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脑肿瘤分类方法
摘要。脑肿瘤诊断是一个复杂的问题，需要专业技能和知识。手动分析通常很耗时，而且解释结果的主观性很强。卷积神经网络 (CNN) 已成为一种有前途的解决方案，可自动从磁共振图像 (MRI) 中对脑肿瘤进行分类。CNN 是一种神经网络，可以自动学习并从图像中提取相关特征，使其在应用于深度学习算法时特别适合这项任务。文献中广泛探讨了 CNN 在脑肿瘤诊断中的应用，许多研究报告了有希望的结果。通过利用标记的 MRI 数据集，CNN 可以学习准确检测和分类不同类型的脑肿瘤，包括神经胶质瘤、脑膜瘤和垂体腺瘤。这些模型已被证明在某些情况下优于传统的机器学习算法，甚至优于人类专家。本文介绍了一种旨在从 MRI 中识别和分类脑肿瘤的 CNN 模型。该模型在大量 MRI 数据集上进行训练，并在独立测试集上评估其性能。考虑到所有验证步骤，该模型的准确率达到 99%，并且优于最先进的脑肿瘤分类方法。当考虑单个类别时，胶质瘤、脑膜瘤、背神经瘤和垂体的准确率分别为 100%、98%、99% 和 99%。开发准确有效的脑肿瘤诊断方法对于改善患者预后和降低医疗成本至关重要。本文可以为日益增多的医学图像分析深度学习文献做出贡献，从而加深我们对如何充分利用这些强大算法来解决现实世界医疗问题的理解。
肿瘤标志物及临床应用
根据 2018 年对 12,993 名乳腺癌患者进行的荟萃分析，CA15-3 和 CEA 在原发性和继发性癌症以及不同阈值中均具有显著的预测价值。此外，高 CA15-3 与晚期组织学分级和年轻患者有关，而高 CEA 与三阳性肿瘤和高龄患者有关。这两个升高的体征都与较高的肿瘤负担有关。[22] 另一项研究在 BRCA 相关乳腺肿瘤中使用聚（ADP-核糖）聚合酶 (PARP) 抑制剂和 DNA 修复剂等靶向药物取得了有希望的结果。 [23] 此外，HER2 状态在乳腺癌中也非常重要。它是 15% 至 30% 浸润性乳腺癌中过度表达的原癌基因。它有助于确定预后和预测治疗反应。 [24] 这种物质的水平是在组织中确定的。然而，细胞外结构域（ECD）可以从肿瘤组织溢出的细胞中混入血液，部分转移性乳腺癌患者的 HER2 ECD 血液水平可能较高。[25] 血液中 HER2 ECD 水平高的患者临床表现更严重，治疗反应更差，这一发现可能有助于在临床前期检测疾病复发。[25,26]
肿瘤免疫微环境的表征（...
mtap del定义为两拷贝损失。体细胞改变（ALTS），从IHC，TMB和MSI的基因表达模式，PD-L1预测的免疫细胞浸润。融合，以避免任何潜在的偏见。卡方/Fisher的精确测试或Kruskal-Wallis检验用于评估统计显着性（p <0.05，Q <0.05，用于用于多次测试的错误发现率校正）。
南加州大学脑肿瘤中心
结果：48 种 lncRNA 在敲低后与侵袭性下降 33-83% 显著相关（p<0.01）。根据效应大小和 p 值确定的首选候选物 LINC03045 在敲低后显示肿瘤细胞侵袭性下降 82.7%，而 LINC03045 表达与患者生存和肿瘤分级显著相关（p<0.0001）。LINC03045 敲低的 RNAseq 分析显示，之前在肿瘤侵袭研究中涉及的 WASF3 与 lncRNA 表达高度相关，而 WASF3 KD 与侵袭性显著下降相关。最后，WASF3 过表达显示 LINC03045 KD 丧失的侵袭功能得以挽救。
循环肿瘤细胞和贝伐单抗
1 CNRS U7258，INSERM U1068，PAOLI-CALMETTES，CRCM，AIX MARSEILLE UNIXPYSION，13009 MARSEILLE，法国Marseille； lambaudiee@ipc.unicancer.fr（E.L.）; goncalvesa@ipc.unicancer.fr（A.G.）2医学肿瘤学，法国Marseille 13009； rabulnaja@gmail.com（R.A.）; extlejm@ipc.unicancer.fr（J.-M.E.）3法国75005巴黎大学的巴黎和圣云医学肿瘤学系，法国巴黎75005； jean-yves.pierga@curie.fr（J.-Y.P.）; francois-clement.bidard@curie.fr（F.-C.B.）4法国雷姆斯51100的医学肿瘤科医学肿瘤学系； hcure@chu-grenoble.fr 5手术肿瘤科，Paoli-Calmettes，13009 Marseille，法国6法国6临床研究与创新部，生物统计学部门，Paoli-Calmettes研究所，法国13009 Marseille，法国，法国Marseille； sfumatop@ipc.unicancer.fr *通信：sabatierr@ipc.unicancer.fr;电话。： +33-4-9122-3537
循环肿瘤DNA动力学和...
结果总共分析了110例患者的285个血液样本。较高的基线CFDNA浓度与较差的无进展生存率（PFS）和总生存期（OS）有关。处理2个循环后，ctDNA突变主要ITY中的变异等位基因频率（VAF）随着平均相对变化为–31.6％而降低。在2个循环恢复后的TP53，APC，TCF7L2和ROS1的VAF中减少与较长的PF相关。我们在每个时间点使用VAF的总和作为整体ctDNA负担的替代物。2个周期后的总和（VAF）≥50％的降低与PFS更长（6.1 vs. 2.7个月，P = 0.002），OS（11.3 vs. 5.9个月，P = 0.001）和较高的疾病控制率（86.3％vs. 51.1％，P <0.001）。vaf在疾病进展时增加，BRAF的VAF显着增加。
Microbiota- ...
摘要：发现结直肠癌（CRC）的新治疗方法的相关性增加，因为CRC是全球最常见的癌症之一。CRC标准疗法包括手术，化学疗法和放疗，可以单独或组合使用。所报告的副作用和与这些策略相关的抗药性导致越来越需要寻找具有更好效率和毒性较小的新疗法。几项研究表明，微生物源性短链脂肪酸（SCFA）具有抗肿瘤性特性。肿瘤微环境由非细胞成分，微生物群和大量细胞（例如免疫细胞）组成。SCFA对肿瘤微环境的不同成分的影响是一个重要的问题，应考虑到一个重要的问题，据我们所知，缺乏对此主题的评论。肿瘤微环境不仅与CRC的生长和发育密切相关，而且还会影响患者的治疗和预后。免疫疗法已成为一种新的希望，但是，在CRC中，发现这种治疗中只有一小部分患者密切取决于肿瘤的遗传背景。本综述的目的是对有关微生物群衍生的SCFA在肿瘤微环境中的影响的当前知识进行最新的批判文献综述，尤其是在CRC及其对CRC治疗策略的影响。scfas，即乙酸盐，丁酸酯和丙酸，具有以不同方式调节肿瘤微环境的能力。SCFA促进免疫细胞分化，下调促炎性介质的表达，并限制肿瘤诱导的血管生成。SCFA还维持基底膜的完整性并调节肠道pH。CRC患者的SCFA浓度低于健康个体。通过操纵肠道微生物群来增加SCFA的产生，可能构成CRC的重要治疗策略，因为它们的抗肿瘤效应和调节肿瘤微环境的能力。
可溶性环氧化物水解酶通过环氧酸卫星酸
外泌体是细胞分泌的小细胞外囊泡，大小为30至150 nm。它们包含蛋白质，核酸，脂质和其他生物活性分子，它们在细胞间通信和材料转移中起着至关重要的作用。在肿瘤免疫中，外泌体具有各种功能，而以下两个功能非常重要：调节免疫反应并用作递送载体。 本综述首先引入了外泌体的形成，组成，功能，隔离，表征和应用，然后讨论了外泌体在肿瘤免疫疗法中的当前状态，以及基于外部肿瘤的肿瘤免疫调节和抗肿瘤药物的最新应用。 最后，提出了当前的挑战和未来的前景，并希望为领域的目标读者展示灵感。在肿瘤免疫中，外泌体具有各种功能，而以下两个功能非常重要：调节免疫反应并用作递送载体。本综述首先引入了外泌体的形成，组成，功能，隔离，表征和应用，然后讨论了外泌体在肿瘤免疫疗法中的当前状态，以及基于外部肿瘤的肿瘤免疫调节和抗肿瘤药物的最新应用。最后，提出了当前的挑战和未来的前景，并希望为领域的目标读者展示灵感。
肿瘤微环境： - 3D Genomics
单细胞多组学技术 • 空间转录组学（10X Visium，通常与 10X Genomics 单核 RNAseq 集成） • 具有大量和少量细胞的单细胞转录组学（分别为 10X Genomics 和 SmartSeq）。 • 来自新鲜冷冻和 FFPE 包埋组织的单核 RNAseq。 • IHC 成像（宽视野/共聚焦、显色/荧光） • 高内涵成像（细胞绘画、HCS） • 单细胞免疫组库分析、B 细胞/T 细胞克隆型研究，通过 FACS 和 MACS 分离细胞类型。 批量细胞技术 • 使用患者来源和对照细胞系在多个治疗领域进行基因表达和药物反应研究的 3D 类器官模型 • 具有多种模态读数的定制细胞检测开发和化合物研究。 • 毛细管印迹 (ProteinSimple) 用于空间转录组学的组织 • 脑、肾、肺、心脏等。 • FFPE 样本即将推出 参考文献