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人类遗传研究显着提高了我们对心血管疾病(CVD)的病理生理学和临床管理的理解。在这种情况下,遗传变异或突变分为两个主要群体:起源于生殖细胞的群体,这些群体被传递给后代(称为生殖线突变),而在个体的一生中被非毛细胞(称为体细胞突变)中的遗传细胞(称为生殖线突变)。在过去的二十年中,人类的遗传研究揭示了CVD中遗传差异所起的重要作用。1然而,最近,躯体突变也成为心血管疾病的引人注目的贡献。2在这种情况下,特别研究了造血系统,部分原因是获得外周血样本的易度性以及可从大型同类群体获得广泛的血液脱氧核糖核酸(DNA)测序数据。造血干细胞(HSC)已被证明随着个体生长的年龄增长,可以连续地检测随机突变。3 - 5,虽然这些突变大多数是
潜力不确定的克隆造血 (CHIP) 与心血管疾病 (CVD) 风险增加有关,据推测是通过炎症小体激活实现的。我们对 424,651 名英国生物银行参与者进行了炎症基因修饰扫描,以寻找 CHIP 相关的 CVD 风险。我们使用血液 DNA 的全外显子组测序数据确定了 CHIP,并将其作为一个复合模型进行建模,将所有驱动基因一起考虑,也分别考虑常见的驱动基因( DNMT3A 、 TET2 、 ASXL1 和 JAK2 )。我们为 26 个炎症小体相关基因开发了预测基因表达评分,并评估了它们如何改变 CHIP 相关的 CVD 风险。我们确定 IL1RAP 是跨基因 CHIP 相关 CVD 风险的潜在关键分子,并且 AIM2 基因表达增加导致 JAK2 和 ASXL1 相关的 CVD 风险增加。我们发现,CRISPR 诱导的 Asxl1 突变小鼠巨噬细胞对 AIM2 激动剂的炎症反应特别强烈,与 DNA 损伤反应增强以及 IL-10 分泌增加有关,反映了 ASXL1 CHIP 中 IL10 表达的 CVD 保护作用。我们的研究支持炎症小体在 CHIP 相关 CVD 中的作用,并提供了证据来支持针对 CHIP 相关 CVD 风险的基因特异性策略。
您的医生将进行检查以检查血液癌。这些测试可能包括血液检测,例如全血细胞计数(CBC)或基因检测。血液计数低,遗传突变的某些类型和大小会增加患血癌的风险。基因检测有助于监测突变的类型和大小。大多数CH患者患血癌的风险非常低。
简单摘要:转移性结直肠癌是一种复杂,普遍且威胁生命的疾病,受到影响其进展,进化和治疗反应的各种因素的影响。肿瘤异质性,源于遗传和非遗传因素,影响肿瘤的发育和治疗效果。可以通过对下一代测序的计算分析来评估此特征,以了解空间肿瘤的演变和多样性。分析循环肿瘤DNA可以通过实时监测肿瘤变化和治疗反应来研究时间异质性。不同的模型解释了这种异质性的起源,强调了复杂的分子途径。本综述研究了这些概念,并着重于克隆进化和肿瘤异质性的临床意义。
尽管在过去几十年中取得了巨大进步,但治疗失败仍然是抗癌疗法的重大负担。肿瘤细胞倾向于通过克隆进化和抗性亚克隆的选择来逃避化疗,从而导致治疗复发。下一代测序旨在找到耐药性癌细胞串扰中有希望的候选变异。这种方法可能进一步有助于分子肿瘤板适应每个患者的靶向治疗方案(1)。髓增生性综合征慢性髓样白血病(CML)成为有效且成功的靶向治疗的榜样。cml是一种罕见的肿瘤,主要是由相互易位t(9; 22)(q34; q11)引起的,导致BCR :: ABL1融合基因的形成(2)。在许多情况下,它通过酪氨酸激酶抑制剂(TKI)成功治疗,尤其是与BCR :: ABL1激酶结合的2-苯基氨基嘧啶伊替尼,从而预防了下游靶标的磷酸化(3)。尽管总体10年生存率为83%,但在治疗的五年内,所有患者中有20%至25%遭受治疗衰竭(4,5)。第二代和第三代TKI,即尼洛替尼,达沙替尼,鲍苏替尼和庞替尼,开发了以可变成功的变化(6,7)克服这种抗药性(6,7)。TKI抗性发生在依赖性或独立于BCR :: ABL1激酶改变。第一个提及的主要是由BCR :: abl1中的突变引起的,例如ABL1 p。(Tyr253His),p。(GLU255VAL)或p。(THR315ile))防止TKIS与BCR或BCR expristion TKIS结合,以防止TKIS与BCR :: ABCR1 anbl1 anbl1 and anbl1 and anbl1fination and Overection(8)。对于BCR :: ABL1-独立抵抗力,讨论了几种机制,例如,药物过表达EF ef lox top子转运蛋白,尤其是ATP结合盒(ABC)转运蛋白转运蛋白家族成员P-糖蛋白(P-GP,P-GP,ABCB1)或乳腺癌抗癌蛋白(BCRP,ABCG2)的传播(abcg2)的demaption(p-gp,abcb1),abcg2 abcg2 ryaption(abcg2)。 10)。此外,显示遗传像差,例如第8条或影响RUNT相关转录因子1(RUNX1)的突变,显示出患者中爆炸危机或抗TKI耐药性克隆的进展(11,12)。除了临床研究外,体外模型还可以详细研究耐药性的机理。这样的模型是关键工具,因为这些模型从这些模型中得出的发现被成功地转化为诊所,例如预测药物效率并改善治疗方案(13)。可以通过暴露于缓慢增加抗癌药物浓度或通过脉冲治疗来获得肿瘤细胞系的耐药性。 在这里,我们使用外显子组测序在体外模型中研究TKI抗性CML中的遗传变异。 为此,我们建立了伊马替尼和尼洛替尼抵抗的生物学重复。 我们报告了伊马替尼和尼洛替尼抗性发展中演变的序列变体。 此外,我们研究了候选变体PTPN11 p。(Tyr279Cys),PDGFRB p。(GLU578GLN)和NRAS p。(GLN61LYS)对TKI治疗的反应的影响。可以通过暴露于缓慢增加抗癌药物浓度或通过脉冲治疗来获得肿瘤细胞系的耐药性。在这里,我们使用外显子组测序在体外模型中研究TKI抗性CML中的遗传变异。为此,我们建立了伊马替尼和尼洛替尼抵抗的生物学重复。我们报告了伊马替尼和尼洛替尼抗性发展中演变的序列变体。此外,我们研究了候选变体PTPN11 p。(Tyr279Cys),PDGFRB p。(GLU578GLN)和NRAS p。(GLN61LYS)对TKI治疗的反应的影响。
摘要由于树木的常规育种和克隆繁殖作物所固有的局限性,因此基因编辑引起了极大的兴趣。数十篇已发表的论文证明了克隆作物和树木中基于CRISPR的系统的高效率。预计“清洁”编辑的机会将避免或减轻许多国家的监管负担,并可能改善市场接受。然而,迄今为止,几乎所有对树木和克隆作物的研究都保留了基因组中的所有基因编辑机制。尽管基因编辑效率很高,但技术和监管障碍可能会极大地限制商业用途的进展。技术障碍包括困难和缓慢的转化和再生,开花或克隆系统的延迟发作,这些系统使CRISPR相关基因的性隔离变得难度,效率低下的切除系统可以启用功能性(蛋白质或RNA加密的蛋白质或RNA加密DNA),以及狭窄的宿主范围或有限的基因范围或有限的基因上的变速器系统。调节性障碍包括诸如基因编辑植物(如转基因作物)的欧盟中,以及基于方法的许多形式的基于方法的系统,这些系统基于方法与产品新颖性进行了严格调节,因此很大程度上应用于每个插入事件。其他主要障碍包括关于国际贸易方案的规定以及对美国国家环境政策法的遵守情况。《 USDA Secure Act》已迈出了基于科学和风险的更大的一步 - 基于方法和插入事件 - 系统,但在美国及其他地区需要进一步的监管和法律创新。
1 卢旺达生物医学中心 (RBC) 疟疾和其他寄生虫病科,卢旺达基加利。 2 法国巴黎巴斯德研究所疟疾遗传学和抗药性研究中心。 3 美国纽约哥伦比亚大学欧文医学中心微生物学和免疫学系。 4 瑞典哥德堡大学。 5 美国马里兰州巴尔的摩市母婴生存计划/JHPIEGO。 6 影响卢旺达疟疾协会,卢旺达基加利。 7 卢旺达基加利卫生部。 8 国家参考实验室 (NRL)、BIOS/卢旺达生物医学中心 (RBC),卢旺达基加利。 9 美国总统疟疾倡议,卢旺达基加利。 10 法国巴黎生物信息学和生物统计学中心——计算生物学系。 11 法国巴黎巴黎大学科钦医院科钦研究所 INSERM 1016 寄生虫学-真菌学系。 12 西非和中非遏制疟疾行动,卢旺达基加利。 13 瑞士日内瓦世界卫生组织全球疟疾规划署。 14 美国纽约州纽约市哥伦比亚大学欧文医学中心医学系传染病科。 15 以下作者贡献相同:Aline Uwimana、Eric Legrand。 ✉电子邮件:Aline.Uwimana@rbc.gov.rw; dmenard@pasteur.fr
抽象目的:染色体不稳定性(CIN)是癌症的标志,其特征是染色体的细胞对细胞变异性,在癌细胞群体中经常观察到,并且与预后不良,转移和治疗耐药性不佳有关。乳腺癌(BC)的特征是不稳定的核型,最近的报道表明CIN可能会影响BC对化疗方案的反应。然而,已经观察到极端CIN与改善结果之间的矛盾关联。Methods: This study aimed to 1) evaluate CIN levels and clonal heterogeneity (CH) in MCF7, ZR-751, MDA-MB468, BT474, and KPL4 BC cells treated with low doses of tamoxifen (TAM), docetaxel (DOC), doxorubicin (DOX), Herceptin (HT), and combined treatments (TAM/DOC,通过使用荧光原位杂交(FISH),TAM/DOX,TAM/HT,HT/DOC和HT/DOX)通过将鱼类的结果与细胞增殖进行比较,检查与治疗的响应相关性。结果:根据三个特征,中间CIN与药物敏感性有关:雌激素受体α(ERα)和HER2状态,癌细胞中的CIN水平以及治疗诱导的CIN。ERα +/HER2-具有中间CIN的细胞对紫杉烷(DOC)和蒽环类动物(DOX)的治疗敏感,而ERα - /HER2-,ERα +/HER2 +,ERα +/HER2 +,ERα-/HER2 +细胞具有中间型的抗性。结论:对BC中CIN和CH的更深入的了解可以帮助优化现有的治疗方案和/或支持改善癌症结局的新策略。关键词乳腺癌;染色体不稳定性;耐药性;鱼;克隆异质性