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Cereblon 的结构功能研究及其对新型分子胶发现的意义
Cereblon 是 CRL4-CRBN E3 泛素连接酶的组成部分，是骨髓瘤药物沙利度胺、来那度胺和泊马度胺的靶标。在发现 Cereblon 直接与沙利度胺结合后，结构研究对于了解分子胶水的作用机制至关重要。这些药物与 Cereblon 表面结合并重新利用 E3 连接酶来招募非天然底物，从而导致泛素化和降解。Cereblon 的重新利用可以通过异双功能药物或分子胶水降解剂实现。分子胶水药物的分子量低于异双功能药物，并且更广泛地依赖于稳定蛋白质-蛋白质相互作用。沙利度胺类似物作为原型分子胶水得到了非常深入的研究，已经确定了几种 Cereblon 复合物的晶体结构。除了 Cereblon-药物二元复合物外，还解决了几种底物结合的三元复合物。底物募集所需的关键“降解决定子”特征，可实现优化功效和选择性的合理设计。降解决定子存在于其他不相关的 cereblon 底物中，这些底物没有序列、折叠或功能相似性。
[DZNE-2024-00092.pdf
摘要：神经退行性疾病，例如帕金森氏病，阿尔茨海默氏病和亨特顿病，都以神经元和神经元功能障碍的进行性丧失鉴定和特征，导致认知和运动障碍。最近的研究表明，PTM的重要性，例如磷酸化，乙酰化，甲基化，泛素化，Sumoylation，硝化，硝化，截断，O-Glcnacylation和羟基化和羟基化，在NeuroDegeneration灾难的进展中。PTM可以改变蛋白质的结构和功能，从而影响蛋白质稳定性，定位，相互作用和酶活性。异常的PTM会导致蛋白质错误折叠和聚集，降解和清除，并最终导致神经元功能障碍和死亡。本综述的主要目的是概述与神经变性有关的PTM，其潜在机制，分离PTM的方法以及这些疾病的潜在治疗靶标。本文讨论的PTM包括tau磷酸化，α-突触核蛋白和狩猎蛋白泛素，组蛋白乙酰化和甲基化以及RNA修饰。了解PTM在神经退行性疾病中的作用可能为这些毁灭性疾病提供新的治疗策略。
Cullin环泛素连接酶在心脏发育中的新作用
摘要：心脏发育是一个时空调节的过程，从胚胎阶段延伸到产后阶段。这种高度精心策划的过程的破坏会导致先天性心脏病或使心脏疾病或心脏衰竭使心脏易受。因此，对控制心脏发育的分子机制有深入的了解，对开发各种心脏疾病的创新疗法具有很大的希望。尽管已经取得了心脏发育的新型转录和表观遗传调节剂的重大进展，但探索影响这一过程的翻译后机制却滞后。culling环E3泛素连接酶（CRLS）是最大的泛素连接酶家族，控制约20％的细胞内蛋白的泛素化和降解。新兴证据发现了CRL在调节广泛的细胞，生理和病理过程中的关键作用。在这篇综述中，我们总结了有关CRL对心脏形态发生和成熟的多功能调节的最新发现，并呈现未来的观点，以促进我们对CRLS如何管理心脏发育过程的全面理解。
2024 年美国癌症研究学会年会
TEAD 转录因子已成为 Hippo 变异癌症（例如由 NF2 失活/缺陷引起的间皮瘤）的临床验证靶点。我们开发了一系列新型小分子靶向 TEAD 蛋白质降解剂，这些降解剂基于 TEAD 界面 3 的结合剂。在细胞中，这些化合物通过与 Cereblon 形成三元复合物来诱导 TEAD 降解，从而导致 TEAD 泛素化和随后的蛋白酶体降解。在基于细胞的荧光素酶报告基因测定中，降解剂显示出低纳摩尔活性。通过对真正的 YAP-TEAD 靶基因（例如 CTGF、Cyr61 和 AMOTL2）进行 qPCR 分析，进一步研究了 TEAD 降解的下游效应。通过使用各种间皮瘤细胞系进行细胞活力和增殖测定，将 TEAD 降解剂的有效性与其他类别的 TEAD 调节剂（如棕榈酰化和 YAP–TEAD 蛋白质相互作用抑制剂）进行了比较。最后，我们通过将一种选定的 TEAD 降解剂与约 2,800 种肿瘤药物库相结合，进行了无偏、定量的高通量药物组合筛选 1。
范可尼贫血核心复合物促进 CtIP-...
在修复链间交联 (ICL) 期间，会产生 DNA 双链断裂 (DSB)。范康尼贫血症 (FA) 核心复合物被募集到 ICL，通过同源重组 (HR) 促进该 DSB 的高精度修复。然而，FA 核心复合物是否也促进 ICL 独立 DSB（例如由电离辐射或核酸酶诱导的 DSB）的 HR 仍存在争议。在这里，我们在基于 CRISPR/Cas9 的筛选中将 FA 核心复合物成员 FANCL 和 Ube2T 鉴定为 HR 促进因子。使用同源细胞系模型，我们进一步证明了 FANCL 和 Ube2T 及其泛素化底物 FANCD2 的 HR 促进功能。我们表明 FANCL 和 Ube2T 以 FANCM 依赖的方式定位在 DSB 上，并且是 FANCD2 在 DSB 上积累所必需的。从机制上讲，我们证明 FANCL 泛素连接酶活性是 CtIP 在 DSB 上积累所必需的，从而促进末端切除和 Rad51 加载。总之，这些数据表明 FA 核心复合物和 FANCD2 在促进 ICL 和 DSB 修复方面具有双重基因组维护功能。
GRC 65327，一种新型小分子选择性口服 Cbl-b 抑制剂，用于实体肿瘤患者的体内治疗
卡西塔斯 B 系淋巴瘤-b (Cbl-b) 是环指 E3 连接酶 Cbl 家族的一种蛋白质 1 ，它通过介导各种信号转导分子的泛素化和降解来调节先天性和适应性免疫激活 2,3 。Cbl-b 是 TAM 受体（NK 细胞）4 和 CD28 / CTLA4（T 细胞）下游的主要调节器，它在 TME（肿瘤微环境）中促进免疫抑制环境，限制 T 细胞和 NK 细胞的抗肿瘤效应功能 5 。据报道，CD28 缺乏会导致严重衰竭的 T 细胞表型，从而导致对抗 PD-1 疗法的耐药性 6,7 。即使在没有 CD28 共刺激的情况下，Cbl-b 抑制也会激活 T 细胞，从而为免疫抑制 TME 提供了潜在优势。 GRC 65327 阻断 Cbl-b 功能可激活免疫功能，从而在结肠癌、CT26 和 MC38 hPD-L1 的小鼠体内模型中发挥疗效，并与 ICI（免疫检查点抑制剂）联合使用可增强疗效，从而凸显了 Cbl-b 抑制在癌症免疫治疗中的治疗潜力。GRC 65327 比 c-Cbl 具有更好的选择性，因此与非选择性抑制剂相比，其安全性有望更佳。
遗传和分子因素决定水稻中的谷物体重
谷物重量是决定米饭和其他谷物作物单植物产量产生的主要因素之一。研究已开始揭示晶粒重量和晶粒尺寸的调节机制，突出了这项研究对植物分子生物学的重要性。晶粒重量的发育特征受到多个分子和遗传方面的影响，这些方面导致细胞分裂，扩张和分化的动态变化。此外，几种重要的生物学途径有助于晶粒重量，例如泛素化，植物激素，G蛋白，光合作用，表观遗传修饰和microRNA。我们的评论综合了早期和最新的发现，并为对谷物重量的更全面了解如何优化提高产量产量的策略提供了未来的观点。令人惊讶的是，获得的知识并未揭示出对基本分子机制的更多见解。加速大米和其他谷物的分子育种正在成为农艺学家的一项紧急和至关重要的任务。最后，我们强调了利用基因编辑技术以及为未来水稻育种应用的结构研究的重要性。
科学期刊
泛素化是通过电离辐射（IR）诱导的DNA双链断裂（DSB）的正确修复所需的至关重要的翻译后修饰。dsbs主要通过同源重组（HR）修复，并且在不存在的情况下非同源末端连接（NHEJ）。此外，微型学介导的终端连接（MMEJ）和单链退火（SSA）提供了备份DSBS修复途径。然而，控制其使用的机制仍然知之甚少。通过在IR之后使用泛素系统的高分辨率CRISPR筛选，我们会系统地揭示细胞存活所需的基因，并阐明E3泛素连接酶SCF Cyclin F在依赖细胞周期依赖性DSB修复中的关键作用。我们表明，SCF细胞周期蛋白介导的EXO1降解可防止有丝分裂中的DNA末端切除，从而允许MMEJ发生。此外，我们确定了一个保守的细胞周期蛋白识别基序，与其他细胞周期蛋白所使用的基序不同，对细胞周期蛋白的特异性具有广泛的影响。
DNA双链断裂修复中的液态液相分离
DNA修复因子通过时空的隔离和DNA双链断裂（DSB）的溶解作用。最近的进步表明，某些DSB修复因子经历了液 - 液相分离（LLP），并显示出类似液滴的特性以及动态材料交换。重要的是，LLP调节了各种生物学过程，异常LLP参与了农业疾病的病理发展。此外，DSB修复过程中DNA修复因子的动态冷凝和溶解的表型呈现了LLP的特性。显着，RNA，聚（ADP-核糖）[PAR]和转录后修饰（PTM），例如磷酸化，泛素化和甲基化，被认为有助于DSB修复因子的LLP。从DSB期间LLP的功能的观点中，DNA修复因子可能会在DSB传感和DNA损伤修复信号转导中作用，参与同源推荐（HR）（HR）和非同源性端始终连接（NHEJ） - 介导的DSB介导的DSB修复，并调节下游径流的途径。基于这些发现，研究人员专注于
MDP
描述Muramyl二肽（MDP）是一种由N-乙酰毛素酸组成的合成免疫反应性肽，其乳酸部分与L-丙氨酸D-异谷胺二肽的N-末端相连。MDP是几乎所有细菌中发现的最小生物活性肽聚糖基序。它首先被识别为Freund完整辅助1中的活动组件。MDP被胞质受体NOD2 2，3识别。配体 - 结合NOD2通过丝氨酸/苏氨酸RIP2（Rick，Cardiak）激酶通过卡片卡均质相互作用4。一旦激活，RIP2介导了NEMO/IKKγ的泛素化，从而导致NF-κB的激活和炎症细胞因子的产生。此外，多泛素化的RIP2募集了TAK1，这会导致IKK复合物激活和MAPK 5的激活。此信号涉及适配器蛋白卡9 6。nod2识别MDP对L-D异构体是立体特异性的，不包括对D-D或L-L类似物3的任何反应。MDP的有效辅助活性也可能与NLRP3炎性症7的激活有关。值得注意的是，已经发现与克罗恩病易感性相关的NOD2突变体在识别MDP 2、3方面缺乏。