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DNA损伤修复改变对前列腺癌进展和转移的影响
前列腺癌是全球最常见的疾病之一。尽管最近在治疗方面取得了进展，但晚期前列腺癌的患者的预后较差，并且该人群的需求很高。了解前列腺癌的分子决定因素和疾病的侵袭性表型可以帮助设计更好的临床试验并改善这些患者的治疗方法。晚期前列腺癌经常改变的途径之一是DNA损伤反应（DDR），包括BRCA1/2的改变和其他同源重组修复（HRR）基因。DDR途径的改变在转移性前列腺癌中尤为普遍。在这篇综述中，我们总结了原发性和晚期前列腺癌中DDR改变的普遍性，并讨论了DDR途径中的变化对DDR基因的侵袭性疾病表型，预后和种系致病性的关联的影响，而DDR基因与患有前列腺癌风险的DDR基因改变了。
杰克锅！关于类风湿关节炎的治疗循环的注册表，我们可以学到什么？
炎症性疾病（包括类风湿关节炎（RA））的色氨酸（TRP）代谢的抽象目标改变已有报道。但是，了解这些变化是否参与RA开发，并且可以被认为是假定的治疗靶标仍然不确定。在这项研究中，我们将RA患者的血清中的定量TRP代谢组合并为实验性关节炎中的重组酶，以解决这个问题。方法针对的定量TRP代谢组学是对来自Espoir的574例先前未经治疗的RA患者（Etude et Suivi des polyarthitesIndifférenciéesRécentes）和98名健康受试者进行的。验证队列涉及69名既定RA患者。剂量也是在胶原蛋白诱导的关节炎（CIA）和胶原蛋白抗体诱导的关节炎（CAIA）小鼠和对照组的血清上进行的。在CAIA模型中进行了一项评估靶向Kynurenine途径的治疗效力的概念验证研究。结果差异分析显示，与健康对照组相比，RA患者的TRP代谢物水平发生了巨大变化。降低kynurenic（kyna）和黄脑酸（XANA）酸和吲哚衍生物的水平，以及含喹啉酸（Quin）的水平升高。它们与疾病的严重程度（通过循环生物标志物和疾病活动得分评估）和寿命分数呈负相关。在CAIA和CIA模型中观察到Kynurenine途径代谢产物的相似谱。从机械的角度来看，我们证明了奎因有利于人类成纤维细胞样的滑膜细胞增殖，并通过诱导线粒体呼吸和糖酵解来影响其细胞代谢。最后，在CAIA模型中，重组酶氨基磷酸氨基转移酶的全身给药是XANA和KYNA产生的。结论总的来说，我们的临床前和临床数据表明，TRP代谢的改变在RA发病机理中起积极作用，并且可以被视为新的治疗途径。
肠道微生物组的改变与表观遗传年龄的加速和身体健康有关
fi g u r e 2肠道微生物组和表观遗传老化时钟的关联。（a，b）在物种，（s），属（g），家庭（F），（O），（C），Phylum（p）和王国（K）和年龄，年龄，年龄，加速及年龄的物种水平上，微生物组的多样性（通过相对丰度的香农熵测量）之间的相关性。（c，d）类似于类似的相对丰度的相似相关分析。（e，f）肠道微生物组丰富物种的相似相关分析。门也显示在括号中，由门的前四个字母缩写。（g，h）肠道微生物组中最丰富的细菌途径的相似相关分析（SPWY。，SuperPathway； Bios。，生物合成）。
通过超声心动图测量的心脏微观结构改变确定性别特定的心力衰竭风险
抽象目标建立的心力衰竭（HF）风险的临床前成像评估基于宏观结构心脏重塑。鉴于微观结构改变也可能影响HF风险，尤其是在女性中，我们检查了微观结构改变与事件HF之间的关联。我们研究了n = 2511名成年参与者（平均年龄65.7±8.8岁，56％的女性），他们在基线时没有心血管疾病。，我们基于高频谱信号强度系数（HS-SIC）对超声心动图的纹理分析来量化微结构变化。我们检查了其与性行为和性别特定的COX模型的关系，这些模型涉及传统的HF风险因素和宏观结构的改变。结果我们观察到94个新的HF事件在7。4±1.7岁以上。HS-SIC较高的个体患有HF的风险增加（HS-SIC中的HR 1.67，95％CI 1.31至2.13； P <0.0001）。调整年龄和降压药的使用，这种关联在女性中很重要（p = 0.02），但没有男性（p = 0.78）。调整传统危险因素（包括体重指数，总/高密度脂蛋白胆固醇，血压特征，糖尿病和吸烟）减弱了女性的关联（HR 1.30，P = 0.07），并在这些风险因素的主要方面看到HS-SIC的HF风险中介。然而，除了这些危险因素外，调整了相对壁厚（代表宏观结构改变）后，女性中与HF的HF与HF的关联（HR 1.47，p = 0.02）仍然显着。结论心脏微结构改变与HF的风险升高有关，尤其是在女性中。微观结构改变可能会识别个人从风险因素到临床HF的发展的性别途径。
转录组和文本的多模式学习启用与自然语言聊天的交互式单细胞RNA-seq数据探索
此预印本版的版权持有人于2024年12月17日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.12.16.628764 doi：biorxiv Preprint
唐氏综合症小鼠模型大脑中dyRK1a表达的性别特异性发育改变
唐氏综合症（DS）中异常的神经发育（通过人类染色体的一式三次造成）通常归因于基因剂量不平衡，将三叶基因的过度表达与破坏的发育过程联系起来，而DYRK1A与DYRK1A特别含义。我们假设，trisomic小鼠中的区域脑DyRK1a蛋白过表达在性别特异性模式中随发育而有所不同，这可能与DyRK1A转录不同，而DyRK1A拷贝数的副本副本数量从否则Trisomic小鼠中的3减少到2，而不是其他曲核小鼠的Dyrk1a，独立于其他trisomamic Genes。dyrk1a的过表达随着年龄，性别和大脑区域而变化，两性的产后日（P）6的峰值过表达。性别依赖性差异也从p15-p24中明显出现。减少DYRK1A拷贝数证实，这些差异取决于Dyrk1a基因剂量，而不是其他三异构体基因。trisomic dyRK1a mRNA和蛋白表达不高度相关。在trisomic神经发育过程中DYRK1A过表达的性别特异性模式可以为DS治疗干预提供机械靶标。
线粒体DNA氧化，甲基化和双极抑郁症的拷贝数改变
情绪障碍，包括重度抑郁症（MDD）和双相情感障碍（BD），是普遍且致残的精神疾病（1）。情绪障碍的患者表现出由遗传和环境因素的复杂相互作用引起的症状（2-4）。尽管有很多发现，涉及各个级别的结构和功能改变，从微结构和分子途径到神经网络，但对抑郁症基本机制的理解仍然很少（4）。最近的证据表明，情绪障碍与几种机制有关，包括表观遗传调节和氧化应激，这可以触发基因组材料中的各种修饰，例如DNA甲基化或氧化（3，5，6）。表观遗传调节包括控制基因表达的机制，而DNA核苷酸序列没有任何变化。越来越多的报告表明表观遗传机制，例如DNA甲基化，组蛋白修饰和非编码RNA可能在情绪障碍的发病机理以及对药理干预措施的反应中起关键作用（3、5、7、8）。在表观遗传机理中，DNA甲基化是情绪障碍中最广泛的研究，涉及将甲基添加到DNA分子中。DNA甲基化改变经常在抑郁症患者中显示（9）。除了甲基化变化外，DNA还易于自由基氧化，从而导致氧化引起的DNA损伤。以前的证据支持氧化诱导的DNA损伤在抑郁症的发病机理中存在（10 - 13）。但是，这些发现仅基于核遗传物质在内的核DNA和RNA的修改。线粒体是半自治的细胞器，其中包含其自己的，圆形的，母体遗传和双链（即重和轻链）线粒体DNA（mtDNA），并用作人体的主要能量供应。mtDNA编码属于电子传输链复合物，22个转移RNA和2个核糖体RNA的13个多肽，并包含一个非编码区域，其中包括位移环（D-Loop）（14，15）。mtDNA的改变可能会导致线粒体基因表达的变化，从而影响人体的线粒体功能和生物能调节，从而导致线粒体功能障碍（16）。线粒体功能障碍已被确定为抑郁症各个方面的关键机制之一，例如精神症状和神经认知异常以及早期衰老（17，18）。先前的研究报告了MDD和BD（19，20）中线粒体代谢产物，基因或蛋白质水平的异常，并提出了类似的线粒体功能障碍，这些疾病之间的线粒体功能障碍（21 - 23）。尽管mtDNA比核DNA更容易受到基因组修饰的影响（例如甲基化和氧化）（24，25），但识别mtDNA修饰，
宏观结构改变
研究文章：新研究| Disorders of the Nervous System Macro- and Micro-Structural Alterations in the Midbrain in Early Psychosis associates with clinical symptom scores https://doi.org/10.1523/ENEURO.0361-24.2025 Received: 21 August 2024 Revised: 21 February 2025 Accepted: 24 February 2025 Copyright © 2025 Zhou et al.这是根据Creative Commons Attribution 4.0国际许可条款分发的开放访问文章，只要将原始工作正确归因于任何媒介，它允许在任何媒介中进行无限制的使用，分发和复制。
急性运动和缺氧对记忆的结合影响
摘要疾病媒介的微生物群落可能代表了几种生物学功能的关键特征，因此鉴于气候变化，应特别关注，因此需要制定新颖的控制策略。然而，媒介传播的微生物网络仍然鲜为人知。评估向量的微生物相互作用和气候依赖性可能有助于更好地估计病原体传播特征和公共卫生风险。在全国范围内的气候代表性的调查中，ixodes ricinus tick是从匈牙利的17个地点收集的。使用shot弹枪元基因组测序，通过研究各种气候环境中的若虫和女性之间的关系来分析细菌组的组成。在属水平上的细菌组成显示女性和若虫的样品之间存在显着差异。在核心细菌组中，女性和若虫在以下属中显示出显着差异：arsenophonus，芽孢杆菌，念珠菌中氯酸酯，犀牛，鞘氨虫，鞘氨虫，葡萄球菌，葡萄球菌cus和沃尔巴基亚。发现了以下区分：cur虫，假单胞菌和鞘氨虫。没有女性降水类别有显着差异的属。covtobac terium在若虫中的各种降水水平上显示温度和芽孢杆菌之间的差异显着差异。矢量传播的细菌组成员的组成在具有不同气候条件和tick宿主的发育阶段的采样点显示出显着变化。我们的发现不仅为理解tick传播的细菌网络和相互依赖性铺平了道路，而且还阐明了存在可能存在的生物滴答控制物种的高潜力，tick寄生虫，ixodiphagus hookeri基于相关细菌组的模式。
FGFR 和 IDH1-2 变异是否是肝内胆管癌的积极预后因素？一个尚未解决的问题
尽管 FGFR 和 IDH1/2 变异代表了肝内胆管癌 (iCCA) 中一些最常见和研究最多的分子变化，但它们的预后作用仍是一个悬而未决的问题。在这篇评论中，我们对有关该主题的现有文献数据进行了批判性分析，强调了每项报告研究的优势和缺陷。尽管目前可用的研究总体质量较差，但可以推断出 FGFR2 重排和 FGFR2-3 变异的总体生存率总体趋势较好。另一方面，IDH1/2 突变的积极预后作用似乎更加不确定。在这种情况下，需要在这些 iCCA 患者子集中进行更好的临床试验设计，以便就此问题得出明确的结论。