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用于酵母细胞工厂开发的多重基因组工程方法
随着包括多重基因组工程在内的合成生物学工具的生物技术应用迅速扩展，构建战略性设计的酵母细胞工厂变得越来越可能。这在很大程度上要归功于 CRISPR/Cas 技术和高通量组学工具等基因组编辑方法的最新进展。模型生物面包酵母 ( 酿酒酵母 ) 是生产高价值代谢物的重要合成生物学基础。多重基因组工程方法可以加快酵母细胞工厂中有效异源途径的构建和微调。最近出现了许多利用这一点的多重基因组编辑技术。本综述重点介绍此类工具的最新进展，例如 delta 整合和 rDNA 簇整合与 CRISPR-Cas 工具相结合，可大大提高多重整合效率。还回顾了作为多拷贝基因整合创新替代方法的预置门系统的例子。除了多重整合研究之外，还讨论了替代基因组编辑方法的多重化。最后，我们讨论了涉及非常规酵母的多重基因组编辑研究以及自动化对于高效细胞工厂设计和构建的重要性。将 CRISPR/Cas 系统与传统酵母多重基因组整合或供体 DNA 递送方法相结合，可通过提高效率和准确性来加快菌株开发。诸如在基因组中预先放置合成序列等新方法以及改进的生物信息学工具和自动化技术有可能进一步简化菌株开发过程。此外，讨论的用于改造酿酒酵母的技术可以适用于其他工业上重要的酵母物种，以进行细胞工厂开发。
智能原型的霍斯学学习
摘要B-千奇蛋白具有重要的生态和生理作用以及广泛应用的潜力，但是很少有来自B-奇异生产剂的差异相关酶的表征。针对Tara Oceans基因地图集的查询，在芽孢杆菌元转录组中发现了来自12个PFAM接收器的4,939个与丁氏蛋白相关的独特序列。假定的几丁质合酶（CHS）序列在甲壳类（39％），斯特雷默刺激（16％）和昆虫（14％）中降低，来自Tara Oceans Unigenes Unigenes Unigenes Unigenes Unigenes版本1 Metatranscrentsomes（Matouv1 1 T）数据库的昆虫（14％）。从模型diatom thalassiosira pseudonana（thaps3_j4413，指定为tp chs1）中的CHS基因被鉴定。海洋微生物真核生物转录组测序项目（MMETSP），Phycocosm和Plaza Diotom Omics数据集的TP CHS1的同源分析表明，Mediophyceae和thalassionemales物种是潜在的B -Chitin生产国。tp chs1在酿酒酵母和三角肌中过表达。在转基因P. tricornutum系中，TPCHS1- EGFP定位于高尔基体和质膜，并且在细胞分裂期间的裂解沟中主要可获得。增强的TP CHS1表达可以诱导异常的细胞形态并降低三角杆菌的生长速率，这可能归因于G2/M期的抑制。S.酿酒酵母被证明是表达大量活性TPCHS1的更好系统，在放射测定中，在放射测定中有效地不合适的UDP-N-乙酰葡萄糖胺。我们的研究扩大了有关海洋真核微生物中几丁质合酶分类分布的知识，并且是第一个集体表征活性海洋硅藻CHS的知识，该硅藻可能在细胞分裂过程中起重要作用。
真菌在粮食生产和发酵中的作用
除了其生态贡献外，真菌在医学中也很重要，它们已经使用了几个世纪。真菌物种，例如青霉和曲霉菌，一直是关键抗生素和其他治疗剂的来源，彻底改变了现代医学。除了在医疗保健中的使用之外，真菌在诸如粮食生产之类的行业中至关重要，它们被用来发酵面包，奶酪，啤酒和葡萄酒。真菌（例如酿酒酵母）被广泛用于烘烤和酿造，因为它们能够将糖转化为酒精和二氧化碳。此外，真菌在生物修复中发挥作用，在那里它们分解了环境污染物，包括漏油和重金属，并将其转化为无害的物质。
用于神经退行性实验模型的人工智能
图 1 人类与非人类物种之间共享的基因。系统发育树标注了每个物种中具有 1:1 直系同源物的人类基因百分比（以数字和每个圆圈的填充比例显示）。与人类共享的 1:1 直系同源物的绝对数量绘制为每个圆圈的颜色。使用 orthogene R 包构建。92 关键词：Anolis carolinensis，绿变色蜥；Bos taurus，牛；Caenorhabditis elegans，蛔虫；Canis lupus familiaris，狗；Danio rerio，斑马鱼；Drosophila melanogaster，果蝇；Equus caballus，马；Felis catus，猫；Gallus gallus，鸡；Homo sapiens，人类；Macaca mulatta，恒河猴；Monodelphis domestica，灰色短尾负鼠；小家鼠 (Mus musculus)，家鼠；鸭嘴兽 (Ornithorhynchus anatinus)，鸭嘴兽；黑猩猩 (Pan troglodytes)，黑猩猩；褐家鼠 (Rattus norvegicus)，褐家鼠；酿酒酵母 (Saccharomyces cerevisiae)，面包酵母；粟酒裂殖酵母 (Schizosaccharomyces pombe)，裂殖酵母；野猪 (Sus scrofa)，猪；热带爪蟾 (Xenopustropicalis)，西方爪蟾。
有效的重组蛋白表达和纯化...
表达和纯化的重组蛋白在生物学和生物医学科学中高度使用。由于缺乏翻译后修饰（PTM）系统以及许多重组蛋白的不溶性，用于蛋白质表达和纯化的传统宿主生物，尤其是大肠杆菌，用于蛋白质表达和纯化。酵母蛋白生产系统一直是生产生物药物蛋白，蛋白质复合物和翻译后修饰蛋白的宝贵工具。在这里，我们使用半乳糖诱导系统描述了酿酒酵母中详细的蛋白质表达和纯化方案。发芽的酵母菌具有快速的细胞生长，可以达到高密度，从而产生具有高蛋白质产量的快速，简单的真核蛋白质生产平台。
Ogunoye，O。A.，Adesina，J.M.，Ayodeji，M.S.，Johnson，T.A.，Bolarinwa，S.A. 的微生物评估Ogunoye，O。A.，Adesina，J.M.，Ayodeji，M.S.，Johnson，T.A.，Bolarinwa，S.A.
fufu（木薯样食物）是尼日利亚最消耗的主食食品之一，尤其是在该国南部。这项研究旨在检测和量化在Owo大型Owo owo州市场市场上出售的fufu中的微生物。在三个主要的OWO市场的卖方中无菌地收集了大约50/克的新鲜烹饪FUFU样品，并运送到联邦技术大学，Akure（FUTA）作物，土壤和PEST Management系实验室进行分析。对于细菌，将营养琼脂板（Na）板以37+2ºC孵育24小时，而酵母和霉菌的PDA板则在27+2ºC下孵育48小时。计数并记录孵育后每克每克细菌细胞和真菌孢子产生孢子（CFU/G）的菌落（CFU/G）。通过亚文化获得了每个分离物的纯化培养物，并在4ºC下存储以进行生化测试。Cooked fufu samples found mostly lactic acid bacteria like Lactobacillus plantarum, L. fermentum, L. brevis, Leuconostoc mesenteroides, Streptococcus thermophiles, S. mutans, Pediococcus cerevisiae, Staphylococcus hominis, Bacillus pumilus, acidophilus, L. lactis, Micrococcus spp。，B。枯草芽孢杆菌，椎球spp，S。表皮和双歧杆菌以及两个酵母包括酿酒酵母和Zygosacchachomyces spp。OWO Metropolis的一些主要市场出售了煮熟的FUFU样品，细菌载荷范围从0.2到2.3×10 7 CFU/g，酵母负荷在1.6至4.55×107 cfu/g中。良好的卫生可以提高OWO主要市场上出售的熟食的安全性和质量，并降低饮食疾病的危险。
重新设定
甲虫巨星Jannaschi（古细菌）1.7 100-200 X / 0.1-0.2 E. Coli K12（细菌）4.6 100-200× / 0.5-0.5-0.5-0.5-0-0。 1-1.2秀丽隐杆线虫（线虫蠕虫）97 80-100-100× / 8-10拟南芥（植物）125 80-100-100× / 10-13果蝇黑色素果（果蝇）180 80-100-100-100× / 15-18 Danio Rerio（斑马鱼）1400 30-50× / 42-70 HOMO SAPIENS（HUMAN）3300 30× / 99（浅层）; ≥80×/≥264（DEP）Hordeum dufgarre（大麦）4200 30× / 126 BUFO BUFO（TOAD）5000 30× / 150× / 150× /
4萨里大学化学与化学工程学院，吉尔福德GU2 7XH，英国 *通信：duo.zhang@surrey.ac.ac.uk（D.Z.）; LS01AX@1 4中国科学院，北京100049，中国 *通信：ji.dai@siat.ac.ac.cn收到：2023年9月21日；接受：Novembe 合成酵母基因组项目和超越 通向高能密度电池的道路 - 创新 确保人工智能的碳中性未来 5呼吸道疾病系，深圳儿童医院，深圳518000，中国 *通信：xubaopingbch@163.com收到：2月3日 世界遗产保护的生物多样性共同利益 1呼吸系，北京儿童医院，首都医科大学，中国国家临床研究中心，NA 将木质纤维素变成氢 - 创新 气候变化加剧了社会经济不平等 基于PI-MXENE/SRTIO3混合气凝胶的多功能灵活传感器用于触觉感知 2024年创新会议的特别会议
酿酒酵母（通常称为芽酵母）是一种单细胞真核生物，用作研究广泛的生物学过程的模型，因为其简单，快速生长和基因操纵性。此外，它也是一种无价的工业微生物，用于生产面包，啤酒和药品。为了进一步使该器官适合各种应用，全球一组科学家启动了合成酵母基因组项目（SC2.0项目），以通过设计师染色体为其提供基因组大修。1通过实施众多故意修改，SC2.0项目试图调查与染色体特性，基因组组织，基因组功能和进化有关的许多原本具有挑战性和基本问题。
监视可行的葡萄微生物组以提高野生葡萄酒的质量
葡萄藤构成了构成其微生物组的各种微生物。酿酒师已经使用了居住在葡萄树的微生物数百年来，尽管现代葡萄酒生产商经常依靠接种的微生物，例如酿酒酵母。在澳大利亚葡萄酒行业中，有一种恢复使用微生物组进行葡萄酒发酵的运动。随着对葡萄藤微生物组在葡萄疾病，发酵和随后的葡萄酒感官特征方面的作用的了解的提高，微生物世界提供了一种新的复杂程度，可用于酿酒。为了开发和维护所需的葡萄园微生物多样性，需要进行广泛的微生物监测。在这里，我们讨论了可活力选择染料的利用，以区分生物和与宿主相关的微生物以及非生存来源产生的遗物信号。