抽象聚类定期间隔短的短质体重复序列(CRISPR)介导的基因组工程和相关技术在过去十年中彻底改变了生物技术,通过提高了复杂的生物系统的效率。cas12a(CPF1)是与许多原核生物中发现的CRISPR自适应免疫系统相关的RNA引导的内切酶。与其更突出的对应物Cas9相反,Cas12a识别富含DNA序列,并能够直接处理其相应的指南RNA,从而使其成为多重基因组编辑工作和其他应用于生物技术中的多功能工具。虽然CAS12A已在真核细胞系统中广泛使用,但微生物应用仍然受到限制。在这篇综述中,我们强调了Cas12a和Cas9之间的机械和功能差异,并着重于使用CAS12A在细菌宿主中使用CAS12A的最新应用。此外,我们讨论了优势以及当前的挑战,并为这种有希望的替代CRISPR-CAS系统提供了未来的前景,用于细菌基因组编辑及其他挑战。
抽象益生菌是保护宿主免受许多疾病的功能性和有用的微生物之一,并被用作食品工业的实时补充剂。新的细菌具有益生菌能力的隔离,扩大了这种有益的微生物在人和动物健康中的有效性。考虑致病细菌的发展及其对抗生素的耐药性,研究益生菌在治疗和预防疾病中的重要性至关重要。药用植物含有较低并发症的天然化合物,而它们与益生菌的结合可能会对人类和动物的健康产生更积极和令人惊讶的影响。由于食品工业中同时使用药用植物和益生菌,包括益生菌和酸奶产品,可以防止致病性微生物的生长;进行了本研究以研究药用植物对益生菌微生物的性能和功能的影响。
耕种土壤主要由N 2 O排放造成全球变暖,并且证明很难缓解。然而,一种具有令人鼓舞的新方法在实验室中,利用有机废物作为N 2 O-令人反感细菌(NRB)菌株的底物和向量,以其在土壤中生存的能力而被选中。在这里,我们在现场实验中证明了强大的作用:产生沼气产生的废物,其中菌株cloacibacterium sp。CB-01在有氧运动中生长到〜6*10 9细胞ML -1,将N 2 O-排放降低了50-95%。CB-01的强大而持久的作用归因于其在土壤中的坚韧性,而不是其生物动力学参数,该参数不如其他NRB量。扩展到欧盟水平,我们发现国家人为n 2 O-发射可以降低5-20%,如果包括其他有机废物,则可以降低更多。这为目前缺乏其他缓解措施的N 2 O排放量开辟了一条途径。
背景和目标:细菌群落在氮循环中起着至关重要的作用。氧化池是废水的天然处理系统,旨在促进某些细菌物种的生长和活性,从而去除水中的污染物。这些池塘中的氮循环涉及细菌通过生物过程转化氮化合物。某些细菌物种的存在或不存在会极大地影响这些池塘中氮循环的效率。本研究调查了氧化池中细菌与氮动力学(废水处理的关键组成部分)之间的关系。这项工作旨在确定氧化池中的细菌群落组成,研究细菌在氧化池中转化和去除废水中氮化合物的作用,并评估环境因素对氧化池中微生物群落和氮动力学的影响。这项研究是在泰国碧武里皇家发起的 Laem Phak Bia 环境研究与开发或 LERD 项目的氧化废水处理中进行的。方法:采集1~5个氧化塘水面30 cm深处的废水样品,分析温度、溶解氧、生化需氧量、硝酸盐、氨、凯氏氮等水质参数。采用Illumina Miseq二代测序技术对采集样品中的细菌16S核糖体核糖核酸进行检测。采用相关性检验进行统计分析。结果:氧化塘的温度、生化需氧量(1~5个塘)和溶解氧(2~5个塘)均在标准值范围内。5个氧化塘共鉴定出15个细菌门,其中变形菌门数量最多,占细菌总数的47.56%。结论:Novosphingobium 属(变形菌门)、Ammonia-11 属(疣微菌门)和 Vicinamibacteraceae 属(酸杆菌门)与氨、硝酸盐和总凯氏氮的关系最密切(R 2 = 0.9710、0.986、0.8124)。细菌种群是影响氮营养和水质的关键因素。Novosphingobium 参与去除废水中的氨,疣微菌门充当反硝化菌,而 Vicinamibacteraceae 可提高总凯氏氮水平。
传统上,农作物种植依赖于化学方法,这意味着严重的人为环境负荷和农田植物检疫条件差[6–8]。细菌植物生长促进法在俄罗斯农业中被称为生物化,是小麦种植中一个很有前途的方向,因为它充分利用了植物生长刺激细菌的潜力[9–11]。这些细菌及其代谢物提供生物肥料,增强根际生物源性,从而改善整个农业群落的生态条件。在适当的条件下,微生物会产生具有农业重要性的代谢物[12]。微生物及其代谢物分解复杂的土壤矿物质,将其转化为特定作物的生长促进剂。
食品发酵包括各种各样的产品,从酸奶和奶酪等乳制品订书钉到全球享受的调味品,例如酱油和酸菜。细菌以及其他微生物(如酵母菌)有助于这些食物的独特品质。乳酸细菌(LAB)包括乳杆菌和链球菌等物种,是许多食品发酵的主要参与者。这些细菌将存在于原成分中的糖代谢,从而产生乳酸作为副产品。这不仅赋予发酵食品的特征性浓郁,而且通过创造酸性环境抑制有害细菌的生长来有助于其保存。
皮尤慈善信托基金会 (Pew Charitable Trusts) 成立 75 周年,该基金会利用数据来改变现状。皮尤基金会通过阐明问题、创造共识和推进雄心勃勃的项目来应对不断变化的世界所带来的挑战,从而取得切实的进展。
益生菌已用于预防和治疗疾病一个多世纪。它们可以减轻胃肠炎的影响,现在还用于治疗急性腹泻。这项研究旨在评估益生菌对腹泻病原菌的共聚集作用。为此,本研究使用了 11 株益生菌分离株,包括三株植物乳杆菌、一株加氏乳杆菌、两株发酵乳杆菌、三株嗜酸乳杆菌和两株加氏乳球菌分离株。对所有分离株进行了抗生素敏感性、自聚集能力、粘附能力、抗菌活性、酸性耐受性和胆汁盐耐受性测试。结果表明,大多数分离株在 4 小时后具有自聚集能力,其中发酵乳杆菌的比例最高,为 57.14%。药敏试验中,除1株分离株外,其余分离株均对甲氧苄啶/磺胺甲恶唑有抗性,除1株分离株外,其余分离株均对万古霉素和四环素敏感。所有分离株均具有黏附能力,但存活率不同,在酸性条件下,乳酸杆菌的存活率可达34.57%,在胆盐耐受性方面,乳酸杆菌的存活率最高,为85.17%,属于加氏乳杆菌。益生菌分离株对不同乳酸杆菌属和乳球菌属分离株的致腹泻菌均有抑菌作用,抑菌直径为17~49 mm。此外,还研究了益生菌分离株对腹泻致病菌的共聚集能力,结果表明,益生菌分离株在培养24 h后对大肠杆菌、宋内氏志贺氏菌和产碱普罗维登斯菌均有共聚集作用。益生菌分离株对产碱普罗维登斯菌的共聚集作用最强的是发酵乳酸杆菌和嗜酸乳杆菌,共聚集率达100%,而对大肠杆菌的共聚集率最低,为14.29%。研究结果揭示了益生菌的益生特性和对腹泻致病菌的共聚集作用。关键词:自聚集、腹泻、乳酸杆菌属、乳球菌属、益生菌
tan,S.M.,Muhammad Hafiz Ismail,&Cao,B。(2021)。通过元基因组分析揭示的新加坡热带海洋环境中磁性细菌的生物多样性。环境研究,194,110714-。doi:10.1016/j.envres.2021.110714
序列号 细菌分离物 透明区 (mm) 1. SSCL1 7 2 SSCL2 7.5 3 SSCL3 7 4 SSCL4 8.1 5 SSCL5 9 6 SSCL6 8.5 7 SSCL7 8.3 8 SSCL8 7 9 SSCL9 7.8 10 SSCL10 14 11 SSCL11 8.2 12 SSCL12 7.1 13 SSCL13 9 14 SSCL14 11 15 SSCL15 8.3 16 SSCL16 8.4 仅产生透明区超过 5mm 的分离物被挑选出来并进行二次
