1 癌症分子机制项目,癌症研究中心 (CIC),CSIC-萨拉曼卡大学,萨拉曼卡,西班牙 2 生物医学研究所 (IRB 巴塞罗那),巴塞罗那科学技术研究所 (BIST),西班牙巴塞罗那 3 癌症转化和临床研究项目,CSIC-大学癌症研究中心 (CIC)萨拉曼卡,萨拉曼卡,西班牙 4 纳瓦拉大学,应用医学研究中心,实体瘤项目,潘普洛纳,西班牙 5 肿瘤与发育生物学实验室 (LBTD),GIGA-Cancer,列日大学,列日,比利时 6 动物实验服务,萨拉曼卡大学,萨拉曼卡,西班牙 7 分子生物技术和健康科学系,大学分子生物技术中心都灵,都灵,意大利 8 采购计划,加泰罗尼亚肿瘤研究所 (ICO),L'Hospitalet de Llobregat,巴塞罗那,西班牙 9 Departament de Química Inorgànica i Orgànica,Universitat de Barcelona,巴塞罗那,西班牙 # 共同第一作者 * 共同通讯作者:d.santamaria@usal.es & cristina.mayor-ruiz@irbbarcelona.org
摘要:KRAS 原癌基因是胰腺肿瘤发生的主要驱动因素,在胰腺导管腺癌 (PDAC) 中几乎普遍发生突变。超过 90% 的 PDAC 病例中检测到 KRAS 点突变,这些突变已被证明与较差的治疗反应和总体生存率有关。致病性 KRAS 突变大多局限于密码子 12、13 和 61,其中 G12D、G12V、G12R、Q61H 和 G13D 约占突变病例的 95%。新兴数据表明特定突变亚型以及 KRAS 变异等位基因频率对临床预后的重要性。此外,正在开发针对特定突变亚型的新技术和疗法,并取得了令人鼓舞的早期结果。在本文中,我们旨在回顾最近关于特定突变 KRAS 亚型对肿瘤学结果的相对影响、变异等位基因频率在下一代测序分析中的应用以及针对特定突变 KRAS 亚型的治疗方法的持续研究的研究。
肺腺癌 (LUAD) 是非小细胞肺癌 (NSCLC) 中最常见的类型,是全球胸部癌症中发病率和死亡率最高的。BIRC5 是一种与肿瘤细胞增殖、分化、迁移和侵袭相关的蛋白质,作为潜在的 LUAD 生物标志物的研究尚不足。在本研究中,我们利用生物信息学技术分析来自 Cancer Genome Atlas (TCGA) 和 Gene Expression Omnibus (GEO) 数据库的 LUAD 相关数据,以识别与 LUAD 发病、进展和预后相关的生物标志物并评估其临床意义。免疫细胞浸润和单细胞 RNA 测序分析评估了核心基因在不同免疫环境中的表达。药物敏感性分析评估了这些生物标志物对治疗反应的影响,为早期诊断和个性化 LUAD 治疗提供依据。对来自 TCGA 和 GEO 的基因表达和临床数据进行加权相关网络分析 (WGCNA)、差异分析以及单变量和多变量 Cox 回归,以确定预后核心基因。高 BIRC5 表达成为 LUAD 中总体生存率 (OS) 较差的独立风险因素,表现出强大的诊断性能。富集分析表明 BIRC5 参与细胞周期和 P53 信号通路。单细胞 RNA 测序和免疫浸润分析表明,BIRC5 在免疫微环境中起着关键作用。药物敏感性分析表明,高 BIRC5 表达与对几种抗癌药物的敏感性增加相关。这些发现证实 BIRC5 是 LUAD 诊断和预后的有希望的生物标志物。它在免疫调节和药物敏感性中的作用凸显了其指导个性化治疗策略的潜力。
KRAS 突变型肺癌是腺癌 (LUAD) 最常见的分子亚类,它是取决于突变类型的异质性组,它不仅影响致癌基因的功能,还影响癌症的生物学行为。此外,KRAS 突变会影响放射敏感性,但也会导致贝伐单抗和双膦酸盐耐药性。针对吸烟相关的 G12C 突变 KRAS (sotorasib 和 adagrasib) 的等位基因特异性不可逆抑制剂的开发具有重要意义。根据试验数据,sotorasib 和 adagrasib 均获得 FDA 的有条件批准,用于治疗先前接受过治疗的晚期 LUAD。与其他靶向疗法类似,临床给予 KRASG12C 抑制剂 (sotorasib 和 adagrasib) 会导致获得性耐药,这是由于不仅 KRAS 而且其他致癌基因的各种基因变化造成的。最近的临床研究旨在通过新颖的组合策略来提高 G12C 抑制剂的疗效。
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纤维化,以及四个主要驱动基因(KRAS,TP53,CDKN2A /P16,SMAD4)的改变。结果使用QPCR和ISH将肿瘤内细菌的存在固定在52个肿瘤中(32%)。16S元基因组测序揭示了这些肿瘤内的特征性剖面,包括蛋白质细菌和坚果类的门。比较良好和预后良好的病例之间的细菌核对文件表明,较短的生存时间与厌氧细菌(例如bacte-roides,乳酸杆菌和peptoniphilus)之间存在显着的正相关。这些细菌的丰度与CD4,CD8和CD45RO阳性的肿瘤浸润T细胞的减少相关。结论厌氧菌细菌(例如菌孢子,乳酸杆菌和peptoniphilus)的肿瘤内感染与抑制的抗PDAC免疫和不良预后有关。
摘要:胰腺导管腺癌 (PDAC) 占所有胰腺癌的 90%,5 年生存率为 7%,80% 的患者被诊断为晚期或转移性恶性肿瘤。尽管诊断检测、手术技术和全身治疗方面取得了最新进展,但有效治疗 PDAC 的选择仍然有限。迫切需要开发能够区分癌细胞和非癌细胞的靶向疗法,以减少副作用并更好地抑制肿瘤生长。抗体靶向策略是引入创新疗法的潜在有效选择。可以提出基于抗体的免疫疗法和基于抗体偶联纳米颗粒的靶向疗法,其中抗体靶向特定的肿瘤相关抗原 (TAA)。在此背景下,在 PDAC 中高表达而在非恶性病变和健康胰腺组织中不表达或表达水平非常低的磷脂酰肌醇聚糖-1 (GPC1) 是一种有用的 TAA,可通过基于特定抗体的免疫疗法和基于抗体偶联纳米颗粒的靶向疗法实现。在这篇综述中,我们描述了 PDAC 的主要临床特征。我们提出蛋白聚糖 GPC1 是用于 PDAC 靶向疗法的有用 TAA。我们还对可用于靶向 GPC1 的基于抗体的免疫疗法和基于抗体偶联纳米颗粒的靶向疗法的主要开发方法进行了概述。
肺癌是全球癌症相关死亡的主要原因。肺腺癌 (LUAD) 是最常见的组织学亚型,占所有病例的 40%。虽然现有的基因工程小鼠模型 (GEMM) 重现了人类 LUAD 的组织学进展和转录进化,但它们耗时且技术要求高。相比之下,细胞系移植模型快速灵活,但这些模型无法捕捉疾病进展的全部范围。类器官技术提供了一种创建下一代癌症模型的方法,该模型整合了自体系统和基于移植的系统的最有利特征。然而,目前缺乏强大而可靠的 LUAD 类器官平台。在这里,我们描述了在类器官培养中持续扩增小鼠肺泡 2 型 (AT2) 细胞(LUAD 的主要起源细胞)的优化条件。这些类器官表现出 AT2 细胞的典型特征,包括标记基因表达、层状体的存在以及分化为 AT1 谱系的能力。我们利用该系统开发了灵活且多功能的免疫功能正常的类器官模型,用于 KRAS 、 BRAF 和 ALK 突变型 LUAD。值得注意的是,类器官肿瘤表现出广泛的负担和完全渗透性,并且在组织病理学上与原发肿瘤没有区别。总之,该类器官平台是一个功能强大、用途广泛的新型 LUAD 研究模型系统。
癌症研究旨在了解恶性转化的生物学原理。最近,食管腺癌 (EAC) 的发病率急剧上升,如果我们了解其原因和方式,我们将能够更好地进行诊断、预后、检测、预防和干预。大多数恶性肿瘤进展的最初阶段是最难研究的。人们认为癌症的发生是一种相对罕见和偶然的事件,其发生的位置和时间通常不为人知。在我们体内数以万亿的体细胞中,只有少数细胞会走上恶性肿瘤的道路。然而,慢性炎症会产生一种化生病变,这种病变与 EAC 发病率增加直接相关,从而提醒我们进展开始的时间和地点,并使我们能够研究其生物学原理。我们描述了最近的研究,这些研究确定了进展为 EAC 的基质细胞和上皮细胞之间的协调作用。
背景肺癌仍然是全球癌症相关死亡的主要原因。非小细胞肺癌(NSCLC)的治疗策略根据多个驱动癌基因进行细分。然而,神经内分泌肺癌,特别是大细胞神经内分泌癌(LCNEC)的治疗并未改善。由于 LCNEC 的发生率低,其基因状态和体细胞突变检测在日常实践中的意义尚不清楚。2013 年,日本开展了全国性的个体化医疗肺癌基因组筛查项目(LC-SCRUM Japan),旨在为携带稀有基因的 NSCLC 患者开发分子靶向治疗方法。自 2019 年起,Onco-mine Dx Target test 多 CDx 系统已在日本晚期肺癌的多重基因检测中用于日常实践。因此,肺癌患者很可能接受体细胞突变检测。我们报告了一例携带 BRAF V600E 突变的 LCNEC 病例,该病例对达拉非尼和曲美替尼 (DT) 有反应。该病例证明了体细胞突变检测在 LCNEC 中的重要性。