda（相）板来提高图像的质量进行分析。 我们计算了整个肉瘤的长度和A和我的磁盘，然后使用Origin Pro软件（OriginLab，USA）对数据进行了统计分析。 在使用ANOVA通过非参数分析检查分布的正态性后，评估了测量结果。 对心肌细胞的极化特性的研究表明，肉皮长度在呼吸停滞和心脏骤停期间显着降低。A1（德国Carl Zeiss）具有和不具有极化系统的显微镜。由于心肌的各向异性现象，观察到光学特性，例如双折射。这使我们能够可视化肌膜的成分，因为磁盘具有异质性和独特的光学特性。在我们的实验中，我们使用了lambda（相）板来提高图像的质量进行分析。我们计算了整个肉瘤的长度和A和我的磁盘，然后使用Origin Pro软件（OriginLab，USA）对数据进行了统计分析。在使用ANOVA通过非参数分析检查分布的正态性后，评估了测量结果。对心肌细胞的极化特性的研究表明，肉皮长度在呼吸停滞和心脏骤停期间显着降低。根据这些数据，我们与确定相关和确定系数的确定以及构建阶阶3的多项式模型的相关性和回归分析，并构建了描述所获得数据的依赖方程。我们研究了未染色的心脏切片的极化图像和非极化图像，以及用苏木精和曙红，碱性富氏素和李染色方法染色的切片。正常情况下的中位肌节长度为1.86（1.79; 1.92）μm，呼吸停滞中的1.77（1.66; 1.82）μm，心脏骤停中的1.77（1.66; 1.82）μm。I-DISC的大小在实验组中也减小。对照组中位的各向同性盘长度为0.56（0.45; 0.65）μm和0.44（0.38; 0.57）μm，用于呼吸停滞，而对心脏骤停的中位数为0.25（0.22; 0.22; 0.22; 0.22; 0.22; 0.26; 0.26; 0.26）μm。同时，所有组中值的a磁盘并不以显着差异的存在为特征。这项研究表明，在与缺氧相关的各种病理过程的发展过程中，A磁盘和I-Disk Saromere参数之间的相关程度大大降低。与急性心脏骤停的实验中，椎间盘长度之间的关系显着较低，与急性呼吸停滞相比，这可以表征为更快的心肌损伤过程，这可能与循环滞留，快速血液脱氧和明显的心肌缺血发展有关。
针对黑色素的放射性示踪剂及其临床前、转化和临床状态：从过去到未来
黑色素是恶性黑色素瘤的代表性生物标志物之一，是诊断和治疗的潜在靶点。随着化学和放射性标记技术的进步，人们在合成放射性标记的黑色素结合分子以用于各种应用方面取得了有希望的进展。我们概述了黑色素靶向放射性标记分子，并比较了临床前研究中报告的它们的特征。还讨论了临床实践和试验，以详细说明探针的安全性和有效性，并回顾了黑色素瘤以外的扩展应用。黑色素靶向成像在黑色素瘤的诊断、分期和预后评估以及其他应用中具有潜在价值。黑色素靶向放射性核素治疗具有巨大的潜力，但需要更多的临床验证。此外，未来研究的一个有趣途径是扩大黑色素靶向探针的应用范围并探索其价值。
NICE：四项以人为本的人工智能原则，用于弥合人工智能与临床转化差距
尽管近年来人工智能 (AI) 方法发展迅速，并应用于临床研究的无数挑战，但最终真正应用于医疗保健系统的比例却非常低。在本文中，我通过研究文献、我自己的研究和临床合作，提出了一个由四大支柱（需求、迭代、协作、错误预防 (NICE)）组成的设计启发框架，以缩小这一转化差距。专注于构建以临床医生为中心的临床护理方法，我概述了 (1) 加剧人工智能方法与临床实施之间转化差距的几个关键因素，(2) 从长远来看如何理想地解决这些因素，以及最关键的是，(3) 人工智能研究人员和工程师可以立即开始采取的激动人心的方向，以发挥我们的作用，推进这些目标。
RTX-KG2：构建转化生物医学语义标准化知识图谱的系统
背景：生物医学转化科学越来越多地利用大型结构化知识库（如统一医学语言系统 (UMLS)、语义医学数据库 (SemMedDB)、ChEMBL、DrugBank 和小分子途径数据库 (SMPDB)）和数据的计算推理，以促进发现新的治疗目标和治疗方式。自 2016 年以来，NCATS 生物医学数据翻译器项目一直致力于在分布式系统内联合自主推理代理和知识提供者，以回答转化问题。在该项目内以及更广泛的领域内，迫切需要一个开源框架，可以有效且可重复地构建一个集成的、符合标准的、全面的生物医学知识图谱，该图谱可以以标准序列化形式下载或通过符合 FAIR 数据原则的公共应用程序编程接口 (API) 进行查询。
社论：神经追踪：缩小神经生理学与转化医学之间的差距
感知涉及通过处理连续的多模态感官信息流来理解我们周围的世界。在此过程中，人类大脑会产生电活动，这些电活动可以在各种场景和任务中测量，以阐明连续感知的神经基础。这项研究表明，大脑电活动与感官输入的特定属性同步，这种现象称为神经追踪（Obleser 和 Kayser，2019 年）。最近的研究表明，侵入式和非侵入式电生理记录都可以稳健地检测到神经追踪（Lalor 等人，2006 年；Ding 和 Simon，2012 年；Gross 等人，2013 年；Zion Golumbic 等人，2013 年），为研究越来越复杂的涉及连续现实刺激（如语音和音乐）的任务中的感知提供了客观的测量方法。听觉感知的情况尤为引人注目。神经信号能够可靠地跟踪连续声音的幅度包络（包络跟踪）（Lalor 等人，2009 年）的发现引领了新的研究方向。首先，包络跟踪测量已使一系列关于现实多说话者场景中的听觉注意力的研究成为可能（例如，参见 COCOHA 项目，H2020.2.1.1.4。ID = 644732），表明用侵入性皮层脑电图 (ECoG) 以及非侵入性脑电图和脑磁图 (EEG/MEG) 记录的信号以不同的方式跟踪有人注意和无人注意的声音（Ding 和 Simon，2012 年；Zion Golumbic 等人，2013 年；O'Sullivan 等人，2014 年、2019 年）。这一开创性的发现为脑机接口研究开辟了一个全新的方向，有望用于脑控助听器等新型设备（Eyndhoven 等人，2017 年；O'Sullivan 等人，2017 年；Ceolini 等人，2020 年）。一项平行的研究表明，可以同时跟踪同一刺激的多个属性（O'Sullivan 等人，2016 年；Di Liberto 等人，2021a 年；Gillis 等人，2021 年）。在语音聆听的背景下，皮质信号被证明可以逐步跟踪语音信号的高级属性，从声学特征（Lalor 和 Foxe，2010；Ding 等人，2014）到语言单位（Di Liberto 等人，2015、2018b；Brodbeck 等人，2018；Lesenfants 等人，2019）、韵律（Myers 等人，2019；Teoh 等人，2019）和语义内容（Broderick 等人，2018、2021；Weissbart 等人，2020）。因此，神经跟踪测量可以通过为我们提供指向不同处理阶段的不同客观指标，为语音的分层编码提供丰富的视图。